MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_020564	TCA	2	6	1801139	1801144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219221
33503	NC_020564	TCA	2	6	1801229	1801234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219221
33504	NC_020564	CAA	2	6	1801248	1801253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219221
33505	NC_020564	TAT	2	6	1801344	1801349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219221
33506	NC_020564	T	7	7	1801366	1801372	0 %	100 %	0 %	0 %	470219221
33507	NC_020564	CAA	2	6	1801401	1801406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219221
33508	NC_020564	GT	3	6	1801455	1801460	0 %	50 %	50 %	0 %	470219221
33509	NC_020564	T	6	6	1801505	1801510	0 %	100 %	0 %	0 %	470219221
33510	NC_020564	CAT	2	6	1801546	1801551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219221
33511	NC_020564	TAA	2	6	1801588	1801593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219221
33512	NC_020564	TTA	2	6	1801709	1801714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219221
33513	NC_020564	TTGACC	2	12	1801726	1801737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470219221
33514	NC_020564	TCT	2	6	1801771	1801776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219221
33515	NC_020564	TAA	2	6	1801785	1801790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219221
33516	NC_020564	AT	3	6	1801818	1801823	50 %	50 %	0 %	0 %	470219221
33517	NC_020564	AAC	2	6	1801834	1801839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219221
33518	NC_020564	CAT	2	6	1801851	1801856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219221
33519	NC_020564	ATT	2	6	1801877	1801882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219221
33520	NC_020564	T	7	7	1802129	1802135	0 %	100 %	0 %	0 %	470219222
33521	NC_020564	TAA	2	6	1802147	1802152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219222
33522	NC_020564	T	6	6	1802156	1802161	0 %	100 %	0 %	0 %	470219222
33523	NC_020564	GCA	2	6	1802169	1802174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219222
33524	NC_020564	A	7	7	1802174	1802180	100 %	0 %	0 %	0 %	470219222
33525	NC_020564	TTAA	2	8	1802235	1802242	50 %	50 %	0 %	0 %	470219222
33526	NC_020564	GAA	2	6	1802316	1802321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219222
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33529	NC_020564	CAA	2	6	1802529	1802534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219222
33530	NC_020564	AAC	2	6	1802737	1802742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219222
33531	NC_020564	ACGC	2	8	1802752	1802759	25 %	0 %	25 %	50 %	470219222
33532	NC_020564	CAT	2	6	1802792	1802797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219222
33533	NC_020564	GAAA	2	8	1802819	1802826	75 %	0 %	25 %	0 %	470219222
33534	NC_020564	AGA	2	6	1802888	1802893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219222
33535	NC_020564	GAT	2	6	1802940	1802945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219222
33536	NC_020564	CTG	2	6	1803022	1803027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219222
33537	NC_020564	A	6	6	1803093	1803098	100 %	0 %	0 %	0 %	470219222
33538	NC_020564	TCC	2	6	1803707	1803712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219223
33539	NC_020564	ATTTTT	2	12	1803728	1803739	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470219223
33540	NC_020564	T	7	7	1803735	1803741	0 %	100 %	0 %	0 %	470219223
33541	NC_020564	TTCT	2	8	1803792	1803799	0 %	75 %	0 %	25 %	470219223
33542	NC_020564	ATT	2	6	1803844	1803849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219223
33543	NC_020564	TAA	2	6	1803853	1803858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219223
33544	NC_020564	GCA	2	6	1803896	1803901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219223
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33547	NC_020564	CTT	2	6	1804020	1804025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219223
33548	NC_020564	ATAA	2	8	1804033	1804040	75 %	25 %	0 %	0 %	470219223
33549	NC_020564	CCA	2	6	1804046	1804051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219223
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33551	NC_020564	TGT	2	6	1804160	1804165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219223
33552	NC_020564	CATA	2	8	1804224	1804231	50 %	25 %	0 %	25 %	470219223
33553	NC_020564	T	6	6	1804294	1804299	0 %	100 %	0 %	0 %	470219223
33554	NC_020564	ATC	2	6	1804315	1804320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219223
33555	NC_020564	ATC	2	6	1804328	1804333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219223
33556	NC_020564	TCA	2	6	1804391	1804396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219223
33557	NC_020564	TG	3	6	1804465	1804470	0 %	50 %	50 %	0 %	470219223
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33559	NC_020564	AAAT	2	8	1804513	1804520	75 %	25 %	0 %	0 %	470219223
33560	NC_020564	ACT	2	6	1804549	1804554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219223
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33564	NC_020564	TAT	2	6	1804764	1804769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219223
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33566	NC_020564	TCA	2	6	1804820	1804825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219223
33567	NC_020564	CTA	2	6	1804827	1804832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219223
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33570	NC_020564	CCT	2	6	1804900	1804905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219224
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33584	NC_020564	TAA	2	6	1805579	1805584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219225
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33586	NC_020564	AATT	2	8	1805672	1805679	50 %	50 %	0 %	0 %	470219225
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33589	NC_020564	AGT	2	6	1805735	1805740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219225
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33596	NC_020564	T	6	6	1805964	1805969	0 %	100 %	0 %	0 %	470219225
33597	NC_020564	GTA	2	6	1805985	1805990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219225
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33600	NC_020564	TTGCT	2	10	1806167	1806176	0 %	60 %	20 %	20 %	470219225
33601	NC_020564	A	6	6	1806185	1806190	100 %	0 %	0 %	0 %	470219225
33602	NC_020564	TCA	3	9	1806216	1806224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219225
33603	NC_020564	TCA	2	6	1806261	1806266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219225
33604	NC_020564	TG	3	6	1806270	1806275	0 %	50 %	50 %	0 %	470219225
33605	NC_020564	TTG	2	6	1806292	1806297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219225
33606	NC_020564	TAC	2	6	1806302	1806307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219225
33607	NC_020564	CAAT	2	8	1806321	1806328	50 %	25 %	0 %	25 %	470219225
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33613	NC_020564	CAT	2	6	1806616	1806621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219225
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33615	NC_020564	TGT	2	6	1807086	1807091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219226
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33968	NC_020564	TTG	2	6	1829033	1829038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219241
33969	NC_020564	ATG	2	6	1829126	1829131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219241
33970	NC_020564	TGT	2	6	1829139	1829144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219241
33971	NC_020564	TA	3	6	1829152	1829157	50 %	50 %	0 %	0 %	470219241
33972	NC_020564	TTATTT	2	12	1829333	1829344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470219242
33973	NC_020564	TTG	2	6	1829388	1829393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219242
33974	NC_020564	CAT	2	6	1829397	1829402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219242
33975	NC_020564	TCA	2	6	1829459	1829464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219242
33976	NC_020564	ATA	2	6	1829488	1829493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219242
33977	NC_020564	AT	3	6	1829564	1829569	50 %	50 %	0 %	0 %	470219242
33978	NC_020564	AATA	2	8	1829572	1829579	75 %	25 %	0 %	0 %	470219242
33979	NC_020564	TGC	2	6	1829589	1829594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219242
33980	NC_020564	CTG	2	6	1829655	1829660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219242
33981	NC_020564	TAC	2	6	1829670	1829675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219242
33982	NC_020564	TGT	3	9	1829690	1829698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219242
33983	NC_020564	CTA	2	6	1829715	1829720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219242
33984	NC_020564	TAT	2	6	1829724	1829729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219242
33985	NC_020564	ACT	2	6	1829740	1829745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219242
33986	NC_020564	A	7	7	1829747	1829753	100 %	0 %	0 %	0 %	470219242
33987	NC_020564	AAC	2	6	1830135	1830140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219243
33988	NC_020564	GCG	2	6	1830196	1830201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470219243
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33990	NC_020564	TAA	2	6	1830226	1830231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219243
33991	NC_020564	TTA	2	6	1830234	1830239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219243
33992	NC_020564	ATG	2	6	1830252	1830257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219243
33993	NC_020564	TAA	2	6	1830263	1830268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219243
33994	NC_020564	AATC	2	8	1830285	1830292	50 %	25 %	0 %	25 %	470219243
33995	NC_020564	GAA	2	6	1830390	1830395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219243
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33997	NC_020564	TGA	2	6	1830437	1830442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219243
33998	NC_020564	AAC	2	6	1830446	1830451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219243
33999	NC_020564	ATCA	2	8	1830457	1830464	50 %	25 %	0 %	25 %	470219243
34000	NC_020564	GAT	2	6	1830465	1830470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219243

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