MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021026	GCT	2	6	363041	363046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534306
6002	NC_021026	TGA	2	6	363084	363089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534306
6003	NC_021026	TTA	2	6	363135	363140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534306
6004	NC_021026	CTG	2	6	363206	363211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534306
6005	NC_021026	ATG	3	9	363242	363250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534306
6006	NC_021026	GAG	2	6	363262	363267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534306
6007	NC_021026	GTC	2	6	363356	363361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534306
6008	NC_021026	AGT	2	6	363368	363373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534306
6009	NC_021026	CAGC	2	8	363402	363409	25 %	0 %	25 %	50 %	480534306
6010	NC_021026	T	6	6	363471	363476	0 %	100 %	0 %	0 %	480534306
6011	NC_021026	GCCA	2	8	363589	363596	25 %	0 %	25 %	50 %	480534306
6012	NC_021026	TCA	2	6	363621	363626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534306
6013	NC_021026	CAT	2	6	363648	363653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534306
6014	NC_021026	GTC	2	6	363658	363663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534306
6015	NC_021026	TCA	2	6	363690	363695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534306
6016	NC_021026	TGA	3	9	363735	363743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534306
6017	NC_021026	GATTTT	2	12	363814	363825	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480534306
6018	NC_021026	TAG	2	6	363895	363900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534306
6019	NC_021026	ATG	2	6	364002	364007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534306
6020	NC_021026	AGC	2	6	364022	364027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534306
6021	NC_021026	TA	3	6	364035	364040	50 %	50 %	0 %	0 %	480534306
6022	NC_021026	TGT	2	6	364041	364046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534306
6023	NC_021026	AAT	2	6	364055	364060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534306
6024	NC_021026	CAAA	2	8	364149	364156	75 %	0 %	0 %	25 %	480534307
6025	NC_021026	ATC	2	6	364198	364203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534307
6026	NC_021026	T	7	7	364236	364242	0 %	100 %	0 %	0 %	480534307
6027	NC_021026	GTA	2	6	364278	364283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534307
6028	NC_021026	TCA	2	6	364311	364316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534307
6029	NC_021026	GAT	2	6	364323	364328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534307
6030	NC_021026	TAA	2	6	364356	364361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534307
6031	NC_021026	TACA	2	8	364385	364392	50 %	25 %	0 %	25 %	480534307
6032	NC_021026	ATT	2	6	364403	364408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534307
6033	NC_021026	TAA	2	6	364477	364482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534307
6034	NC_021026	T	7	7	364483	364489	0 %	100 %	0 %	0 %	480534307
6035	NC_021026	CTTT	2	8	364610	364617	0 %	75 %	0 %	25 %	480534307
6036	NC_021026	AAT	2	6	364638	364643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534307
6037	NC_021026	TTA	2	6	364713	364718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534307
6038	NC_021026	ATA	2	6	364722	364727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534307
6039	NC_021026	T	6	6	364789	364794	0 %	100 %	0 %	0 %	480534307
6040	NC_021026	AAAT	2	8	364843	364850	75 %	25 %	0 %	0 %	480534307
6041	NC_021026	ATAG	2	8	364863	364870	50 %	25 %	25 %	0 %	480534307
6042	NC_021026	ATGT	2	8	364908	364915	25 %	50 %	25 %	0 %	480534307
6043	NC_021026	CTT	2	6	364936	364941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534307
6044	NC_021026	GAT	2	6	364942	364947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534307
6045	NC_021026	AG	3	6	364948	364953	50 %	0 %	50 %	0 %	480534307
6046	NC_021026	G	6	6	364973	364978	0 %	0 %	100 %	0 %	480534307
6047	NC_021026	ATTT	2	8	364983	364990	25 %	75 %	0 %	0 %	480534307
6048	NC_021026	TTTC	2	8	365785	365792	0 %	75 %	0 %	25 %	480534308
6049	NC_021026	GAC	2	6	365803	365808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534308
6050	NC_021026	GGTT	2	8	365810	365817	0 %	50 %	50 %	0 %	480534308
6051	NC_021026	TAC	2	6	365837	365842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534308
6052	NC_021026	AAT	2	6	365919	365924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534308
6053	NC_021026	A	6	6	366040	366045	100 %	0 %	0 %	0 %	480534309
6054	NC_021026	A	7	7	366050	366056	100 %	0 %	0 %	0 %	480534309
6055	NC_021026	TGGAGG	2	12	366145	366156	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	480534309
6056	NC_021026	AG	3	6	366179	366184	50 %	0 %	50 %	0 %	480534309
6057	NC_021026	GAG	2	6	366201	366206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534309
6058	NC_021026	CGTT	2	8	366266	366273	0 %	50 %	25 %	25 %	480534309
6059	NC_021026	ACT	2	6	366358	366363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534309
6060	NC_021026	ATG	2	6	366382	366387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534309
6061	NC_021026	GAT	2	6	366416	366421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534309
6062	NC_021026	AGCA	2	8	366646	366653	50 %	0 %	25 %	25 %	480534309
6063	NC_021026	GGT	2	6	366807	366812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534309
6064	NC_021026	AGG	2	6	366818	366823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534309
6065	NC_021026	ACGC	2	8	366852	366859	25 %	0 %	25 %	50 %	480534309
6066	NC_021026	AGA	2	6	366881	366886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534309
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6068	NC_021026	TAT	2	6	366949	366954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534310
6069	NC_021026	GAAA	2	8	366966	366973	75 %	0 %	25 %	0 %	480534310
6070	NC_021026	A	6	6	366971	366976	100 %	0 %	0 %	0 %	480534310
6071	NC_021026	CTA	2	6	366996	367001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534310
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6073	NC_021026	ATT	2	6	367136	367141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534310
6074	NC_021026	TTGGA	2	10	367275	367284	20 %	40 %	40 %	0 %	480534310
6075	NC_021026	CTT	2	6	367326	367331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534310
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6077	NC_021026	A	6	6	367442	367447	100 %	0 %	0 %	0 %	480534310
6078	NC_021026	TG	3	6	367478	367483	0 %	50 %	50 %	0 %	480534310
6079	NC_021026	CGA	2	6	367491	367496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534310
6080	NC_021026	GAC	2	6	367502	367507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534310
6081	NC_021026	ATGC	2	8	367610	367617	25 %	25 %	25 %	25 %	480534310
6082	NC_021026	TCT	2	6	367752	367757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534310
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6086	NC_021026	GAG	2	6	368269	368274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534311
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6088	NC_021026	AGA	3	9	368366	368374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534311
6089	NC_021026	T	6	6	368409	368414	0 %	100 %	0 %	0 %	480534311
6090	NC_021026	ATCA	2	8	368514	368521	50 %	25 %	0 %	25 %	480534311
6091	NC_021026	T	6	6	368525	368530	0 %	100 %	0 %	0 %	480534311
6092	NC_021026	GGT	2	6	368549	368554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534311
6093	NC_021026	AAGTAG	2	12	368605	368616	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480534311
6094	NC_021026	AAG	2	6	368677	368682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534311
6095	NC_021026	AGT	2	6	368712	368717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534311
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6097	NC_021026	A	6	6	368780	368785	100 %	0 %	0 %	0 %	480534311
6098	NC_021026	GAC	2	6	368838	368843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534311
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6101	NC_021026	TGG	2	6	369021	369026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534312
6102	NC_021026	TAA	2	6	369030	369035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534312
6103	NC_021026	ATCA	2	8	369046	369053	50 %	25 %	0 %	25 %	480534312
6104	NC_021026	TATTT	2	10	369084	369093	20 %	80 %	0 %	0 %	480534312
6105	NC_021026	GAT	2	6	369133	369138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534312
6106	NC_021026	TCC	2	6	369170	369175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534312
6107	NC_021026	ATTGG	2	10	369187	369196	20 %	40 %	40 %	0 %	480534312
6108	NC_021026	AGA	2	6	369228	369233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534312
6109	NC_021026	ATGTCA	2	12	369260	369271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480534312
6110	NC_021026	GTG	2	6	369452	369457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534312
6111	NC_021026	CGT	2	6	369484	369489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534312
6112	NC_021026	TCAA	2	8	369509	369516	50 %	25 %	0 %	25 %	480534312
6113	NC_021026	GAA	2	6	369694	369699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534312
6114	NC_021026	CCA	2	6	369764	369769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534312
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6116	NC_021026	AAG	2	6	369815	369820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534312
6117	NC_021026	TTTA	2	8	369944	369951	25 %	75 %	0 %	0 %	480534313
6118	NC_021026	TCT	2	6	369962	369967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534313
6119	NC_021026	CTG	2	6	370014	370019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534313
6120	NC_021026	CTA	2	6	370049	370054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534313
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6122	NC_021026	TAG	2	6	370084	370089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534313
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6351	NC_021026	CAAA	2	8	385794	385801	75 %	0 %	0 %	25 %	480534325
6352	NC_021026	ATGA	2	8	385807	385814	50 %	25 %	25 %	0 %	480534325
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6489	NC_021026	TGC	2	6	393875	393880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534334
6490	NC_021026	GGCT	2	8	393881	393888	0 %	25 %	50 %	25 %	480534334
6491	NC_021026	TAC	2	6	393998	394003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534334
6492	NC_021026	TCAGC	2	10	394008	394017	20 %	20 %	20 %	40 %	480534334
6493	NC_021026	GTT	2	6	394155	394160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534334
6494	NC_021026	TGG	2	6	394175	394180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534334
6495	NC_021026	AGA	2	6	394220	394225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534334
6496	NC_021026	GAA	2	6	394233	394238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534334
6497	NC_021026	AAG	3	9	394279	394287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534334
6498	NC_021026	CGAG	2	8	394417	394424	25 %	0 %	50 %	25 %	480534335
6499	NC_021026	GAA	2	6	394465	394470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534335
6500	NC_021026	TGG	2	6	394604	394609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534335

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