MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021026	GAAA	2	8	149649	149656	75 %	0 %	25 %	0 %	480534114
2502	NC_021026	A	7	7	149975	149981	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2503	NC_021026	TTG	2	6	150027	150032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534115
2504	NC_021026	AGA	2	6	150058	150063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
2505	NC_021026	AGA	2	6	150096	150101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
2506	NC_021026	AAGCAA	2	12	150111	150122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	480534115
2507	NC_021026	GCT	2	6	150131	150136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534115
2508	NC_021026	AAG	2	6	150137	150142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
2509	NC_021026	ACG	2	6	150147	150152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534115
2510	NC_021026	AGC	2	6	150166	150171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534115
2511	NC_021026	A	6	6	150182	150187	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2512	NC_021026	AGA	2	6	150201	150206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
2513	NC_021026	GAG	2	6	150212	150217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534115
2514	NC_021026	A	6	6	150224	150229	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2515	NC_021026	GCT	2	6	150239	150244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534115
2516	NC_021026	GAT	2	6	150254	150259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534115
2517	NC_021026	A	6	6	150347	150352	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2518	NC_021026	AGCAGA	2	12	150355	150366	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480534115
2519	NC_021026	A	7	7	150368	150374	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2520	NC_021026	GAG	2	6	150380	150385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534115
2521	NC_021026	ACTAA	2	10	150389	150398	60 %	20 %	0 %	20 %	480534115
2522	NC_021026	AAC	2	6	150430	150435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534115
2523	NC_021026	A	6	6	150476	150481	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2524	NC_021026	AGA	2	6	150484	150489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
2525	NC_021026	AGA	2	6	150499	150504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
2526	NC_021026	GAA	2	6	150556	150561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
2527	NC_021026	TTGAAA	2	12	150582	150593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	480534115
2528	NC_021026	AAG	2	6	150624	150629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
2529	NC_021026	A	6	6	150662	150667	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2530	NC_021026	CTT	2	6	150668	150673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534115
2531	NC_021026	TGA	2	6	150688	150693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534115
2532	NC_021026	A	7	7	150718	150724	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2533	NC_021026	A	7	7	150763	150769	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2534	NC_021026	CTT	2	6	150788	150793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534115
2535	NC_021026	GCT	2	6	150842	150847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534115
2536	NC_021026	A	6	6	150863	150868	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2537	NC_021026	GAT	2	6	150953	150958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534115
2538	NC_021026	CTG	2	6	150960	150965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534115
2539	NC_021026	CTA	2	6	150984	150989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
2540	NC_021026	A	6	6	150989	150994	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2541	NC_021026	A	7	7	151006	151012	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2542	NC_021026	CTT	2	6	151031	151036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534115
2543	NC_021026	GCT	2	6	151085	151090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534115
2544	NC_021026	A	6	6	151106	151111	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2545	NC_021026	GAT	2	6	151196	151201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534115
2546	NC_021026	CTG	2	6	151203	151208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534115
2547	NC_021026	CTA	2	6	151227	151232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
2548	NC_021026	A	6	6	151232	151237	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2549	NC_021026	A	6	6	151248	151253	100 %	0 %	0 %	0 %	480534115
2550	NC_021026	GAA	3	9	151304	151312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534115
2551	NC_021026	CTC	2	6	151326	151331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534115
2552	NC_021026	AAC	2	6	151562	151567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534115
2553	NC_021026	TAC	2	6	151577	151582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
2554	NC_021026	AAGC	2	8	151665	151672	50 %	0 %	25 %	25 %	480534115
2555	NC_021026	TAC	2	6	151760	151765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
2556	NC_021026	TAC	2	6	151820	151825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
2557	NC_021026	AAGC	2	8	151908	151915	50 %	0 %	25 %	25 %	480534115
2558	NC_021026	TAC	2	6	152003	152008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
2559	NC_021026	TAC	2	6	152063	152068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534115
2560	NC_021026	AAGC	2	8	152151	152158	50 %	0 %	25 %	25 %	480534115
2561	NC_021026	GTG	3	9	152710	152718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534116
2562	NC_021026	TCG	2	6	152724	152729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534116
2563	NC_021026	GAA	2	6	152783	152788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534116
2564	NC_021026	CTA	2	6	152876	152881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534116
2565	NC_021026	CAA	2	6	152978	152983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534116
2566	NC_021026	TGA	2	6	153071	153076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534116
2567	NC_021026	CGTGG	2	10	153099	153108	0 %	20 %	60 %	20 %	480534116
2568	NC_021026	AAC	2	6	153154	153159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534116
2569	NC_021026	A	6	6	153163	153168	100 %	0 %	0 %	0 %	480534116
2570	NC_021026	AGA	2	6	153218	153223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534116
2571	NC_021026	AAG	2	6	153243	153248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534116
2572	NC_021026	ATG	2	6	153333	153338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534116
2573	NC_021026	CGG	2	6	153428	153433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534116
2574	NC_021026	AGA	2	6	153569	153574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534116
2575	NC_021026	CG	3	6	153681	153686	0 %	0 %	50 %	50 %	480534116
2576	NC_021026	TTGA	2	8	153744	153751	25 %	50 %	25 %	0 %	480534116
2577	NC_021026	CAA	2	6	153938	153943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534117
2578	NC_021026	TTC	2	6	153999	154004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534117
2579	NC_021026	CGG	2	6	154054	154059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534117
2580	NC_021026	GTGAA	2	10	154101	154110	40 %	20 %	40 %	0 %	480534117
2581	NC_021026	GAA	2	6	154112	154117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534117
2582	NC_021026	AGCT	2	8	154143	154150	25 %	25 %	25 %	25 %	480534117
2583	NC_021026	TGG	2	6	154215	154220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534117
2584	NC_021026	ACTT	2	8	154221	154228	25 %	50 %	0 %	25 %	480534117
2585	NC_021026	GAA	2	6	154415	154420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534118
2586	NC_021026	ATT	2	6	154427	154432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534118
2587	NC_021026	GGT	2	6	154556	154561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534118
2588	NC_021026	TGAT	2	8	154773	154780	25 %	50 %	25 %	0 %	480534118
2589	NC_021026	TGG	2	6	154788	154793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534118
2590	NC_021026	TGC	2	6	154840	154845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534118
2591	NC_021026	GAC	2	6	154861	154866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534118
2592	NC_021026	ATC	2	6	154892	154897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534118
2593	NC_021026	TCA	2	6	154913	154918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534118
2594	NC_021026	CTT	2	6	155022	155027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534118
2595	NC_021026	TGA	2	6	155098	155103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534118
2596	NC_021026	AAC	2	6	155174	155179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534118
2597	NC_021026	GAT	2	6	155410	155415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534118
2598	NC_021026	TCA	2	6	155455	155460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534118
2599	NC_021026	TGCG	2	8	155463	155470	0 %	25 %	50 %	25 %	480534118
2600	NC_021026	CTG	2	6	155505	155510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534118
2601	NC_021026	GAA	2	6	155537	155542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534118
2602	NC_021026	GCT	2	6	155543	155548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534118
2603	NC_021026	TGA	2	6	155640	155645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534118
2604	NC_021026	CGA	2	6	155647	155652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534118
2605	NC_021026	TTC	2	6	155718	155723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534118
2606	NC_021026	GAT	2	6	155780	155785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534118
2607	NC_021026	TGG	2	6	155973	155978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534118
2608	NC_021026	AGA	2	6	155998	156003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534118
2609	NC_021026	ATTG	2	8	156025	156032	25 %	50 %	25 %	0 %	480534118
2610	NC_021026	GAA	2	6	156101	156106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534118
2611	NC_021026	TCA	2	6	156180	156185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534118
2612	NC_021026	AGCC	2	8	156205	156212	25 %	0 %	25 %	50 %	480534118
2613	NC_021026	CAG	2	6	156231	156236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534118
2614	NC_021026	GTA	2	6	156276	156281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534118
2615	NC_021026	TAT	2	6	156642	156647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534119
2616	NC_021026	ATC	2	6	156666	156671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534119
2617	NC_021026	GAT	3	9	156674	156682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534119
2618	NC_021026	CT	3	6	156833	156838	0 %	50 %	0 %	50 %	480534119
2619	NC_021026	ATC	2	6	156882	156887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534119
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2621	NC_021026	CGA	2	6	156945	156950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534119
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2989	NC_021026	ATTT	2	8	184976	184983	25 %	75 %	0 %	0 %	480534141
2990	NC_021026	TGA	2	6	184998	185003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534141
2991	NC_021026	ATGA	2	8	185104	185111	50 %	25 %	25 %	0 %	480534141
2992	NC_021026	TCTA	2	8	185204	185211	25 %	50 %	0 %	25 %	480534141
2993	NC_021026	AAAC	2	8	185259	185266	75 %	0 %	0 %	25 %	480534141
2994	NC_021026	CAA	2	6	185284	185289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534141
2995	NC_021026	ACTAT	2	10	185422	185431	40 %	40 %	0 %	20 %	480534141
2996	NC_021026	AAG	2	6	185582	185587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534142
2997	NC_021026	TGC	2	6	185595	185600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534142
2998	NC_021026	AGA	2	6	185637	185642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534142
2999	NC_021026	CTA	2	6	185714	185719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534142
3000	NC_021026	TAT	2	6	185805	185810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534142

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