MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 33629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020564	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217947
2	NC_020564	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217947
3	NC_020564	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217947
4	NC_020564	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217947
5	NC_020564	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217947
6	NC_020564	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217947
7	NC_020564	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217947
8	NC_020564	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217947
9	NC_020564	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217947
10	NC_020564	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217947
11	NC_020564	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217947
12	NC_020564	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217947
13	NC_020564	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217947
14	NC_020564	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217947
15	NC_020564	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217947
16	NC_020564	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217947
17	NC_020564	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470217947
18	NC_020564	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217947
19	NC_020564	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217947
20	NC_020564	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470217947
21	NC_020564	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217947
22	NC_020564	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217947
23	NC_020564	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470217947
24	NC_020564	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217947
25	NC_020564	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217947
26	NC_020564	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217947
27	NC_020564	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217947
28	NC_020564	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217947
29	NC_020564	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217947
30	NC_020564	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217948
31	NC_020564	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217948
32	NC_020564	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217948
33	NC_020564	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217948
34	NC_020564	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217948
35	NC_020564	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217948
36	NC_020564	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217948
37	NC_020564	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217948
38	NC_020564	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217948
39	NC_020564	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470217948
40	NC_020564	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217948
41	NC_020564	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217948
42	NC_020564	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217948
43	NC_020564	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217948
44	NC_020564	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217948
45	NC_020564	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217948
46	NC_020564	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217948
47	NC_020564	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470217948
48	NC_020564	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217948
49	NC_020564	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217948
50	NC_020564	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217948
51	NC_020564	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470217948
52	NC_020564	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217948
53	NC_020564	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217949
54	NC_020564	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217949
55	NC_020564	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217949
56	NC_020564	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470217949
57	NC_020564	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217949
58	NC_020564	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217949
59	NC_020564	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217949
60	NC_020564	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217949
61	NC_020564	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217949
62	NC_020564	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217949
63	NC_020564	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217949
64	NC_020564	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217949
65	NC_020564	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217949
66	NC_020564	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217949
67	NC_020564	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217949
68	NC_020564	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217949
69	NC_020564	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217950
70	NC_020564	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217950
71	NC_020564	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217950
72	NC_020564	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217950
73	NC_020564	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470217950
74	NC_020564	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217950
75	NC_020564	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217950
76	NC_020564	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217950
77	NC_020564	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217950
78	NC_020564	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217950
79	NC_020564	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217950
80	NC_020564	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217950
81	NC_020564	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217950
82	NC_020564	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217950
83	NC_020564	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217950
84	NC_020564	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217950
85	NC_020564	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217950
86	NC_020564	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217950
87	NC_020564	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217950
88	NC_020564	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470217950
89	NC_020564	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217950
90	NC_020564	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217950
91	NC_020564	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217950
92	NC_020564	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217950
93	NC_020564	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470217950
94	NC_020564	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217950
95	NC_020564	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217950
96	NC_020564	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217950
97	NC_020564	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217951
98	NC_020564	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217951
99	NC_020564	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217951
100	NC_020564	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217951
101	NC_020564	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217951
102	NC_020564	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470217951
103	NC_020564	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470217951
104	NC_020564	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217951
105	NC_020564	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217951
106	NC_020564	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217951
107	NC_020564	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217951
108	NC_020564	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217951
109	NC_020564	TTA	2	6	8038	8043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217951
110	NC_020564	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217951
111	NC_020564	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217951
112	NC_020564	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217951
113	NC_020564	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217951
114	NC_020564	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217951
115	NC_020564	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217951
116	NC_020564	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217951
117	NC_020564	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217951
118	NC_020564	TAC	2	6	8398	8403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217951
119	NC_020564	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217951
120	NC_020564	TCG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217951
121	NC_020564	AGA	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217951
122	NC_020564	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217951
123	NC_020564	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217951
124	NC_020564	GTG	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217951
125	NC_020564	GTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217951
126	NC_020564	GAA	2	6	8628	8633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217951
127	NC_020564	ATG	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217951
128	NC_020564	CTT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470217951
129	NC_020564	GTG	2	6	8866	8871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217951
130	NC_020564	AGA	2	6	8942	8947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217951
131	NC_020564	TGA	2	6	8948	8953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217951
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255	NC_020564	AGA	2	6	17854	17859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217957
256	NC_020564	TCA	2	6	17895	17900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217957
257	NC_020564	TAT	2	6	18021	18026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217957
258	NC_020564	ATT	2	6	18035	18040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217957
259	NC_020564	TAT	2	6	18054	18059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217957
260	NC_020564	ACT	2	6	18247	18252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217957
261	NC_020564	AAT	2	6	18296	18301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217957
262	NC_020564	AAT	2	6	18324	18329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217958
263	NC_020564	TCA	2	6	18371	18376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217958
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270	NC_020564	TTA	2	6	18941	18946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217958
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275	NC_020564	ACG	2	6	19470	19475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217958
276	NC_020564	TGA	2	6	19478	19483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217958
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284	NC_020564	AAC	2	6	19763	19768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217958
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499	NC_020564	AAG	2	6	37955	37960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217970
500	NC_020564	TCA	2	6	38696	38701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217971

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