MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021026	AAGA	2	8	31196	31203	75 %	0 %	25 %	0 %	480533999
502	NC_021026	AGG	2	6	31209	31214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533999
503	NC_021026	TAT	2	6	31264	31269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534000
504	NC_021026	GAA	2	6	31284	31289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534000
505	NC_021026	ACCA	2	8	31304	31311	50 %	0 %	0 %	50 %	480534000
506	NC_021026	TCA	2	6	31314	31319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534000
507	NC_021026	CTTAT	2	10	31406	31415	20 %	60 %	0 %	20 %	480534001
508	NC_021026	AAC	2	6	31429	31434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534001
509	NC_021026	AAG	2	6	31435	31440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534001
510	NC_021026	TG	3	6	31507	31512	0 %	50 %	50 %	0 %	480534001
511	NC_021026	GAA	2	6	31530	31535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534001
512	NC_021026	TGAA	2	8	31549	31556	50 %	25 %	25 %	0 %	480534001
513	NC_021026	GA	3	6	31579	31584	50 %	0 %	50 %	0 %	480534001
514	NC_021026	TC	3	6	31606	31611	0 %	50 %	0 %	50 %	480534001
515	NC_021026	ATG	2	6	31615	31620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534001
516	NC_021026	AAG	2	6	31669	31674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534001
517	NC_021026	AGCT	2	8	31681	31688	25 %	25 %	25 %	25 %	480534001
518	NC_021026	AAC	2	6	31731	31736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534001
519	NC_021026	TTA	2	6	31831	31836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534001
520	NC_021026	TGA	2	6	31852	31857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534001
521	NC_021026	GAT	2	6	31929	31934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534001
522	NC_021026	A	6	6	32041	32046	100 %	0 %	0 %	0 %	480534001
523	NC_021026	ACAA	2	8	32121	32128	75 %	0 %	0 %	25 %	480534001
524	NC_021026	GAT	2	6	32422	32427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534002
525	NC_021026	ATC	2	6	32447	32452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534002
526	NC_021026	GAC	2	6	32508	32513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534002
527	NC_021026	AGG	2	6	32562	32567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534002
528	NC_021026	AAT	2	6	32570	32575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534002
529	NC_021026	GAA	2	6	32771	32776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534003
530	NC_021026	AAT	2	6	32778	32783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534003
531	NC_021026	A	6	6	32812	32817	100 %	0 %	0 %	0 %	480534003
532	NC_021026	TTA	2	6	32818	32823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534003
533	NC_021026	GAA	2	6	32865	32870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534003
534	NC_021026	TTG	2	6	33102	33107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534004
535	NC_021026	GTC	2	6	33135	33140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534004
536	NC_021026	TGG	2	6	33177	33182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534004
537	NC_021026	AGA	2	6	33217	33222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534004
538	NC_021026	GAT	2	6	33402	33407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534005
539	NC_021026	A	6	6	33421	33426	100 %	0 %	0 %	0 %	480534005
540	NC_021026	AGA	2	6	33453	33458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534005
541	NC_021026	AGA	2	6	33534	33539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534005
542	NC_021026	TGA	2	6	33579	33584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534005
543	NC_021026	CTA	2	6	33611	33616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534005
544	NC_021026	GTTG	2	8	33620	33627	0 %	50 %	50 %	0 %	480534005
545	NC_021026	TGA	2	6	33645	33650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534005
546	NC_021026	GGA	2	6	33709	33714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534005
547	NC_021026	A	6	6	33743	33748	100 %	0 %	0 %	0 %	480534006
548	NC_021026	GAA	2	6	33759	33764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534006
549	NC_021026	AAT	2	6	33766	33771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534006
550	NC_021026	TGAT	2	8	33830	33837	25 %	50 %	25 %	0 %	480534006
551	NC_021026	A	6	6	33976	33981	100 %	0 %	0 %	0 %	480534007
552	NC_021026	CGA	2	6	33987	33992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534007
553	NC_021026	AAG	2	6	34056	34061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534007
554	NC_021026	GAT	2	6	34153	34158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534007
555	NC_021026	ATT	2	6	34192	34197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534007
556	NC_021026	GAA	2	6	34276	34281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534007
557	NC_021026	CAGAA	2	10	34286	34295	60 %	0 %	20 %	20 %	480534007
558	NC_021026	CAT	2	6	34510	34515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534008
559	NC_021026	TTTTG	2	10	34536	34545	0 %	80 %	20 %	0 %	480534008
560	NC_021026	AGG	2	6	34551	34556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534008
561	NC_021026	ATG	2	6	34590	34595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534008
562	NC_021026	GAATG	2	10	34625	34634	40 %	20 %	40 %	0 %	480534008
563	NC_021026	TAT	2	6	34640	34645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534008
564	NC_021026	TCA	2	6	34653	34658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534008
565	NC_021026	GA	3	6	34738	34743	50 %	0 %	50 %	0 %	480534008
566	NC_021026	AAGA	2	8	34790	34797	75 %	0 %	25 %	0 %	480534008
567	NC_021026	GAG	2	6	34801	34806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534008
568	NC_021026	TCA	2	6	34828	34833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534008
569	NC_021026	GAGC	2	8	34880	34887	25 %	0 %	50 %	25 %	480534008
570	NC_021026	AGC	2	6	34906	34911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534008
571	NC_021026	GAA	2	6	34913	34918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534008
572	NC_021026	CA	3	6	34939	34944	50 %	0 %	0 %	50 %	480534008
573	NC_021026	ACA	2	6	34977	34982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534008
574	NC_021026	TCA	2	6	35024	35029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534008
575	NC_021026	AGCA	2	8	35061	35068	50 %	0 %	25 %	25 %	480534008
576	NC_021026	TGA	2	6	35074	35079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534008
577	NC_021026	AAG	2	6	35517	35522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534009
578	NC_021026	A	6	6	35688	35693	100 %	0 %	0 %	0 %	480534009
579	NC_021026	AATC	2	8	35729	35736	50 %	25 %	0 %	25 %	480534009
580	NC_021026	A	7	7	35754	35760	100 %	0 %	0 %	0 %	480534009
581	NC_021026	A	7	7	35762	35768	100 %	0 %	0 %	0 %	480534009
582	NC_021026	T	6	6	35780	35785	0 %	100 %	0 %	0 %	480534009
583	NC_021026	TGA	3	9	36212	36220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534010
584	NC_021026	TC	3	6	36229	36234	0 %	50 %	0 %	50 %	480534010
585	NC_021026	GTA	2	6	36241	36246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534010
586	NC_021026	AAG	2	6	36251	36256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534010
587	NC_021026	AAG	3	9	36301	36309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534010
588	NC_021026	GAA	2	6	36377	36382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534011
589	NC_021026	TGC	2	6	36403	36408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534011
590	NC_021026	T	6	6	36415	36420	0 %	100 %	0 %	0 %	480534011
591	NC_021026	GATG	2	8	36448	36455	25 %	25 %	50 %	0 %	480534011
592	NC_021026	TGG	2	6	36462	36467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534011
593	NC_021026	CAA	2	6	36506	36511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534011
594	NC_021026	GAT	2	6	36515	36520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
595	NC_021026	TATC	2	8	36531	36538	25 %	50 %	0 %	25 %	480534011
596	NC_021026	TAC	2	6	36602	36607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534011
597	NC_021026	AAG	2	6	36633	36638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534011
598	NC_021026	TGCT	2	8	36648	36655	0 %	50 %	25 %	25 %	480534011
599	NC_021026	GAA	2	6	36658	36663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534011
600	NC_021026	CTG	2	6	36681	36686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534011
601	NC_021026	CAAG	2	8	36757	36764	50 %	0 %	25 %	25 %	480534011
602	NC_021026	T	6	6	36781	36786	0 %	100 %	0 %	0 %	480534011
603	NC_021026	ATA	2	6	36834	36839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534011
604	NC_021026	TGA	2	6	36871	36876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
605	NC_021026	TTCT	2	8	36880	36887	0 %	75 %	0 %	25 %	480534011
606	NC_021026	ATG	2	6	36906	36911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
607	NC_021026	ATC	2	6	36944	36949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534011
608	NC_021026	CA	3	6	36962	36967	50 %	0 %	0 %	50 %	480534011
609	NC_021026	A	7	7	36998	37004	100 %	0 %	0 %	0 %	480534011
610	NC_021026	TGA	2	6	37123	37128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
611	NC_021026	TCATCT	2	12	37137	37148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	480534011
612	NC_021026	AATC	2	8	37157	37164	50 %	25 %	0 %	25 %	480534011
613	NC_021026	GTG	2	6	37178	37183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534011
614	NC_021026	GAA	2	6	37259	37264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534011
615	NC_021026	ATGA	2	8	37277	37284	50 %	25 %	25 %	0 %	480534011
616	NC_021026	TGA	2	6	37360	37365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
617	NC_021026	AGA	2	6	37402	37407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534011
618	NC_021026	TGG	2	6	37435	37440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534011
619	NC_021026	GCT	3	9	37472	37480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534011
620	NC_021026	CT	3	6	37479	37484	0 %	50 %	0 %	50 %	480534011
621	NC_021026	CA	3	6	37528	37533	50 %	0 %	0 %	50 %	480534011
622	NC_021026	TTC	2	6	37538	37543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534011
623	NC_021026	A	6	6	37562	37567	100 %	0 %	0 %	0 %	480534011
624	NC_021026	ATG	2	6	37572	37577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
625	NC_021026	GGTT	2	8	37610	37617	0 %	50 %	50 %	0 %	480534011
626	NC_021026	ATG	2	6	37647	37652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
627	NC_021026	TCA	2	6	37668	37673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534011
628	NC_021026	TGC	2	6	37699	37704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534011
629	NC_021026	GAT	2	6	37768	37773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
630	NC_021026	T	6	6	37788	37793	0 %	100 %	0 %	0 %	480534011
631	NC_021026	TG	3	6	37880	37885	0 %	50 %	50 %	0 %	480534011
632	NC_021026	GTG	2	6	38025	38030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534011
633	NC_021026	TGA	2	6	38034	38039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
634	NC_021026	GTCA	2	8	38217	38224	25 %	25 %	25 %	25 %	480534012
635	NC_021026	GAAAC	2	10	38320	38329	60 %	0 %	20 %	20 %	480534013
636	NC_021026	TAA	2	6	38437	38442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534013
637	NC_021026	TCTAA	2	10	38663	38672	40 %	40 %	0 %	20 %	480534013
638	NC_021026	GA	3	6	38686	38691	50 %	0 %	50 %	0 %	480534013
639	NC_021026	GAA	2	6	38741	38746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534013
640	NC_021026	TGA	2	6	38755	38760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534013
641	NC_021026	AGT	2	6	38761	38766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534013
642	NC_021026	TCA	2	6	38775	38780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534013
643	NC_021026	ATCCAG	2	12	38781	38792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480534013
644	NC_021026	A	7	7	38870	38876	100 %	0 %	0 %	0 %	480534013
645	NC_021026	GAA	2	6	38890	38895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534013
646	NC_021026	CAG	2	6	39038	39043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534013
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650	NC_021026	CTCTT	2	10	39284	39293	0 %	60 %	0 %	40 %	480534013
651	NC_021026	ACA	2	6	39294	39299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534013
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654	NC_021026	TGC	2	6	39340	39345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534013
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656	NC_021026	TCCTGA	2	12	39385	39396	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480534013
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659	NC_021026	TGA	2	6	39575	39580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534014
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661	NC_021026	ATG	2	6	39676	39681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534014
662	NC_021026	TGA	2	6	39731	39736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534014
663	NC_021026	ATC	2	6	39756	39761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534014
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666	NC_021026	TGC	2	6	39962	39967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534014
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669	NC_021026	GAA	2	6	40118	40123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534015
670	NC_021026	GAA	2	6	40130	40135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534015
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746	NC_021026	TTC	2	6	43626	43631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534022
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749	NC_021026	A	6	6	43706	43711	100 %	0 %	0 %	0 %	480534022
750	NC_021026	GAATCA	2	12	43721	43732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480534022
751	NC_021026	GAA	2	6	43739	43744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534022
752	NC_021026	TC	3	6	43995	44000	0 %	50 %	0 %	50 %	480534023
753	NC_021026	T	7	7	44013	44019	0 %	100 %	0 %	0 %	480534023
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