MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021026	CTA	2	6	216261	216266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534173
3502	NC_021026	GTA	2	6	216317	216322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534173
3503	NC_021026	AG	3	6	216390	216395	50 %	0 %	50 %	0 %	480534173
3504	NC_021026	CCTTG	2	10	216400	216409	0 %	40 %	20 %	40 %	480534173
3505	NC_021026	GAA	2	6	216437	216442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534173
3506	NC_021026	A	6	6	216534	216539	100 %	0 %	0 %	0 %	480534173
3507	NC_021026	GAG	2	6	216560	216565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534173
3508	NC_021026	ATCA	2	8	216708	216715	50 %	25 %	0 %	25 %	480534173
3509	NC_021026	ACTTA	2	10	216740	216749	40 %	40 %	0 %	20 %	480534173
3510	NC_021026	CAAA	2	8	217015	217022	75 %	0 %	0 %	25 %	480534174
3511	NC_021026	A	7	7	217020	217026	100 %	0 %	0 %	0 %	480534174
3512	NC_021026	AC	3	6	217215	217220	50 %	0 %	0 %	50 %	480534174
3513	NC_021026	A	6	6	217252	217257	100 %	0 %	0 %	0 %	480534174
3514	NC_021026	TGA	2	6	217270	217275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534174
3515	NC_021026	GTG	2	6	217291	217296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534174
3516	NC_021026	A	6	6	217557	217562	100 %	0 %	0 %	0 %	480534175
3517	NC_021026	GTT	2	6	217635	217640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534175
3518	NC_021026	CAA	2	6	217718	217723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534175
3519	NC_021026	TGT	2	6	217847	217852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534175
3520	NC_021026	TAAAGG	2	12	217871	217882	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480534175
3521	NC_021026	ACC	2	6	217945	217950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534175
3522	NC_021026	GTC	2	6	217951	217956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534175
3523	NC_021026	GTG	2	6	218023	218028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534175
3524	NC_021026	GTT	2	6	218064	218069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534175
3525	NC_021026	CAG	2	6	218140	218145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534175
3526	NC_021026	ATA	2	6	218159	218164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534175
3527	NC_021026	ATT	2	6	218201	218206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534176
3528	NC_021026	AAG	2	6	218221	218226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534176
3529	NC_021026	GTT	2	6	218235	218240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534176
3530	NC_021026	ATC	2	6	218295	218300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534176
3531	NC_021026	AC	3	6	218328	218333	50 %	0 %	0 %	50 %	480534176
3532	NC_021026	GGT	2	6	218361	218366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534176
3533	NC_021026	CAC	2	6	218425	218430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534176
3534	NC_021026	GTG	4	12	218437	218448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534176
3535	NC_021026	TCG	2	6	218501	218506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534176
3536	NC_021026	CTG	2	6	218593	218598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534176
3537	NC_021026	GCA	2	6	218616	218621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534176
3538	NC_021026	GAA	2	6	218655	218660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534176
3539	NC_021026	CTT	2	6	218760	218765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534176
3540	NC_021026	CA	3	6	218768	218773	50 %	0 %	0 %	50 %	480534176
3541	NC_021026	AGC	2	6	218774	218779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534176
3542	NC_021026	GAG	2	6	218793	218798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534176
3543	NC_021026	ATG	2	6	218820	218825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534177
3544	NC_021026	A	6	6	218831	218836	100 %	0 %	0 %	0 %	480534177
3545	NC_021026	TCA	2	6	218841	218846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534177
3546	NC_021026	CA	3	6	218907	218912	50 %	0 %	0 %	50 %	480534177
3547	NC_021026	CAAG	2	8	218923	218930	50 %	0 %	25 %	25 %	480534177
3548	NC_021026	GCT	2	6	218939	218944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534177
3549	NC_021026	A	6	6	219038	219043	100 %	0 %	0 %	0 %	480534177
3550	NC_021026	ATC	2	6	219047	219052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534177
3551	NC_021026	GTT	2	6	219082	219087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534177
3552	NC_021026	TGC	2	6	219088	219093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534177
3553	NC_021026	AAT	2	6	219102	219107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534177
3554	NC_021026	CAA	3	9	219146	219154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534178
3555	NC_021026	CTT	2	6	219173	219178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534178
3556	NC_021026	CAA	2	6	219197	219202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534178
3557	NC_021026	TTG	2	6	219224	219229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534178
3558	NC_021026	AAC	3	9	219253	219261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534178
3559	NC_021026	GGT	2	6	219286	219291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534178
3560	NC_021026	TAA	2	6	219330	219335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534178
3561	NC_021026	GTT	2	6	219352	219357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534178
3562	NC_021026	TACAC	2	10	219404	219413	40 %	20 %	0 %	40 %	480534178
3563	NC_021026	CAT	2	6	219432	219437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534178
3564	NC_021026	GTG	3	9	219572	219580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534178
3565	NC_021026	TGC	2	6	219591	219596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534178
3566	NC_021026	AAC	2	6	219716	219721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534178
3567	NC_021026	GGT	3	9	219820	219828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534178
3568	NC_021026	TCGT	2	8	219932	219939	0 %	50 %	25 %	25 %	480534178
3569	NC_021026	ATA	2	6	219954	219959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534178
3570	NC_021026	A	6	6	220076	220081	100 %	0 %	0 %	0 %	480534179
3571	NC_021026	TCG	2	6	220089	220094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534179
3572	NC_021026	TGA	2	6	220104	220109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534179
3573	NC_021026	A	6	6	220109	220114	100 %	0 %	0 %	0 %	480534179
3574	NC_021026	ACG	2	6	220131	220136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534179
3575	NC_021026	A	6	6	220142	220147	100 %	0 %	0 %	0 %	480534179
3576	NC_021026	TTA	2	6	220149	220154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534179
3577	NC_021026	GACG	2	8	220217	220224	25 %	0 %	50 %	25 %	480534179
3578	NC_021026	AAG	2	6	220248	220253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534179
3579	NC_021026	GAC	2	6	220316	220321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534179
3580	NC_021026	GCAATC	2	12	220459	220470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480534180
3581	NC_021026	CAAA	2	8	220484	220491	75 %	0 %	0 %	25 %	480534180
3582	NC_021026	GCT	2	6	220492	220497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534180
3583	NC_021026	ATC	2	6	220501	220506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534180
3584	NC_021026	TTTGG	2	10	220549	220558	0 %	60 %	40 %	0 %	480534180
3585	NC_021026	GTA	2	6	220573	220578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534180
3586	NC_021026	CAA	2	6	220653	220658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534180
3587	NC_021026	AGG	2	6	220698	220703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534180
3588	NC_021026	CAT	2	6	220749	220754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534181
3589	NC_021026	GCA	2	6	220855	220860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534181
3590	NC_021026	TTCAC	2	10	220905	220914	20 %	40 %	0 %	40 %	480534181
3591	NC_021026	GGT	2	6	220945	220950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534181
3592	NC_021026	ACATCA	2	12	221006	221017	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480534181
3593	NC_021026	AAC	2	6	221027	221032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534181
3594	NC_021026	CGT	2	6	221098	221103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534181
3595	NC_021026	CA	3	6	221233	221238	50 %	0 %	0 %	50 %	480534181
3596	NC_021026	GAA	2	6	221266	221271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534181
3597	NC_021026	TAC	2	6	221277	221282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534181
3598	NC_021026	GTG	2	6	221318	221323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534181
3599	NC_021026	TTC	2	6	221327	221332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534181
3600	NC_021026	AGG	2	6	221352	221357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534181
3601	NC_021026	CGT	2	6	221395	221400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534182
3602	NC_021026	AAG	2	6	221441	221446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534182
3603	NC_021026	GCT	2	6	221512	221517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534182
3604	NC_021026	GTG	2	6	221546	221551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534182
3605	NC_021026	CA	3	6	221576	221581	50 %	0 %	0 %	50 %	480534182
3606	NC_021026	AAG	2	6	221843	221848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534183
3607	NC_021026	A	6	6	221875	221880	100 %	0 %	0 %	0 %	480534183
3608	NC_021026	GCT	2	6	221905	221910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534183
3609	NC_021026	AACA	2	8	221924	221931	75 %	0 %	0 %	25 %	480534183
3610	NC_021026	A	6	6	221950	221955	100 %	0 %	0 %	0 %	480534183
3611	NC_021026	ATA	2	6	221994	221999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534183
3612	NC_021026	AAT	2	6	222031	222036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534184
3613	NC_021026	TTG	2	6	222047	222052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534184
3614	NC_021026	GACAA	2	10	222076	222085	60 %	0 %	20 %	20 %	480534184
3615	NC_021026	ACC	2	6	222113	222118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534184
3616	NC_021026	ACT	2	6	222140	222145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534184
3617	NC_021026	A	6	6	222148	222153	100 %	0 %	0 %	0 %	480534184
3618	NC_021026	ATG	2	6	222164	222169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534184
3619	NC_021026	AAG	2	6	222185	222190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534184
3620	NC_021026	CGTA	2	8	222198	222205	25 %	25 %	25 %	25 %	480534184
3621	NC_021026	GTT	2	6	222256	222261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534184
3622	NC_021026	GAA	2	6	222262	222267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534184
3623	NC_021026	TCA	2	6	222272	222277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534184
3624	NC_021026	ACA	2	6	222342	222347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534185
3625	NC_021026	TGG	2	6	222382	222387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534185
3626	NC_021026	TGG	2	6	222451	222456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534185
3627	NC_021026	A	6	6	222464	222469	100 %	0 %	0 %	0 %	480534185
3628	NC_021026	GTT	2	6	222476	222481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534185
3629	NC_021026	TCGT	2	8	222492	222499	0 %	50 %	25 %	25 %	480534185
3630	NC_021026	TCG	2	6	222514	222519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534185
3631	NC_021026	GCA	2	6	222554	222559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534185
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3634	NC_021026	GGT	2	6	222632	222637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534185
3635	NC_021026	A	7	7	222762	222768	100 %	0 %	0 %	0 %	480534186
3636	NC_021026	TGT	2	6	222816	222821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534186
3637	NC_021026	GGT	2	6	222913	222918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534186
3638	NC_021026	ATC	2	6	222919	222924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534186
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3641	NC_021026	ACA	2	6	223028	223033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534186
3642	NC_021026	A	6	6	223033	223038	100 %	0 %	0 %	0 %	480534186
3643	NC_021026	AGT	2	6	223118	223123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534187
3644	NC_021026	ACT	2	6	223147	223152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534187
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3648	NC_021026	GTG	2	6	223360	223365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534187
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3652	NC_021026	ATA	2	6	223622	223627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534187
3653	NC_021026	A	6	6	223649	223654	100 %	0 %	0 %	0 %	480534188
3654	NC_021026	AG	3	6	223667	223672	50 %	0 %	50 %	0 %	480534188
3655	NC_021026	A	6	6	223683	223688	100 %	0 %	0 %	0 %	480534188
3656	NC_021026	TTG	2	6	223689	223694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534188
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3660	NC_021026	A	6	6	224293	224298	100 %	0 %	0 %	0 %	480534189
3661	NC_021026	A	6	6	224334	224339	100 %	0 %	0 %	0 %	480534189
3662	NC_021026	ACAA	2	8	224360	224367	75 %	0 %	0 %	25 %	480534189
3663	NC_021026	A	6	6	224461	224466	100 %	0 %	0 %	0 %	480534189
3664	NC_021026	AAG	2	6	224543	224548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534189
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3672	NC_021026	GGTT	2	8	225059	225066	0 %	50 %	50 %	0 %	480534190
3673	NC_021026	CAA	3	9	225169	225177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534190
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3677	NC_021026	TACG	2	8	225225	225232	25 %	25 %	25 %	25 %	480534190
3678	NC_021026	TAAAGG	2	12	225257	225268	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480534190
3679	NC_021026	TTCG	2	8	225288	225295	0 %	50 %	25 %	25 %	480534190
3680	NC_021026	AAG	2	6	225301	225306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534190
3681	NC_021026	AAT	2	6	225319	225324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534190
3682	NC_021026	AAAC	2	8	225427	225434	75 %	0 %	0 %	25 %	480534191
3683	NC_021026	CT	3	6	225470	225475	0 %	50 %	0 %	50 %	480534191
3684	NC_021026	CTG	2	6	225480	225485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534191
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3696	NC_021026	CTG	2	6	226070	226075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534192
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3714	NC_021026	AG	3	6	227056	227061	50 %	0 %	50 %	0 %	480534194
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3725	NC_021026	GAT	2	6	227653	227658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534195
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3730	NC_021026	CAA	2	6	227780	227785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534195
3731	NC_021026	TCCAA	2	10	227800	227809	40 %	20 %	0 %	40 %	480534195
3732	NC_021026	CTG	2	6	227868	227873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534195
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3740	NC_021026	AGA	2	6	228145	228150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534195
3741	NC_021026	AT	3	6	228151	228156	50 %	50 %	0 %	0 %	480534195
3742	NC_021026	CTT	2	6	228164	228169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534195
3743	NC_021026	CGT	2	6	228170	228175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534195
3744	NC_021026	TGT	2	6	228256	228261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534195
3745	NC_021026	TGG	2	6	228268	228273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534195
3746	NC_021026	ACAGA	2	10	228366	228375	60 %	0 %	20 %	20 %	480534195
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3749	NC_021026	GAT	2	6	228752	228757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534196
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3856	NC_021026	GCAT	2	8	234482	234489	25 %	25 %	25 %	25 %	480534204
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3860	NC_021026	AAGAT	2	10	234924	234933	60 %	20 %	20 %	0 %	480534205
3861	NC_021026	CAT	2	6	234958	234963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534205
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3864	NC_021026	CTT	2	6	235020	235025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534205
3865	NC_021026	TGT	2	6	235043	235048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534205
3866	NC_021026	TCT	2	6	235084	235089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534205
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3868	NC_021026	TAGG	2	8	235270	235277	25 %	25 %	50 %	0 %	480534205
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3979	NC_021026	GAT	2	6	242628	242633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534214
3980	NC_021026	AGT	2	6	242700	242705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534214
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3982	NC_021026	TATCTG	2	12	242909	242920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480534214
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3984	NC_021026	GTTTG	2	10	242992	243001	0 %	60 %	40 %	0 %	480534214
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3986	NC_021026	CTT	2	6	243060	243065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534214
3987	NC_021026	TTA	2	6	243083	243088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534214
3988	NC_021026	TCT	2	6	243163	243168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534214
3989	NC_021026	TA	3	6	243176	243181	50 %	50 %	0 %	0 %	480534214
3990	NC_021026	TGG	2	6	243313	243318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534214
3991	NC_021026	GTA	2	6	243340	243345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534214
3992	NC_021026	AGT	2	6	243351	243356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534214
3993	NC_021026	TAA	2	6	243387	243392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534214
3994	NC_021026	CAA	2	6	243448	243453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534214
3995	NC_021026	GCA	2	6	243523	243528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534214
3996	NC_021026	TGG	2	6	243767	243772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534214
3997	NC_021026	TTA	2	6	243799	243804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534214
3998	NC_021026	AAC	2	6	244065	244070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534215
3999	NC_021026	TAAA	2	8	244133	244140	75 %	25 %	0 %	0 %	480534215
4000	NC_021026	A	6	6	244138	244143	100 %	0 %	0 %	0 %	480534215

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