MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020566	AT	3	6	178166	178171	50 %	50 %	0 %	0 %	470221896
3502	NC_020566	TCA	2	6	178225	178230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221896
3503	NC_020566	CAT	2	6	178245	178250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221896
3504	NC_020566	TAT	2	6	178313	178318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221896
3505	NC_020566	AT	3	6	178391	178396	50 %	50 %	0 %	0 %	470221896
3506	NC_020566	AAT	2	6	178431	178436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221896
3507	NC_020566	GTG	2	6	178465	178470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221896
3508	NC_020566	GAA	2	6	178513	178518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221896
3509	NC_020566	TGA	2	6	178559	178564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221896
3510	NC_020566	TGT	2	6	178607	178612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221896
3511	NC_020566	AT	3	6	178639	178644	50 %	50 %	0 %	0 %	470221896
3512	NC_020566	TTA	2	6	178652	178657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221896
3513	NC_020566	CAA	2	6	178668	178673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221896
3514	NC_020566	TAC	2	6	178784	178789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221896
3515	NC_020566	ACA	2	6	178814	178819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221896
3516	NC_020566	TAA	2	6	178823	178828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221896
3517	NC_020566	TTG	2	6	178867	178872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221896
3518	NC_020566	ATG	2	6	178900	178905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221896
3519	NC_020566	GAT	2	6	178917	178922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221896
3520	NC_020566	TGG	2	6	178934	178939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221896
3521	NC_020566	CAT	2	6	178989	178994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221896
3522	NC_020566	CAA	2	6	179061	179066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221896
3523	NC_020566	T	6	6	179198	179203	0 %	100 %	0 %	0 %	470221896
3524	NC_020566	TGA	2	6	179296	179301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221896
3525	NC_020566	ATT	2	6	179314	179319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221896
3526	NC_020566	AGA	2	6	179324	179329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221896
3527	NC_020566	ATG	2	6	179340	179345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221896
3528	NC_020566	TTG	2	6	179365	179370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221896
3529	NC_020566	GAT	2	6	179388	179393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221896
3530	NC_020566	GTT	2	6	179394	179399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221896
3531	NC_020566	ATT	2	6	179421	179426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221896
3532	NC_020566	TGA	4	12	179456	179467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221896
3533	NC_020566	CAA	2	6	179517	179522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221896
3534	NC_020566	CAT	2	6	179523	179528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221896
3535	NC_020566	AT	3	6	179538	179543	50 %	50 %	0 %	0 %	470221896
3536	NC_020566	AGA	2	6	179585	179590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221896
3537	NC_020566	ACT	2	6	179627	179632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221896
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3539	NC_020566	AATG	2	8	179795	179802	50 %	25 %	25 %	0 %	470221896
3540	NC_020566	AC	3	6	179908	179913	50 %	0 %	0 %	50 %	470221896
3541	NC_020566	TAA	2	6	179942	179947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221896
3542	NC_020566	AAC	3	9	180079	180087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221896
3543	NC_020566	GATA	2	8	180095	180102	50 %	25 %	25 %	0 %	470221896
3544	NC_020566	AACATT	2	12	180104	180115	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470221896
3545	NC_020566	AAT	2	6	180119	180124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221896
3546	NC_020566	TAAC	2	8	180154	180161	50 %	25 %	0 %	25 %	470221896
3547	NC_020566	AT	3	6	180185	180190	50 %	50 %	0 %	0 %	470221896
3548	NC_020566	TAAG	2	8	180206	180213	50 %	25 %	25 %	0 %	470221896
3549	NC_020566	GAA	2	6	180270	180275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221897
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3551	NC_020566	TTA	2	6	180402	180407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221897
3552	NC_020566	GT	4	8	180519	180526	0 %	50 %	50 %	0 %	470221897
3553	NC_020566	AAAG	2	8	180666	180673	75 %	0 %	25 %	0 %	470221897
3554	NC_020566	ATTG	2	8	180683	180690	25 %	50 %	25 %	0 %	470221897
3555	NC_020566	TATGA	2	10	180720	180729	40 %	40 %	20 %	0 %	470221897
3556	NC_020566	ATCA	2	8	180745	180752	50 %	25 %	0 %	25 %	470221897
3557	NC_020566	GTGAA	2	10	180754	180763	40 %	20 %	40 %	0 %	470221897
3558	NC_020566	ATTT	2	8	180773	180780	25 %	75 %	0 %	0 %	470221897
3559	NC_020566	A	6	6	180834	180839	100 %	0 %	0 %	0 %	470221897
3560	NC_020566	AGT	2	6	180861	180866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221897
3561	NC_020566	TTAAT	2	10	181197	181206	40 %	60 %	0 %	0 %	470221898
3562	NC_020566	TGT	2	6	181225	181230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221898
3563	NC_020566	TCA	2	6	181247	181252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221898
3564	NC_020566	CA	3	6	181306	181311	50 %	0 %	0 %	50 %	470221898
3565	NC_020566	AAT	2	6	181351	181356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221898
3566	NC_020566	TAAG	2	8	181398	181405	50 %	25 %	25 %	0 %	470221898
3567	NC_020566	T	6	6	181410	181415	0 %	100 %	0 %	0 %	470221898
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3569	NC_020566	ACT	2	6	181527	181532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221898
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3571	NC_020566	TTG	2	6	181960	181965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221899
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3573	NC_020566	ATT	2	6	181979	181984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221899
3574	NC_020566	AT	3	6	182112	182117	50 %	50 %	0 %	0 %	470221899
3575	NC_020566	TGA	2	6	182118	182123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221899
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3579	NC_020566	CAT	2	6	182263	182268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221899
3580	NC_020566	TGA	2	6	182290	182295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221899
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3589	NC_020566	CCA	2	6	182682	182687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221899
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3593	NC_020566	CAA	2	6	183166	183171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221900
3594	NC_020566	TAA	2	6	183308	183313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221900
3595	NC_020566	TGA	2	6	183315	183320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221900
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3601	NC_020566	GTT	2	6	183625	183630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221900
3602	NC_020566	TGTTTG	2	12	183641	183652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221900
3603	NC_020566	CAT	2	6	183658	183663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221900
3604	NC_020566	TTG	2	6	183671	183676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221900
3605	NC_020566	AAC	2	6	183707	183712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221900
3606	NC_020566	GTG	2	6	183766	183771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221900
3607	NC_020566	TA	3	6	183793	183798	50 %	50 %	0 %	0 %	470221900
3608	NC_020566	T	6	6	183845	183850	0 %	100 %	0 %	0 %	470221900
3609	NC_020566	ACC	2	6	183875	183880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221900
3610	NC_020566	TAA	2	6	183919	183924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221900
3611	NC_020566	TTG	2	6	183938	183943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221900
3612	NC_020566	TGAT	2	8	183994	184001	25 %	50 %	25 %	0 %	470221901
3613	NC_020566	ATATA	2	10	184027	184036	60 %	40 %	0 %	0 %	470221901
3614	NC_020566	ATCA	2	8	184081	184088	50 %	25 %	0 %	25 %	470221901
3615	NC_020566	TGT	2	6	184111	184116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221901
3616	NC_020566	AGT	2	6	184143	184148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221901
3617	NC_020566	TAC	2	6	184149	184154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221901
3618	NC_020566	CTT	2	6	184161	184166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221901
3619	NC_020566	ATA	2	6	184219	184224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221901
3620	NC_020566	TTG	2	6	184284	184289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221901
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3622	NC_020566	TCAT	2	8	184424	184431	25 %	50 %	0 %	25 %	470221901
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3988	NC_020566	A	6	6	202534	202539	100 %	0 %	0 %	0 %	470221913
3989	NC_020566	ATG	2	6	202652	202657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221913
3990	NC_020566	AAC	2	6	202678	202683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221913
3991	NC_020566	TAA	2	6	202737	202742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221913
3992	NC_020566	TGA	2	6	202776	202781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221913
3993	NC_020566	AAT	2	6	202873	202878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221913
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3999	NC_020566	ATA	3	9	203326	203334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221914
4000	NC_020566	TA	3	6	203365	203370	50 %	50 %	0 %	0 %	470221914

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