MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021005	AAGA	2	8	31196	31203	75 %	0 %	25 %	0 %	480530379
502	NC_021005	AGG	2	6	31209	31214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530379
503	NC_021005	TAT	2	6	31264	31269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530380
504	NC_021005	GAA	2	6	31284	31289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530380
505	NC_021005	ACCA	2	8	31304	31311	50 %	0 %	0 %	50 %	480530380
506	NC_021005	TCA	2	6	31314	31319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530380
507	NC_021005	CTTAT	2	10	31406	31415	20 %	60 %	0 %	20 %	480530381
508	NC_021005	AAC	2	6	31429	31434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530381
509	NC_021005	AAG	2	6	31435	31440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530381
510	NC_021005	TG	3	6	31507	31512	0 %	50 %	50 %	0 %	480530381
511	NC_021005	GAA	2	6	31530	31535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530381
512	NC_021005	TGAA	2	8	31549	31556	50 %	25 %	25 %	0 %	480530381
513	NC_021005	GA	3	6	31579	31584	50 %	0 %	50 %	0 %	480530381
514	NC_021005	TC	3	6	31606	31611	0 %	50 %	0 %	50 %	480530381
515	NC_021005	ATG	2	6	31615	31620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530381
516	NC_021005	AAG	2	6	31669	31674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530381
517	NC_021005	AGCT	2	8	31681	31688	25 %	25 %	25 %	25 %	480530381
518	NC_021005	AAC	2	6	31731	31736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530381
519	NC_021005	TTA	2	6	31831	31836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530381
520	NC_021005	TGA	2	6	31852	31857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530381
521	NC_021005	GAT	2	6	31929	31934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530381
522	NC_021005	A	6	6	32041	32046	100 %	0 %	0 %	0 %	480530381
523	NC_021005	ACAA	2	8	32121	32128	75 %	0 %	0 %	25 %	480530381
524	NC_021005	GAT	2	6	32422	32427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530382
525	NC_021005	ATC	2	6	32447	32452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530382
526	NC_021005	GAC	2	6	32508	32513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530382
527	NC_021005	AGG	2	6	32562	32567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530382
528	NC_021005	AAT	2	6	32570	32575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530382
529	NC_021005	GAA	2	6	32771	32776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530383
530	NC_021005	AAT	2	6	32778	32783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530383
531	NC_021005	A	6	6	32812	32817	100 %	0 %	0 %	0 %	480530383
532	NC_021005	TTA	2	6	32818	32823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530383
533	NC_021005	GAA	2	6	32865	32870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530383
534	NC_021005	TTG	2	6	33102	33107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530384
535	NC_021005	GTC	2	6	33135	33140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530384
536	NC_021005	TGG	2	6	33177	33182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530384
537	NC_021005	AGA	2	6	33217	33222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530384
538	NC_021005	GAT	2	6	33402	33407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530385
539	NC_021005	A	6	6	33421	33426	100 %	0 %	0 %	0 %	480530385
540	NC_021005	AGA	2	6	33453	33458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530385
541	NC_021005	AGA	2	6	33534	33539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530385
542	NC_021005	TGA	2	6	33579	33584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530385
543	NC_021005	CTA	2	6	33611	33616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530385
544	NC_021005	GTTG	2	8	33620	33627	0 %	50 %	50 %	0 %	480530385
545	NC_021005	TGA	2	6	33645	33650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530385
546	NC_021005	GGA	2	6	33709	33714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530385
547	NC_021005	A	6	6	33743	33748	100 %	0 %	0 %	0 %	480530386
548	NC_021005	GAA	2	6	33759	33764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530386
549	NC_021005	AAT	2	6	33766	33771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530386
550	NC_021005	TGAT	2	8	33830	33837	25 %	50 %	25 %	0 %	480530386
551	NC_021005	A	6	6	33976	33981	100 %	0 %	0 %	0 %	480530387
552	NC_021005	CGA	2	6	33987	33992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530387
553	NC_021005	AAG	2	6	34056	34061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530387
554	NC_021005	GAT	2	6	34153	34158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530387
555	NC_021005	ATT	2	6	34192	34197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530387
556	NC_021005	GAA	2	6	34276	34281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530387
557	NC_021005	CAGAA	2	10	34286	34295	60 %	0 %	20 %	20 %	480530387
558	NC_021005	CAT	2	6	34510	34515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530388
559	NC_021005	TTTTG	2	10	34536	34545	0 %	80 %	20 %	0 %	480530388
560	NC_021005	AGG	2	6	34551	34556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530388
561	NC_021005	ATG	2	6	34590	34595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530388
562	NC_021005	GAATG	2	10	34625	34634	40 %	20 %	40 %	0 %	480530388
563	NC_021005	TAT	2	6	34640	34645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530388
564	NC_021005	TCA	2	6	34653	34658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530388
565	NC_021005	GA	3	6	34738	34743	50 %	0 %	50 %	0 %	480530388
566	NC_021005	AAGA	2	8	34790	34797	75 %	0 %	25 %	0 %	480530388
567	NC_021005	GAG	2	6	34801	34806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530388
568	NC_021005	TCA	2	6	34828	34833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530388
569	NC_021005	GAGC	2	8	34880	34887	25 %	0 %	50 %	25 %	480530388
570	NC_021005	AGC	2	6	34906	34911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530388
571	NC_021005	GAA	2	6	34913	34918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530388
572	NC_021005	CA	3	6	34939	34944	50 %	0 %	0 %	50 %	480530388
573	NC_021005	ACA	2	6	34977	34982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530388
574	NC_021005	TCA	2	6	35024	35029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530388
575	NC_021005	AGCA	2	8	35061	35068	50 %	0 %	25 %	25 %	480530388
576	NC_021005	TGA	2	6	35074	35079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530388
577	NC_021005	AAG	2	6	35517	35522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530389
578	NC_021005	A	6	6	35688	35693	100 %	0 %	0 %	0 %	480530389
579	NC_021005	AATC	2	8	35729	35736	50 %	25 %	0 %	25 %	480530389
580	NC_021005	A	7	7	35754	35760	100 %	0 %	0 %	0 %	480530389
581	NC_021005	A	7	7	35762	35768	100 %	0 %	0 %	0 %	480530389
582	NC_021005	T	6	6	35780	35785	0 %	100 %	0 %	0 %	480530389
583	NC_021005	TGA	3	9	36212	36220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530390
584	NC_021005	TC	3	6	36229	36234	0 %	50 %	0 %	50 %	480530390
585	NC_021005	GTA	2	6	36241	36246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530390
586	NC_021005	AAG	2	6	36251	36256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530390
587	NC_021005	AAG	3	9	36301	36309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530390
588	NC_021005	GAA	2	6	36377	36382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530391
589	NC_021005	TGC	2	6	36403	36408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530391
590	NC_021005	T	6	6	36415	36420	0 %	100 %	0 %	0 %	480530391
591	NC_021005	GATG	2	8	36448	36455	25 %	25 %	50 %	0 %	480530391
592	NC_021005	TGG	2	6	36462	36467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530391
593	NC_021005	CAA	2	6	36506	36511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530391
594	NC_021005	GAT	2	6	36515	36520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530391
595	NC_021005	TATC	2	8	36531	36538	25 %	50 %	0 %	25 %	480530391
596	NC_021005	TAC	2	6	36602	36607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530391
597	NC_021005	AAG	2	6	36633	36638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530391
598	NC_021005	TGCT	2	8	36648	36655	0 %	50 %	25 %	25 %	480530391
599	NC_021005	GAA	2	6	36658	36663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530391
600	NC_021005	CTG	2	6	36681	36686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530391
601	NC_021005	CAAG	2	8	36757	36764	50 %	0 %	25 %	25 %	480530391
602	NC_021005	T	6	6	36781	36786	0 %	100 %	0 %	0 %	480530391
603	NC_021005	ATA	2	6	36834	36839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530391
604	NC_021005	TGA	2	6	36871	36876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530391
605	NC_021005	TTCT	2	8	36880	36887	0 %	75 %	0 %	25 %	480530391
606	NC_021005	ATG	2	6	36906	36911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530391
607	NC_021005	ATC	2	6	36944	36949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530391
608	NC_021005	CA	3	6	36962	36967	50 %	0 %	0 %	50 %	480530391
609	NC_021005	A	7	7	36998	37004	100 %	0 %	0 %	0 %	480530391
610	NC_021005	TGA	2	6	37123	37128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530391
611	NC_021005	TCATCT	2	12	37137	37148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	480530391
612	NC_021005	AATC	2	8	37157	37164	50 %	25 %	0 %	25 %	480530391
613	NC_021005	GTG	2	6	37178	37183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530391
614	NC_021005	GAA	2	6	37259	37264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530391
615	NC_021005	ATGA	2	8	37277	37284	50 %	25 %	25 %	0 %	480530391
616	NC_021005	TGA	2	6	37360	37365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530391
617	NC_021005	AGA	2	6	37402	37407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530391
618	NC_021005	TGG	2	6	37435	37440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530391
619	NC_021005	GCT	3	9	37472	37480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530391
620	NC_021005	CT	3	6	37479	37484	0 %	50 %	0 %	50 %	480530391
621	NC_021005	CA	3	6	37528	37533	50 %	0 %	0 %	50 %	480530391
622	NC_021005	TTC	2	6	37538	37543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530391
623	NC_021005	A	6	6	37562	37567	100 %	0 %	0 %	0 %	480530391
624	NC_021005	ATG	2	6	37572	37577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530391
625	NC_021005	GGTT	2	8	37610	37617	0 %	50 %	50 %	0 %	480530391
626	NC_021005	ATG	2	6	37647	37652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530391
627	NC_021005	TCA	2	6	37668	37673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530391
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629	NC_021005	GAT	2	6	37768	37773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530391
630	NC_021005	T	6	6	37788	37793	0 %	100 %	0 %	0 %	480530391
631	NC_021005	TG	3	6	37880	37885	0 %	50 %	50 %	0 %	480530391
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638	NC_021005	GA	3	6	38686	38691	50 %	0 %	50 %	0 %	480530393
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751	NC_021005	GAA	2	6	43739	43744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530402
752	NC_021005	TC	3	6	43995	44000	0 %	50 %	0 %	50 %	480530403
753	NC_021005	T	7	7	44013	44019	0 %	100 %	0 %	0 %	480530403
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