MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021026	CT	4	8	275291	275298	0 %	50 %	0 %	50 %	480534232
4502	NC_021026	GTCAGT	2	12	275315	275326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480534232
4503	NC_021026	CCTT	2	8	275441	275448	0 %	50 %	0 %	50 %	480534232
4504	NC_021026	GAA	2	6	275542	275547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534232
4505	NC_021026	CGAG	2	8	275616	275623	25 %	0 %	50 %	25 %	480534232
4506	NC_021026	GCG	2	6	275674	275679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534232
4507	NC_021026	ACA	2	6	275692	275697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534232
4508	NC_021026	G	6	6	275709	275714	0 %	0 %	100 %	0 %	480534232
4509	NC_021026	GTT	2	6	275719	275724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534232
4510	NC_021026	CAG	2	6	275771	275776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534232
4511	NC_021026	ATG	2	6	275777	275782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534232
4512	NC_021026	CACT	2	8	275802	275809	25 %	25 %	0 %	50 %	480534232
4513	NC_021026	ATG	2	6	275861	275866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534232
4514	NC_021026	TAA	2	6	275913	275918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534232
4515	NC_021026	GTCTG	2	10	276099	276108	0 %	40 %	40 %	20 %	480534232
4516	NC_021026	TTGG	2	8	276126	276133	0 %	50 %	50 %	0 %	480534232
4517	NC_021026	GAC	2	6	276196	276201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534232
4518	NC_021026	CATG	2	8	276216	276223	25 %	25 %	25 %	25 %	480534232
4519	NC_021026	AGA	2	6	276294	276299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534232
4520	NC_021026	GA	3	6	276301	276306	50 %	0 %	50 %	0 %	480534232
4521	NC_021026	TAA	2	6	276333	276338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534232
4522	NC_021026	ATG	2	6	276415	276420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534232
4523	NC_021026	TATT	2	8	276456	276463	25 %	75 %	0 %	0 %	480534232
4524	NC_021026	ACT	2	6	276464	276469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534232
4525	NC_021026	TCA	2	6	276533	276538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534232
4526	NC_021026	GAA	2	6	276550	276555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534232
4527	NC_021026	GAA	2	6	276570	276575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534232
4528	NC_021026	GAC	2	6	276684	276689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534232
4529	NC_021026	CCA	2	6	276721	276726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534232
4530	NC_021026	ATGG	2	8	276736	276743	25 %	25 %	50 %	0 %	480534232
4531	NC_021026	CT	3	6	276799	276804	0 %	50 %	0 %	50 %	480534232
4532	NC_021026	GTG	2	6	276824	276829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534232
4533	NC_021026	TCA	2	6	276835	276840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534232
4534	NC_021026	GATG	2	8	276855	276862	25 %	25 %	50 %	0 %	480534232
4535	NC_021026	GTTT	2	8	276905	276912	0 %	75 %	25 %	0 %	480534232
4536	NC_021026	GTT	2	6	276918	276923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534232
4537	NC_021026	A	6	6	276926	276931	100 %	0 %	0 %	0 %	480534232
4538	NC_021026	ACA	2	6	277116	277121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534233
4539	NC_021026	TAGAC	2	10	277178	277187	40 %	20 %	20 %	20 %	480534233
4540	NC_021026	GGA	2	6	277274	277279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534233
4541	NC_021026	A	6	6	277315	277320	100 %	0 %	0 %	0 %	480534234
4542	NC_021026	ATT	2	6	277359	277364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534234
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4544	NC_021026	TCAT	2	8	277422	277429	25 %	50 %	0 %	25 %	480534234
4545	NC_021026	CCAG	2	8	277473	277480	25 %	0 %	25 %	50 %	480534234
4546	NC_021026	ATTT	2	8	277553	277560	25 %	75 %	0 %	0 %	480534234
4547	NC_021026	AAG	2	6	277620	277625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534235
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4549	NC_021026	GA	3	6	277724	277729	50 %	0 %	50 %	0 %	480534235
4550	NC_021026	AAAATA	2	12	277730	277741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	480534235
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4552	NC_021026	CT	4	8	277849	277856	0 %	50 %	0 %	50 %	480534236
4553	NC_021026	AAG	2	6	277897	277902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534236
4554	NC_021026	GAT	2	6	277944	277949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534236
4555	NC_021026	TCC	2	6	277969	277974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534236
4556	NC_021026	GTTC	2	8	278064	278071	0 %	50 %	25 %	25 %	480534236
4557	NC_021026	AGC	2	6	278195	278200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534236
4558	NC_021026	GCT	2	6	278202	278207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534236
4559	NC_021026	GAA	2	6	278253	278258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534236
4560	NC_021026	TAA	2	6	278372	278377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534236
4561	NC_021026	AGA	2	6	278510	278515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534236
4562	NC_021026	CGT	2	6	278538	278543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534236
4563	NC_021026	ATC	2	6	278592	278597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534236
4564	NC_021026	CTG	2	6	278644	278649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534236
4565	NC_021026	TCAG	2	8	278747	278754	25 %	25 %	25 %	25 %	480534236
4566	NC_021026	CTT	2	6	278762	278767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534236
4567	NC_021026	GTT	2	6	278832	278837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534236
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4569	NC_021026	ATA	2	6	279004	279009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534237
4570	NC_021026	TAT	2	6	279176	279181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534237
4571	NC_021026	T	6	6	279217	279222	0 %	100 %	0 %	0 %	480534237
4572	NC_021026	A	6	6	279555	279560	100 %	0 %	0 %	0 %	480534238
4573	NC_021026	TGA	2	6	279584	279589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534238
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4575	NC_021026	CTA	2	6	279644	279649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534238
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4588	NC_021026	TCT	2	6	280697	280702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534239
4589	NC_021026	CTT	2	6	280785	280790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534239
4590	NC_021026	CAA	2	6	280804	280809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534239
4591	NC_021026	AGC	2	6	280897	280902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534239
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4593	NC_021026	AAGA	2	8	281005	281012	75 %	0 %	25 %	0 %	480534239
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4600	NC_021026	GTTTG	2	10	281341	281350	0 %	60 %	40 %	0 %	480534239
4601	NC_021026	TGA	2	6	281480	281485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534239
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4603	NC_021026	TGGA	2	8	281608	281615	25 %	25 %	50 %	0 %	480534239
4604	NC_021026	GTT	2	6	281635	281640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534239
4605	NC_021026	CAG	2	6	281657	281662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534239
4606	NC_021026	ATG	2	6	281796	281801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534240
4607	NC_021026	GAA	2	6	281803	281808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534240
4608	NC_021026	ATA	2	6	281844	281849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534240
4609	NC_021026	T	6	6	281864	281869	0 %	100 %	0 %	0 %	480534240
4610	NC_021026	TAAG	2	8	281872	281879	50 %	25 %	25 %	0 %	480534240
4611	NC_021026	AAAGT	2	10	281887	281896	60 %	20 %	20 %	0 %	480534240
4612	NC_021026	AGT	2	6	281901	281906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534240
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4617	NC_021026	CAA	2	6	282268	282273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534240
4618	NC_021026	AGA	2	6	282274	282279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534240
4619	NC_021026	GA	3	6	282323	282328	50 %	0 %	50 %	0 %	480534240
4620	NC_021026	CAT	2	6	282389	282394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534240
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4622	NC_021026	TTC	3	9	282449	282457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534240
4623	NC_021026	AGC	2	6	282485	282490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534240
4624	NC_021026	GAA	2	6	282509	282514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534240
4625	NC_021026	AGC	2	6	282533	282538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534240
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4989	NC_021026	AGTGG	2	10	300067	300076	20 %	20 %	60 %	0 %	480534259
4990	NC_021026	ATT	2	6	300135	300140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534259
4991	NC_021026	A	6	6	300223	300228	100 %	0 %	0 %	0 %	480534260
4992	NC_021026	AAC	3	9	300245	300253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534260
4993	NC_021026	GA	3	6	300257	300262	50 %	0 %	50 %	0 %	480534260
4994	NC_021026	CTAA	2	8	300268	300275	50 %	25 %	0 %	25 %	480534260
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4996	NC_021026	TCT	3	9	300294	300302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534260
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4998	NC_021026	T	6	6	300325	300330	0 %	100 %	0 %	0 %	480534260
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5000	NC_021026	TAT	3	9	300375	300383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534260

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