MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020564	ATGA	2	8	177409	177416	50 %	25 %	25 %	0 %	470218073
3502	NC_020564	GCG	2	6	177541	177546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218073
3503	NC_020564	TA	3	6	177577	177582	50 %	50 %	0 %	0 %	470218073
3504	NC_020564	GGA	2	6	177627	177632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218073
3505	NC_020564	TTGAAA	2	12	177665	177676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218073
3506	NC_020564	TTG	2	6	177716	177721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218073
3507	NC_020564	ATG	2	6	177743	177748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
3508	NC_020564	TTG	2	6	177862	177867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218073
3509	NC_020564	TGCA	2	8	177875	177882	25 %	25 %	25 %	25 %	470218073
3510	NC_020564	TTG	2	6	177969	177974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218073
3511	NC_020564	AG	3	6	178009	178014	50 %	0 %	50 %	0 %	470218073
3512	NC_020564	ACA	2	6	178038	178043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218073
3513	NC_020564	TAA	2	6	178050	178055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218073
3514	NC_020564	GTA	2	6	178094	178099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
3515	NC_020564	AT	3	6	178167	178172	50 %	50 %	0 %	0 %	470218073
3516	NC_020564	TCA	2	6	178226	178231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218073
3517	NC_020564	CAT	2	6	178246	178251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218073
3518	NC_020564	TAT	2	6	178314	178319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218073
3519	NC_020564	AT	3	6	178392	178397	50 %	50 %	0 %	0 %	470218073
3520	NC_020564	AAT	2	6	178432	178437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218073
3521	NC_020564	GTG	2	6	178466	178471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218073
3522	NC_020564	GAA	2	6	178514	178519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218073
3523	NC_020564	TGA	2	6	178560	178565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
3524	NC_020564	TGT	2	6	178608	178613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218073
3525	NC_020564	AT	3	6	178640	178645	50 %	50 %	0 %	0 %	470218073
3526	NC_020564	TTA	2	6	178653	178658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218073
3527	NC_020564	CAA	2	6	178669	178674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218073
3528	NC_020564	TAC	2	6	178785	178790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218073
3529	NC_020564	ACA	2	6	178815	178820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218073
3530	NC_020564	TAA	2	6	178824	178829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218073
3531	NC_020564	TTG	2	6	178868	178873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218073
3532	NC_020564	ATG	2	6	178901	178906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
3533	NC_020564	GAT	2	6	178918	178923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
3534	NC_020564	TGG	2	6	178935	178940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218073
3535	NC_020564	CAT	2	6	178990	178995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218073
3536	NC_020564	CAA	2	6	179062	179067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218073
3537	NC_020564	T	6	6	179199	179204	0 %	100 %	0 %	0 %	470218073
3538	NC_020564	TGA	2	6	179297	179302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
3539	NC_020564	ATT	2	6	179315	179320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218073
3540	NC_020564	AGA	2	6	179325	179330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218073
3541	NC_020564	ATG	2	6	179341	179346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
3542	NC_020564	TTG	2	6	179366	179371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218073
3543	NC_020564	GAT	2	6	179389	179394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
3544	NC_020564	GTT	2	6	179395	179400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218073
3545	NC_020564	ATT	2	6	179422	179427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218073
3546	NC_020564	TGA	4	12	179457	179468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
3547	NC_020564	CAA	2	6	179518	179523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218073
3548	NC_020564	CAT	2	6	179524	179529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218073
3549	NC_020564	AT	3	6	179539	179544	50 %	50 %	0 %	0 %	470218073
3550	NC_020564	AGA	2	6	179586	179591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218073
3551	NC_020564	ACT	2	6	179628	179633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218073
3552	NC_020564	AAT	2	6	179692	179697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218073
3553	NC_020564	AATG	2	8	179796	179803	50 %	25 %	25 %	0 %	470218073
3554	NC_020564	AC	3	6	179909	179914	50 %	0 %	0 %	50 %	470218073
3555	NC_020564	TAA	2	6	179943	179948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218073
3556	NC_020564	AAC	3	9	180080	180088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218073
3557	NC_020564	GATA	2	8	180096	180103	50 %	25 %	25 %	0 %	470218073
3558	NC_020564	AACATT	2	12	180105	180116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218073
3559	NC_020564	AAT	2	6	180120	180125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218073
3560	NC_020564	TAAC	2	8	180155	180162	50 %	25 %	0 %	25 %	470218073
3561	NC_020564	AT	3	6	180186	180191	50 %	50 %	0 %	0 %	470218073
3562	NC_020564	TAAG	2	8	180207	180214	50 %	25 %	25 %	0 %	470218073
3563	NC_020564	GAA	2	6	180271	180276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218074
3564	NC_020564	A	6	6	180304	180309	100 %	0 %	0 %	0 %	470218074
3565	NC_020564	TTA	2	6	180403	180408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218074
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3567	NC_020564	AAAG	2	8	180667	180674	75 %	0 %	25 %	0 %	470218074
3568	NC_020564	ATTG	2	8	180684	180691	25 %	50 %	25 %	0 %	470218074
3569	NC_020564	TATGA	2	10	180721	180730	40 %	40 %	20 %	0 %	470218074
3570	NC_020564	ATCA	2	8	180746	180753	50 %	25 %	0 %	25 %	470218074
3571	NC_020564	GTGAA	2	10	180755	180764	40 %	20 %	40 %	0 %	470218074
3572	NC_020564	ATTT	2	8	180774	180781	25 %	75 %	0 %	0 %	470218074
3573	NC_020564	A	6	6	180835	180840	100 %	0 %	0 %	0 %	470218074
3574	NC_020564	AGT	2	6	180862	180867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218074
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3579	NC_020564	AAT	2	6	181352	181357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218075
3580	NC_020564	TAAG	2	8	181399	181406	50 %	25 %	25 %	0 %	470218075
3581	NC_020564	T	6	6	181411	181416	0 %	100 %	0 %	0 %	470218075
3582	NC_020564	AAT	2	6	181432	181437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218075
3583	NC_020564	ACT	2	6	181528	181533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218075
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3588	NC_020564	AT	3	6	182113	182118	50 %	50 %	0 %	0 %	470218076
3589	NC_020564	TGA	2	6	182119	182124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218076
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3591	NC_020564	TGA	2	6	182162	182167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218076
3592	NC_020564	ATG	3	9	182210	182218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218076
3593	NC_020564	CAT	2	6	182264	182269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218076
3594	NC_020564	TGA	2	6	182291	182296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218076
3595	NC_020564	TTG	2	6	182370	182375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218076
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3597	NC_020564	GT	3	6	182488	182493	0 %	50 %	50 %	0 %	470218076
3598	NC_020564	TAA	2	6	182579	182584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218076
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3600	NC_020564	TGT	2	6	182642	182647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218076
3601	NC_020564	TAA	2	6	182648	182653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218076
3602	NC_020564	GATG	2	8	182656	182663	25 %	25 %	50 %	0 %	470218076
3603	NC_020564	CCA	2	6	182683	182688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218076
3604	NC_020564	ATG	2	6	182738	182743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218077
3605	NC_020564	TCA	2	6	182866	182871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218077
3606	NC_020564	TTG	2	6	183101	183106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218077
3607	NC_020564	CAA	2	6	183167	183172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218077
3608	NC_020564	TAA	2	6	183309	183314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218077
3609	NC_020564	TGA	2	6	183316	183321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218077
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3612	NC_020564	ACC	2	6	183411	183416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218077
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3614	NC_020564	AGCAAC	2	12	183594	183605	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470218077
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3617	NC_020564	CAT	2	6	183659	183664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218077
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3620	NC_020564	GTG	2	6	183767	183772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218077
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3622	NC_020564	T	6	6	183846	183851	0 %	100 %	0 %	0 %	470218077
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3745	NC_020564	TGT	2	6	189313	189318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218082
3746	NC_020564	GAT	2	6	189362	189367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218082
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3988	NC_020564	TAT	2	6	201969	201974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218090
3989	NC_020564	ATACA	2	10	202039	202048	60 %	20 %	0 %	20 %	470218090
3990	NC_020564	AAAG	2	8	202061	202068	75 %	0 %	25 %	0 %	470218090
3991	NC_020564	AAT	2	6	202124	202129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218090
3992	NC_020564	A	6	6	202178	202183	100 %	0 %	0 %	0 %	470218090
3993	NC_020564	TTAA	2	8	202193	202200	50 %	50 %	0 %	0 %	470218090
3994	NC_020564	TAA	2	6	202216	202221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218090
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3997	NC_020564	TTTA	2	8	202275	202282	25 %	75 %	0 %	0 %	470218090
3998	NC_020564	GA	3	6	202308	202313	50 %	0 %	50 %	0 %	470218090
3999	NC_020564	AGA	2	6	202317	202322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218090
4000	NC_020564	GTAT	2	8	202398	202405	25 %	50 %	25 %	0 %	470218090

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