MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI3T3 complete sequence

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020565	T	7	7	1253	1259	0 %	100 %	0 %	0 %	469823628
2	NC_020565	T	6	6	1460	1465	0 %	100 %	0 %	0 %	469823628
3	NC_020565	T	6	6	1896	1901	0 %	100 %	0 %	0 %	469823628
4	NC_020565	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	469823628
5	NC_020565	T	6	6	4256	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	469823629
6	NC_020565	T	6	6	4337	4342	0 %	100 %	0 %	0 %	469823629
7	NC_020565	T	6	6	4430	4435	0 %	100 %	0 %	0 %	469823629
8	NC_020565	T	6	6	4589	4594	0 %	100 %	0 %	0 %	469823629
9	NC_020565	T	8	8	4745	4752	0 %	100 %	0 %	0 %	469823629
10	NC_020565	T	6	6	5010	5015	0 %	100 %	0 %	0 %	469823630
11	NC_020565	A	7	7	5374	5380	100 %	0 %	0 %	0 %	469823630
12	NC_020565	A	8	8	5415	5422	100 %	0 %	0 %	0 %	469823630
13	NC_020565	T	6	6	5769	5774	0 %	100 %	0 %	0 %	469823630
14	NC_020565	A	6	6	5859	5864	100 %	0 %	0 %	0 %	469823630
15	NC_020565	T	6	6	5903	5908	0 %	100 %	0 %	0 %	469823630
16	NC_020565	A	6	6	6456	6461	100 %	0 %	0 %	0 %	469823630
17	NC_020565	A	6	6	6667	6672	100 %	0 %	0 %	0 %	469823630
18	NC_020565	A	7	7	9579	9585	100 %	0 %	0 %	0 %	469823633
19	NC_020565	T	6	6	9781	9786	0 %	100 %	0 %	0 %	469823633
20	NC_020565	T	6	6	10074	10079	0 %	100 %	0 %	0 %	469823633
21	NC_020565	A	8	8	10345	10352	100 %	0 %	0 %	0 %	469823634
22	NC_020565	A	7	7	10552	10558	100 %	0 %	0 %	0 %	469823634
23	NC_020565	A	7	7	12554	12560	100 %	0 %	0 %	0 %	469823635
24	NC_020565	T	6	6	12724	12729	0 %	100 %	0 %	0 %	469823635
25	NC_020565	A	8	8	12883	12890	100 %	0 %	0 %	0 %	469823635
26	NC_020565	A	6	6	13583	13588	100 %	0 %	0 %	0 %	469823636
27	NC_020565	A	6	6	13590	13595	100 %	0 %	0 %	0 %	469823636
28	NC_020565	A	6	6	13693	13698	100 %	0 %	0 %	0 %	469823636
29	NC_020565	A	6	6	13914	13919	100 %	0 %	0 %	0 %	469823636
30	NC_020565	T	7	7	14836	14842	0 %	100 %	0 %	0 %	469823637
31	NC_020565	T	6	6	14938	14943	0 %	100 %	0 %	0 %	469823637
32	NC_020565	A	6	6	15715	15720	100 %	0 %	0 %	0 %	469823638
33	NC_020565	A	6	6	15732	15737	100 %	0 %	0 %	0 %	469823638
34	NC_020565	A	6	6	16060	16065	100 %	0 %	0 %	0 %	469823638
35	NC_020565	T	7	7	20595	20601	0 %	100 %	0 %	0 %	469823639
36	NC_020565	A	6	6	20616	20621	100 %	0 %	0 %	0 %	469823639
37	NC_020565	T	7	7	20789	20795	0 %	100 %	0 %	0 %	469823639
38	NC_020565	T	6	6	20991	20996	0 %	100 %	0 %	0 %	469823639
39	NC_020565	A	8	8	21506	21513	100 %	0 %	0 %	0 %	469823640
40	NC_020565	T	7	7	23082	23088	0 %	100 %	0 %	0 %	469823641
41	NC_020565	T	6	6	23090	23095	0 %	100 %	0 %	0 %	469823641
42	NC_020565	A	6	6	23468	23473	100 %	0 %	0 %	0 %	469823641
43	NC_020565	T	6	6	23567	23572	0 %	100 %	0 %	0 %	469823641
44	NC_020565	T	7	7	23671	23677	0 %	100 %	0 %	0 %	469823642
45	NC_020565	A	7	7	24118	24124	100 %	0 %	0 %	0 %	469823642
46	NC_020565	A	6	6	25270	25275	100 %	0 %	0 %	0 %	469823643
47	NC_020565	T	6	6	26194	26199	0 %	100 %	0 %	0 %	469823644
48	NC_020565	G	6	6	26970	26975	0 %	0 %	100 %	0 %	469823645
49	NC_020565	T	6	6	27850	27855	0 %	100 %	0 %	0 %	469823646
50	NC_020565	C	6	6	28588	28593	0 %	0 %	0 %	100 %	469823646
51	NC_020565	T	6	6	29565	29570	0 %	100 %	0 %	0 %	469823647
52	NC_020565	T	6	6	30636	30641	0 %	100 %	0 %	0 %	469823648
53	NC_020565	T	7	7	31715	31721	0 %	100 %	0 %	0 %	469823649
54	NC_020565	T	6	6	31875	31880	0 %	100 %	0 %	0 %	469823649
55	NC_020565	T	7	7	31977	31983	0 %	100 %	0 %	0 %	469823649

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.