MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 1684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020568	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470223735
2	NC_020568	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470223736
3	NC_020568	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470223736
4	NC_020568	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470223736
5	NC_020568	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470223738
6	NC_020568	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	470223739
7	NC_020568	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	470223740
8	NC_020568	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	470223741
9	NC_020568	GCAAG	2	10	16624	16633	40 %	0 %	40 %	20 %	470223744
10	NC_020568	TTTGA	2	10	16783	16792	20 %	60 %	20 %	0 %	470223744
11	NC_020568	TCAAT	2	10	18920	18929	40 %	40 %	0 %	20 %	470223746
12	NC_020568	AGTTA	2	10	22098	22107	40 %	40 %	20 %	0 %	470223747
13	NC_020568	ATGTA	2	10	23656	23665	40 %	40 %	20 %	0 %	470223748
14	NC_020568	ACCAA	2	10	26266	26275	60 %	0 %	0 %	40 %	470223750
15	NC_020568	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470223750
16	NC_020568	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470223751
17	NC_020568	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470223751
18	NC_020568	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470223752
19	NC_020568	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470223752
20	NC_020568	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470223754
21	NC_020568	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470223754
22	NC_020568	TATGA	2	10	32680	32689	40 %	40 %	20 %	0 %	470223754
23	NC_020568	CATTA	2	10	33910	33919	40 %	40 %	0 %	20 %	470223755
24	NC_020568	AAATG	2	10	35554	35563	60 %	20 %	20 %	0 %	470223757
25	NC_020568	ATTTT	2	10	35635	35644	20 %	80 %	0 %	0 %	470223757
26	NC_020568	TGAAT	2	10	37413	37422	40 %	40 %	20 %	0 %	470223758
27	NC_020568	TTGGT	2	10	37455	37464	0 %	60 %	40 %	0 %	470223758
28	NC_020568	AATAT	2	10	37523	37532	60 %	40 %	0 %	0 %	470223758
29	NC_020568	TTCGT	2	10	37734	37743	0 %	60 %	20 %	20 %	470223758
30	NC_020568	AAATT	2	10	40193	40202	60 %	40 %	0 %	0 %	470223759
31	NC_020568	TTGAA	2	10	42222	42231	40 %	40 %	20 %	0 %	470223761
32	NC_020568	TTGAA	2	10	42568	42577	40 %	40 %	20 %	0 %	470223761
33	NC_020568	ATATT	2	10	45239	45248	40 %	60 %	0 %	0 %	470223763
34	NC_020568	GAATT	2	10	46156	46165	40 %	40 %	20 %	0 %	470223764
35	NC_020568	TCAGT	2	10	48057	48066	20 %	40 %	20 %	20 %	470223765
36	NC_020568	GGCCA	2	10	53064	53073	20 %	0 %	40 %	40 %	470223768
37	NC_020568	TAAAT	2	10	58774	58783	60 %	40 %	0 %	0 %	470223772
38	NC_020568	ATATT	2	10	60644	60653	40 %	60 %	0 %	0 %	470223773
39	NC_020568	AATGT	2	10	61369	61378	40 %	40 %	20 %	0 %	470223774
40	NC_020568	TAGTA	2	10	64917	64926	40 %	40 %	20 %	0 %	470223775
41	NC_020568	TACTA	2	10	66276	66285	40 %	40 %	0 %	20 %	470223776
42	NC_020568	ATCAA	2	10	69026	69035	60 %	20 %	0 %	20 %	470223778
43	NC_020568	TAATA	2	10	70858	70867	60 %	40 %	0 %	0 %	470223779
44	NC_020568	TATAT	2	10	73794	73803	40 %	60 %	0 %	0 %	470223781
45	NC_020568	CTAAA	2	10	75434	75443	60 %	20 %	0 %	20 %	470223782
46	NC_020568	CAAAA	2	10	75465	75474	80 %	0 %	0 %	20 %	470223782
47	NC_020568	GATAT	2	10	80157	80166	40 %	40 %	20 %	0 %	470223785
48	NC_020568	ATATA	2	10	80980	80989	60 %	40 %	0 %	0 %	470223786
49	NC_020568	GATAT	2	10	81814	81823	40 %	40 %	20 %	0 %	470223787
50	NC_020568	AATAA	2	10	82444	82453	80 %	20 %	0 %	0 %	470223788
51	NC_020568	ATTGC	2	10	84424	84433	20 %	40 %	20 %	20 %	470223790
52	NC_020568	TCATT	2	10	84612	84621	20 %	60 %	0 %	20 %	470223790
53	NC_020568	CATGG	2	10	85828	85837	20 %	20 %	40 %	20 %	470223790
54	NC_020568	TGAAA	2	10	86496	86505	60 %	20 %	20 %	0 %	470223791
55	NC_020568	TCAAT	2	10	86868	86877	40 %	40 %	0 %	20 %	470223791
56	NC_020568	GTATT	2	10	87357	87366	20 %	60 %	20 %	0 %	470223792
57	NC_020568	ATTAA	2	10	90099	90108	60 %	40 %	0 %	0 %	470223793
58	NC_020568	AGATA	2	10	93218	93227	60 %	20 %	20 %	0 %	470223795
59	NC_020568	TAAAA	2	10	93778	93787	80 %	20 %	0 %	0 %	470223795
60	NC_020568	ATACA	2	10	94208	94217	60 %	20 %	0 %	20 %	470223796
61	NC_020568	AAAGA	2	10	95411	95420	80 %	0 %	20 %	0 %	470223796
62	NC_020568	ATGTT	2	10	96896	96905	20 %	60 %	20 %	0 %	470223798
63	NC_020568	TTGCG	2	10	97467	97476	0 %	40 %	40 %	20 %	470223798
64	NC_020568	AGTTA	2	10	99027	99036	40 %	40 %	20 %	0 %	470223799
65	NC_020568	GGTGA	2	10	102822	102831	20 %	20 %	60 %	0 %	470223802
66	NC_020568	GAAAA	2	10	106259	106268	80 %	0 %	20 %	0 %	470223805
67	NC_020568	TTATT	2	10	106426	106435	20 %	80 %	0 %	0 %	470223805
68	NC_020568	AATCA	2	10	109448	109457	60 %	20 %	0 %	20 %	470223807
69	NC_020568	ATTTT	2	10	110146	110155	20 %	80 %	0 %	0 %	470223808
70	NC_020568	ATCAA	2	10	110173	110182	60 %	20 %	0 %	20 %	470223808
71	NC_020568	ATCAC	2	10	111406	111415	40 %	20 %	0 %	40 %	470223809
72	NC_020568	AACGA	2	10	112083	112092	60 %	0 %	20 %	20 %	470223809
73	NC_020568	ACACA	2	10	114139	114148	60 %	0 %	0 %	40 %	470223811
74	NC_020568	GACAA	2	10	115290	115299	60 %	0 %	20 %	20 %	470223812
75	NC_020568	ATTAC	2	10	117474	117483	40 %	40 %	0 %	20 %	470223814
76	NC_020568	TATCT	2	10	118134	118143	20 %	60 %	0 %	20 %	470223815
77	NC_020568	ATACG	2	10	120567	120576	40 %	20 %	20 %	20 %	470223817
78	NC_020568	TTATA	2	10	121225	121234	40 %	60 %	0 %	0 %	470223818
79	NC_020568	TTTTA	2	10	122023	122032	20 %	80 %	0 %	0 %	470223818
80	NC_020568	GTATT	2	10	122536	122545	20 %	60 %	20 %	0 %	470223819
81	NC_020568	AATAA	2	10	123129	123138	80 %	20 %	0 %	0 %	470223819
82	NC_020568	TACGC	2	10	123396	123405	20 %	20 %	20 %	40 %	470223819
83	NC_020568	TCCCT	2	10	126202	126211	0 %	40 %	0 %	60 %	470223822
84	NC_020568	GCTTT	2	10	128436	128445	0 %	60 %	20 %	20 %	470223824
85	NC_020568	TAATT	2	10	128521	128530	40 %	60 %	0 %	0 %	470223824
86	NC_020568	ATACT	2	10	129702	129711	40 %	40 %	0 %	20 %	470223826
87	NC_020568	TAATA	2	10	130866	130875	60 %	40 %	0 %	0 %	470223827
88	NC_020568	ATTTT	2	10	131857	131866	20 %	80 %	0 %	0 %	470223828
89	NC_020568	TTGTA	2	10	134062	134071	20 %	60 %	20 %	0 %	470223830
90	NC_020568	TGCAA	2	10	135067	135076	40 %	20 %	20 %	20 %	470223831
91	NC_020568	ATATG	2	10	137085	137094	40 %	40 %	20 %	0 %	470223832
92	NC_020568	TATGA	2	10	138765	138774	40 %	40 %	20 %	0 %	470223834
93	NC_020568	AATAT	2	10	139771	139780	60 %	40 %	0 %	0 %	470223834
94	NC_020568	TGGTA	2	10	141668	141677	20 %	40 %	40 %	0 %	470223835
95	NC_020568	CGAAC	2	10	141758	141767	40 %	0 %	20 %	40 %	470223835
96	NC_020568	TTCAA	2	10	143783	143792	40 %	40 %	0 %	20 %	470223836
97	NC_020568	ACATC	2	10	144626	144635	40 %	20 %	0 %	40 %	470223838
98	NC_020568	TAATT	2	10	146849	146858	40 %	60 %	0 %	0 %	470223839
99	NC_020568	AGAGA	2	10	149875	149884	60 %	0 %	40 %	0 %	470223842
100	NC_020568	AATCC	2	10	150231	150240	40 %	20 %	0 %	40 %	470223842
101	NC_020568	TGAAT	2	10	158987	158996	40 %	40 %	20 %	0 %	470223851
102	NC_020568	TTCAT	2	10	163225	163234	20 %	60 %	0 %	20 %	470223853
103	NC_020568	TTTAC	2	10	163608	163617	20 %	60 %	0 %	20 %	470223853
104	NC_020568	TTATT	2	10	164822	164831	20 %	80 %	0 %	0 %	470223854
105	NC_020568	GGATT	2	10	165810	165819	20 %	40 %	40 %	0 %	470223855
106	NC_020568	TAACT	2	10	168847	168856	40 %	40 %	0 %	20 %	470223858
107	NC_020568	TTTAT	2	10	171755	171764	20 %	80 %	0 %	0 %	470223860
108	NC_020568	ATGCA	2	10	173358	173367	40 %	20 %	20 %	20 %	470223861
109	NC_020568	TATGA	2	10	180604	180613	40 %	40 %	20 %	0 %	470223862
110	NC_020568	GTGAA	2	10	180638	180647	40 %	20 %	40 %	0 %	470223862
111	NC_020568	TTAAT	2	10	181081	181090	40 %	60 %	0 %	0 %	470223863
112	NC_020568	ATATA	2	10	183911	183920	60 %	40 %	0 %	0 %	470223866
113	NC_020568	AAGAT	2	10	187640	187649	60 %	20 %	20 %	0 %	470223868
114	NC_020568	CGTTT	2	10	188088	188097	0 %	60 %	20 %	20 %	470223869
115	NC_020568	AAATG	2	10	190568	190577	60 %	20 %	20 %	0 %	470223871
116	NC_020568	GTAAA	2	10	190732	190741	60 %	20 %	20 %	0 %	470223871
117	NC_020568	TTTAA	2	10	190752	190761	40 %	60 %	0 %	0 %	470223871
118	NC_020568	TTTGC	2	10	191268	191277	0 %	60 %	20 %	20 %	470223871
119	NC_020568	TTGTT	2	10	192274	192283	0 %	80 %	20 %	0 %	470223871
120	NC_020568	CAAAA	2	10	195486	195495	80 %	0 %	0 %	20 %	470223874
121	NC_020568	AGTTT	2	10	196022	196031	20 %	60 %	20 %	0 %	470223874
122	NC_020568	CAACA	2	10	196252	196261	60 %	0 %	0 %	40 %	470223874
123	NC_020568	AAAAT	2	10	196880	196889	80 %	20 %	0 %	0 %	470223875
124	NC_020568	AAATG	2	10	197289	197298	60 %	20 %	20 %	0 %	470223875
125	NC_020568	TTGAA	2	10	198563	198572	40 %	40 %	20 %	0 %	470223876
126	NC_020568	ATTAT	2	10	200519	200528	40 %	60 %	0 %	0 %	470223876
127	NC_020568	AATAG	2	10	201285	201294	60 %	20 %	20 %	0 %	470223877
128	NC_020568	ATACA	2	10	201922	201931	60 %	20 %	0 %	20 %	470223878
129	NC_020568	GTGTT	2	10	204607	204616	0 %	60 %	40 %	0 %	470223880
130	NC_020568	TAATT	2	10	207111	207120	40 %	60 %	0 %	0 %	470223882
131	NC_020568	TCTAT	2	10	207244	207253	20 %	60 %	0 %	20 %	470223882
132	NC_020568	ATAAA	2	10	207359	207368	80 %	20 %	0 %	0 %	470223882
133	NC_020568	AAAGA	2	10	208014	208023	80 %	0 %	20 %	0 %	470223883
134	NC_020568	CATGT	2	10	209219	209228	20 %	40 %	20 %	20 %	470223884
135	NC_020568	TTGAA	2	10	209294	209303	40 %	40 %	20 %	0 %	470223884
136	NC_020568	AATTG	2	10	210619	210628	40 %	40 %	20 %	0 %	470223884
137	NC_020568	TTTTC	2	10	210868	210877	0 %	80 %	0 %	20 %	470223885
138	NC_020568	TCAAT	2	10	211307	211316	40 %	40 %	0 %	20 %	470223885
139	NC_020568	TTATT	2	10	211340	211349	20 %	80 %	0 %	0 %	470223885
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246	NC_020568	AGCGA	2	10	383770	383779	40 %	0 %	40 %	20 %	470224010
247	NC_020568	TAGCG	2	10	388665	388674	20 %	20 %	40 %	20 %	470224014
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249	NC_020568	TCTAT	2	10	390429	390438	20 %	60 %	0 %	20 %	470224015
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251	NC_020568	ATTTT	2	10	395280	395289	20 %	80 %	0 %	0 %	470224018
252	NC_020568	TAAGT	2	10	396466	396475	40 %	40 %	20 %	0 %	470224019
253	NC_020568	TTAAG	2	10	397341	397350	40 %	40 %	20 %	0 %	470224019
254	NC_020568	CATGC	2	10	398088	398097	20 %	20 %	20 %	40 %	470224020
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256	NC_020568	CAATA	2	10	401020	401029	60 %	20 %	0 %	20 %	470224022
257	NC_020568	TTACT	2	10	402104	402113	20 %	60 %	0 %	20 %	470224023
258	NC_020568	CGATT	2	10	402526	402535	20 %	40 %	20 %	20 %	470224023
259	NC_020568	GCTGT	2	10	403632	403641	0 %	40 %	40 %	20 %	470224024
260	NC_020568	CTGCA	2	10	406557	406566	20 %	20 %	20 %	40 %	470224027
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262	NC_020568	TTAAA	2	10	408357	408366	60 %	40 %	0 %	0 %	470224029
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