MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020568	T	6	6	281486	281491	0 %	100 %	0 %	0 %	470223933
5502	NC_020568	GTGC	2	8	281553	281560	0 %	25 %	50 %	25 %	470223933
5503	NC_020568	ACC	2	6	281645	281650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223933
5504	NC_020568	TAT	2	6	281762	281767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223933
5505	NC_020568	TTG	2	6	281811	281816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223933
5506	NC_020568	AGAATC	2	12	281831	281842	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470223933
5507	NC_020568	ATT	2	6	281888	281893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223933
5508	NC_020568	GCA	2	6	281904	281909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223933
5509	NC_020568	GT	3	6	281948	281953	0 %	50 %	50 %	0 %	470223933
5510	NC_020568	AGG	2	6	281974	281979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470223933
5511	NC_020568	AATA	2	8	281980	281987	75 %	25 %	0 %	0 %	470223933
5512	NC_020568	GAT	2	6	282005	282010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223934
5513	NC_020568	TTA	2	6	282041	282046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223934
5514	NC_020568	TGG	2	6	282055	282060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223934
5515	NC_020568	GAA	2	6	282065	282070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223934
5516	NC_020568	ACT	2	6	282109	282114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223934
5517	NC_020568	ATCA	2	8	282116	282123	50 %	25 %	0 %	25 %	470223934
5518	NC_020568	ATT	2	6	282215	282220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223934
5519	NC_020568	GTGC	2	8	282329	282336	0 %	25 %	50 %	25 %	470223934
5520	NC_020568	GAT	2	6	282350	282355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223934
5521	NC_020568	CAA	2	6	282446	282451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223934
5522	NC_020568	ATT	2	6	282455	282460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223934
5523	NC_020568	CA	3	6	282469	282474	50 %	0 %	0 %	50 %	470223934
5524	NC_020568	CATA	2	8	282490	282497	50 %	25 %	0 %	25 %	470223934
5525	NC_020568	ACA	2	6	282518	282523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223934
5526	NC_020568	AT	3	6	282586	282591	50 %	50 %	0 %	0 %	470223934
5527	NC_020568	CAA	2	6	282620	282625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223934
5528	NC_020568	AC	3	6	283298	283303	50 %	0 %	0 %	50 %	470223935
5529	NC_020568	ATT	2	6	283353	283358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223935
5530	NC_020568	A	6	6	283361	283366	100 %	0 %	0 %	0 %	470223935
5531	NC_020568	TCT	2	6	283376	283381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223935
5532	NC_020568	ATT	2	6	283474	283479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223935
5533	NC_020568	CTT	3	9	283482	283490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223935
5534	NC_020568	CAA	2	6	283499	283504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223935
5535	NC_020568	TA	3	6	283523	283528	50 %	50 %	0 %	0 %	470223935
5536	NC_020568	AGG	2	6	283569	283574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470223935
5537	NC_020568	TTA	2	6	283600	283605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223935
5538	NC_020568	ATT	2	6	283606	283611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223935
5539	NC_020568	ATG	2	6	283643	283648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223935
5540	NC_020568	AGC	2	6	283671	283676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223935
5541	NC_020568	GGT	2	6	283714	283719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223935
5542	NC_020568	CAT	2	6	283733	283738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223935
5543	NC_020568	ATT	2	6	283762	283767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223935
5544	NC_020568	TAA	2	6	283779	283784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223935
5545	NC_020568	CA	3	6	283849	283854	50 %	0 %	0 %	50 %	470223935
5546	NC_020568	AGA	2	6	283890	283895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223935
5547	NC_020568	GTT	2	6	283933	283938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223935
5548	NC_020568	TTC	2	6	283969	283974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223935
5549	NC_020568	TATT	2	8	284079	284086	25 %	75 %	0 %	0 %	470223936
5550	NC_020568	TGG	2	6	284179	284184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223936
5551	NC_020568	GTA	2	6	284216	284221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223936
5552	NC_020568	AAT	2	6	284303	284308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223936
5553	NC_020568	ATC	2	6	284331	284336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223936
5554	NC_020568	ATA	2	6	284364	284369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223936
5555	NC_020568	CAT	2	6	284390	284395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223936
5556	NC_020568	TAG	2	6	284422	284427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223936
5557	NC_020568	ATC	2	6	284433	284438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223936
5558	NC_020568	CTTA	2	8	284670	284677	25 %	50 %	0 %	25 %	470223936
5559	NC_020568	AATA	2	8	284944	284951	75 %	25 %	0 %	0 %	470223937
5560	NC_020568	GGT	2	6	284986	284991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223937
5561	NC_020568	TTG	2	6	285002	285007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223937
5562	NC_020568	ATG	2	6	285113	285118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223937
5563	NC_020568	ATTA	2	8	285177	285184	50 %	50 %	0 %	0 %	470223937
5564	NC_020568	AG	3	6	285201	285206	50 %	0 %	50 %	0 %	470223937
5565	NC_020568	AAGTAA	2	12	285254	285265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223937
5566	NC_020568	GTC	2	6	285299	285304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223937
5567	NC_020568	AAG	2	6	285317	285322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223937
5568	NC_020568	AG	3	6	285340	285345	50 %	0 %	50 %	0 %	470223937
5569	NC_020568	GAA	2	6	285382	285387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223937
5570	NC_020568	AGA	2	6	285462	285467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223937
5571	NC_020568	TCAT	2	8	285482	285489	25 %	50 %	0 %	25 %	470223937
5572	NC_020568	GTT	2	6	285573	285578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223937
5573	NC_020568	AT	3	6	285594	285599	50 %	50 %	0 %	0 %	470223937
5574	NC_020568	ACA	3	9	285600	285608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223937
5575	NC_020568	TTA	2	6	285635	285640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223937
5576	NC_020568	AATG	2	8	285675	285682	50 %	25 %	25 %	0 %	470223937
5577	NC_020568	TAA	2	6	285740	285745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223938
5578	NC_020568	GGT	2	6	285820	285825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223938
5579	NC_020568	GTG	2	6	285857	285862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223938
5580	NC_020568	TAT	2	6	285910	285915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223938
5581	NC_020568	ATC	2	6	285941	285946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223938
5582	NC_020568	TACG	2	8	285995	286002	25 %	25 %	25 %	25 %	470223938
5583	NC_020568	GAA	2	6	286054	286059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223938
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5585	NC_020568	TGT	2	6	286116	286121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223938
5586	NC_020568	TGG	2	6	286167	286172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223938
5587	NC_020568	ATT	2	6	286196	286201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223938
5588	NC_020568	ATAAAG	2	12	286235	286246	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470223938
5589	NC_020568	TAA	2	6	286275	286280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223938
5590	NC_020568	GAA	2	6	286354	286359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223938
5591	NC_020568	CAT	2	6	286378	286383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223938
5592	NC_020568	ATG	2	6	286501	286506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223938
5593	NC_020568	TTA	2	6	286563	286568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223938
5594	NC_020568	A	7	7	286582	286588	100 %	0 %	0 %	0 %	470223938
5595	NC_020568	ATG	2	6	286607	286612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223938
5596	NC_020568	AAG	2	6	286622	286627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223938
5597	NC_020568	GAC	2	6	286630	286635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223938
5598	NC_020568	CAG	2	6	286645	286650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223938
5599	NC_020568	TTA	2	6	286677	286682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223938
5600	NC_020568	ATG	2	6	286703	286708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223938
5601	NC_020568	TAC	2	6	286713	286718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223938
5602	NC_020568	ACA	2	6	286727	286732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223938
5603	NC_020568	GGT	2	6	286741	286746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223938
5604	NC_020568	TGA	2	6	286893	286898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223938
5605	NC_020568	ATG	2	6	286919	286924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223938
5606	NC_020568	CAG	2	6	286958	286963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223938
5607	NC_020568	GAA	2	6	287055	287060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223938
5608	NC_020568	AT	3	6	287074	287079	50 %	50 %	0 %	0 %	470223938
5609	NC_020568	ATG	2	6	287093	287098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223938
5610	NC_020568	A	6	6	287122	287127	100 %	0 %	0 %	0 %	470223938
5611	NC_020568	CAA	2	6	287146	287151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223938
5612	NC_020568	T	6	6	287677	287682	0 %	100 %	0 %	0 %	470223939
5613	NC_020568	T	7	7	287764	287770	0 %	100 %	0 %	0 %	470223939
5614	NC_020568	CAA	2	6	287799	287804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223939
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5616	NC_020568	GACATT	2	12	287926	287937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223939
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5619	NC_020568	TG	3	6	287966	287971	0 %	50 %	50 %	0 %	470223939
5620	NC_020568	GTA	2	6	288037	288042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223939
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5990	NC_020568	GAT	2	6	307695	307700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223953
5991	NC_020568	ATG	2	6	307723	307728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223953
5992	NC_020568	A	7	7	307739	307745	100 %	0 %	0 %	0 %	470223953
5993	NC_020568	CAAA	2	8	307788	307795	75 %	0 %	0 %	25 %	470223953
5994	NC_020568	AAGA	2	8	307818	307825	75 %	0 %	25 %	0 %	470223953
5995	NC_020568	TAA	2	6	307835	307840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223953
5996	NC_020568	CAAA	2	8	307855	307862	75 %	0 %	0 %	25 %	470223953
5997	NC_020568	ACT	2	6	307864	307869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223953
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5999	NC_020568	TGGA	2	8	307878	307885	25 %	25 %	50 %	0 %	470223953
6000	NC_020568	AGGACA	2	12	307889	307900	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470223953

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