MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020568	TCA	2	6	176999	177004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223861
3502	NC_020568	GAA	2	6	177007	177012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223861
3503	NC_020568	CAAT	2	8	177029	177036	50 %	25 %	0 %	25 %	470223861
3504	NC_020568	TATGAT	2	12	177096	177107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223861
3505	NC_020568	GGA	2	6	177165	177170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470223861
3506	NC_020568	AAAT	2	8	177225	177232	75 %	25 %	0 %	0 %	470223861
3507	NC_020568	ATGA	2	8	177292	177299	50 %	25 %	25 %	0 %	470223861
3508	NC_020568	GCG	2	6	177424	177429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470223861
3509	NC_020568	TA	3	6	177460	177465	50 %	50 %	0 %	0 %	470223861
3510	NC_020568	GGA	2	6	177510	177515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470223861
3511	NC_020568	TTGAAA	2	12	177548	177559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223861
3512	NC_020568	TTG	2	6	177599	177604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223861
3513	NC_020568	ATG	2	6	177626	177631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223861
3514	NC_020568	TTG	2	6	177745	177750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223861
3515	NC_020568	TGCA	2	8	177758	177765	25 %	25 %	25 %	25 %	470223861
3516	NC_020568	TTG	2	6	177852	177857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223861
3517	NC_020568	AG	3	6	177892	177897	50 %	0 %	50 %	0 %	470223861
3518	NC_020568	ACA	2	6	177921	177926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223861
3519	NC_020568	TAA	2	6	177933	177938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223861
3520	NC_020568	GTA	2	6	177977	177982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223861
3521	NC_020568	AT	3	6	178050	178055	50 %	50 %	0 %	0 %	470223861
3522	NC_020568	TCA	2	6	178109	178114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223861
3523	NC_020568	CAT	2	6	178129	178134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223861
3524	NC_020568	TAT	2	6	178197	178202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223861
3525	NC_020568	AT	3	6	178275	178280	50 %	50 %	0 %	0 %	470223861
3526	NC_020568	AAT	2	6	178315	178320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223861
3527	NC_020568	GTG	2	6	178349	178354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223861
3528	NC_020568	GAA	2	6	178397	178402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223861
3529	NC_020568	TGA	2	6	178443	178448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223861
3530	NC_020568	TGT	2	6	178491	178496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223861
3531	NC_020568	AT	3	6	178523	178528	50 %	50 %	0 %	0 %	470223861
3532	NC_020568	TTA	2	6	178536	178541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223861
3533	NC_020568	CAA	2	6	178552	178557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223861
3534	NC_020568	TAC	2	6	178668	178673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223861
3535	NC_020568	ACA	2	6	178698	178703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223861
3536	NC_020568	TAA	2	6	178707	178712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223861
3537	NC_020568	TTG	2	6	178751	178756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223861
3538	NC_020568	ATG	2	6	178784	178789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223861
3539	NC_020568	GAT	2	6	178801	178806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223861
3540	NC_020568	TGG	2	6	178818	178823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223861
3541	NC_020568	CAT	2	6	178873	178878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223861
3542	NC_020568	CAA	2	6	178945	178950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223861
3543	NC_020568	T	6	6	179082	179087	0 %	100 %	0 %	0 %	470223861
3544	NC_020568	TGA	2	6	179180	179185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223861
3545	NC_020568	ATT	2	6	179198	179203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223861
3546	NC_020568	AGA	2	6	179208	179213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223861
3547	NC_020568	ATG	2	6	179224	179229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223861
3548	NC_020568	TTG	2	6	179249	179254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223861
3549	NC_020568	GAT	2	6	179272	179277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223861
3550	NC_020568	GTT	2	6	179278	179283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223861
3551	NC_020568	ATT	2	6	179305	179310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223861
3552	NC_020568	TGA	4	12	179340	179351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223861
3553	NC_020568	CAA	2	6	179401	179406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223861
3554	NC_020568	CAT	2	6	179407	179412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223861
3555	NC_020568	AT	3	6	179422	179427	50 %	50 %	0 %	0 %	470223861
3556	NC_020568	AGA	2	6	179469	179474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223861
3557	NC_020568	ACT	2	6	179511	179516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223861
3558	NC_020568	AAT	2	6	179575	179580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223861
3559	NC_020568	AATG	2	8	179679	179686	50 %	25 %	25 %	0 %	470223861
3560	NC_020568	AC	3	6	179792	179797	50 %	0 %	0 %	50 %	470223861
3561	NC_020568	TAA	2	6	179826	179831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223861
3562	NC_020568	AAC	3	9	179963	179971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223861
3563	NC_020568	GATA	2	8	179979	179986	50 %	25 %	25 %	0 %	470223861
3564	NC_020568	AACATT	2	12	179988	179999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470223861
3565	NC_020568	AAT	2	6	180003	180008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223861
3566	NC_020568	TAAC	2	8	180038	180045	50 %	25 %	0 %	25 %	470223861
3567	NC_020568	AT	3	6	180069	180074	50 %	50 %	0 %	0 %	470223861
3568	NC_020568	TAAG	2	8	180090	180097	50 %	25 %	25 %	0 %	470223861
3569	NC_020568	GAA	2	6	180154	180159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223862
3570	NC_020568	A	6	6	180187	180192	100 %	0 %	0 %	0 %	470223862
3571	NC_020568	TTA	2	6	180286	180291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223862
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3573	NC_020568	AAAG	2	8	180550	180557	75 %	0 %	25 %	0 %	470223862
3574	NC_020568	ATTG	2	8	180567	180574	25 %	50 %	25 %	0 %	470223862
3575	NC_020568	TATGA	2	10	180604	180613	40 %	40 %	20 %	0 %	470223862
3576	NC_020568	ATCA	2	8	180629	180636	50 %	25 %	0 %	25 %	470223862
3577	NC_020568	GTGAA	2	10	180638	180647	40 %	20 %	40 %	0 %	470223862
3578	NC_020568	ATTT	2	8	180657	180664	25 %	75 %	0 %	0 %	470223862
3579	NC_020568	A	6	6	180718	180723	100 %	0 %	0 %	0 %	470223862
3580	NC_020568	AGT	2	6	180745	180750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223862
3581	NC_020568	TTAAT	2	10	181081	181090	40 %	60 %	0 %	0 %	470223863
3582	NC_020568	TGT	2	6	181109	181114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223863
3583	NC_020568	TCA	2	6	181131	181136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223863
3584	NC_020568	CA	3	6	181190	181195	50 %	0 %	0 %	50 %	470223863
3585	NC_020568	AAT	2	6	181235	181240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223863
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3587	NC_020568	T	6	6	181294	181299	0 %	100 %	0 %	0 %	470223863
3588	NC_020568	AAT	2	6	181315	181320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223863
3589	NC_020568	ACT	2	6	181411	181416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223863
3590	NC_020568	TTG	2	6	181426	181431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223863
3591	NC_020568	TTG	2	6	181844	181849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223864
3592	NC_020568	CAA	2	6	181853	181858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223864
3593	NC_020568	ATT	2	6	181863	181868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223864
3594	NC_020568	AT	3	6	181996	182001	50 %	50 %	0 %	0 %	470223864
3595	NC_020568	TGA	2	6	182002	182007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223864
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3597	NC_020568	TGA	2	6	182045	182050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223864
3598	NC_020568	ATG	3	9	182093	182101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223864
3599	NC_020568	CAT	2	6	182147	182152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223864
3600	NC_020568	TGA	2	6	182174	182179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223864
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3602	NC_020568	CTA	2	6	182339	182344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223864
3603	NC_020568	GT	3	6	182371	182376	0 %	50 %	50 %	0 %	470223864
3604	NC_020568	TAA	2	6	182462	182467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223864
3605	NC_020568	TGT	2	6	182501	182506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223864
3606	NC_020568	TGT	2	6	182525	182530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223864
3607	NC_020568	TAA	2	6	182531	182536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223864
3608	NC_020568	GATG	2	8	182539	182546	25 %	25 %	50 %	0 %	470223864
3609	NC_020568	CCA	2	6	182566	182571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223864
3610	NC_020568	ATG	2	6	182621	182626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223865
3611	NC_020568	TCA	2	6	182749	182754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223865
3612	NC_020568	TTG	2	6	182984	182989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223865
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3614	NC_020568	TAA	2	6	183192	183197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223865
3615	NC_020568	TGA	2	6	183199	183204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223865
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3617	NC_020568	AGCA	2	8	183243	183250	50 %	0 %	25 %	25 %	470223865
3618	NC_020568	ACC	2	6	183294	183299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223865
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3992	NC_020568	ATG	2	6	201515	201520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223877
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