MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020564	TAA	2	6	26379	26384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217962
503	NC_020564	AAG	2	6	26402	26407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217962
504	NC_020564	TAT	2	6	26472	26477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217962
505	NC_020564	CCG	2	6	26487	26492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470217962
506	NC_020564	AGA	2	6	26547	26552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217962
507	NC_020564	CAT	2	6	26553	26558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217962
508	NC_020564	GAA	2	6	26608	26613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217962
509	NC_020564	AAT	2	6	26623	26628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217962
510	NC_020564	T	6	6	26634	26639	0 %	100 %	0 %	0 %	470217962
511	NC_020564	GAA	3	9	26653	26661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217962
512	NC_020564	AAC	3	9	26750	26758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217962
513	NC_020564	CGT	2	6	26773	26778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217962
514	NC_020564	TTG	2	6	26783	26788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217962
515	NC_020564	GAA	2	6	26851	26856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217962
516	NC_020564	GAA	2	6	26908	26913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217962
517	NC_020564	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470217962
518	NC_020564	TAA	2	6	27018	27023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217962
519	NC_020564	ATT	2	6	27025	27030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217962
520	NC_020564	ACA	2	6	27058	27063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217962
521	NC_020564	GGT	2	6	27325	27330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217962
522	NC_020564	ATCT	2	8	27417	27424	25 %	50 %	0 %	25 %	470217962
523	NC_020564	AAT	2	6	27470	27475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217962
524	NC_020564	TGA	2	6	27516	27521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217963
525	NC_020564	AT	3	6	27535	27540	50 %	50 %	0 %	0 %	470217963
526	NC_020564	AAG	2	6	27590	27595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217963
527	NC_020564	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470217963
528	NC_020564	ATT	2	6	27662	27667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217963
529	NC_020564	ATC	2	6	27681	27686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217963
530	NC_020564	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470217963
531	NC_020564	TCG	2	6	27772	27777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217963
532	NC_020564	TGA	2	6	27789	27794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217963
533	NC_020564	ATT	2	6	27820	27825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217963
534	NC_020564	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470217963
535	NC_020564	ATG	2	6	27930	27935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217963
536	NC_020564	TGA	2	6	27937	27942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217963
537	NC_020564	AAC	2	6	27994	27999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217963
538	NC_020564	T	6	6	28018	28023	0 %	100 %	0 %	0 %	470217963
539	NC_020564	AGC	2	6	28033	28038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217963
540	NC_020564	A	6	6	28043	28048	100 %	0 %	0 %	0 %	470217963
541	NC_020564	ATC	2	6	28070	28075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217963
542	NC_020564	ACAA	2	8	28076	28083	75 %	0 %	0 %	25 %	470217963
543	NC_020564	ACG	2	6	28100	28105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217963
544	NC_020564	AATG	2	8	28180	28187	50 %	25 %	25 %	0 %	470217963
545	NC_020564	TCGT	2	8	28212	28219	0 %	50 %	25 %	25 %	470217963
546	NC_020564	GTG	2	6	28230	28235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217963
547	NC_020564	ACA	2	6	28245	28250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217963
548	NC_020564	ATA	2	6	28251	28256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217963
549	NC_020564	GAA	2	6	28340	28345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217963
550	NC_020564	TTA	2	6	28368	28373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217963
551	NC_020564	TGG	2	6	28381	28386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217963
552	NC_020564	AAT	2	6	28421	28426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217963
553	NC_020564	TAA	2	6	28477	28482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217963
554	NC_020564	TCG	2	6	28537	28542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217963
555	NC_020564	ATA	2	6	28581	28586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217963
556	NC_020564	AACA	2	8	28657	28664	75 %	0 %	0 %	25 %	470217963
557	NC_020564	ATG	2	6	28758	28763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217963
558	NC_020564	TAA	2	6	28879	28884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217964
559	NC_020564	CA	3	6	28896	28901	50 %	0 %	0 %	50 %	470217964
560	NC_020564	AAG	2	6	28941	28946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217964
561	NC_020564	TGG	2	6	29071	29076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217964
562	NC_020564	ATT	2	6	29080	29085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217964
563	NC_020564	GT	3	6	29160	29165	0 %	50 %	50 %	0 %	470217964
564	NC_020564	AATT	2	8	29194	29201	50 %	50 %	0 %	0 %	470217964
565	NC_020564	AGA	2	6	29281	29286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217964
566	NC_020564	CAAT	2	8	29309	29316	50 %	25 %	0 %	25 %	470217964
567	NC_020564	GATG	2	8	29317	29324	25 %	25 %	50 %	0 %	470217964
568	NC_020564	AAG	2	6	29351	29356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217964
569	NC_020564	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470217964
570	NC_020564	A	6	6	29414	29419	100 %	0 %	0 %	0 %	470217964
571	NC_020564	TGA	2	6	29422	29427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217964
572	NC_020564	TAC	2	6	29450	29455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217964
573	NC_020564	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470217964
574	NC_020564	TACT	2	8	29539	29546	25 %	50 %	0 %	25 %	470217964
575	NC_020564	ATA	2	6	29562	29567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217964
576	NC_020564	ATT	2	6	29576	29581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217964
577	NC_020564	GTA	2	6	30016	30021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217965
578	NC_020564	GAA	2	6	30096	30101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217965
579	NC_020564	GGCA	2	8	30238	30245	25 %	0 %	50 %	25 %	470217965
580	NC_020564	AAAG	2	8	30251	30258	75 %	0 %	25 %	0 %	470217965
581	NC_020564	ATG	2	6	30352	30357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217965
582	NC_020564	ATA	2	6	30385	30390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217965
583	NC_020564	AAG	2	6	30396	30401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217965
584	NC_020564	AAC	2	6	30535	30540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217965
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586	NC_020564	AAG	2	6	30721	30726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217965
587	NC_020564	AT	3	6	30765	30770	50 %	50 %	0 %	0 %	470217965
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589	NC_020564	TTA	2	6	31015	31020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217966
590	NC_020564	GTA	2	6	31117	31122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217966
591	NC_020564	CAA	2	6	31139	31144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217966
592	NC_020564	CAA	2	6	31153	31158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217966
593	NC_020564	CAA	2	6	31166	31171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217966
594	NC_020564	TCA	2	6	31182	31187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217966
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596	NC_020564	CAAC	2	8	31205	31212	50 %	0 %	0 %	50 %	470217966
597	NC_020564	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470217966
598	NC_020564	TGA	2	6	31239	31244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217966
599	NC_020564	CAG	2	6	31292	31297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217966
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601	NC_020564	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470217966
602	NC_020564	ACA	2	6	31335	31340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217966
603	NC_020564	CAC	2	6	31409	31414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470217966
604	NC_020564	TGC	2	6	31422	31427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217966
605	NC_020564	ACA	3	9	31441	31449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217966
606	NC_020564	TACA	2	8	31460	31467	50 %	25 %	0 %	25 %	470217966
607	NC_020564	GAA	2	6	31492	31497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217966
608	NC_020564	GAA	2	6	31618	31623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217966
609	NC_020564	AATG	2	8	31635	31642	50 %	25 %	25 %	0 %	470217966
610	NC_020564	ATG	2	6	31652	31657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217966
611	NC_020564	CG	3	6	31768	31773	0 %	0 %	50 %	50 %	470217966
612	NC_020564	CAA	2	6	31784	31789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217966
613	NC_020564	ATT	2	6	31819	31824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217966
614	NC_020564	CAG	2	6	31910	31915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217966
615	NC_020564	ATG	2	6	31918	31923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217966
616	NC_020564	TGT	2	6	31950	31955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217966
617	NC_020564	GTG	2	6	32000	32005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217966
618	NC_020564	GAA	2	6	32043	32048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217966
619	NC_020564	ATG	2	6	32111	32116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217966
620	NC_020564	CAG	2	6	32297	32302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217966
621	NC_020564	TTA	2	6	32306	32311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217966
622	NC_020564	ATA	2	6	32318	32323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217966
623	NC_020564	GACT	2	8	32433	32440	25 %	25 %	25 %	25 %	470217966
624	NC_020564	TGG	2	6	32454	32459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217966
625	NC_020564	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470217966
626	NC_020564	CAA	2	6	32600	32605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217966
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