MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021026	GGA	2	6	332619	332624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534287
5502	NC_021026	AAG	2	6	332650	332655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534287
5503	NC_021026	ATC	2	6	332668	332673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534287
5504	NC_021026	TGG	2	6	332681	332686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534287
5505	NC_021026	ACT	2	6	332756	332761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534287
5506	NC_021026	GAT	2	6	332919	332924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534287
5507	NC_021026	TGG	2	6	332949	332954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534287
5508	NC_021026	AAT	2	6	333010	333015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534287
5509	NC_021026	ACTCT	2	10	333123	333132	20 %	40 %	0 %	40 %	480534287
5510	NC_021026	CAA	2	6	333258	333263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534287
5511	NC_021026	CAGA	2	8	333268	333275	50 %	0 %	25 %	25 %	480534287
5512	NC_021026	AAC	2	6	333313	333318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534287
5513	NC_021026	CCTC	2	8	333324	333331	0 %	25 %	0 %	75 %	480534287
5514	NC_021026	GAG	2	6	333439	333444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534287
5515	NC_021026	AGA	2	6	333486	333491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534287
5516	NC_021026	TC	3	6	333499	333504	0 %	50 %	0 %	50 %	480534287
5517	NC_021026	TTGG	2	8	333645	333652	0 %	50 %	50 %	0 %	480534287
5518	NC_021026	GAT	2	6	333672	333677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534287
5519	NC_021026	AAG	2	6	333686	333691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534287
5520	NC_021026	TA	3	6	333814	333819	50 %	50 %	0 %	0 %	480534287
5521	NC_021026	TTGA	2	8	333910	333917	25 %	50 %	25 %	0 %	480534287
5522	NC_021026	AAG	2	6	333932	333937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534287
5523	NC_021026	TG	3	6	333976	333981	0 %	50 %	50 %	0 %	480534287
5524	NC_021026	AAAG	2	8	337029	337036	75 %	0 %	25 %	0 %	480534288
5525	NC_021026	TTA	2	6	337046	337051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534288
5526	NC_021026	CTT	2	6	337065	337070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534288
5527	NC_021026	GA	3	6	337155	337160	50 %	0 %	50 %	0 %	480534288
5528	NC_021026	GCAG	2	8	337186	337193	25 %	0 %	50 %	25 %	480534288
5529	NC_021026	GGA	2	6	337246	337251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534288
5530	NC_021026	TAA	2	6	337297	337302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534288
5531	NC_021026	GA	3	6	337396	337401	50 %	0 %	50 %	0 %	480534288
5532	NC_021026	GCT	2	6	337406	337411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534288
5533	NC_021026	A	6	6	337413	337418	100 %	0 %	0 %	0 %	480534288
5534	NC_021026	GGA	2	6	337456	337461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534288
5535	NC_021026	T	6	6	337519	337524	0 %	100 %	0 %	0 %	480534288
5536	NC_021026	G	6	6	337529	337534	0 %	0 %	100 %	0 %	480534288
5537	NC_021026	TTC	3	9	337554	337562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534288
5538	NC_021026	TCT	2	6	338677	338682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534289
5539	NC_021026	TGGAAT	2	12	338730	338741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534289
5540	NC_021026	CTTTAA	2	12	338799	338810	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	480534289
5541	NC_021026	TGATG	2	10	338814	338823	20 %	40 %	40 %	0 %	480534289
5542	NC_021026	CAG	2	6	338855	338860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534289
5543	NC_021026	CAT	2	6	338902	338907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534289
5544	NC_021026	GCT	2	6	338926	338931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534289
5545	NC_021026	A	6	6	338992	338997	100 %	0 %	0 %	0 %	480534289
5546	NC_021026	AAC	2	6	339017	339022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534289
5547	NC_021026	ATT	2	6	339047	339052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534289
5548	NC_021026	A	7	7	339119	339125	100 %	0 %	0 %	0 %	480534289
5549	NC_021026	CTA	2	6	339283	339288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534290
5550	NC_021026	CAT	2	6	339295	339300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534290
5551	NC_021026	CCT	2	6	339419	339424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534290
5552	NC_021026	TAT	2	6	339462	339467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534290
5553	NC_021026	ATG	2	6	339485	339490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534290
5554	NC_021026	GCT	2	6	339526	339531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534290
5555	NC_021026	AAG	2	6	339605	339610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534290
5556	NC_021026	TAT	2	6	339636	339641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534290
5557	NC_021026	T	6	6	339641	339646	0 %	100 %	0 %	0 %	480534290
5558	NC_021026	TTG	2	6	339704	339709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534290
5559	NC_021026	GAT	2	6	339724	339729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534290
5560	NC_021026	GTT	2	6	339808	339813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534290
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5562	NC_021026	GATA	2	8	339888	339895	50 %	25 %	25 %	0 %	480534290
5563	NC_021026	ATT	2	6	339931	339936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534290
5564	NC_021026	TTGT	2	8	339941	339948	0 %	75 %	25 %	0 %	480534290
5565	NC_021026	TAA	2	6	339975	339980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534290
5566	NC_021026	TAA	2	6	340086	340091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534290
5567	NC_021026	TA	3	6	340105	340110	50 %	50 %	0 %	0 %	480534290
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5570	NC_021026	TCTGAT	2	12	340171	340182	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480534290
5571	NC_021026	CTA	2	6	340259	340264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534290
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5573	NC_021026	GAT	2	6	340357	340362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534290
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5575	NC_021026	ATTT	2	8	340440	340447	25 %	75 %	0 %	0 %	480534291
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5579	NC_021026	TTATTC	2	12	340508	340519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480534291
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5590	NC_021026	TTTG	2	8	340918	340925	0 %	75 %	25 %	0 %	480534291
5591	NC_021026	A	7	7	340930	340936	100 %	0 %	0 %	0 %	480534291
5592	NC_021026	GACAA	2	10	340950	340959	60 %	0 %	20 %	20 %	480534291
5593	NC_021026	A	6	6	340958	340963	100 %	0 %	0 %	0 %	480534291
5594	NC_021026	AG	3	6	341110	341115	50 %	0 %	50 %	0 %	480534291
5595	NC_021026	ATGA	2	8	341131	341138	50 %	25 %	25 %	0 %	480534291
5596	NC_021026	TGA	2	6	341169	341174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534291
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5601	NC_021026	ATTT	2	8	341368	341375	25 %	75 %	0 %	0 %	480534291
5602	NC_021026	TTA	2	6	341402	341407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534291
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5604	NC_021026	TGG	2	6	341473	341478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534291
5605	NC_021026	ATT	2	6	341482	341487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534291
5606	NC_021026	GGA	2	6	341521	341526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534291
5607	NC_021026	TAT	2	6	341560	341565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534291
5608	NC_021026	TGA	2	6	341646	341651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534291
5609	NC_021026	A	6	6	341986	341991	100 %	0 %	0 %	0 %	480534292
5610	NC_021026	A	7	7	341994	342000	100 %	0 %	0 %	0 %	480534292
5611	NC_021026	CTG	2	6	342011	342016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534292
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5613	NC_021026	GAA	2	6	342109	342114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534292
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5623	NC_021026	GATG	2	8	342426	342433	25 %	25 %	50 %	0 %	480534292
5624	NC_021026	TCT	2	6	342493	342498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534292
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5987	NC_021026	GAT	2	6	362182	362187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534305
5988	NC_021026	CAA	2	6	362210	362215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534305
5989	NC_021026	TAT	2	6	362220	362225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534305
5990	NC_021026	TAA	2	6	362250	362255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534305
5991	NC_021026	TAC	2	6	362260	362265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534305
5992	NC_021026	CTGG	2	8	362291	362298	0 %	25 %	50 %	25 %	480534305
5993	NC_021026	TAT	2	6	362320	362325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534305
5994	NC_021026	TGGT	2	8	362415	362422	0 %	50 %	50 %	0 %	480534305
5995	NC_021026	TAT	2	6	362443	362448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534305
5996	NC_021026	TGGT	2	8	362538	362545	0 %	50 %	50 %	0 %	480534305
5997	NC_021026	TAC	2	6	362566	362571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534305
5998	NC_021026	GGTT	2	8	362602	362609	0 %	50 %	50 %	0 %	480534305
5999	NC_021026	GTTA	2	8	362832	362839	25 %	50 %	25 %	0 %	480534306
6000	NC_021026	CAGAG	2	10	362989	362998	40 %	0 %	40 %	20 %	480534306

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