MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021006	GCG	2	6	303539	303544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480532430
5002	NC_021006	AGCC	2	8	303551	303558	25 %	0 %	25 %	50 %	480532430
5003	NC_021006	TAA	2	6	303578	303583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532430
5004	NC_021006	TAC	2	6	303746	303751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532430
5005	NC_021006	TGTT	2	8	303767	303774	0 %	75 %	25 %	0 %	480532430
5006	NC_021006	TTCTT	2	10	303869	303878	0 %	80 %	0 %	20 %	480532431
5007	NC_021006	T	6	6	303912	303917	0 %	100 %	0 %	0 %	480532431
5008	NC_021006	TTG	3	9	303943	303951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532431
5009	NC_021006	CTGT	2	8	304044	304051	0 %	50 %	25 %	25 %	480532431
5010	NC_021006	TTGC	2	8	304100	304107	0 %	50 %	25 %	25 %	480532431
5011	NC_021006	CTG	2	6	304116	304121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532431
5012	NC_021006	GCT	2	6	304136	304141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532431
5013	NC_021006	GAC	2	6	304235	304240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532432
5014	NC_021006	T	6	6	304254	304259	0 %	100 %	0 %	0 %	480532432
5015	NC_021006	TCT	2	6	304407	304412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532432
5016	NC_021006	TCA	2	6	304413	304418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532432
5017	NC_021006	CAC	3	9	304453	304461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532432
5018	NC_021006	GTT	2	6	304486	304491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532432
5019	NC_021006	A	6	6	304505	304510	100 %	0 %	0 %	0 %	480532432
5020	NC_021006	ACC	2	6	304673	304678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532432
5021	NC_021006	ATA	2	6	304895	304900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532432
5022	NC_021006	AGC	2	6	304931	304936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532432
5023	NC_021006	ATGGG	2	10	304959	304968	20 %	20 %	60 %	0 %	480532432
5024	NC_021006	GCCA	2	8	304991	304998	25 %	0 %	25 %	50 %	480532432
5025	NC_021006	CCG	2	6	305008	305013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532432
5026	NC_021006	ATA	2	6	305052	305057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532432
5027	NC_021006	GTTT	2	8	305106	305113	0 %	75 %	25 %	0 %	480532432
5028	NC_021006	ATC	2	6	305165	305170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532432
5029	NC_021006	CTT	2	6	305191	305196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532432
5030	NC_021006	TC	3	6	305208	305213	0 %	50 %	0 %	50 %	480532432
5031	NC_021006	GAT	2	6	305254	305259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532432
5032	NC_021006	CTT	2	6	305377	305382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532433
5033	NC_021006	TGA	2	6	305402	305407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532433
5034	NC_021006	TC	3	6	305495	305500	0 %	50 %	0 %	50 %	480532433
5035	NC_021006	AAC	2	6	305588	305593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532433
5036	NC_021006	ACC	2	6	305615	305620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532433
5037	NC_021006	ACC	2	6	305627	305632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532433
5038	NC_021006	ATT	2	6	305636	305641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532433
5039	NC_021006	TCT	2	6	305661	305666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532433
5040	NC_021006	ACA	2	6	305763	305768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532433
5041	NC_021006	CGA	2	6	305839	305844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532433
5042	NC_021006	CCA	2	6	306009	306014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532433
5043	NC_021006	TGG	2	6	306094	306099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532433
5044	NC_021006	TGA	2	6	306110	306115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532433
5045	NC_021006	ATC	2	6	306137	306142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532433
5046	NC_021006	C	6	6	306158	306163	0 %	0 %	0 %	100 %	480532433
5047	NC_021006	GCTT	2	8	306205	306212	0 %	50 %	25 %	25 %	480532433
5048	NC_021006	TCC	2	6	306231	306236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532433
5049	NC_021006	ATG	2	6	306243	306248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532433
5050	NC_021006	TGG	2	6	306261	306266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532433
5051	NC_021006	TGA	2	6	306274	306279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532433
5052	NC_021006	CATA	2	8	306280	306287	50 %	25 %	0 %	25 %	480532433
5053	NC_021006	GTC	2	6	306303	306308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532433
5054	NC_021006	ACC	2	6	306365	306370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532433
5055	NC_021006	AAT	2	6	306452	306457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532433
5056	NC_021006	AGT	2	6	306526	306531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532434
5057	NC_021006	CATG	2	8	306793	306800	25 %	25 %	25 %	25 %	480532434
5058	NC_021006	ATGGC	2	10	306828	306837	20 %	20 %	40 %	20 %	480532434
5059	NC_021006	ACC	2	6	306894	306899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532434
5060	NC_021006	TCAA	2	8	306927	306934	50 %	25 %	0 %	25 %	480532434
5061	NC_021006	AG	3	6	306985	306990	50 %	0 %	50 %	0 %	480532434
5062	NC_021006	TCAA	2	8	307008	307015	50 %	25 %	0 %	25 %	480532434
5063	NC_021006	TCAA	2	8	307044	307051	50 %	25 %	0 %	25 %	480532434
5064	NC_021006	CT	3	6	307052	307057	0 %	50 %	0 %	50 %	480532434
5065	NC_021006	ATCA	2	8	307085	307092	50 %	25 %	0 %	25 %	480532434
5066	NC_021006	CCA	2	6	307120	307125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532434
5067	NC_021006	GT	3	6	307141	307146	0 %	50 %	50 %	0 %	480532434
5068	NC_021006	AGA	2	6	307169	307174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532434
5069	NC_021006	CCAG	2	8	307248	307255	25 %	0 %	25 %	50 %	480532434
5070	NC_021006	CAA	2	6	307261	307266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532434
5071	NC_021006	CCA	3	9	307269	307277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532434
5072	NC_021006	CTTG	2	8	307309	307316	0 %	50 %	25 %	25 %	480532434
5073	NC_021006	AGT	2	6	307343	307348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532434
5074	NC_021006	TTCT	3	12	307353	307364	0 %	75 %	0 %	25 %	480532434
5075	NC_021006	TCT	2	6	307407	307412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532434
5076	NC_021006	AG	4	8	307438	307445	50 %	0 %	50 %	0 %	480532434
5077	NC_021006	GAT	2	6	307552	307557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532434
5078	NC_021006	CTTT	2	8	307595	307602	0 %	75 %	0 %	25 %	480532435
5079	NC_021006	TCT	2	6	307635	307640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532435
5080	NC_021006	CTG	2	6	307714	307719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532435
5081	NC_021006	AG	3	6	307789	307794	50 %	0 %	50 %	0 %	480532435
5082	NC_021006	GA	3	6	307825	307830	50 %	0 %	50 %	0 %	480532435
5083	NC_021006	CCAT	2	8	307836	307843	25 %	25 %	0 %	50 %	480532435
5084	NC_021006	TGG	2	6	307852	307857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532435
5085	NC_021006	CTTG	2	8	307887	307894	0 %	50 %	25 %	25 %	480532435
5086	NC_021006	CA	3	6	307918	307923	50 %	0 %	0 %	50 %	480532435
5087	NC_021006	T	6	6	307975	307980	0 %	100 %	0 %	0 %	480532435
5088	NC_021006	GAAC	2	8	307992	307999	50 %	0 %	25 %	25 %	480532435
5089	NC_021006	CTGA	2	8	308012	308019	25 %	25 %	25 %	25 %	480532435
5090	NC_021006	GATT	2	8	308045	308052	25 %	50 %	25 %	0 %	480532435
5091	NC_021006	CAC	2	6	308059	308064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532435
5092	NC_021006	CAG	2	6	308072	308077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532435
5093	NC_021006	AAG	2	6	308104	308109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532435
5094	NC_021006	A	6	6	308120	308125	100 %	0 %	0 %	0 %	480532435
5095	NC_021006	TAT	2	6	308140	308145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532435
5096	NC_021006	GC	3	6	308198	308203	0 %	0 %	50 %	50 %	480532435
5097	NC_021006	CGA	2	6	308283	308288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532435
5098	NC_021006	CAA	2	6	308416	308421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532435
5099	NC_021006	T	7	7	308471	308477	0 %	100 %	0 %	0 %	480532436
5100	NC_021006	GCTA	2	8	308481	308488	25 %	25 %	25 %	25 %	480532436
5101	NC_021006	GA	3	6	308567	308572	50 %	0 %	50 %	0 %	480532436
5102	NC_021006	TCA	2	6	308648	308653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532436
5103	NC_021006	CAT	2	6	308739	308744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532436
5104	NC_021006	CTT	2	6	309005	309010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532436
5105	NC_021006	ATG	2	6	309037	309042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532436
5106	NC_021006	CCT	2	6	309080	309085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532436
5107	NC_021006	CTT	2	6	309091	309096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532436
5108	NC_021006	TAC	2	6	309157	309162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532437
5109	NC_021006	T	6	6	309170	309175	0 %	100 %	0 %	0 %	480532437
5110	NC_021006	CTG	2	6	309190	309195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532437
5111	NC_021006	CTT	2	6	309225	309230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532437
5112	NC_021006	GCA	2	6	309282	309287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532437
5113	NC_021006	TCCC	2	8	309307	309314	0 %	25 %	0 %	75 %	480532437
5114	NC_021006	GTTT	2	8	309375	309382	0 %	75 %	25 %	0 %	480532437
5115	NC_021006	T	6	6	309380	309385	0 %	100 %	0 %	0 %	480532437
5116	NC_021006	CTC	2	6	309580	309585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532437
5117	NC_021006	AACTA	2	10	309662	309671	60 %	20 %	0 %	20 %	480532437
5118	NC_021006	TCA	2	6	309706	309711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532437
5119	NC_021006	CAT	2	6	309715	309720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532437
5120	NC_021006	CTT	2	6	309775	309780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532437
5121	NC_021006	ATC	2	6	310007	310012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532437
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5123	NC_021006	TCTTT	2	10	310030	310039	0 %	80 %	0 %	20 %	480532437
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5247	NC_021006	T	6	6	320791	320796	0 %	100 %	0 %	0 %	480532445
5248	NC_021006	TC	3	6	320803	320808	0 %	50 %	0 %	50 %	480532446
5249	NC_021006	TGA	2	6	320831	320836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532446
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5251	NC_021006	CCA	2	6	320941	320946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532446
5252	NC_021006	ATAG	2	8	321019	321026	50 %	25 %	25 %	0 %	480532446
5253	NC_021006	ATGAC	2	10	321034	321043	40 %	20 %	20 %	20 %	480532446
5254	NC_021006	TGA	2	6	321086	321091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532446
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5259	NC_021006	CTAAA	2	10	321476	321485	60 %	20 %	0 %	20 %	480532446
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5282	NC_021006	TTG	2	6	322508	322513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532447
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5289	NC_021006	GACAA	2	10	323193	323202	60 %	0 %	20 %	20 %	480532448
5290	NC_021006	CCA	2	6	323325	323330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532448
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5349	NC_021006	ATAA	2	8	327606	327613	75 %	25 %	0 %	0 %	480532451
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5351	NC_021006	CGT	2	6	327979	327984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532452
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5355	NC_021006	TTC	2	6	328058	328063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532452
5356	NC_021006	GA	3	6	328192	328197	50 %	0 %	50 %	0 %	480532452
5357	NC_021006	GTT	2	6	328201	328206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532452
5358	NC_021006	CAT	2	6	328267	328272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532452
5359	NC_021006	CGTAC	2	10	328320	328329	20 %	20 %	20 %	40 %	480532452
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5361	NC_021006	CTT	2	6	328348	328353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532452
5362	NC_021006	TCT	2	6	328392	328397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532452
5363	NC_021006	TCAA	2	8	328508	328515	50 %	25 %	0 %	25 %	480532453
5364	NC_021006	TGC	2	6	328562	328567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532453
5365	NC_021006	GAT	2	6	328678	328683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532453
5366	NC_021006	GCT	2	6	328722	328727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532453
5367	NC_021006	ACC	2	6	328732	328737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532453
5368	NC_021006	ACA	2	6	328868	328873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532453
5369	NC_021006	ATAG	2	8	328879	328886	50 %	25 %	25 %	0 %	480532453
5370	NC_021006	GTT	2	6	328905	328910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532453
5371	NC_021006	TGT	2	6	328968	328973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532453
5372	NC_021006	GA	3	6	329035	329040	50 %	0 %	50 %	0 %	480532453
5373	NC_021006	GAG	2	6	329044	329049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532453
5374	NC_021006	CTT	2	6	329131	329136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532453
5375	NC_021006	TAT	2	6	329139	329144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532453
5376	NC_021006	TGG	2	6	329229	329234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532454
5377	NC_021006	TCAA	2	8	329279	329286	50 %	25 %	0 %	25 %	480532454
5378	NC_021006	AAG	2	6	329300	329305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532454
5379	NC_021006	AGC	2	6	329326	329331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532454
5380	NC_021006	CTG	2	6	329332	329337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532454
5381	NC_021006	ATG	3	9	329354	329362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532454
5382	NC_021006	TCT	2	6	329393	329398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532454
5383	NC_021006	AGGCTG	2	12	329424	329435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480532454
5384	NC_021006	GTT	2	6	329493	329498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532454
5385	NC_021006	ACC	2	6	329503	329508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532454
5386	NC_021006	TCAT	2	8	329792	329799	25 %	50 %	0 %	25 %	480532454
5387	NC_021006	GTAG	2	8	329818	329825	25 %	25 %	50 %	0 %	480532454
5388	NC_021006	TTTC	2	8	329867	329874	0 %	75 %	0 %	25 %	480532454
5389	NC_021006	TAG	2	6	329934	329939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532454
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5391	NC_021006	CTG	2	6	330109	330114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532455
5392	NC_021006	CTG	2	6	330262	330267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532455
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5397	NC_021006	AAT	2	6	330674	330679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532455
5398	NC_021006	CAC	2	6	330730	330735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532455
5399	NC_021006	AGA	2	6	330749	330754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532455
5400	NC_021006	AAGA	2	8	330765	330772	75 %	0 %	25 %	0 %	480532455
5401	NC_021006	ATG	2	6	330837	330842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532455
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5403	NC_021006	CTTT	2	8	330913	330920	0 %	75 %	0 %	25 %	480532456
5404	NC_021006	TCA	2	6	330956	330961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532456
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5409	NC_021006	CCA	2	6	331354	331359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532456
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5471	NC_021006	CTTG	2	8	335439	335446	0 %	50 %	25 %	25 %	480532460
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5478	NC_021006	CT	3	6	335787	335792	0 %	50 %	0 %	50 %	480532461
5479	NC_021006	ATG	2	6	335835	335840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532461
5480	NC_021006	TCA	2	6	335841	335846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532461
5481	NC_021006	AAGGA	2	10	335862	335871	60 %	0 %	40 %	0 %	480532461
5482	NC_021006	TTCTT	2	10	335882	335891	0 %	80 %	0 %	20 %	480532461
5483	NC_021006	ATA	2	6	335907	335912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532461
5484	NC_021006	GCCTTA	2	12	335952	335963	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480532461
5485	NC_021006	ATG	2	6	335968	335973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532461
5486	NC_021006	CTTTC	2	10	336206	336215	0 %	60 %	0 %	40 %	480532462
5487	NC_021006	CAGATA	2	12	336232	336243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480532462
5488	NC_021006	AAG	2	6	336248	336253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532462
5489	NC_021006	A	6	6	336268	336273	100 %	0 %	0 %	0 %	480532462
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5491	NC_021006	GAA	2	6	336288	336293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532462
5492	NC_021006	ATA	2	6	336314	336319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532462
5493	NC_021006	ATC	2	6	336352	336357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532462
5494	NC_021006	ATC	2	6	336428	336433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532462
5495	NC_021006	ACT	2	6	336443	336448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532462
5496	NC_021006	CTA	2	6	336540	336545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532462
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5499	NC_021006	TCA	2	6	336657	336662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532462
5500	NC_021006	TAGA	2	8	336697	336704	50 %	25 %	25 %	0 %	480532462

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