MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020568	AAC	2	6	252616	252621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223913
5002	NC_020568	A	6	6	252624	252629	100 %	0 %	0 %	0 %	470223913
5003	NC_020568	AAT	3	9	252637	252645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223913
5004	NC_020568	GTT	2	6	252968	252973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223914
5005	NC_020568	AGC	2	6	253033	253038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223914
5006	NC_020568	TAA	2	6	253095	253100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223914
5007	NC_020568	ATTA	2	8	253153	253160	50 %	50 %	0 %	0 %	470223914
5008	NC_020568	ATC	2	6	253162	253167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223914
5009	NC_020568	TAT	2	6	253176	253181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223914
5010	NC_020568	TTA	2	6	253193	253198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223914
5011	NC_020568	T	6	6	253210	253215	0 %	100 %	0 %	0 %	470223914
5012	NC_020568	TCA	2	6	253319	253324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223914
5013	NC_020568	T	6	6	253354	253359	0 %	100 %	0 %	0 %	470223914
5014	NC_020568	GAC	2	6	253401	253406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223914
5015	NC_020568	TAA	2	6	253465	253470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223914
5016	NC_020568	TTTG	2	8	253491	253498	0 %	75 %	25 %	0 %	470223914
5017	NC_020568	AT	3	6	253517	253522	50 %	50 %	0 %	0 %	470223914
5018	NC_020568	ATGAT	2	10	253601	253610	40 %	40 %	20 %	0 %	470223914
5019	NC_020568	T	7	7	253638	253644	0 %	100 %	0 %	0 %	470223914
5020	NC_020568	AAG	2	6	253668	253673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223914
5021	NC_020568	ATT	2	6	253711	253716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223914
5022	NC_020568	TTA	2	6	253733	253738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223914
5023	NC_020568	TTA	2	6	253752	253757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223914
5024	NC_020568	ATC	2	6	253759	253764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223914
5025	NC_020568	ATT	2	6	253792	253797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223914
5026	NC_020568	TCT	2	6	253802	253807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223914
5027	NC_020568	TAA	2	6	253961	253966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223914
5028	NC_020568	TGA	2	6	254056	254061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223914
5029	NC_020568	T	7	7	254091	254097	0 %	100 %	0 %	0 %	470223914
5030	NC_020568	TGA	2	6	254204	254209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223914
5031	NC_020568	AAT	2	6	254258	254263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223914
5032	NC_020568	GCA	2	6	254270	254275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223914
5033	NC_020568	CTG	2	6	254394	254399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223914
5034	NC_020568	TTCAT	2	10	254426	254435	20 %	60 %	0 %	20 %	470223914
5035	NC_020568	ACC	2	6	255445	255450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223915
5036	NC_020568	TTC	2	6	255493	255498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223915
5037	NC_020568	GT	3	6	255529	255534	0 %	50 %	50 %	0 %	470223915
5038	NC_020568	TGT	2	6	255596	255601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223915
5039	NC_020568	CTA	2	6	255666	255671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223915
5040	NC_020568	CTT	2	6	255771	255776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223915
5041	NC_020568	TTG	2	6	255795	255800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223915
5042	NC_020568	TGT	2	6	255820	255825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223915
5043	NC_020568	T	7	7	255857	255863	0 %	100 %	0 %	0 %	470223915
5044	NC_020568	TTC	2	6	255967	255972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223915
5045	NC_020568	CAT	2	6	256051	256056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223915
5046	NC_020568	TTC	2	6	256144	256149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223915
5047	NC_020568	TAA	2	6	256177	256182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223915
5048	NC_020568	TAA	2	6	256263	256268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223915
5049	NC_020568	GTTT	2	8	256448	256455	0 %	75 %	25 %	0 %	470223915
5050	NC_020568	TTG	2	6	257146	257151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223916
5051	NC_020568	TCA	2	6	257161	257166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223916
5052	NC_020568	GAG	2	6	257191	257196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470223916
5053	NC_020568	CAA	2	6	257233	257238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223916
5054	NC_020568	ATG	2	6	257275	257280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223916
5055	NC_020568	TGC	2	6	257306	257311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223916
5056	NC_020568	TTG	2	6	257374	257379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223916
5057	NC_020568	ATT	2	6	257528	257533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223916
5058	NC_020568	AAGCG	2	10	257537	257546	40 %	0 %	40 %	20 %	470223916
5059	NC_020568	ATT	2	6	257580	257585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223916
5060	NC_020568	AAC	2	6	257662	257667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223916
5061	NC_020568	GCA	2	6	257718	257723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223916
5062	NC_020568	ATT	2	6	257730	257735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223916
5063	NC_020568	TTA	2	6	257753	257758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223916
5064	NC_020568	ATT	2	6	257834	257839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223916
5065	NC_020568	ATG	2	6	257851	257856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223916
5066	NC_020568	AAG	2	6	257857	257862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223916
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5068	NC_020568	TCA	2	6	257887	257892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223916
5069	NC_020568	CGT	2	6	257912	257917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223916
5070	NC_020568	ACG	2	6	257932	257937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223916
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5074	NC_020568	TTG	2	6	258577	258582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223917
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5076	NC_020568	TCT	2	6	258596	258601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223917
5077	NC_020568	AAATT	2	10	258617	258626	60 %	40 %	0 %	0 %	470223917
5078	NC_020568	CA	3	6	258668	258673	50 %	0 %	0 %	50 %	470223917
5079	NC_020568	GTTT	2	8	258700	258707	0 %	75 %	25 %	0 %	470223917
5080	NC_020568	CAT	2	6	258796	258801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223917
5081	NC_020568	AAG	2	6	258818	258823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223917
5082	NC_020568	ACAA	2	8	258851	258858	75 %	0 %	0 %	25 %	470223917
5083	NC_020568	AAACT	2	10	258860	258869	60 %	20 %	0 %	20 %	470223917
5084	NC_020568	AGTG	2	8	258901	258908	25 %	25 %	50 %	0 %	470223917
5085	NC_020568	CCG	2	6	258926	258931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470223917
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5087	NC_020568	TG	3	6	258958	258963	0 %	50 %	50 %	0 %	470223917
5088	NC_020568	CAC	2	6	258981	258986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223917
5089	NC_020568	CAT	2	6	258997	259002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223917
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5091	NC_020568	AC	3	6	259032	259037	50 %	0 %	0 %	50 %	470223917
5092	NC_020568	AAT	2	6	259041	259046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223917
5093	NC_020568	AGA	2	6	259080	259085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223917
5094	NC_020568	ACC	2	6	259129	259134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223917
5095	NC_020568	GTAA	2	8	259155	259162	50 %	25 %	25 %	0 %	470223917
5096	NC_020568	A	6	6	259161	259166	100 %	0 %	0 %	0 %	470223917
5097	NC_020568	CCA	2	6	259250	259255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223917
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5100	NC_020568	TGT	2	6	259401	259406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223917
5101	NC_020568	ATA	2	6	259421	259426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223917
5102	NC_020568	TAA	2	6	259534	259539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223917
5103	NC_020568	AGC	2	6	259574	259579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223917
5104	NC_020568	TAC	2	6	259668	259673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223917
5105	NC_020568	TAA	2	6	259705	259710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223917
5106	NC_020568	CAC	2	6	259761	259766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223917
5107	NC_020568	CAA	2	6	259774	259779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223917
5108	NC_020568	CTG	2	6	259831	259836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223917
5109	NC_020568	TCA	2	6	259857	259862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223917
5110	NC_020568	ATT	2	6	260234	260239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223918
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5112	NC_020568	AAC	2	6	260323	260328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223918
5113	NC_020568	AATC	2	8	260339	260346	50 %	25 %	0 %	25 %	470223918
5114	NC_020568	TTAA	2	8	260435	260442	50 %	50 %	0 %	0 %	470223918
5115	NC_020568	TGA	2	6	260562	260567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223918
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5117	NC_020568	CAG	2	6	260709	260714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223918
5118	NC_020568	AGC	2	6	260740	260745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223918
5119	NC_020568	AAT	2	6	260849	260854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223918
5120	NC_020568	TCG	2	6	260868	260873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223918
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5231	NC_020568	AGA	2	6	267713	267718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223923
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5239	NC_020568	AAGA	2	8	268077	268084	75 %	0 %	25 %	0 %	470223923
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5487	NC_020568	AAG	2	6	280933	280938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223933
5488	NC_020568	GAT	2	6	280970	280975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223933
5489	NC_020568	ATC	2	6	281056	281061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223933
5490	NC_020568	CAA	2	6	281068	281073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223933
5491	NC_020568	GTCT	2	8	281089	281096	0 %	50 %	25 %	25 %	470223933
5492	NC_020568	AAG	2	6	281125	281130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223933
5493	NC_020568	AGA	2	6	281141	281146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223933
5494	NC_020568	AGC	2	6	281180	281185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223933
5495	NC_020568	TCG	2	6	281218	281223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223933
5496	NC_020568	TAG	2	6	281306	281311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223933
5497	NC_020568	AAGT	2	8	281342	281349	50 %	25 %	25 %	0 %	470223933
5498	NC_020568	T	6	6	281399	281404	0 %	100 %	0 %	0 %	470223933
5499	NC_020568	TTCAA	2	10	281406	281415	40 %	40 %	0 %	20 %	470223933
5500	NC_020568	AATA	2	8	281441	281448	75 %	25 %	0 %	0 %	470223933

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