MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021005	GAA	2	6	216437	216442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530553
3502	NC_021005	A	6	6	216534	216539	100 %	0 %	0 %	0 %	480530553
3503	NC_021005	GAG	2	6	216560	216565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530553
3504	NC_021005	ATCA	2	8	216708	216715	50 %	25 %	0 %	25 %	480530553
3505	NC_021005	ACTTA	2	10	216740	216749	40 %	40 %	0 %	20 %	480530553
3506	NC_021005	CAAA	2	8	217015	217022	75 %	0 %	0 %	25 %	480530554
3507	NC_021005	A	7	7	217020	217026	100 %	0 %	0 %	0 %	480530554
3508	NC_021005	AC	3	6	217215	217220	50 %	0 %	0 %	50 %	480530554
3509	NC_021005	A	6	6	217252	217257	100 %	0 %	0 %	0 %	480530554
3510	NC_021005	TGA	2	6	217270	217275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530554
3511	NC_021005	GTG	2	6	217291	217296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530554
3512	NC_021005	A	6	6	217557	217562	100 %	0 %	0 %	0 %	480530555
3513	NC_021005	GTT	2	6	217635	217640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530555
3514	NC_021005	CAA	2	6	217718	217723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530555
3515	NC_021005	TGT	2	6	217847	217852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530555
3516	NC_021005	TAAAGG	2	12	217871	217882	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480530555
3517	NC_021005	ACC	2	6	217945	217950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530555
3518	NC_021005	GTC	2	6	217951	217956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530555
3519	NC_021005	GTG	2	6	218023	218028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530555
3520	NC_021005	GTT	2	6	218064	218069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530555
3521	NC_021005	CAG	2	6	218140	218145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530555
3522	NC_021005	ATA	2	6	218159	218164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530555
3523	NC_021005	ATT	2	6	218201	218206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530556
3524	NC_021005	AAG	2	6	218221	218226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530556
3525	NC_021005	GTT	2	6	218235	218240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530556
3526	NC_021005	ATC	2	6	218295	218300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530556
3527	NC_021005	AC	3	6	218328	218333	50 %	0 %	0 %	50 %	480530556
3528	NC_021005	GGT	2	6	218361	218366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530556
3529	NC_021005	CAC	2	6	218425	218430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530556
3530	NC_021005	GTG	4	12	218437	218448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530556
3531	NC_021005	TCG	2	6	218501	218506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530556
3532	NC_021005	CTG	2	6	218593	218598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530556
3533	NC_021005	GCA	2	6	218616	218621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530556
3534	NC_021005	GAA	2	6	218655	218660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530556
3535	NC_021005	CTT	2	6	218760	218765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530556
3536	NC_021005	CA	3	6	218768	218773	50 %	0 %	0 %	50 %	480530556
3537	NC_021005	AGC	2	6	218774	218779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530556
3538	NC_021005	GAG	2	6	218793	218798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530556
3539	NC_021005	ATG	2	6	218820	218825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530557
3540	NC_021005	A	6	6	218831	218836	100 %	0 %	0 %	0 %	480530557
3541	NC_021005	TCA	2	6	218841	218846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530557
3542	NC_021005	CA	3	6	218907	218912	50 %	0 %	0 %	50 %	480530557
3543	NC_021005	CAAG	2	8	218923	218930	50 %	0 %	25 %	25 %	480530557
3544	NC_021005	GCT	2	6	218939	218944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530557
3545	NC_021005	A	6	6	219038	219043	100 %	0 %	0 %	0 %	480530557
3546	NC_021005	ATC	2	6	219047	219052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530557
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3548	NC_021005	TGC	2	6	219088	219093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530557
3549	NC_021005	AAT	2	6	219102	219107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530557
3550	NC_021005	CAA	3	9	219146	219154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530558
3551	NC_021005	CTT	2	6	219173	219178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530558
3552	NC_021005	CAA	2	6	219197	219202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530558
3553	NC_021005	TTG	2	6	219224	219229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530558
3554	NC_021005	AAC	3	9	219253	219261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530558
3555	NC_021005	GGT	2	6	219286	219291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530558
3556	NC_021005	TAA	2	6	219330	219335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530558
3557	NC_021005	GTT	2	6	219352	219357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530558
3558	NC_021005	TACAC	2	10	219404	219413	40 %	20 %	0 %	40 %	480530558
3559	NC_021005	CAT	2	6	219432	219437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530558
3560	NC_021005	GTG	3	9	219572	219580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530558
3561	NC_021005	TGC	2	6	219591	219596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530558
3562	NC_021005	AAC	2	6	219716	219721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530558
3563	NC_021005	GGT	3	9	219820	219828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530558
3564	NC_021005	TCGT	2	8	219932	219939	0 %	50 %	25 %	25 %	480530558
3565	NC_021005	ATA	2	6	219954	219959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530558
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3569	NC_021005	A	6	6	220109	220114	100 %	0 %	0 %	0 %	480530559
3570	NC_021005	ACG	2	6	220131	220136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530559
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3572	NC_021005	TTA	2	6	220149	220154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530559
3573	NC_021005	GACG	2	8	220217	220224	25 %	0 %	50 %	25 %	480530559
3574	NC_021005	AAG	2	6	220248	220253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530559
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3576	NC_021005	GCAATC	2	12	220459	220470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480530560
3577	NC_021005	CAAA	2	8	220484	220491	75 %	0 %	0 %	25 %	480530560
3578	NC_021005	GCT	2	6	220492	220497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530560
3579	NC_021005	ATC	2	6	220501	220506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530560
3580	NC_021005	TTTGG	2	10	220549	220558	0 %	60 %	40 %	0 %	480530560
3581	NC_021005	GTA	2	6	220573	220578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530560
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3587	NC_021005	GGT	2	6	220945	220950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530561
3588	NC_021005	ACATCA	2	12	221006	221017	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480530561
3589	NC_021005	AAC	2	6	221027	221032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530561
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3592	NC_021005	GAA	2	6	221266	221271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530561
3593	NC_021005	TAC	2	6	221277	221282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530561
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3600	NC_021005	GTG	2	6	221546	221551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530562
3601	NC_021005	CA	3	6	221576	221581	50 %	0 %	0 %	50 %	480530562
3602	NC_021005	AAG	2	6	221843	221848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530563
3603	NC_021005	A	6	6	221875	221880	100 %	0 %	0 %	0 %	480530563
3604	NC_021005	GCT	2	6	221905	221910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530563
3605	NC_021005	AACA	2	8	221924	221931	75 %	0 %	0 %	25 %	480530563
3606	NC_021005	A	6	6	221950	221955	100 %	0 %	0 %	0 %	480530563
3607	NC_021005	ATA	2	6	221994	221999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530563
3608	NC_021005	AAT	2	6	222031	222036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530564
3609	NC_021005	TTG	2	6	222047	222052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530564
3610	NC_021005	GACAA	2	10	222076	222085	60 %	0 %	20 %	20 %	480530564
3611	NC_021005	ACC	2	6	222113	222118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530564
3612	NC_021005	ACT	2	6	222140	222145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530564
3613	NC_021005	A	6	6	222148	222153	100 %	0 %	0 %	0 %	480530564
3614	NC_021005	ATG	2	6	222164	222169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530564
3615	NC_021005	AAG	2	6	222185	222190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530564
3616	NC_021005	CGTA	2	8	222198	222205	25 %	25 %	25 %	25 %	480530564
3617	NC_021005	GTT	2	6	222256	222261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530564
3618	NC_021005	GAA	2	6	222262	222267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530564
3619	NC_021005	TCA	2	6	222272	222277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530564
3620	NC_021005	ACA	2	6	222342	222347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530565
3621	NC_021005	TGG	2	6	222382	222387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530565
3622	NC_021005	TGG	2	6	222451	222456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530565
3623	NC_021005	A	6	6	222464	222469	100 %	0 %	0 %	0 %	480530565
3624	NC_021005	GTT	2	6	222476	222481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530565
3625	NC_021005	TCGT	2	8	222492	222499	0 %	50 %	25 %	25 %	480530565
3626	NC_021005	TCG	2	6	222514	222519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530565
3627	NC_021005	GCA	2	6	222554	222559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530565
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3632	NC_021005	TGT	2	6	222816	222821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530566
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3637	NC_021005	ACA	2	6	223028	223033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530566
3638	NC_021005	A	6	6	223033	223038	100 %	0 %	0 %	0 %	480530566
3639	NC_021005	AGT	2	6	223118	223123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530567
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3644	NC_021005	GTG	2	6	223360	223365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530567
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3651	NC_021005	A	6	6	223683	223688	100 %	0 %	0 %	0 %	480530568
3652	NC_021005	TTG	2	6	223689	223694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530568
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3657	NC_021005	A	6	6	224334	224339	100 %	0 %	0 %	0 %	480530569
3658	NC_021005	ACAA	2	8	224360	224367	75 %	0 %	0 %	25 %	480530569
3659	NC_021005	A	6	6	224461	224466	100 %	0 %	0 %	0 %	480530569
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3739	NC_021005	CGT	2	6	228170	228175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530575
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3742	NC_021005	ACAGA	2	10	228366	228375	60 %	0 %	20 %	20 %	480530575
3743	NC_021005	AGC	2	6	228577	228582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530576
3744	NC_021005	AT	3	6	228682	228687	50 %	50 %	0 %	0 %	480530576
3745	NC_021005	GAT	2	6	228752	228757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530576
3746	NC_021005	ATC	2	6	228914	228919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530576
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3748	NC_021005	AGA	3	9	228976	228984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530576
3749	NC_021005	TAC	2	6	228986	228991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530576
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3752	NC_021005	ATG	2	6	229122	229127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530576
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3754	NC_021005	TTGAAG	2	12	229304	229315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530577
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3772	NC_021005	TGC	2	6	230338	230343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530579
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3853	NC_021005	GAA	2	6	234601	234606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530584
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3855	NC_021005	AG	3	6	234898	234903	50 %	0 %	50 %	0 %	480530585
3856	NC_021005	AAGAT	2	10	234924	234933	60 %	20 %	20 %	0 %	480530585
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3987	NC_021005	GTA	2	6	243340	243345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530594
3988	NC_021005	AGT	2	6	243351	243356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530594
3989	NC_021005	TAA	2	6	243387	243392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530594
3990	NC_021005	CAA	2	6	243448	243453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530594
3991	NC_021005	GCA	2	6	243523	243528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530594
3992	NC_021005	TGG	2	6	243767	243772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530594
3993	NC_021005	TTA	2	6	243799	243804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530594
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3995	NC_021005	TAAA	2	8	244133	244140	75 %	25 %	0 %	0 %	480530595
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3997	NC_021005	GA	3	6	244159	244164	50 %	0 %	50 %	0 %	480530595
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4000	NC_021005	GAAA	2	8	244236	244243	75 %	0 %	25 %	0 %	480530595

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