MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020568	ATG	2	6	26348	26353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223750
502	NC_020568	TAA	2	6	26379	26384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223750
503	NC_020568	AAG	2	6	26402	26407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223750
504	NC_020568	TAT	2	6	26472	26477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223750
505	NC_020568	CCG	2	6	26487	26492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470223750
506	NC_020568	AGA	2	6	26547	26552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223750
507	NC_020568	CAT	2	6	26553	26558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223750
508	NC_020568	GAA	2	6	26608	26613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223750
509	NC_020568	AAT	2	6	26623	26628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223750
510	NC_020568	T	6	6	26634	26639	0 %	100 %	0 %	0 %	470223750
511	NC_020568	GAA	3	9	26653	26661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223750
512	NC_020568	AAC	3	9	26750	26758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223750
513	NC_020568	CGT	2	6	26773	26778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223750
514	NC_020568	TTG	2	6	26783	26788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223750
515	NC_020568	GAA	2	6	26851	26856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223750
516	NC_020568	GAA	2	6	26908	26913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223750
517	NC_020568	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470223750
518	NC_020568	TAA	2	6	27018	27023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223750
519	NC_020568	ATT	2	6	27025	27030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223750
520	NC_020568	ACA	2	6	27058	27063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223750
521	NC_020568	GGT	2	6	27325	27330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223750
522	NC_020568	ATCT	2	8	27417	27424	25 %	50 %	0 %	25 %	470223750
523	NC_020568	AAT	2	6	27470	27475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223750
524	NC_020568	TGA	2	6	27516	27521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223751
525	NC_020568	AT	3	6	27535	27540	50 %	50 %	0 %	0 %	470223751
526	NC_020568	AAG	2	6	27590	27595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223751
527	NC_020568	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470223751
528	NC_020568	ATT	2	6	27662	27667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223751
529	NC_020568	ATC	2	6	27681	27686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223751
530	NC_020568	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470223751
531	NC_020568	TCG	2	6	27772	27777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223751
532	NC_020568	TGA	2	6	27789	27794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223751
533	NC_020568	ATT	2	6	27820	27825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223751
534	NC_020568	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223751
535	NC_020568	ATG	2	6	27930	27935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223751
536	NC_020568	TGA	2	6	27937	27942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223751
537	NC_020568	AAC	2	6	27994	27999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223751
538	NC_020568	T	6	6	28018	28023	0 %	100 %	0 %	0 %	470223751
539	NC_020568	AGC	2	6	28033	28038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223751
540	NC_020568	A	6	6	28043	28048	100 %	0 %	0 %	0 %	470223751
541	NC_020568	ATC	2	6	28070	28075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223751
542	NC_020568	ACAA	2	8	28076	28083	75 %	0 %	0 %	25 %	470223751
543	NC_020568	ACG	2	6	28100	28105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223751
544	NC_020568	AATG	2	8	28180	28187	50 %	25 %	25 %	0 %	470223751
545	NC_020568	TCGT	2	8	28212	28219	0 %	50 %	25 %	25 %	470223751
546	NC_020568	GTG	2	6	28230	28235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223751
547	NC_020568	ACA	2	6	28245	28250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223751
548	NC_020568	ATA	2	6	28251	28256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223751
549	NC_020568	GAA	2	6	28340	28345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223751
550	NC_020568	TTA	2	6	28368	28373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223751
551	NC_020568	TGG	2	6	28381	28386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223751
552	NC_020568	AAT	2	6	28421	28426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223751
553	NC_020568	TAA	2	6	28477	28482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223751
554	NC_020568	TCG	2	6	28537	28542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223751
555	NC_020568	ATA	2	6	28581	28586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223751
556	NC_020568	AACA	2	8	28657	28664	75 %	0 %	0 %	25 %	470223751
557	NC_020568	ATG	2	6	28758	28763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223751
558	NC_020568	TAA	2	6	28879	28884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223752
559	NC_020568	CA	3	6	28896	28901	50 %	0 %	0 %	50 %	470223752
560	NC_020568	AAG	2	6	28941	28946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223752
561	NC_020568	TGG	2	6	29071	29076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223752
562	NC_020568	ATT	2	6	29080	29085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223752
563	NC_020568	GT	3	6	29160	29165	0 %	50 %	50 %	0 %	470223752
564	NC_020568	AATT	2	8	29194	29201	50 %	50 %	0 %	0 %	470223752
565	NC_020568	AGA	2	6	29281	29286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223752
566	NC_020568	CAAT	2	8	29309	29316	50 %	25 %	0 %	25 %	470223752
567	NC_020568	GATG	2	8	29317	29324	25 %	25 %	50 %	0 %	470223752
568	NC_020568	AAG	2	6	29351	29356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223752
569	NC_020568	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470223752
570	NC_020568	A	6	6	29414	29419	100 %	0 %	0 %	0 %	470223752
571	NC_020568	TGA	2	6	29422	29427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223752
572	NC_020568	TAC	2	6	29450	29455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223752
573	NC_020568	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470223752
574	NC_020568	TACT	2	8	29539	29546	25 %	50 %	0 %	25 %	470223752
575	NC_020568	ATA	2	6	29562	29567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223752
576	NC_020568	ATT	2	6	29576	29581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223752
577	NC_020568	GTA	2	6	30016	30021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223753
578	NC_020568	GAA	2	6	30096	30101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223753
579	NC_020568	GGCA	2	8	30238	30245	25 %	0 %	50 %	25 %	470223753
580	NC_020568	AAAG	2	8	30251	30258	75 %	0 %	25 %	0 %	470223753
581	NC_020568	ATG	2	6	30352	30357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223753
582	NC_020568	ATA	2	6	30385	30390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223753
583	NC_020568	AAG	2	6	30396	30401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223753
584	NC_020568	AAC	2	6	30535	30540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223753
585	NC_020568	GAAC	2	8	30695	30702	50 %	0 %	25 %	25 %	470223753
586	NC_020568	AAG	2	6	30721	30726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223753
587	NC_020568	AT	3	6	30765	30770	50 %	50 %	0 %	0 %	470223753
588	NC_020568	ATA	2	6	30967	30972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223754
589	NC_020568	TTA	2	6	31015	31020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223754
590	NC_020568	GTA	2	6	31117	31122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223754
591	NC_020568	CAA	2	6	31139	31144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223754
592	NC_020568	CAA	2	6	31153	31158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223754
593	NC_020568	CAA	2	6	31166	31171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223754
594	NC_020568	TCA	2	6	31182	31187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223754
595	NC_020568	GAA	2	6	31195	31200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223754
596	NC_020568	CAAC	2	8	31205	31212	50 %	0 %	0 %	50 %	470223754
597	NC_020568	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470223754
598	NC_020568	TGA	2	6	31239	31244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223754
599	NC_020568	CAG	2	6	31292	31297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223754
600	NC_020568	CAA	2	6	31301	31306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223754
601	NC_020568	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470223754
602	NC_020568	ACA	2	6	31335	31340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223754
603	NC_020568	CAC	2	6	31409	31414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223754
604	NC_020568	TGC	2	6	31422	31427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223754
605	NC_020568	ACA	3	9	31441	31449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223754
606	NC_020568	TACA	2	8	31460	31467	50 %	25 %	0 %	25 %	470223754
607	NC_020568	GAA	2	6	31492	31497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223754
608	NC_020568	GAA	2	6	31618	31623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223754
609	NC_020568	AATG	2	8	31635	31642	50 %	25 %	25 %	0 %	470223754
610	NC_020568	ATG	2	6	31652	31657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223754
611	NC_020568	CG	3	6	31768	31773	0 %	0 %	50 %	50 %	470223754
612	NC_020568	CAA	2	6	31784	31789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223754
613	NC_020568	ATT	2	6	31819	31824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223754
614	NC_020568	CAG	2	6	31910	31915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223754
615	NC_020568	ATG	2	6	31918	31923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223754
616	NC_020568	TGT	2	6	31950	31955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223754
617	NC_020568	GTG	2	6	32000	32005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223754
618	NC_020568	GAA	2	6	32043	32048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223754
619	NC_020568	ATG	2	6	32111	32116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223754
620	NC_020568	CAG	2	6	32297	32302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223754
621	NC_020568	TTA	2	6	32306	32311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223754
622	NC_020568	ATA	2	6	32318	32323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223754
623	NC_020568	GACT	2	8	32433	32440	25 %	25 %	25 %	25 %	470223754
624	NC_020568	TGG	2	6	32454	32459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223754
625	NC_020568	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470223754
626	NC_020568	CAA	2	6	32600	32605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223754
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