MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020566	ATT	2	6	226310	226315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221932
4502	NC_020566	CA	3	6	226338	226343	50 %	0 %	0 %	50 %	470221932
4503	NC_020566	A	6	6	226362	226367	100 %	0 %	0 %	0 %	470221932
4504	NC_020566	TGGT	2	8	226384	226391	0 %	50 %	50 %	0 %	470221932
4505	NC_020566	TAG	2	6	226399	226404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221932
4506	NC_020566	TGGG	2	8	226439	226446	0 %	25 %	75 %	0 %	470221932
4507	NC_020566	AAC	2	6	226588	226593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221932
4508	NC_020566	GAT	2	6	226644	226649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221932
4509	NC_020566	AGCA	2	8	226682	226689	50 %	0 %	25 %	25 %	470221932
4510	NC_020566	ATTT	2	8	226771	226778	25 %	75 %	0 %	0 %	470221932
4511	NC_020566	AT	3	6	226788	226793	50 %	50 %	0 %	0 %	470221932
4512	NC_020566	AAAGC	2	10	226819	226828	60 %	0 %	20 %	20 %	470221932
4513	NC_020566	GA	3	6	226860	226865	50 %	0 %	50 %	0 %	470221932
4514	NC_020566	AGA	2	6	226901	226906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221932
4515	NC_020566	GAA	2	6	226923	226928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221932
4516	NC_020566	TAT	2	6	227077	227082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221933
4517	NC_020566	TGGAT	2	10	227129	227138	20 %	40 %	40 %	0 %	470221933
4518	NC_020566	GGT	2	6	227157	227162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221933
4519	NC_020566	GTT	2	6	227195	227200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221933
4520	NC_020566	CAGA	2	8	227242	227249	50 %	0 %	25 %	25 %	470221933
4521	NC_020566	AAG	2	6	227314	227319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221933
4522	NC_020566	GTT	2	6	227373	227378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221933
4523	NC_020566	GAT	2	6	227406	227411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221933
4524	NC_020566	AT	3	6	227624	227629	50 %	50 %	0 %	0 %	470221933
4525	NC_020566	TGG	2	6	227658	227663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221933
4526	NC_020566	TGC	2	6	227681	227686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221933
4527	NC_020566	TCA	2	6	227717	227722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221933
4528	NC_020566	TTA	3	9	227881	227889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221933
4529	NC_020566	TAT	2	6	227930	227935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221933
4530	NC_020566	AGA	2	6	227942	227947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221933
4531	NC_020566	CAG	2	6	228001	228006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470221933
4532	NC_020566	TGG	2	6	228012	228017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221933
4533	NC_020566	ATA	2	6	228020	228025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221933
4534	NC_020566	TCT	2	6	228403	228408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221934
4535	NC_020566	TAA	2	6	228447	228452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
4536	NC_020566	GT	3	6	228471	228476	0 %	50 %	50 %	0 %	470221934
4537	NC_020566	TAA	3	9	228477	228485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
4538	NC_020566	ATG	2	6	228505	228510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221934
4539	NC_020566	AAG	2	6	228514	228519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221934
4540	NC_020566	TA	3	6	228542	228547	50 %	50 %	0 %	0 %	470221934
4541	NC_020566	TAA	2	6	228557	228562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
4542	NC_020566	AAT	2	6	228583	228588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
4543	NC_020566	ACC	2	6	228603	228608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470221934
4544	NC_020566	TAA	2	6	228617	228622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
4545	NC_020566	ATAA	2	8	228625	228632	75 %	25 %	0 %	0 %	470221934
4546	NC_020566	TAA	2	6	228698	228703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221934
4547	NC_020566	GT	3	6	228738	228743	0 %	50 %	50 %	0 %	470221934
4548	NC_020566	ATAG	2	8	228865	228872	50 %	25 %	25 %	0 %	470221934
4549	NC_020566	ATG	2	6	228877	228882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221934
4550	NC_020566	TCC	2	6	228883	228888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470221934
4551	NC_020566	ACA	2	6	228922	228927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221934
4552	NC_020566	T	6	6	229117	229122	0 %	100 %	0 %	0 %	470221935
4553	NC_020566	CTTT	2	8	229199	229206	0 %	75 %	0 %	25 %	470221935
4554	NC_020566	AAC	2	6	229246	229251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221935
4555	NC_020566	GGC	2	6	229257	229262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470221935
4556	NC_020566	TAT	2	6	229395	229400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
4557	NC_020566	CTTA	2	8	229407	229414	25 %	50 %	0 %	25 %	470221935
4558	NC_020566	ATT	2	6	229479	229484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
4559	NC_020566	TGG	2	6	229524	229529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221935
4560	NC_020566	ATA	2	6	229610	229615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221935
4561	NC_020566	GGT	2	6	229618	229623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221935
4562	NC_020566	GGT	2	6	229633	229638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470221935
4563	NC_020566	TTC	2	6	229663	229668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221935
4564	NC_020566	ATT	2	6	229734	229739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
4565	NC_020566	GAT	2	6	229750	229755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221935
4566	NC_020566	AGA	2	6	229758	229763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221935
4567	NC_020566	GAA	2	6	229783	229788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221935
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4569	NC_020566	TAT	2	6	230039	230044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
4570	NC_020566	TTA	2	6	230062	230067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
4571	NC_020566	GTC	2	6	230072	230077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470221935
4572	NC_020566	TGT	2	6	230118	230123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221935
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4574	NC_020566	ATT	2	6	230205	230210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221935
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4579	NC_020566	GAA	2	6	230458	230463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470221935
4580	NC_020566	GCTT	2	8	230856	230863	0 %	50 %	25 %	25 %	470221936
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4583	NC_020566	AAT	2	6	231013	231018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221936
4584	NC_020566	TCGCA	2	10	231053	231062	20 %	20 %	20 %	40 %	470221936
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4589	NC_020566	TTG	2	6	231233	231238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221936
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4591	NC_020566	TAA	2	6	231302	231307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221936
4592	NC_020566	ATG	2	6	231320	231325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221936
4593	NC_020566	AT	3	6	231342	231347	50 %	50 %	0 %	0 %	470221936
4594	NC_020566	ATA	2	6	231367	231372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221936
4595	NC_020566	TGA	2	6	231373	231378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470221936
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4599	NC_020566	CAT	2	6	231927	231932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221937
4600	NC_020566	CTT	2	6	231956	231961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221937
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4602	NC_020566	GTAAC	2	10	232083	232092	40 %	20 %	20 %	20 %	470221937
4603	NC_020566	TTG	2	6	232104	232109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221937
4604	NC_020566	ATTGT	2	10	232151	232160	20 %	60 %	20 %	0 %	470221937
4605	NC_020566	AAAT	2	8	232278	232285	75 %	25 %	0 %	0 %	470221937
4606	NC_020566	ATT	2	6	232296	232301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221937
4607	NC_020566	TCT	2	6	232306	232311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470221937
4608	NC_020566	TGT	2	6	232319	232324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221937
4609	NC_020566	T	6	6	232324	232329	0 %	100 %	0 %	0 %	470221937
4610	NC_020566	T	6	6	232373	232378	0 %	100 %	0 %	0 %	470221937
4611	NC_020566	AAT	2	6	232380	232385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221937
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4613	NC_020566	AAC	2	6	232480	232485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470221937
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4616	NC_020566	TTG	2	6	232581	232586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470221937
4617	NC_020566	TCTT	2	8	232678	232685	0 %	75 %	0 %	25 %	470221937
4618	NC_020566	AT	3	6	232729	232734	50 %	50 %	0 %	0 %	470221937
4619	NC_020566	TAT	2	6	232739	232744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221937
4620	NC_020566	AAAT	2	8	232767	232774	75 %	25 %	0 %	0 %	470221937
4621	NC_020566	ATT	2	6	232803	232808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221937
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4623	NC_020566	TAA	2	6	232875	232880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470221937
4624	NC_020566	CAT	2	6	232901	232906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470221937
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4731	NC_020566	TAT	2	6	238871	238876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470221941
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4733	NC_020566	TACT	2	8	239045	239052	25 %	50 %	0 %	25 %	470221941
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4866	NC_020566	CG	3	6	247577	247582	0 %	0 %	50 %	50 %	470221945
4867	NC_020566	TAATT	2	10	247667	247676	40 %	60 %	0 %	0 %	470221945
4868	NC_020566	TACT	2	8	247745	247752	25 %	50 %	0 %	25 %	470221945
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4985	NC_020566	TTTG	2	8	253525	253532	0 %	75 %	25 %	0 %	470221949
4986	NC_020566	AT	3	6	253551	253556	50 %	50 %	0 %	0 %	470221949
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