MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020566	GCA	2	6	254304	254309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221949
5002	NC_020566	CTG	2	6	254428	254433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221949
5003	NC_020566	TTCAT	2	10	254460	254469	20 %	60 %	0 %	20 %	470221949
5004	NC_020566	ACC	2	6	255479	255484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221950
5005	NC_020566	TTC	2	6	255527	255532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221950
5006	NC_020566	GT	3	6	255563	255568	0 %	50 %	50 %	0 %	470221950
5007	NC_020566	TGT	2	6	255630	255635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221950
5008	NC_020566	CTA	2	6	255700	255705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221950
5009	NC_020566	CTT	2	6	255805	255810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221950
5010	NC_020566	TTG	2	6	255829	255834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221950
5011	NC_020566	TGT	2	6	255854	255859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221950
5012	NC_020566	T	7	7	255891	255897	0 %	100 %	0 %	0 %	470221950
5013	NC_020566	TTC	2	6	256001	256006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221950
5014	NC_020566	CAT	2	6	256085	256090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221950
5015	NC_020566	TTC	2	6	256178	256183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221950
5016	NC_020566	TAA	2	6	256211	256216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221950
5017	NC_020566	TAA	2	6	256297	256302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221950
5018	NC_020566	GTTT	2	8	256482	256489	0 %	75 %	25 %	0 %	470221950
5019	NC_020566	TTG	2	6	257180	257185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221951
5020	NC_020566	TCA	2	6	257195	257200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221951
5021	NC_020566	GAG	2	6	257225	257230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470221951
5022	NC_020566	CAA	2	6	257267	257272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221951
5023	NC_020566	ATG	2	6	257309	257314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221951
5024	NC_020566	TGC	2	6	257340	257345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221951
5025	NC_020566	TTG	2	6	257408	257413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221951
5026	NC_020566	ATT	2	6	257562	257567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221951
5027	NC_020566	AAGCG	2	10	257571	257580	40 %	0 %	40 %	20 %	470221951
5028	NC_020566	ATT	2	6	257614	257619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221951
5029	NC_020566	AAC	2	6	257696	257701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221951
5030	NC_020566	GCA	2	6	257752	257757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221951
5031	NC_020566	ATT	2	6	257764	257769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221951
5032	NC_020566	TTA	2	6	257787	257792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221951
5033	NC_020566	ATT	2	6	257868	257873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221951
5034	NC_020566	ATG	2	6	257885	257890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221951
5035	NC_020566	AAG	2	6	257891	257896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221951
5036	NC_020566	CAG	2	6	257915	257920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221951
5037	NC_020566	TCA	2	6	257921	257926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221951
5038	NC_020566	CGT	2	6	257946	257951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221951
5039	NC_020566	ACG	2	6	257966	257971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221951
5040	NC_020566	AGA	2	6	258030	258035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221951
5041	NC_020566	TTC	2	6	258380	258385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221952
5042	NC_020566	CAA	2	6	258577	258582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221952
5043	NC_020566	TTG	2	6	258611	258616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221952
5044	NC_020566	TGC	2	6	258617	258622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221952
5045	NC_020566	TCT	2	6	258630	258635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221952
5046	NC_020566	AAATT	2	10	258651	258660	60 %	40 %	0 %	0 %	470221952
5047	NC_020566	CA	3	6	258702	258707	50 %	0 %	0 %	50 %	470221952
5048	NC_020566	GTTT	2	8	258734	258741	0 %	75 %	25 %	0 %	470221952
5049	NC_020566	CAT	2	6	258830	258835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221952
5050	NC_020566	AAG	2	6	258852	258857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221952
5051	NC_020566	ACAA	2	8	258885	258892	75 %	0 %	0 %	25 %	470221952
5052	NC_020566	AAACT	2	10	258894	258903	60 %	20 %	0 %	20 %	470221952
5053	NC_020566	AGTG	2	8	258935	258942	25 %	25 %	50 %	0 %	470221952
5054	NC_020566	CCG	2	6	258960	258965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470221952
5055	NC_020566	T	6	6	258971	258976	0 %	100 %	0 %	0 %	470221952
5056	NC_020566	TG	3	6	258992	258997	0 %	50 %	50 %	0 %	470221952
5057	NC_020566	CAC	2	6	259015	259020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221952
5058	NC_020566	CAT	2	6	259031	259036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221952
5059	NC_020566	TAA	2	6	259039	259044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221952
5060	NC_020566	AC	3	6	259066	259071	50 %	0 %	0 %	50 %	470221952
5061	NC_020566	AAT	2	6	259075	259080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221952
5062	NC_020566	AGA	2	6	259114	259119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221952
5063	NC_020566	ACC	2	6	259163	259168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221952
5064	NC_020566	GTAA	2	8	259189	259196	50 %	25 %	25 %	0 %	470221952
5065	NC_020566	A	6	6	259195	259200	100 %	0 %	0 %	0 %	470221952
5066	NC_020566	CCA	2	6	259284	259289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221952
5067	NC_020566	CCA	2	6	259389	259394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221952
5068	NC_020566	GGT	2	6	259410	259415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221952
5069	NC_020566	TGT	2	6	259435	259440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221952
5070	NC_020566	ATA	2	6	259455	259460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221952
5071	NC_020566	TAA	2	6	259568	259573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221952
5072	NC_020566	AGC	2	6	259608	259613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221952
5073	NC_020566	TAC	2	6	259702	259707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221952
5074	NC_020566	TAA	2	6	259739	259744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221952
5075	NC_020566	CAC	2	6	259795	259800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221952
5076	NC_020566	CAA	2	6	259808	259813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221952
5077	NC_020566	CTG	2	6	259865	259870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221952
5078	NC_020566	TCA	2	6	259891	259896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221952
5079	NC_020566	ATT	2	6	260268	260273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221953
5080	NC_020566	GAT	2	6	260295	260300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221953
5081	NC_020566	AAC	2	6	260357	260362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221953
5082	NC_020566	AATC	2	8	260373	260380	50 %	25 %	0 %	25 %	470221953
5083	NC_020566	TTAA	2	8	260469	260476	50 %	50 %	0 %	0 %	470221953
5084	NC_020566	TGA	2	6	260596	260601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221953
5085	NC_020566	GTG	2	6	260713	260718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221953
5086	NC_020566	CAG	2	6	260743	260748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221953
5087	NC_020566	AGC	2	6	260774	260779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221953
5088	NC_020566	AAT	2	6	260883	260888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221953
5089	NC_020566	TCG	2	6	260902	260907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221953
5090	NC_020566	ATT	2	6	260912	260917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221953
5091	NC_020566	AAG	2	6	260928	260933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221953
5092	NC_020566	ATGG	2	8	260955	260962	25 %	25 %	50 %	0 %	470221953
5093	NC_020566	ATG	2	6	260974	260979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221953
5094	NC_020566	CAG	2	6	261130	261135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221953
5095	NC_020566	GAA	2	6	261144	261149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221953
5096	NC_020566	AAT	3	9	261187	261195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221953
5097	NC_020566	AGG	2	6	261516	261521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470221954
5098	NC_020566	CTA	2	6	261575	261580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221954
5099	NC_020566	A	6	6	261644	261649	100 %	0 %	0 %	0 %	470221954
5100	NC_020566	AGC	2	6	261758	261763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221954
5101	NC_020566	CAA	2	6	261777	261782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221954
5102	NC_020566	CGT	2	6	261805	261810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221954
5103	NC_020566	TAT	2	6	261811	261816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221954
5104	NC_020566	TTG	2	6	261983	261988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221954
5105	NC_020566	TGA	2	6	261990	261995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221954
5106	NC_020566	TTC	2	6	262012	262017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221954
5107	NC_020566	TTGA	2	8	262024	262031	25 %	50 %	25 %	0 %	470221954
5108	NC_020566	TG	3	6	262192	262197	0 %	50 %	50 %	0 %	470221954
5109	NC_020566	TGA	2	6	262226	262231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221954
5110	NC_020566	ATTA	2	8	262243	262250	50 %	50 %	0 %	0 %	470221954
5111	NC_020566	ACTT	2	8	262349	262356	25 %	50 %	0 %	25 %	470221954
5112	NC_020566	CAA	2	6	262358	262363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221954
5113	NC_020566	TTA	2	6	262457	262462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221954
5114	NC_020566	TGA	2	6	262551	262556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221954
5115	NC_020566	TAA	2	6	262559	262564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221954
5116	NC_020566	TGT	2	6	262679	262684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221954
5117	NC_020566	TAT	2	6	262737	262742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221954
5118	NC_020566	GT	3	6	262744	262749	0 %	50 %	50 %	0 %	470221954
5119	NC_020566	ATG	2	6	262774	262779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221954
5120	NC_020566	ATT	2	6	262810	262815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221954
5121	NC_020566	A	6	6	262903	262908	100 %	0 %	0 %	0 %	470221954
5122	NC_020566	TTAT	2	8	262909	262916	25 %	75 %	0 %	0 %	470221954
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5130	NC_020566	TGA	2	6	263301	263306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221954
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5241	NC_020566	ATT	2	6	270303	270308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221960
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5243	NC_020566	TAA	2	6	270412	270417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221960
5244	NC_020566	TA	3	6	270494	270499	50 %	50 %	0 %	0 %	470221961
5245	NC_020566	AAATG	2	10	270582	270591	60 %	20 %	20 %	0 %	470221961
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5489	NC_020566	CA	3	6	282498	282503	50 %	0 %	0 %	50 %	470221969
5490	NC_020566	CATA	2	8	282519	282526	50 %	25 %	0 %	25 %	470221969
5491	NC_020566	ACA	2	6	282547	282552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221969
5492	NC_020566	AT	3	6	282615	282620	50 %	50 %	0 %	0 %	470221969
5493	NC_020566	CAA	2	6	282649	282654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221969
5494	NC_020566	AC	3	6	283327	283332	50 %	0 %	0 %	50 %	470221970
5495	NC_020566	ATT	2	6	283382	283387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221970
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5497	NC_020566	TCT	2	6	283405	283410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221970
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