MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021006	GAG	2	6	180179	180184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532318
3002	NC_021006	TTGA	2	8	180197	180204	25 %	50 %	25 %	0 %	480532318
3003	NC_021006	TCT	2	6	180213	180218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532318
3004	NC_021006	TGC	2	6	180233	180238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532318
3005	NC_021006	TTTC	2	8	180361	180368	0 %	75 %	0 %	25 %	480532318
3006	NC_021006	CTC	2	6	180434	180439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532318
3007	NC_021006	ACAG	2	8	180492	180499	50 %	0 %	25 %	25 %	480532318
3008	NC_021006	TAC	2	6	180529	180534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532318
3009	NC_021006	GAT	2	6	180560	180565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532318
3010	NC_021006	TCA	2	6	180570	180575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532318
3011	NC_021006	TCA	2	6	180594	180599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532318
3012	NC_021006	GAC	2	6	180616	180621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532318
3013	NC_021006	GTC	2	6	180684	180689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532318
3014	NC_021006	CAT	2	6	180704	180709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532318
3015	NC_021006	AAT	2	6	180800	180805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532318
3016	NC_021006	T	6	6	180813	180818	0 %	100 %	0 %	0 %	480532318
3017	NC_021006	T	6	6	180852	180857	0 %	100 %	0 %	0 %	480532319
3018	NC_021006	ATC	2	6	180917	180922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532319
3019	NC_021006	ATC	2	6	181011	181016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532319
3020	NC_021006	GATT	2	8	181073	181080	25 %	50 %	25 %	0 %	480532319
3021	NC_021006	TC	3	6	181107	181112	0 %	50 %	0 %	50 %	480532319
3022	NC_021006	CTT	2	6	181183	181188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532319
3023	NC_021006	TCT	2	6	181206	181211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532319
3024	NC_021006	TCT	2	6	181241	181246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532319
3025	NC_021006	T	6	6	181249	181254	0 %	100 %	0 %	0 %	480532319
3026	NC_021006	TC	3	6	181259	181264	0 %	50 %	0 %	50 %	480532319
3027	NC_021006	T	6	6	181265	181270	0 %	100 %	0 %	0 %	480532319
3028	NC_021006	CT	3	6	181297	181302	0 %	50 %	0 %	50 %	480532320
3029	NC_021006	CTT	2	6	181307	181312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532320
3030	NC_021006	TTGC	2	8	181333	181340	0 %	50 %	25 %	25 %	480532320
3031	NC_021006	CTTTT	2	10	181344	181353	0 %	80 %	0 %	20 %	480532320
3032	NC_021006	T	6	6	181350	181355	0 %	100 %	0 %	0 %	480532320
3033	NC_021006	CCAAG	2	10	181409	181418	40 %	0 %	20 %	40 %	480532320
3034	NC_021006	TGA	2	6	181471	181476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532320
3035	NC_021006	AAT	2	6	181491	181496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532320
3036	NC_021006	ACC	2	6	181552	181557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532320
3037	NC_021006	ACC	2	6	181884	181889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532320
3038	NC_021006	TC	3	6	181949	181954	0 %	50 %	0 %	50 %	480532320
3039	NC_021006	GCCA	2	8	181998	182005	25 %	0 %	25 %	50 %	480532320
3040	NC_021006	CT	3	6	182025	182030	0 %	50 %	0 %	50 %	480532320
3041	NC_021006	AAC	2	6	182038	182043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532320
3042	NC_021006	CTA	2	6	182100	182105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532321
3043	NC_021006	GCT	2	6	182136	182141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532321
3044	NC_021006	TCT	2	6	182150	182155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532321
3045	NC_021006	CAA	2	6	182215	182220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532321
3046	NC_021006	CTGC	2	8	182241	182248	0 %	25 %	25 %	50 %	480532321
3047	NC_021006	CAT	2	6	182304	182309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532321
3048	NC_021006	CAAT	2	8	182331	182338	50 %	25 %	0 %	25 %	480532321
3049	NC_021006	TTC	2	6	182455	182460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532321
3050	NC_021006	CCA	2	6	182508	182513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532321
3051	NC_021006	CTGC	2	8	182580	182587	0 %	25 %	25 %	50 %	480532321
3052	NC_021006	TCA	2	6	182690	182695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532321
3053	NC_021006	ATC	2	6	182738	182743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532321
3054	NC_021006	CCA	2	6	182837	182842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532321
3055	NC_021006	GAATA	2	10	182847	182856	60 %	20 %	20 %	0 %	480532321
3056	NC_021006	CTG	2	6	182887	182892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532321
3057	NC_021006	TTCA	2	8	182948	182955	25 %	50 %	0 %	25 %	480532321
3058	NC_021006	TCT	2	6	182974	182979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532322
3059	NC_021006	TTTTG	2	10	183148	183157	0 %	80 %	20 %	0 %	480532322
3060	NC_021006	T	6	6	183214	183219	0 %	100 %	0 %	0 %	480532323
3061	NC_021006	CTT	2	6	183252	183257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532323
3062	NC_021006	T	6	6	183256	183261	0 %	100 %	0 %	0 %	480532323
3063	NC_021006	TGA	2	6	183449	183454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532323
3064	NC_021006	CTTG	2	8	183458	183465	0 %	50 %	25 %	25 %	480532323
3065	NC_021006	TTGT	2	8	183472	183479	0 %	75 %	25 %	0 %	480532323
3066	NC_021006	GCAGTT	2	12	183516	183527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480532323
3067	NC_021006	GACT	2	8	183584	183591	25 %	25 %	25 %	25 %	480532323
3068	NC_021006	T	6	6	183595	183600	0 %	100 %	0 %	0 %	480532323
3069	NC_021006	TAGA	2	8	183618	183625	50 %	25 %	25 %	0 %	480532323
3070	NC_021006	GCC	2	6	183713	183718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532323
3071	NC_021006	TTC	2	6	183835	183840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532323
3072	NC_021006	ACC	2	6	183868	183873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532323
3073	NC_021006	AAT	2	6	183883	183888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532323
3074	NC_021006	CAAATC	2	12	183892	183903	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480532323
3075	NC_021006	TCC	2	6	183941	183946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532323
3076	NC_021006	AAG	2	6	183979	183984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532323
3077	NC_021006	CTG	2	6	184007	184012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532323
3078	NC_021006	ATA	2	6	184022	184027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532323
3079	NC_021006	TAC	2	6	184057	184062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532323
3080	NC_021006	GCTT	2	8	184091	184098	0 %	50 %	25 %	25 %	480532323
3081	NC_021006	CTT	2	6	184119	184124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532323
3082	NC_021006	T	6	6	184132	184137	0 %	100 %	0 %	0 %	480532323
3083	NC_021006	GTT	2	6	184143	184148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532323
3084	NC_021006	ATG	3	9	184196	184204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532323
3085	NC_021006	CTT	2	6	184263	184268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532323
3086	NC_021006	GTT	2	6	184454	184459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532323
3087	NC_021006	ATT	2	6	184606	184611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532324
3088	NC_021006	CTT	2	6	184624	184629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532324
3089	NC_021006	GTC	2	6	184650	184655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532324
3090	NC_021006	TGG	2	6	184734	184739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532324
3091	NC_021006	CTC	2	6	184799	184804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532324
3092	NC_021006	ACG	2	6	184820	184825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532324
3093	NC_021006	AAT	2	6	184826	184831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532324
3094	NC_021006	TCC	2	6	184893	184898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532324
3095	NC_021006	CAA	2	6	185012	185017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532324
3096	NC_021006	ATC	2	6	185034	185039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532324
3097	NC_021006	GTA	2	6	185117	185122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532324
3098	NC_021006	TCA	2	6	185151	185156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532324
3099	NC_021006	ACC	3	9	185195	185203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532324
3100	NC_021006	ACC	2	6	185207	185212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532324
3101	NC_021006	AAT	2	6	185222	185227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532324
3102	NC_021006	AGCA	2	8	185377	185384	50 %	0 %	25 %	25 %	480532325
3103	NC_021006	ATG	2	6	185473	185478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532325
3104	NC_021006	ACTCA	2	10	185578	185587	40 %	20 %	0 %	40 %	480532325
3105	NC_021006	ATTT	2	8	185596	185603	25 %	75 %	0 %	0 %	480532325
3106	NC_021006	GAA	2	6	185613	185618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532325
3107	NC_021006	CAT	2	6	185650	185655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532325
3108	NC_021006	CCTT	2	8	185907	185914	0 %	50 %	0 %	50 %	480532326
3109	NC_021006	ATC	2	6	185959	185964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532326
3110	NC_021006	TCC	2	6	186131	186136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532326
3111	NC_021006	TCT	2	6	186149	186154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532326
3112	NC_021006	CAG	2	6	186165	186170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532326
3113	NC_021006	CAT	2	6	186297	186302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532326
3114	NC_021006	TCA	2	6	186470	186475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532326
3115	NC_021006	GTC	2	6	186542	186547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532326
3116	NC_021006	CAC	2	6	186649	186654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532326
3117	NC_021006	CCA	2	6	186671	186676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532326
3118	NC_021006	CAT	2	6	186723	186728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532326
3119	NC_021006	CTT	2	6	186744	186749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532326
3120	NC_021006	T	7	7	186748	186754	0 %	100 %	0 %	0 %	480532326
3121	NC_021006	ATA	2	6	186761	186766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532326
3122	NC_021006	TTG	2	6	186819	186824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532327
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3363	NC_021006	ACG	2	6	202283	202288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532339
3364	NC_021006	TCAA	2	8	202329	202336	50 %	25 %	0 %	25 %	480532339
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3366	NC_021006	GCAT	2	8	202368	202375	25 %	25 %	25 %	25 %	480532339
3367	NC_021006	CAC	2	6	202429	202434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532339
3368	NC_021006	CAG	2	6	202435	202440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532339
3369	NC_021006	CAC	2	6	202441	202446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532339
3370	NC_021006	TCG	2	6	202677	202682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532339
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3372	NC_021006	CAA	2	6	202711	202716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532339
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3374	NC_021006	GTTT	2	8	203118	203125	0 %	75 %	25 %	0 %	480532340
3375	NC_021006	CCTAA	2	10	203163	203172	40 %	20 %	0 %	40 %	480532340
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3380	NC_021006	TGA	2	6	203372	203377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532340
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3382	NC_021006	CTA	2	6	203440	203445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532340
3383	NC_021006	CTG	2	6	203466	203471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532340
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3434	NC_021006	ACCAG	2	10	206481	206490	40 %	0 %	20 %	40 %	480532345
3435	NC_021006	CAC	2	6	206520	206525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532345
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3440	NC_021006	T	6	6	206751	206756	0 %	100 %	0 %	0 %	480532346
3441	NC_021006	GC	3	6	206771	206776	0 %	0 %	50 %	50 %	480532346
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3453	NC_021006	TCT	2	6	207168	207173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532347
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3457	NC_021006	TCA	2	6	207274	207279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532347
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3460	NC_021006	T	6	6	207395	207400	0 %	100 %	0 %	0 %	480532347
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3462	NC_021006	ATC	2	6	207479	207484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532347
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3468	NC_021006	TAAA	2	8	207671	207678	75 %	25 %	0 %	0 %	480532347
3469	NC_021006	CAT	2	6	207716	207721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532348
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3473	NC_021006	TTTC	2	8	207892	207899	0 %	75 %	0 %	25 %	480532348
3474	NC_021006	CGG	2	6	207957	207962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480532348
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3477	NC_021006	CGTT	2	8	208071	208078	0 %	50 %	25 %	25 %	480532348
3478	NC_021006	CCTT	2	8	208089	208096	0 %	50 %	0 %	50 %	480532348
3479	NC_021006	TCCG	2	8	208209	208216	0 %	25 %	25 %	50 %	480532348
3480	NC_021006	AGT	2	6	208273	208278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532348
3481	NC_021006	T	7	7	208332	208338	0 %	100 %	0 %	0 %	480532348
3482	NC_021006	TCA	2	6	208368	208373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532348
3483	NC_021006	CGGA	2	8	208388	208395	25 %	0 %	50 %	25 %	480532348
3484	NC_021006	TGA	2	6	208503	208508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532348
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3486	NC_021006	ATC	2	6	208670	208675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532348
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3489	NC_021006	TCCA	2	8	208721	208728	25 %	25 %	0 %	50 %	480532348
3490	NC_021006	AAT	2	6	208738	208743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532348
3491	NC_021006	CCTT	2	8	208833	208840	0 %	50 %	0 %	50 %	480532348
3492	NC_021006	TTC	2	6	208859	208864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532348
3493	NC_021006	GTC	2	6	208904	208909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532348
3494	NC_021006	GT	3	6	208922	208927	0 %	50 %	50 %	0 %	480532348
3495	NC_021006	ACCTG	2	10	208965	208974	20 %	20 %	20 %	40 %	480532348
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3497	NC_021006	CAT	2	6	209260	209265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532348
3498	NC_021006	CTGG	2	8	209371	209378	0 %	25 %	50 %	25 %	480532348
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3500	NC_021006	TAG	2	6	209388	209393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532348

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