MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021026	AGA	2	6	90265	90270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534060
1502	NC_021026	GAA	2	6	90305	90310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534060
1503	NC_021026	GTC	2	6	90331	90336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534060
1504	NC_021026	GAT	2	6	90389	90394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534061
1505	NC_021026	GCG	2	6	90444	90449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534061
1506	NC_021026	TGG	2	6	90770	90775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534061
1507	NC_021026	AGC	2	6	90824	90829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534061
1508	NC_021026	CAG	2	6	90847	90852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534061
1509	NC_021026	CAG	2	6	90856	90861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534061
1510	NC_021026	GAA	2	6	90873	90878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534061
1511	NC_021026	AGG	2	6	90928	90933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534061
1512	NC_021026	CAA	2	6	90968	90973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534061
1513	NC_021026	TAG	2	6	91018	91023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534061
1514	NC_021026	AAC	2	6	91057	91062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534061
1515	NC_021026	CT	3	6	91078	91083	0 %	50 %	0 %	50 %	480534061
1516	NC_021026	TGA	3	9	91103	91111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534061
1517	NC_021026	CTATT	2	10	91157	91166	20 %	60 %	0 %	20 %	480534061
1518	NC_021026	TC	3	6	91180	91185	0 %	50 %	0 %	50 %	480534061
1519	NC_021026	TCA	2	6	91231	91236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534061
1520	NC_021026	GCT	2	6	91287	91292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534061
1521	NC_021026	GAAGC	2	10	91347	91356	40 %	0 %	40 %	20 %	480534061
1522	NC_021026	GATT	2	8	91427	91434	25 %	50 %	25 %	0 %	480534061
1523	NC_021026	GTT	2	6	91500	91505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534062
1524	NC_021026	GAA	2	6	91554	91559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534062
1525	NC_021026	ATT	2	6	91582	91587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534062
1526	NC_021026	CTAT	2	8	91591	91598	25 %	50 %	0 %	25 %	480534062
1527	NC_021026	GAA	2	6	91784	91789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534063
1528	NC_021026	AATA	2	8	91790	91797	75 %	25 %	0 %	0 %	480534063
1529	NC_021026	GCTTG	2	10	91802	91811	0 %	40 %	40 %	20 %	480534063
1530	NC_021026	CT	3	6	91823	91828	0 %	50 %	0 %	50 %	480534063
1531	NC_021026	AAG	2	6	91886	91891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534063
1532	NC_021026	TGG	2	6	91947	91952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534063
1533	NC_021026	GTG	2	6	92027	92032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534063
1534	NC_021026	CAT	2	6	92071	92076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534063
1535	NC_021026	CGT	2	6	92078	92083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534063
1536	NC_021026	ATC	2	6	92105	92110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534063
1537	NC_021026	CAT	2	6	92140	92145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534063
1538	NC_021026	GCT	2	6	92252	92257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534063
1539	NC_021026	CCA	2	6	92309	92314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534063
1540	NC_021026	TCCT	2	8	92376	92383	0 %	50 %	0 %	50 %	480534063
1541	NC_021026	AGA	2	6	92491	92496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534063
1542	NC_021026	CT	3	6	92625	92630	0 %	50 %	0 %	50 %	480534063
1543	NC_021026	TCA	2	6	92654	92659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534063
1544	NC_021026	ATC	2	6	92669	92674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534063
1545	NC_021026	TTGA	2	8	92693	92700	25 %	50 %	25 %	0 %	480534063
1546	NC_021026	ATTG	2	8	92818	92825	25 %	50 %	25 %	0 %	480534063
1547	NC_021026	CTT	2	6	92912	92917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534063
1548	NC_021026	CA	3	6	92947	92952	50 %	0 %	0 %	50 %	480534063
1549	NC_021026	AGA	2	6	92953	92958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534063
1550	NC_021026	TTA	2	6	92983	92988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534063
1551	NC_021026	GAT	2	6	93002	93007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534063
1552	NC_021026	ATTA	2	8	93033	93040	50 %	50 %	0 %	0 %	480534063
1553	NC_021026	TCT	2	6	93096	93101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534064
1554	NC_021026	GCT	2	6	93123	93128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534064
1555	NC_021026	ACT	2	6	93150	93155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534064
1556	NC_021026	T	6	6	93191	93196	0 %	100 %	0 %	0 %	480534064
1557	NC_021026	GCTTT	2	10	93231	93240	0 %	60 %	20 %	20 %	480534064
1558	NC_021026	CAG	2	6	93244	93249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534064
1559	NC_021026	TTC	2	6	93284	93289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534064
1560	NC_021026	TCT	3	9	93531	93539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534064
1561	NC_021026	AGT	2	6	93566	93571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534064
1562	NC_021026	TCA	2	6	93588	93593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534064
1563	NC_021026	CTT	2	6	93640	93645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534064
1564	NC_021026	TGT	2	6	93674	93679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534064
1565	NC_021026	GTTC	2	8	93714	93721	0 %	50 %	25 %	25 %	480534064
1566	NC_021026	CTG	2	6	93733	93738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534064
1567	NC_021026	ATA	2	6	93741	93746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534064
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1569	NC_021026	TTC	2	6	93803	93808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534064
1570	NC_021026	TGA	2	6	93817	93822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534064
1571	NC_021026	TCTGG	2	10	93825	93834	0 %	40 %	40 %	20 %	480534064
1572	NC_021026	TTA	2	6	93951	93956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534064
1573	NC_021026	CTTT	2	8	94008	94015	0 %	75 %	0 %	25 %	480534064
1574	NC_021026	TTC	2	6	94052	94057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534064
1575	NC_021026	AGT	2	6	94084	94089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534064
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1578	NC_021026	ACC	3	9	94277	94285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534064
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1580	NC_021026	GTA	2	6	94310	94315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534064
1581	NC_021026	TGCT	2	8	94351	94358	0 %	50 %	25 %	25 %	480534064
1582	NC_021026	CCA	2	6	94388	94393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534064
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1585	NC_021026	GTA	2	6	94565	94570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534064
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1588	NC_021026	GTT	2	6	94713	94718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534064
1589	NC_021026	AGCAT	2	10	94779	94788	40 %	20 %	20 %	20 %	480534064
1590	NC_021026	TCG	2	6	94896	94901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534064
1591	NC_021026	ATA	2	6	94923	94928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534064
1592	NC_021026	T	6	6	94931	94936	0 %	100 %	0 %	0 %	480534064
1593	NC_021026	TCA	2	6	94941	94946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534064
1594	NC_021026	ATC	2	6	94982	94987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534064
1595	NC_021026	CTT	4	12	95155	95166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534064
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1597	NC_021026	TTG	2	6	95240	95245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534064
1598	NC_021026	GA	3	6	95267	95272	50 %	0 %	50 %	0 %	480534064
1599	NC_021026	CTT	2	6	95290	95295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534064
1600	NC_021026	TGCT	2	8	95354	95361	0 %	50 %	25 %	25 %	480534064
1601	NC_021026	AGC	2	6	95471	95476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534064
1602	NC_021026	TACCA	2	10	95477	95486	40 %	20 %	0 %	40 %	480534064
1603	NC_021026	GAT	2	6	95489	95494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534064
1604	NC_021026	GT	3	6	95536	95541	0 %	50 %	50 %	0 %	480534064
1605	NC_021026	GTA	2	6	95609	95614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534064
1606	NC_021026	CAT	2	6	95620	95625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534064
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1608	NC_021026	AGA	2	6	95666	95671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534064
1609	NC_021026	ACC	2	6	95693	95698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534064
1610	NC_021026	GAT	2	6	95714	95719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534064
1611	NC_021026	GTA	2	6	95756	95761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534064
1612	NC_021026	CGT	2	6	95767	95772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534064
1613	NC_021026	CGAG	2	8	95811	95818	25 %	0 %	50 %	25 %	480534064
1614	NC_021026	CAT	2	6	95923	95928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534064
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1622	NC_021026	TTCCT	2	10	96494	96503	0 %	60 %	0 %	40 %	480534064
1623	NC_021026	T	6	6	96545	96550	0 %	100 %	0 %	0 %	480534064
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1625	NC_021026	CTT	2	6	96631	96636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534064
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1990	NC_021026	CAA	2	6	122189	122194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534085
1991	NC_021026	CAA	2	6	122215	122220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534085
1992	NC_021026	GTTC	2	8	122229	122236	0 %	50 %	25 %	25 %	480534085
1993	NC_021026	GAA	2	6	122239	122244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534085
1994	NC_021026	GCTT	2	8	122273	122280	0 %	50 %	25 %	25 %	480534085
1995	NC_021026	CAA	2	6	122292	122297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534085
1996	NC_021026	TCA	2	6	122327	122332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534085
1997	NC_021026	ACA	2	6	122344	122349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534085
1998	NC_021026	AAC	2	6	122374	122379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534085
1999	NC_021026	A	6	6	122480	122485	100 %	0 %	0 %	0 %	480534085
2000	NC_021026	TGGA	2	8	122547	122554	25 %	25 %	50 %	0 %	480534085

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