MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_020568	TGA	2	6	126100	126105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223822
2503	NC_020568	TTTG	2	8	126179	126186	0 %	75 %	25 %	0 %	470223822
2504	NC_020568	TCCCT	2	10	126202	126211	0 %	40 %	0 %	60 %	470223822
2505	NC_020568	CT	3	6	126218	126223	0 %	50 %	0 %	50 %	470223822
2506	NC_020568	GC	3	6	126286	126291	0 %	0 %	50 %	50 %	470223822
2507	NC_020568	TA	3	6	126354	126359	50 %	50 %	0 %	0 %	470223822
2508	NC_020568	TAT	2	6	126363	126368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223822
2509	NC_020568	GGA	2	6	126640	126645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470223823
2510	NC_020568	CA	3	6	126666	126671	50 %	0 %	0 %	50 %	470223823
2511	NC_020568	AATG	2	8	126679	126686	50 %	25 %	25 %	0 %	470223823
2512	NC_020568	GAT	2	6	126761	126766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223823
2513	NC_020568	A	6	6	126824	126829	100 %	0 %	0 %	0 %	470223823
2514	NC_020568	GGTATG	2	12	126848	126859	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470223823
2515	NC_020568	AATT	2	8	126885	126892	50 %	50 %	0 %	0 %	470223823
2516	NC_020568	A	6	6	126908	126913	100 %	0 %	0 %	0 %	470223823
2517	NC_020568	ATG	2	6	126963	126968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223823
2518	NC_020568	ATT	2	6	126971	126976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223823
2519	NC_020568	CAA	2	6	127010	127015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223823
2520	NC_020568	CTT	2	6	127047	127052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223823
2521	NC_020568	ATT	2	6	127057	127062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223823
2522	NC_020568	TCA	2	6	127102	127107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223823
2523	NC_020568	ACA	2	6	127151	127156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223823
2524	NC_020568	GT	3	6	127254	127259	0 %	50 %	50 %	0 %	470223823
2525	NC_020568	CAA	2	6	127293	127298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223823
2526	NC_020568	GAT	2	6	127360	127365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223823
2527	NC_020568	AAAG	2	8	127390	127397	75 %	0 %	25 %	0 %	470223824
2528	NC_020568	TAT	2	6	127410	127415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223824
2529	NC_020568	TGA	2	6	127477	127482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223824
2530	NC_020568	GTA	2	6	127553	127558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223824
2531	NC_020568	TATT	2	8	127596	127603	25 %	75 %	0 %	0 %	470223824
2532	NC_020568	ATT	2	6	127634	127639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223824
2533	NC_020568	TAT	2	6	127684	127689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223824
2534	NC_020568	GCT	2	6	127706	127711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223824
2535	NC_020568	AT	3	6	127730	127735	50 %	50 %	0 %	0 %	470223824
2536	NC_020568	AGA	2	6	127764	127769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223824
2537	NC_020568	ATTT	2	8	127834	127841	25 %	75 %	0 %	0 %	470223824
2538	NC_020568	GTA	2	6	127886	127891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223824
2539	NC_020568	ATT	2	6	127915	127920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223824
2540	NC_020568	ATA	2	6	127932	127937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223824
2541	NC_020568	TTG	2	6	127959	127964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223824
2542	NC_020568	ACA	2	6	127991	127996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223824
2543	NC_020568	TTA	2	6	128007	128012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223824
2544	NC_020568	TA	3	6	128028	128033	50 %	50 %	0 %	0 %	470223824
2545	NC_020568	TA	3	6	128070	128075	50 %	50 %	0 %	0 %	470223824
2546	NC_020568	TAAA	2	8	128100	128107	75 %	25 %	0 %	0 %	470223824
2547	NC_020568	TTTA	2	8	128140	128147	25 %	75 %	0 %	0 %	470223824
2548	NC_020568	ATC	2	6	128217	128222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223824
2549	NC_020568	ACA	2	6	128234	128239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223824
2550	NC_020568	TTA	2	6	128246	128251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223824
2551	NC_020568	TA	3	6	128261	128266	50 %	50 %	0 %	0 %	470223824
2552	NC_020568	TTG	2	6	128277	128282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223824
2553	NC_020568	ATT	2	6	128342	128347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223824
2554	NC_020568	GCTTT	2	10	128436	128445	0 %	60 %	20 %	20 %	470223824
2555	NC_020568	TAATT	2	10	128521	128530	40 %	60 %	0 %	0 %	470223824
2556	NC_020568	TGC	2	6	128563	128568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223824
2557	NC_020568	ATG	2	6	128607	128612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223824
2558	NC_020568	TAT	2	6	128632	128637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223824
2559	NC_020568	ATT	2	6	128642	128647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223824
2560	NC_020568	AAAT	2	8	128714	128721	75 %	25 %	0 %	0 %	470223824
2561	NC_020568	AGTA	2	8	128793	128800	50 %	25 %	25 %	0 %	470223825
2562	NC_020568	AT	3	6	128814	128819	50 %	50 %	0 %	0 %	470223825
2563	NC_020568	ATC	2	6	128869	128874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223825
2564	NC_020568	TG	3	6	128908	128913	0 %	50 %	50 %	0 %	470223825
2565	NC_020568	GCA	2	6	128935	128940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223825
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2567	NC_020568	TCA	2	6	129071	129076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223825
2568	NC_020568	TGA	2	6	129105	129110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223825
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2570	NC_020568	CA	3	6	129154	129159	50 %	0 %	0 %	50 %	470223825
2571	NC_020568	ATT	2	6	129169	129174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223825
2572	NC_020568	TTG	2	6	129184	129189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223825
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2574	NC_020568	CGTA	2	8	129351	129358	25 %	25 %	25 %	25 %	470223825
2575	NC_020568	AGA	2	6	129363	129368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223825
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2586	NC_020568	TAT	2	6	130068	130073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223826
2587	NC_020568	GGT	2	6	130180	130185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223826
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2589	NC_020568	ATG	2	6	130223	130228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223826
2590	NC_020568	TGA	2	6	130286	130291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223826
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2593	NC_020568	TAG	2	6	130334	130339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223826
2594	NC_020568	TCG	2	6	130362	130367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223826
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2598	NC_020568	CAG	2	6	130463	130468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223826
2599	NC_020568	GA	3	6	130509	130514	50 %	0 %	50 %	0 %	470223826
2600	NC_020568	AT	3	6	130515	130520	50 %	50 %	0 %	0 %	470223826
2601	NC_020568	GGT	2	6	130552	130557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223826
2602	NC_020568	TAC	2	6	130575	130580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223826
2603	NC_020568	TAATA	2	10	130866	130875	60 %	40 %	0 %	0 %	470223827
2604	NC_020568	GTG	2	6	130916	130921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223827
2605	NC_020568	ACC	2	6	130929	130934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223827
2606	NC_020568	AGGC	2	8	131006	131013	25 %	0 %	50 %	25 %	470223827
2607	NC_020568	CAC	2	6	131060	131065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223827
2608	NC_020568	AAAT	2	8	131246	131253	75 %	25 %	0 %	0 %	470223827
2609	NC_020568	ATT	2	6	131289	131294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223827
2610	NC_020568	GCG	2	6	131329	131334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470223827
2611	NC_020568	TAA	2	6	131382	131387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223827
2612	NC_020568	TA	3	6	131403	131408	50 %	50 %	0 %	0 %	470223827
2613	NC_020568	AAT	2	6	131431	131436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223827
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2617	NC_020568	TAAA	2	8	131671	131678	75 %	25 %	0 %	0 %	470223828
2618	NC_020568	ATA	2	6	131800	131805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223828
2619	NC_020568	ACA	2	6	131838	131843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223828
2620	NC_020568	ATTTT	2	10	131857	131866	20 %	80 %	0 %	0 %	470223828
2621	NC_020568	ATA	2	6	131929	131934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223828
2622	NC_020568	AAT	2	6	131942	131947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223828
2623	NC_020568	TGC	2	6	132017	132022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223828
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2743	NC_020568	A	6	6	138734	138739	100 %	0 %	0 %	0 %	470223834
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2991	NC_020568	GAT	2	6	150279	150284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223842
2992	NC_020568	ATT	2	6	150334	150339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223842
2993	NC_020568	GGA	2	6	150374	150379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470223842
2994	NC_020568	TA	3	6	150504	150509	50 %	50 %	0 %	0 %	470223843
2995	NC_020568	TAA	2	6	150578	150583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223843
2996	NC_020568	AC	3	6	150648	150653	50 %	0 %	0 %	50 %	470223843
2997	NC_020568	T	6	6	150654	150659	0 %	100 %	0 %	0 %	470223843
2998	NC_020568	TCA	2	6	150663	150668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223843
2999	NC_020568	T	6	6	150673	150678	0 %	100 %	0 %	0 %	470223843
3000	NC_020568	TAA	3	9	150683	150691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223843

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