MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021005	TGG	2	6	58899	58904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530415
1002	NC_021005	TA	3	6	58988	58993	50 %	50 %	0 %	0 %	480530416
1003	NC_021005	GCA	2	6	59035	59040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530416
1004	NC_021005	AAT	2	6	59083	59088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530416
1005	NC_021005	TCT	2	6	59093	59098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530416
1006	NC_021005	TTA	2	6	59171	59176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530416
1007	NC_021005	AGA	2	6	59225	59230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530416
1008	NC_021005	ATGT	2	8	59317	59324	25 %	50 %	25 %	0 %	480530416
1009	NC_021005	GTT	2	6	59354	59359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530416
1010	NC_021005	GATT	2	8	59401	59408	25 %	50 %	25 %	0 %	480530416
1011	NC_021005	AGGTTG	2	12	59563	59574	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480530417
1012	NC_021005	GT	3	6	59593	59598	0 %	50 %	50 %	0 %	480530417
1013	NC_021005	GGA	2	6	59678	59683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530417
1014	NC_021005	GAG	2	6	59826	59831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530417
1015	NC_021005	CAG	2	6	59838	59843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530417
1016	NC_021005	CCAG	2	8	59942	59949	25 %	0 %	25 %	50 %	480530417
1017	NC_021005	ATT	2	6	59958	59963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530417
1018	NC_021005	TCCA	2	8	59967	59974	25 %	25 %	0 %	50 %	480530417
1019	NC_021005	CAT	2	6	59978	59983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530417
1020	NC_021005	AAG	2	6	60103	60108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530417
1021	NC_021005	TGG	2	6	60142	60147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530417
1022	NC_021005	CAC	2	6	60177	60182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530417
1023	NC_021005	GGC	2	6	60258	60263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480530417
1024	NC_021005	AGA	2	6	60299	60304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530417
1025	NC_021005	TCC	2	6	60327	60332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530417
1026	NC_021005	TAC	2	6	60419	60424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530417
1027	NC_021005	CTG	2	6	60520	60525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530417
1028	NC_021005	GTG	2	6	60526	60531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530417
1029	NC_021005	GA	3	6	60646	60651	50 %	0 %	50 %	0 %	480530417
1030	NC_021005	GCT	2	6	60690	60695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530417
1031	NC_021005	GGT	2	6	61071	61076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530418
1032	NC_021005	TTCG	2	8	61096	61103	0 %	50 %	25 %	25 %	480530418
1033	NC_021005	CAA	2	6	61119	61124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530418
1034	NC_021005	AG	3	6	61134	61139	50 %	0 %	50 %	0 %	480530418
1035	NC_021005	CTT	2	6	61244	61249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530418
1036	NC_021005	AGA	2	6	61265	61270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530418
1037	NC_021005	TCT	2	6	62421	62426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530419
1038	NC_021005	GA	3	6	62506	62511	50 %	0 %	50 %	0 %	480530419
1039	NC_021005	GAA	2	6	62526	62531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530419
1040	NC_021005	TGT	2	6	62651	62656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530419
1041	NC_021005	TGC	2	6	62783	62788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530419
1042	NC_021005	CTC	2	6	62836	62841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530419
1043	NC_021005	ATT	2	6	62851	62856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530419
1044	NC_021005	CGT	2	6	62862	62867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530419
1045	NC_021005	TGGT	2	8	62872	62879	0 %	50 %	50 %	0 %	480530419
1046	NC_021005	TAT	2	6	62963	62968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530419
1047	NC_021005	CGT	2	6	62976	62981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530419
1048	NC_021005	CAT	2	6	63017	63022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530419
1049	NC_021005	TTGA	2	8	63051	63058	25 %	50 %	25 %	0 %	480530419
1050	NC_021005	TGAT	2	8	63064	63071	25 %	50 %	25 %	0 %	480530419
1051	NC_021005	TTCT	2	8	63154	63161	0 %	75 %	0 %	25 %	480530419
1052	NC_021005	GTT	2	6	63207	63212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530419
1053	NC_021005	ATCT	2	8	63222	63229	25 %	50 %	0 %	25 %	480530419
1054	NC_021005	AGA	2	6	63233	63238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530419
1055	NC_021005	TGAT	2	8	63244	63251	25 %	50 %	25 %	0 %	480530419
1056	NC_021005	CGTA	2	8	63296	63303	25 %	25 %	25 %	25 %	480530419
1057	NC_021005	A	7	7	63345	63351	100 %	0 %	0 %	0 %	480530419
1058	NC_021005	T	6	6	63826	63831	0 %	100 %	0 %	0 %	480530420
1059	NC_021005	GCTG	2	8	63874	63881	0 %	25 %	50 %	25 %	480530420
1060	NC_021005	AGA	2	6	63897	63902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530420
1061	NC_021005	CTTC	2	8	63948	63955	0 %	50 %	0 %	50 %	480530420
1062	NC_021005	TTC	2	6	64037	64042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530420
1063	NC_021005	TCC	2	6	64074	64079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530420
1064	NC_021005	CAG	2	6	64100	64105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530420
1065	NC_021005	TTG	2	6	64152	64157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530420
1066	NC_021005	T	6	6	64419	64424	0 %	100 %	0 %	0 %	480530421
1067	NC_021005	TGAT	2	8	64466	64473	25 %	50 %	25 %	0 %	480530421
1068	NC_021005	A	6	6	64475	64480	100 %	0 %	0 %	0 %	480530421
1069	NC_021005	TGA	2	6	64484	64489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530421
1070	NC_021005	AAT	2	6	64504	64509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530421
1071	NC_021005	T	6	6	64625	64630	0 %	100 %	0 %	0 %	480530421
1072	NC_021005	AATCA	2	10	64699	64708	60 %	20 %	0 %	20 %	480530421
1073	NC_021005	A	6	6	65005	65010	100 %	0 %	0 %	0 %	480530422
1074	NC_021005	TTA	2	6	65011	65016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530422
1075	NC_021005	TTGA	2	8	65017	65024	25 %	50 %	25 %	0 %	480530422
1076	NC_021005	TCT	2	6	65029	65034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530422
1077	NC_021005	T	6	6	65050	65055	0 %	100 %	0 %	0 %	480530422
1078	NC_021005	CAG	2	6	65065	65070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530422
1079	NC_021005	TTG	2	6	65143	65148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530422
1080	NC_021005	TGG	2	6	65174	65179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530422
1081	NC_021005	GAC	2	6	65196	65201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530422
1082	NC_021005	GGT	2	6	65233	65238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530422
1083	NC_021005	TGA	2	6	65253	65258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530422
1084	NC_021005	CAT	2	6	65346	65351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530422
1085	NC_021005	AGCAG	2	10	65370	65379	40 %	0 %	40 %	20 %	480530422
1086	NC_021005	GGT	2	6	65445	65450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530422
1087	NC_021005	GAA	2	6	65509	65514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530422
1088	NC_021005	ATA	2	6	65573	65578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530422
1089	NC_021005	TCA	2	6	65699	65704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530422
1090	NC_021005	CGATTG	2	12	65762	65773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480530422
1091	NC_021005	GTC	2	6	65871	65876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530422
1092	NC_021005	TTG	2	6	65909	65914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530422
1093	NC_021005	TTGG	2	8	65995	66002	0 %	50 %	50 %	0 %	480530422
1094	NC_021005	A	6	6	66086	66091	100 %	0 %	0 %	0 %	480530422
1095	NC_021005	AAG	2	6	66115	66120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530422
1096	NC_021005	CCT	2	6	66192	66197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530422
1097	NC_021005	GGA	2	6	66207	66212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530422
1098	NC_021005	ACTT	2	8	66250	66257	25 %	50 %	0 %	25 %	480530422
1099	NC_021005	TGA	3	9	66261	66269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530422
1100	NC_021005	TTG	2	6	66344	66349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530422
1101	NC_021005	CTT	2	6	66409	66414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530422
1102	NC_021005	AAGA	2	8	66478	66485	75 %	0 %	25 %	0 %	480530422
1103	NC_021005	CTTG	2	8	66489	66496	0 %	50 %	25 %	25 %	480530422
1104	NC_021005	GCTG	2	8	66552	66559	0 %	25 %	50 %	25 %	480530422
1105	NC_021005	GAG	2	6	66562	66567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530422
1106	NC_021005	CAG	2	6	66665	66670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530422
1107	NC_021005	GGA	2	6	66927	66932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530422
1108	NC_021005	TGA	2	6	67080	67085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530422
1109	NC_021005	TAA	2	6	67164	67169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530422
1110	NC_021005	GTG	2	6	67255	67260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530422
1111	NC_021005	GCA	2	6	67396	67401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530422
1112	NC_021005	GGT	2	6	67450	67455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530422
1113	NC_021005	A	6	6	67531	67536	100 %	0 %	0 %	0 %	480530422
1114	NC_021005	AAAC	2	8	67543	67550	75 %	0 %	0 %	25 %	480530422
1115	NC_021005	GAA	2	6	67555	67560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530422
1116	NC_021005	TAAA	2	8	67623	67630	75 %	25 %	0 %	0 %	480530422
1117	NC_021005	TGG	2	6	67787	67792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530423
1118	NC_021005	GAA	2	6	67807	67812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530423
1119	NC_021005	ATC	2	6	67861	67866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530423
1120	NC_021005	GGC	2	6	67881	67886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480530423
1121	NC_021005	TCG	2	6	67965	67970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530423
1122	NC_021005	T	6	6	68024	68029	0 %	100 %	0 %	0 %	480530423
1123	NC_021005	TGG	2	6	68079	68084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530423
1124	NC_021005	TGA	2	6	68088	68093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530423
1125	NC_021005	TGA	2	6	68099	68104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530423
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