MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021005	AAGG	2	8	186228	186235	50 %	0 %	50 %	0 %	480530523
3002	NC_021005	T	6	6	186272	186277	0 %	100 %	0 %	0 %	480530523
3003	NC_021005	GAC	2	6	186332	186337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530523
3004	NC_021005	TAA	2	6	186416	186421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530523
3005	NC_021005	TAT	2	6	186527	186532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530523
3006	NC_021005	AGA	2	6	186894	186899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530524
3007	NC_021005	AATC	2	8	186919	186926	50 %	25 %	0 %	25 %	480530524
3008	NC_021005	AAG	2	6	186951	186956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530524
3009	NC_021005	AAAG	2	8	187003	187010	75 %	0 %	25 %	0 %	480530524
3010	NC_021005	GAA	2	6	187069	187074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530524
3011	NC_021005	ATG	2	6	187082	187087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530524
3012	NC_021005	GAT	2	6	187093	187098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530524
3013	NC_021005	GA	3	6	187165	187170	50 %	0 %	50 %	0 %	480530524
3014	NC_021005	GA	3	6	187299	187304	50 %	0 %	50 %	0 %	480530524
3015	NC_021005	AGC	2	6	187318	187323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530524
3016	NC_021005	AGA	2	6	187374	187379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530524
3017	NC_021005	TCT	2	6	187430	187435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530524
3018	NC_021005	CATC	2	8	187510	187517	25 %	25 %	0 %	50 %	480530524
3019	NC_021005	AGG	2	6	187520	187525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530524
3020	NC_021005	TCT	2	6	187563	187568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530524
3021	NC_021005	CCG	2	6	187602	187607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480530524
3022	NC_021005	GAT	2	6	187774	187779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530524
3023	NC_021005	TTGAG	2	10	188002	188011	20 %	40 %	40 %	0 %	480530524
3024	NC_021005	GCTT	2	8	188076	188083	0 %	50 %	25 %	25 %	480530524
3025	NC_021005	TTGA	2	8	188091	188098	25 %	50 %	25 %	0 %	480530524
3026	NC_021005	TTGA	2	8	188452	188459	25 %	50 %	25 %	0 %	480530525
3027	NC_021005	T	6	6	188470	188475	0 %	100 %	0 %	0 %	480530525
3028	NC_021005	CT	3	6	188479	188484	0 %	50 %	0 %	50 %	480530525
3029	NC_021005	GAT	2	6	188503	188508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530525
3030	NC_021005	AACC	2	8	188567	188574	50 %	0 %	0 %	50 %	480530525
3031	NC_021005	AGCC	2	8	188598	188605	25 %	0 %	25 %	50 %	480530525
3032	NC_021005	GAA	2	6	188614	188619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530525
3033	NC_021005	GA	3	6	188770	188775	50 %	0 %	50 %	0 %	480530525
3034	NC_021005	GTG	2	6	188787	188792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530525
3035	NC_021005	T	6	6	188881	188886	0 %	100 %	0 %	0 %	480530525
3036	NC_021005	GA	3	6	188996	189001	50 %	0 %	50 %	0 %	480530526
3037	NC_021005	TGA	2	6	189014	189019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530526
3038	NC_021005	TAGA	2	8	189168	189175	50 %	25 %	25 %	0 %	480530526
3039	NC_021005	ATC	2	6	189180	189185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530526
3040	NC_021005	T	6	6	189200	189205	0 %	100 %	0 %	0 %	480530526
3041	NC_021005	TCC	2	6	189286	189291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530526
3042	NC_021005	ATT	2	6	189691	189696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530527
3043	NC_021005	ATTGAG	2	12	189814	189825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530527
3044	NC_021005	AAG	2	6	189838	189843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530527
3045	NC_021005	A	6	6	189924	189929	100 %	0 %	0 %	0 %	480530527
3046	NC_021005	TTCGGA	2	12	189944	189955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480530527
3047	NC_021005	GTG	2	6	189968	189973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530527
3048	NC_021005	GCCTT	2	10	189976	189985	0 %	40 %	20 %	40 %	480530527
3049	NC_021005	CGG	2	6	190019	190024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480530527
3050	NC_021005	CG	4	8	190056	190063	0 %	0 %	50 %	50 %	480530527
3051	NC_021005	TG	3	6	190117	190122	0 %	50 %	50 %	0 %	480530527
3052	NC_021005	CAG	2	6	190277	190282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530527
3053	NC_021005	AAG	2	6	190336	190341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530527
3054	NC_021005	TCA	2	6	190439	190444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530527
3055	NC_021005	AAGC	2	8	190500	190507	50 %	0 %	25 %	25 %	480530527
3056	NC_021005	TGA	2	6	190622	190627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530527
3057	NC_021005	CTA	2	6	190767	190772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530527
3058	NC_021005	TGA	2	6	190836	190841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530527
3059	NC_021005	AG	3	6	190914	190919	50 %	0 %	50 %	0 %	480530527
3060	NC_021005	GAA	2	6	191002	191007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530527
3061	NC_021005	CAT	2	6	191088	191093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530527
3062	NC_021005	GCT	2	6	191104	191109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530527
3063	NC_021005	GAG	2	6	191128	191133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530527
3064	NC_021005	CAG	2	6	191167	191172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530527
3065	NC_021005	GAT	2	6	191209	191214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530527
3066	NC_021005	CT	3	6	191240	191245	0 %	50 %	0 %	50 %	480530527
3067	NC_021005	AGA	3	9	191322	191330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530527
3068	NC_021005	ATG	2	6	191419	191424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530527
3069	NC_021005	ATC	2	6	191450	191455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530527
3070	NC_021005	TGA	2	6	191460	191465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530527
3071	NC_021005	CTC	2	6	191482	191487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530527
3072	NC_021005	TACA	2	8	192144	192151	50 %	25 %	0 %	25 %	480530528
3073	NC_021005	CAT	2	6	192204	192209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530528
3074	NC_021005	T	6	6	192211	192216	0 %	100 %	0 %	0 %	480530528
3075	NC_021005	TC	3	6	192300	192305	0 %	50 %	0 %	50 %	480530528
3076	NC_021005	ATA	2	6	192330	192335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530528
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3078	NC_021005	CTA	2	6	192396	192401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530528
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3081	NC_021005	TAAA	2	8	192475	192482	75 %	25 %	0 %	0 %	480530529
3082	NC_021005	ATT	2	6	192571	192576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530529
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3087	NC_021005	ATA	2	6	192914	192919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530529
3088	NC_021005	GAT	2	6	192927	192932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530529
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3090	NC_021005	TAG	2	6	192984	192989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530529
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3093	NC_021005	ATC	2	6	193102	193107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530529
3094	NC_021005	TCA	2	6	193113	193118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530529
3095	NC_021005	CAT	2	6	193125	193130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530529
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3098	NC_021005	TG	3	6	193201	193206	0 %	50 %	50 %	0 %	480530529
3099	NC_021005	TTTC	2	8	193211	193218	0 %	75 %	0 %	25 %	480530529
3100	NC_021005	ACC	2	6	193225	193230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530529
3101	NC_021005	T	7	7	193231	193237	0 %	100 %	0 %	0 %	480530529
3102	NC_021005	AC	3	6	193298	193303	50 %	0 %	0 %	50 %	480530529
3103	NC_021005	TGT	2	6	193504	193509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530529
3104	NC_021005	GCT	2	6	193511	193516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530529
3105	NC_021005	GTC	2	6	193558	193563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530529
3106	NC_021005	AACAAG	2	12	193567	193578	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	480530529
3107	NC_021005	CTT	2	6	193605	193610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530529
3108	NC_021005	ATA	2	6	193666	193671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530530
3109	NC_021005	GTTT	2	8	193785	193792	0 %	75 %	25 %	0 %	480530530
3110	NC_021005	TG	3	6	193911	193916	0 %	50 %	50 %	0 %	480530530
3111	NC_021005	TTGAT	2	10	193917	193926	20 %	60 %	20 %	0 %	480530530
3112	NC_021005	ATC	2	6	193940	193945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530530
3113	NC_021005	T	7	7	193946	193952	0 %	100 %	0 %	0 %	480530530
3114	NC_021005	ACG	2	6	193992	193997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530530
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3116	NC_021005	TGA	2	6	194118	194123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530530
3117	NC_021005	ATT	2	6	194268	194273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530530
3118	NC_021005	TCACT	2	10	194292	194301	20 %	40 %	0 %	40 %	480530531
3119	NC_021005	AT	4	8	194429	194436	50 %	50 %	0 %	0 %	480530531
3120	NC_021005	TCA	2	6	194444	194449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530531
3121	NC_021005	TGT	2	6	194456	194461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530531
3122	NC_021005	C	6	6	194489	194494	0 %	0 %	0 %	100 %	480530531
3123	NC_021005	T	6	6	194566	194571	0 %	100 %	0 %	0 %	480530531
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3241	NC_021005	TGG	2	6	201914	201919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530538
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3245	NC_021005	TGTC	2	8	202078	202085	0 %	50 %	25 %	25 %	480530538
3246	NC_021005	GGC	2	6	202092	202097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480530538
3247	NC_021005	ACTTGG	2	12	202147	202158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480530538
3248	NC_021005	CAT	2	6	202190	202195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530538
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3250	NC_021005	AAT	2	6	202242	202247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530538
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3283	NC_021005	GCAG	2	8	204357	204364	25 %	0 %	50 %	25 %	480530539
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3367	NC_021005	ACCG	2	8	208790	208797	25 %	0 %	25 %	50 %	480530546
3368	NC_021005	ATT	2	6	208944	208949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530546
3369	NC_021005	GAT	2	6	208953	208958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530546
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3371	NC_021005	GAT	2	6	208998	209003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530546
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3381	NC_021005	TCA	2	6	209579	209584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530547
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3491	NC_021005	ATG	2	6	215910	215915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530552
3492	NC_021005	AGT	2	6	216068	216073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530552
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3494	NC_021005	AG	3	6	216121	216126	50 %	0 %	50 %	0 %	480530552
3495	NC_021005	GAA	2	6	216130	216135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530552
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