MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_020564	ATA	2	6	102659	102664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218014
2003	NC_020564	ATC	2	6	102665	102670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218014
2004	NC_020564	GTC	2	6	102712	102717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218014
2005	NC_020564	TCA	2	6	102723	102728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218014
2006	NC_020564	TG	3	6	102738	102743	0 %	50 %	50 %	0 %	470218014
2007	NC_020564	AAT	2	6	102787	102792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218014
2008	NC_020564	ATA	2	6	102843	102848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218014
2009	NC_020564	ATA	2	6	102872	102877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218014
2010	NC_020564	ATCGCA	2	12	102908	102919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218014
2011	NC_020564	GGTGA	2	10	102939	102948	20 %	20 %	60 %	0 %	470218014
2012	NC_020564	CAA	2	6	102978	102983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218014
2013	NC_020564	AAC	2	6	102994	102999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218014
2014	NC_020564	A	6	6	103075	103080	100 %	0 %	0 %	0 %	470218014
2015	NC_020564	CAA	2	6	103147	103152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218014
2016	NC_020564	GCA	2	6	103169	103174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218014
2017	NC_020564	ACA	2	6	103220	103225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218014
2018	NC_020564	CTA	2	6	103320	103325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218014
2019	NC_020564	ATT	2	6	103392	103397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218015
2020	NC_020564	ATC	2	6	103495	103500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218015
2021	NC_020564	GTT	2	6	103510	103515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218015
2022	NC_020564	GCA	2	6	103583	103588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218015
2023	NC_020564	TAC	2	6	103612	103617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218015
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2029	NC_020564	ATC	2	6	103864	103869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218015
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2051	NC_020564	GAT	2	6	105363	105368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218016
2052	NC_020564	TGAT	2	8	105397	105404	25 %	50 %	25 %	0 %	470218016
2053	NC_020564	ATT	2	6	105441	105446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218016
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2056	NC_020564	A	6	6	105559	105564	100 %	0 %	0 %	0 %	470218016
2057	NC_020564	GAAT	2	8	105591	105598	50 %	25 %	25 %	0 %	470218016
2058	NC_020564	TGT	2	6	105606	105611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218017
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2091	NC_020564	A	6	6	107087	107092	100 %	0 %	0 %	0 %	470218018
2092	NC_020564	ATCA	2	8	107138	107145	50 %	25 %	0 %	25 %	470218018
2093	NC_020564	GCA	2	6	107161	107166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218018
2094	NC_020564	GACA	2	8	107250	107257	50 %	0 %	25 %	25 %	470218018
2095	NC_020564	GTTG	2	8	107367	107374	0 %	50 %	50 %	0 %	470218018
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2114	NC_020564	CAAA	2	8	108276	108283	75 %	0 %	0 %	25 %	470218018
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2122	NC_020564	TGT	2	6	108721	108726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218019
2123	NC_020564	TCAG	2	8	108803	108810	25 %	25 %	25 %	25 %	470218019
2124	NC_020564	TGA	2	6	108879	108884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218019
2125	NC_020564	TTA	2	6	108894	108899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218019
2126	NC_020564	ATTG	2	8	108931	108938	25 %	50 %	25 %	0 %	470218019
2127	NC_020564	TAA	2	6	108976	108981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218019
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2130	NC_020564	TAT	2	6	109036	109041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218019
2131	NC_020564	TATG	2	8	109066	109073	25 %	50 %	25 %	0 %	470218019
2132	NC_020564	CAC	2	6	109092	109097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218019
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2135	NC_020564	TA	4	8	109233	109240	50 %	50 %	0 %	0 %	470218019
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2142	NC_020564	TAC	2	6	109483	109488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218019
2143	NC_020564	CTA	2	6	109494	109499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218019
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2146	NC_020564	AATCA	2	10	109565	109574	60 %	20 %	0 %	20 %	470218019
2147	NC_020564	CA	3	6	109580	109585	50 %	0 %	0 %	50 %	470218019
2148	NC_020564	A	6	6	109611	109616	100 %	0 %	0 %	0 %	470218019
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2152	NC_020564	AAC	2	6	109847	109852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218020
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2155	NC_020564	ATA	2	6	109954	109959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218020
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2164	NC_020564	TACG	2	8	110470	110477	25 %	25 %	25 %	25 %	470218020
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2223	NC_020564	TCA	2	6	113046	113051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218021
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2229	NC_020564	TGT	2	6	113203	113208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218022
2230	NC_020564	ATG	2	6	113235	113240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218022
2231	NC_020564	AGC	2	6	113272	113277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218022
2232	NC_020564	GATA	2	8	113311	113318	50 %	25 %	25 %	0 %	470218022
2233	NC_020564	TAT	2	6	113356	113361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218022
2234	NC_020564	TTA	2	6	113416	113421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218022
2235	NC_020564	AAG	2	6	113434	113439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218022
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2237	NC_020564	AGA	2	6	113533	113538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218022
2238	NC_020564	TGA	2	6	113650	113655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218022
2239	NC_020564	TGAAGA	2	12	113731	113742	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470218022
2240	NC_020564	GGCA	2	8	113754	113761	25 %	0 %	50 %	25 %	470218022
2241	NC_020564	ATTT	2	8	113776	113783	25 %	75 %	0 %	0 %	470218022
2242	NC_020564	TGA	2	6	113788	113793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218022
2243	NC_020564	AT	3	6	113804	113809	50 %	50 %	0 %	0 %	470218022
2244	NC_020564	GAT	2	6	113852	113857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218022
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2486	NC_020564	TTA	2	6	125843	125848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218034
2487	NC_020564	AAT	2	6	125887	125892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218034
2488	NC_020564	CAA	2	6	125897	125902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218034
2489	NC_020564	TGAT	2	8	125974	125981	25 %	50 %	25 %	0 %	470218034
2490	NC_020564	GTC	2	6	126022	126027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218034
2491	NC_020564	GCTT	2	8	126098	126105	0 %	50 %	25 %	25 %	470218034
2492	NC_020564	T	7	7	126119	126125	0 %	100 %	0 %	0 %	470218034
2493	NC_020564	ATA	2	6	126127	126132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218034
2494	NC_020564	CAAA	2	8	126168	126175	75 %	0 %	0 %	25 %	470218034
2495	NC_020564	TAAT	2	8	126209	126216	50 %	50 %	0 %	0 %	470218034
2496	NC_020564	TGA	2	6	126217	126222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218034
2497	NC_020564	TTTG	2	8	126296	126303	0 %	75 %	25 %	0 %	470218034
2498	NC_020564	TCCCT	2	10	126319	126328	0 %	40 %	0 %	60 %	470218034
2499	NC_020564	CT	3	6	126335	126340	0 %	50 %	0 %	50 %	470218034
2500	NC_020564	GC	3	6	126403	126408	0 %	0 %	50 %	50 %	470218034

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