MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 21357

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021006	GAT	2	6	84	89	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
2	NC_021006	GAA	2	6	100	105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532169
3	NC_021006	CAG	2	6	152	157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532169
4	NC_021006	GAA	2	6	196	201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532169
5	NC_021006	CAG	2	6	245	250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532169
6	NC_021006	GTA	3	9	301	309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
7	NC_021006	ATA	2	6	311	316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532169
8	NC_021006	GTT	2	6	352	357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532169
9	NC_021006	CAA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532169
10	NC_021006	ATG	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
11	NC_021006	ATG	2	6	563	568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
12	NC_021006	GGT	2	6	610	615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532169
13	NC_021006	GAT	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
14	NC_021006	AAG	2	6	815	820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532169
15	NC_021006	GAA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532169
16	NC_021006	AGC	2	6	843	848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532169
17	NC_021006	GAT	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532169
18	NC_021006	TCA	2	6	891	896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532169
19	NC_021006	TTG	2	6	941	946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532169
20	NC_021006	GTT	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532169
21	NC_021006	TGC	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532169
22	NC_021006	TTA	2	6	1209	1214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532170
23	NC_021006	CAT	2	6	1283	1288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532170
24	NC_021006	TTC	2	6	1299	1304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532170
25	NC_021006	CTG	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532170
26	NC_021006	GAG	2	6	1346	1351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532170
27	NC_021006	GTT	2	6	1357	1362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532170
28	NC_021006	AAG	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532170
29	NC_021006	TGG	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532170
30	NC_021006	TAC	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532170
31	NC_021006	AAG	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532170
32	NC_021006	ATT	2	6	1574	1579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532170
33	NC_021006	GAA	2	6	1861	1866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532170
34	NC_021006	GCA	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532170
35	NC_021006	AGA	3	9	2005	2013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532170
36	NC_021006	TAA	2	6	2099	2104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532170
37	NC_021006	TGA	2	6	2183	2188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532171
38	NC_021006	AGC	2	6	2199	2204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532171
39	NC_021006	AGA	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532171
40	NC_021006	GTT	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532171
41	NC_021006	TTA	2	6	2509	2514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532171
42	NC_021006	AAT	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532171
43	NC_021006	AAG	2	6	2550	2555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532171
44	NC_021006	TAG	2	6	2598	2603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532171
45	NC_021006	ATC	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532171
46	NC_021006	GTT	2	6	2796	2801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532171
47	NC_021006	ACG	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532171
48	NC_021006	TCT	2	6	2924	2929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532171
49	NC_021006	AGT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532171
50	NC_021006	CAT	3	9	2960	2968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532171
51	NC_021006	GAT	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532171
52	NC_021006	ATA	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532171
53	NC_021006	AAT	2	6	3348	3353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532171
54	NC_021006	AGC	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532171
55	NC_021006	TGA	3	9	3711	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532172
56	NC_021006	CAG	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532172
57	NC_021006	ATA	2	6	3839	3844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532172
58	NC_021006	TCC	2	6	3848	3853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532172
59	NC_021006	TTC	2	6	3866	3871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532172
60	NC_021006	GAG	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532173
61	NC_021006	AAC	2	6	4154	4159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532173
62	NC_021006	CCA	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532173
63	NC_021006	TGG	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532173
64	NC_021006	ATT	2	6	4510	4515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532173
65	NC_021006	GAA	2	6	4542	4547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532173
66	NC_021006	AGA	2	6	4579	4584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
67	NC_021006	GAA	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
68	NC_021006	AGA	2	6	4663	4668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
69	NC_021006	TCG	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532174
70	NC_021006	GAT	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532174
71	NC_021006	GAA	2	6	4778	4783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
72	NC_021006	AGA	2	6	4822	4827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
73	NC_021006	GAA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
74	NC_021006	ATC	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532174
75	NC_021006	AGC	2	6	4906	4911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532174
76	NC_021006	TGG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532174
77	NC_021006	GGT	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532174
78	NC_021006	AAG	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
79	NC_021006	GAA	2	6	5327	5332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
80	NC_021006	CAG	2	6	5339	5344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532174
81	NC_021006	ACC	2	6	5508	5513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532174
82	NC_021006	AGA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532174
83	NC_021006	AAT	2	6	5625	5630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532174
84	NC_021006	ATT	2	6	5643	5648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532175
85	NC_021006	GAA	2	6	5659	5664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532175
86	NC_021006	CAG	2	6	5758	5763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532175
87	NC_021006	ACA	2	6	5770	5775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532175
88	NC_021006	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532175
89	NC_021006	AGA	2	6	5796	5801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532175
90	NC_021006	AGC	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532175
91	NC_021006	CAT	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532175
92	NC_021006	CAG	3	9	6041	6049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532175
93	NC_021006	TGG	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532175
94	NC_021006	TGA	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532175
95	NC_021006	TGG	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532176
96	NC_021006	CGT	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532176
97	NC_021006	ATT	2	6	6704	6709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532176
98	NC_021006	GTG	2	6	6858	6863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532176
99	NC_021006	GAG	2	6	7043	7048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532176
100	NC_021006	CAT	2	6	7179	7184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532177
101	NC_021006	TAC	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532177
102	NC_021006	AAG	2	6	7354	7359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532177
103	NC_021006	ATC	2	6	7402	7407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532177
104	NC_021006	GAT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532178
105	NC_021006	ATG	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532178
106	NC_021006	AGA	3	9	7611	7619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532178
107	NC_021006	CAA	2	6	7624	7629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532178
108	NC_021006	AAT	2	6	7630	7635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532178
109	NC_021006	TTA	2	6	7737	7742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532178
110	NC_021006	TGG	2	6	7743	7748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532178
111	NC_021006	GTA	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532178
112	NC_021006	GGT	2	6	7918	7923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532178
113	NC_021006	AAG	2	6	8039	8044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532178
114	NC_021006	TGG	2	6	8144	8149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532178
115	NC_021006	CAA	3	9	8219	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532178
116	NC_021006	GTG	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532178
117	NC_021006	GAA	2	6	8281	8286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532178
118	NC_021006	TGT	2	6	8346	8351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532178
119	NC_021006	GGC	2	6	8352	8357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480532178
120	NC_021006	AAG	2	6	8375	8380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532178
121	NC_021006	TGC	2	6	8406	8411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532178
122	NC_021006	TCT	2	6	8447	8452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532178
123	NC_021006	TAT	2	6	8472	8477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532178
124	NC_021006	TTG	2	6	8507	8512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532178
125	NC_021006	AGC	3	9	8643	8651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532178
126	NC_021006	GAA	3	9	8674	8682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532178
127	NC_021006	TCA	2	6	8702	8707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532178
128	NC_021006	AGA	2	6	8745	8750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532178
129	NC_021006	ATT	2	6	8837	8842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532179
130	NC_021006	GAT	2	6	8858	8863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532179
131	NC_021006	GAA	2	6	8912	8917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532179
132	NC_021006	GAA	3	9	8975	8983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532179
133	NC_021006	CTT	2	6	8989	8994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532179
134	NC_021006	TTG	2	6	9014	9019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532179
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136	NC_021006	GGA	2	6	9176	9181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532179
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139	NC_021006	GAT	2	6	9431	9436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532179
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143	NC_021006	AAG	2	6	9573	9578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532179
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147	NC_021006	AAG	2	6	9980	9985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532180
148	NC_021006	CCA	2	6	10022	10027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532180
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150	NC_021006	GGA	2	6	10318	10323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532180
151	NC_021006	TAT	3	9	10327	10335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532180
152	NC_021006	CAT	2	6	10362	10367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532180
153	NC_021006	GCA	2	6	10544	10549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532181
154	NC_021006	TTC	2	6	10606	10611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532181
155	NC_021006	TCA	2	6	10754	10759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532181
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158	NC_021006	AAG	2	6	11001	11006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532181
159	NC_021006	ATG	2	6	11058	11063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532181
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161	NC_021006	AGA	3	9	11140	11148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532181
162	NC_021006	TTG	2	6	11160	11165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532181
163	NC_021006	ATC	3	9	11222	11230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532181
164	NC_021006	GGT	2	6	11384	11389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532181
165	NC_021006	CTT	2	6	11392	11397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532181
166	NC_021006	CTT	2	6	11425	11430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532181
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252	NC_021006	AAG	2	6	18937	18942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532190
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