MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021005	TCTA	2	8	244258	244265	25 %	50 %	0 %	25 %	480530595
4002	NC_021005	GAA	3	9	244270	244278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
4003	NC_021005	CTT	2	6	244301	244306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530595
4004	NC_021005	AGA	2	6	244407	244412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
4005	NC_021005	AAC	2	6	244421	244426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530595
4006	NC_021005	ATA	2	6	244454	244459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530595
4007	NC_021005	TTA	2	6	244483	244488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530595
4008	NC_021005	GAA	2	6	244492	244497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
4009	NC_021005	TTC	2	6	244522	244527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530595
4010	NC_021005	TTG	2	6	244736	244741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530595
4011	NC_021005	AAGA	2	8	244783	244790	75 %	0 %	25 %	0 %	480530595
4012	NC_021005	ACT	2	6	244840	244845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530595
4013	NC_021005	CT	3	6	244911	244916	0 %	50 %	0 %	50 %	480530595
4014	NC_021005	AT	3	6	244938	244943	50 %	50 %	0 %	0 %	480530595
4015	NC_021005	AT	3	6	244950	244955	50 %	50 %	0 %	0 %	480530595
4016	NC_021005	AGA	2	6	244986	244991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
4017	NC_021005	TTG	2	6	244997	245002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530595
4018	NC_021005	ACAATT	2	12	245029	245040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	480530595
4019	NC_021005	CAG	2	6	245075	245080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530595
4020	NC_021005	TGG	2	6	245109	245114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530595
4021	NC_021005	AAG	2	6	245128	245133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
4022	NC_021005	ATGA	2	8	245242	245249	50 %	25 %	25 %	0 %	480530595
4023	NC_021005	TGA	2	6	245261	245266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530595
4024	NC_021005	TAA	2	6	245292	245297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530595
4025	NC_021005	TGA	2	6	245298	245303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530595
4026	NC_021005	ATT	3	9	245305	245313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530595
4027	NC_021005	CTT	2	6	245315	245320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530595
4028	NC_021005	GAT	2	6	245344	245349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530595
4029	NC_021005	ATGA	2	8	245461	245468	50 %	25 %	25 %	0 %	480530595
4030	NC_021005	GAA	2	6	245529	245534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
4031	NC_021005	TTG	2	6	245597	245602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530595
4032	NC_021005	TGA	2	6	245664	245669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530595
4033	NC_021005	AAG	2	6	245696	245701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
4034	NC_021005	TA	3	6	245719	245724	50 %	50 %	0 %	0 %	480530595
4035	NC_021005	A	6	6	245776	245781	100 %	0 %	0 %	0 %	480530595
4036	NC_021005	GAA	2	6	245794	245799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
4037	NC_021005	GAA	2	6	245851	245856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
4038	NC_021005	ATG	2	6	245885	245890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530595
4039	NC_021005	ATG	3	9	245906	245914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530595
4040	NC_021005	CTG	2	6	245936	245941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530595
4041	NC_021005	TGA	2	6	245958	245963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530595
4042	NC_021005	GGA	2	6	246007	246012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530595
4043	NC_021005	TCT	2	6	246031	246036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530595
4044	NC_021005	GTT	2	6	246116	246121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530595
4045	NC_021005	ATA	2	6	246131	246136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530595
4046	NC_021005	AGA	3	9	246249	246257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530595
4047	NC_021005	TGT	2	6	246327	246332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530595
4048	NC_021005	AG	3	6	246337	246342	50 %	0 %	50 %	0 %	480530595
4049	NC_021005	TTC	2	6	246415	246420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530595
4050	NC_021005	TTCT	2	8	246425	246432	0 %	75 %	0 %	25 %	480530595
4051	NC_021005	AG	3	6	246598	246603	50 %	0 %	50 %	0 %	480530596
4052	NC_021005	T	7	7	246615	246621	0 %	100 %	0 %	0 %	480530596
4053	NC_021005	ATTG	2	8	246645	246652	25 %	50 %	25 %	0 %	480530596
4054	NC_021005	GAT	2	6	246742	246747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530596
4055	NC_021005	AT	3	6	246746	246751	50 %	50 %	0 %	0 %	480530596
4056	NC_021005	A	7	7	246801	246807	100 %	0 %	0 %	0 %	480530596
4057	NC_021005	ATT	2	6	246855	246860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530596
4058	NC_021005	AAT	2	6	247024	247029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530596
4059	NC_021005	CAG	2	6	247058	247063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530596
4060	NC_021005	GCCAT	2	10	247090	247099	20 %	20 %	20 %	40 %	480530596
4061	NC_021005	TGA	2	6	247116	247121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530596
4062	NC_021005	TAGA	2	8	247165	247172	50 %	25 %	25 %	0 %	480530596
4063	NC_021005	AT	3	6	247211	247216	50 %	50 %	0 %	0 %	480530597
4064	NC_021005	TAT	2	6	247282	247287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530597
4065	NC_021005	TTG	2	6	247309	247314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530597
4066	NC_021005	GTT	2	6	247407	247412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530597
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4068	NC_021005	TAT	2	6	247442	247447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530597
4069	NC_021005	TGG	2	6	247454	247459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530597
4070	NC_021005	TTGA	2	8	247497	247504	25 %	50 %	25 %	0 %	480530597
4071	NC_021005	TTA	2	6	247513	247518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530597
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4073	NC_021005	CGAC	2	8	247537	247544	25 %	0 %	25 %	50 %	480530597
4074	NC_021005	TTAT	2	8	247567	247574	25 %	75 %	0 %	0 %	480530597
4075	NC_021005	TTA	2	6	247671	247676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530597
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4078	NC_021005	GAA	2	6	247800	247805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530597
4079	NC_021005	GTG	2	6	247854	247859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530597
4080	NC_021005	TTG	2	6	247879	247884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530597
4081	NC_021005	GGA	2	6	247923	247928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530597
4082	NC_021005	GCG	2	6	247935	247940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480530597
4083	NC_021005	TCA	2	6	247982	247987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530597
4084	NC_021005	TAT	2	6	248032	248037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530597
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4086	NC_021005	A	7	7	248085	248091	100 %	0 %	0 %	0 %	480530597
4087	NC_021005	CAA	2	6	248101	248106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530597
4088	NC_021005	ATG	2	6	248140	248145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530597
4089	NC_021005	TAA	2	6	248149	248154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530597
4090	NC_021005	TCA	2	6	248192	248197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530597
4091	NC_021005	TAT	2	6	248237	248242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530597
4092	NC_021005	CAT	2	6	248785	248790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530598
4093	NC_021005	TTC	2	6	248945	248950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530598
4094	NC_021005	CAG	2	6	249017	249022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530598
4095	NC_021005	CAACA	2	10	249102	249111	60 %	0 %	0 %	40 %	480530598
4096	NC_021005	ACT	2	6	249119	249124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530598
4097	NC_021005	GAA	2	6	249232	249237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530598
4098	NC_021005	GCAAC	2	10	249384	249393	40 %	0 %	20 %	40 %	480530598
4099	NC_021005	TAC	2	6	249465	249470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530598
4100	NC_021005	AC	3	6	249479	249484	50 %	0 %	0 %	50 %	480530598
4101	NC_021005	TAG	2	6	249527	249532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530598
4102	NC_021005	AGCA	2	8	249551	249558	50 %	0 %	25 %	25 %	480530598
4103	NC_021005	AGCC	2	8	249585	249592	25 %	0 %	25 %	50 %	480530598
4104	NC_021005	A	6	6	249629	249634	100 %	0 %	0 %	0 %	480530598
4105	NC_021005	TGCC	2	8	249746	249753	0 %	25 %	25 %	50 %	480530598
4106	NC_021005	TCG	2	6	249800	249805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530598
4107	NC_021005	GAA	2	6	249829	249834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530598
4108	NC_021005	AGA	2	6	249894	249899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530598
4109	NC_021005	GCTT	2	8	249919	249926	0 %	50 %	25 %	25 %	480530598
4110	NC_021005	GAA	2	6	249928	249933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530598
4111	NC_021005	TACC	2	8	249957	249964	25 %	25 %	0 %	50 %	480530598
4112	NC_021005	TCAT	2	8	250019	250026	25 %	50 %	0 %	25 %	480530598
4113	NC_021005	GTC	2	6	250178	250183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530598
4114	NC_021005	TAC	2	6	250225	250230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530598
4115	NC_021005	TGA	2	6	250269	250274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530598
4116	NC_021005	CCT	2	6	250278	250283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530598
4117	NC_021005	GTGG	2	8	250312	250319	0 %	25 %	75 %	0 %	480530598
4118	NC_021005	GTT	2	6	250387	250392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530598
4119	NC_021005	GAT	2	6	250431	250436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530598
4120	NC_021005	ACC	2	6	250457	250462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530598
4121	NC_021005	GTG	2	6	250463	250468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530598
4122	NC_021005	CTT	2	6	250509	250514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530598
4123	NC_021005	GCCA	2	8	250548	250555	25 %	0 %	25 %	50 %	480530598
4124	NC_021005	GTT	2	6	250579	250584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530598
4125	NC_021005	GAT	2	6	250591	250596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530598
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4129	NC_021005	TC	3	6	250819	250824	0 %	50 %	0 %	50 %	480530598
4130	NC_021005	TGC	2	6	250866	250871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530598
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4132	NC_021005	AGA	2	6	250950	250955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530598
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4147	NC_021005	A	6	6	252635	252640	100 %	0 %	0 %	0 %	480530599
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4237	NC_021005	AACG	2	8	259816	259823	50 %	0 %	25 %	25 %	480530604
4238	NC_021005	A	6	6	259885	259890	100 %	0 %	0 %	0 %	480530604
4239	NC_021005	CAGA	2	8	260146	260153	50 %	0 %	25 %	25 %	480530605
4240	NC_021005	CA	3	6	260308	260313	50 %	0 %	0 %	50 %	480530605
4241	NC_021005	GATGGT	2	12	260482	260493	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480530605
4242	NC_021005	TTTTG	2	10	260539	260548	0 %	80 %	20 %	0 %	480530605
4243	NC_021005	ATG	2	6	260624	260629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530605
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4245	NC_021005	CTG	2	6	260792	260797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530605
4246	NC_021005	TCTT	2	8	260839	260846	0 %	75 %	0 %	25 %	480530605
4247	NC_021005	ATA	2	6	260951	260956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530605
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4360	NC_021005	GTA	2	6	267833	267838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530608
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4487	NC_021005	A	6	6	274419	274424	100 %	0 %	0 %	0 %	480530612
4488	NC_021005	GCG	2	6	274582	274587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480530612
4489	NC_021005	TAT	2	6	274603	274608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530612
4490	NC_021005	CTAT	2	8	274634	274641	25 %	50 %	0 %	25 %	480530612
4491	NC_021005	GGA	2	6	274677	274682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530612
4492	NC_021005	GAA	2	6	274774	274779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530612
4493	NC_021005	GAT	2	6	274824	274829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530612
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4496	NC_021005	TGGT	2	8	275222	275229	0 %	50 %	50 %	0 %	480530612
4497	NC_021005	CT	4	8	275291	275298	0 %	50 %	0 %	50 %	480530612
4498	NC_021005	GTCAGT	2	12	275315	275326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480530612
4499	NC_021005	CCTT	2	8	275441	275448	0 %	50 %	0 %	50 %	480530612
4500	NC_021005	GAA	2	6	275542	275547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530612

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