MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021026	TTAA	2	8	58711	58718	50 %	50 %	0 %	0 %	480534035
1002	NC_021026	ATT	2	6	58742	58747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534035
1003	NC_021026	GAA	2	6	58788	58793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534035
1004	NC_021026	GTT	2	6	58810	58815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534035
1005	NC_021026	TGG	2	6	58899	58904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534035
1006	NC_021026	TA	3	6	58988	58993	50 %	50 %	0 %	0 %	480534036
1007	NC_021026	GCA	2	6	59035	59040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534036
1008	NC_021026	AAT	2	6	59083	59088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534036
1009	NC_021026	TCT	2	6	59093	59098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534036
1010	NC_021026	TTA	2	6	59171	59176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534036
1011	NC_021026	AGA	2	6	59225	59230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534036
1012	NC_021026	ATGT	2	8	59317	59324	25 %	50 %	25 %	0 %	480534036
1013	NC_021026	GTT	2	6	59354	59359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534036
1014	NC_021026	GATT	2	8	59401	59408	25 %	50 %	25 %	0 %	480534036
1015	NC_021026	AGGTTG	2	12	59563	59574	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480534037
1016	NC_021026	GT	3	6	59593	59598	0 %	50 %	50 %	0 %	480534037
1017	NC_021026	GGA	2	6	59678	59683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534037
1018	NC_021026	GAG	2	6	59826	59831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534037
1019	NC_021026	CAG	2	6	59838	59843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534037
1020	NC_021026	CCAG	2	8	59942	59949	25 %	0 %	25 %	50 %	480534037
1021	NC_021026	ATT	2	6	59958	59963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534037
1022	NC_021026	TCCA	2	8	59967	59974	25 %	25 %	0 %	50 %	480534037
1023	NC_021026	CAT	2	6	59978	59983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534037
1024	NC_021026	AAG	2	6	60103	60108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534037
1025	NC_021026	TGG	2	6	60142	60147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534037
1026	NC_021026	CAC	2	6	60177	60182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534037
1027	NC_021026	GGC	2	6	60258	60263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534037
1028	NC_021026	AGA	2	6	60299	60304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534037
1029	NC_021026	TCC	2	6	60327	60332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534037
1030	NC_021026	TAC	2	6	60419	60424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534037
1031	NC_021026	CTG	2	6	60520	60525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534037
1032	NC_021026	GTG	2	6	60526	60531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534037
1033	NC_021026	GA	3	6	60646	60651	50 %	0 %	50 %	0 %	480534037
1034	NC_021026	GCT	2	6	60690	60695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534037
1035	NC_021026	GGT	2	6	61071	61076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534038
1036	NC_021026	TTCG	2	8	61096	61103	0 %	50 %	25 %	25 %	480534038
1037	NC_021026	CAA	2	6	61119	61124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534038
1038	NC_021026	AG	3	6	61134	61139	50 %	0 %	50 %	0 %	480534038
1039	NC_021026	CTT	2	6	61244	61249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534038
1040	NC_021026	AGA	2	6	61265	61270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534038
1041	NC_021026	TCT	2	6	62421	62426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534039
1042	NC_021026	GA	3	6	62506	62511	50 %	0 %	50 %	0 %	480534039
1043	NC_021026	GAA	2	6	62526	62531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534039
1044	NC_021026	TGT	2	6	62651	62656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534039
1045	NC_021026	TGC	2	6	62783	62788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534039
1046	NC_021026	CTC	2	6	62836	62841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534039
1047	NC_021026	ATT	2	6	62851	62856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534039
1048	NC_021026	CGT	2	6	62862	62867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534039
1049	NC_021026	TGGT	2	8	62872	62879	0 %	50 %	50 %	0 %	480534039
1050	NC_021026	TAT	2	6	62963	62968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534039
1051	NC_021026	CGT	2	6	62976	62981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534039
1052	NC_021026	CAT	2	6	63017	63022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534039
1053	NC_021026	TTGA	2	8	63051	63058	25 %	50 %	25 %	0 %	480534039
1054	NC_021026	TGAT	2	8	63064	63071	25 %	50 %	25 %	0 %	480534039
1055	NC_021026	TTCT	2	8	63154	63161	0 %	75 %	0 %	25 %	480534039
1056	NC_021026	GTT	2	6	63207	63212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534039
1057	NC_021026	ATCT	2	8	63222	63229	25 %	50 %	0 %	25 %	480534039
1058	NC_021026	AGA	2	6	63233	63238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534039
1059	NC_021026	TGAT	2	8	63244	63251	25 %	50 %	25 %	0 %	480534039
1060	NC_021026	CGTA	2	8	63296	63303	25 %	25 %	25 %	25 %	480534039
1061	NC_021026	A	7	7	63345	63351	100 %	0 %	0 %	0 %	480534039
1062	NC_021026	T	6	6	63826	63831	0 %	100 %	0 %	0 %	480534040
1063	NC_021026	GCTG	2	8	63874	63881	0 %	25 %	50 %	25 %	480534040
1064	NC_021026	AGA	2	6	63897	63902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534040
1065	NC_021026	CTTC	2	8	63948	63955	0 %	50 %	0 %	50 %	480534040
1066	NC_021026	TTC	2	6	64037	64042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534040
1067	NC_021026	TCC	2	6	64074	64079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534040
1068	NC_021026	CAG	2	6	64100	64105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534040
1069	NC_021026	TTG	2	6	64152	64157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534040
1070	NC_021026	T	6	6	64419	64424	0 %	100 %	0 %	0 %	480534041
1071	NC_021026	TGAT	2	8	64466	64473	25 %	50 %	25 %	0 %	480534041
1072	NC_021026	A	6	6	64475	64480	100 %	0 %	0 %	0 %	480534041
1073	NC_021026	TGA	2	6	64484	64489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534041
1074	NC_021026	AAT	2	6	64504	64509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534041
1075	NC_021026	T	6	6	64625	64630	0 %	100 %	0 %	0 %	480534041
1076	NC_021026	AATCA	2	10	64699	64708	60 %	20 %	0 %	20 %	480534041
1077	NC_021026	A	6	6	65005	65010	100 %	0 %	0 %	0 %	480534042
1078	NC_021026	TTA	2	6	65011	65016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534042
1079	NC_021026	TTGA	2	8	65017	65024	25 %	50 %	25 %	0 %	480534042
1080	NC_021026	TCT	2	6	65029	65034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534042
1081	NC_021026	T	6	6	65050	65055	0 %	100 %	0 %	0 %	480534042
1082	NC_021026	CAG	2	6	65065	65070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534042
1083	NC_021026	TTG	2	6	65143	65148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534042
1084	NC_021026	TGG	2	6	65174	65179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534042
1085	NC_021026	GAC	2	6	65196	65201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534042
1086	NC_021026	GGT	2	6	65233	65238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534042
1087	NC_021026	TGA	2	6	65253	65258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534042
1088	NC_021026	CAT	2	6	65346	65351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534042
1089	NC_021026	AGCAG	2	10	65370	65379	40 %	0 %	40 %	20 %	480534042
1090	NC_021026	GGT	2	6	65445	65450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534042
1091	NC_021026	GAA	2	6	65509	65514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534042
1092	NC_021026	ATA	2	6	65573	65578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534042
1093	NC_021026	TCA	2	6	65699	65704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534042
1094	NC_021026	CGATTG	2	12	65762	65773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480534042
1095	NC_021026	GTC	2	6	65871	65876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534042
1096	NC_021026	TTG	2	6	65909	65914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534042
1097	NC_021026	TTGG	2	8	65995	66002	0 %	50 %	50 %	0 %	480534042
1098	NC_021026	A	6	6	66086	66091	100 %	0 %	0 %	0 %	480534042
1099	NC_021026	AAG	2	6	66115	66120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534042
1100	NC_021026	CCT	2	6	66192	66197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534042
1101	NC_021026	GGA	2	6	66207	66212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534042
1102	NC_021026	ACTT	2	8	66250	66257	25 %	50 %	0 %	25 %	480534042
1103	NC_021026	TGA	3	9	66261	66269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534042
1104	NC_021026	TTG	2	6	66344	66349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534042
1105	NC_021026	CTT	2	6	66409	66414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534042
1106	NC_021026	AAGA	2	8	66478	66485	75 %	0 %	25 %	0 %	480534042
1107	NC_021026	CTTG	2	8	66489	66496	0 %	50 %	25 %	25 %	480534042
1108	NC_021026	GCTG	2	8	66552	66559	0 %	25 %	50 %	25 %	480534042
1109	NC_021026	GAG	2	6	66562	66567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534042
1110	NC_021026	CAG	2	6	66665	66670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534042
1111	NC_021026	GGA	2	6	66927	66932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534042
1112	NC_021026	TGA	2	6	67080	67085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534042
1113	NC_021026	TAA	2	6	67164	67169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534042
1114	NC_021026	GTG	2	6	67255	67260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534042
1115	NC_021026	GCA	2	6	67396	67401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534042
1116	NC_021026	GGT	2	6	67450	67455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534042
1117	NC_021026	A	6	6	67531	67536	100 %	0 %	0 %	0 %	480534042
1118	NC_021026	AAAC	2	8	67543	67550	75 %	0 %	0 %	25 %	480534042
1119	NC_021026	GAA	2	6	67555	67560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534042
1120	NC_021026	TAAA	2	8	67623	67630	75 %	25 %	0 %	0 %	480534042
1121	NC_021026	TGG	2	6	67787	67792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534043
1122	NC_021026	GAA	2	6	67807	67812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534043
1123	NC_021026	ATC	2	6	67861	67866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534043
1124	NC_021026	GGC	2	6	67881	67886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534043
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1255	NC_021026	TCT	2	6	76187	76192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534050
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1258	NC_021026	CAGA	2	8	76290	76297	50 %	0 %	25 %	25 %	480534050
1259	NC_021026	GGT	2	6	76326	76331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534050
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1271	NC_021026	A	7	7	76957	76963	100 %	0 %	0 %	0 %	480534051
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1369	NC_021026	CT	3	6	83228	83233	0 %	50 %	0 %	50 %	480534054
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1377	NC_021026	TTC	2	6	83750	83755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534054
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