MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020564	ATT	2	6	282005	282010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218145
5502	NC_020564	GCA	2	6	282021	282026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218145
5503	NC_020564	GT	3	6	282065	282070	0 %	50 %	50 %	0 %	470218145
5504	NC_020564	AGG	2	6	282091	282096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218145
5505	NC_020564	AATA	2	8	282097	282104	75 %	25 %	0 %	0 %	470218145
5506	NC_020564	GAT	2	6	282122	282127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218146
5507	NC_020564	TTA	2	6	282158	282163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218146
5508	NC_020564	TGG	2	6	282172	282177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218146
5509	NC_020564	GAA	2	6	282182	282187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218146
5510	NC_020564	ACT	2	6	282226	282231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218146
5511	NC_020564	ATCA	2	8	282233	282240	50 %	25 %	0 %	25 %	470218146
5512	NC_020564	ATT	2	6	282332	282337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218146
5513	NC_020564	GTGC	2	8	282446	282453	0 %	25 %	50 %	25 %	470218146
5514	NC_020564	GAT	2	6	282467	282472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218146
5515	NC_020564	CAA	2	6	282563	282568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218146
5516	NC_020564	ATT	2	6	282572	282577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218146
5517	NC_020564	CA	3	6	282586	282591	50 %	0 %	0 %	50 %	470218146
5518	NC_020564	CATA	2	8	282607	282614	50 %	25 %	0 %	25 %	470218146
5519	NC_020564	ACA	2	6	282635	282640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218146
5520	NC_020564	AT	3	6	282703	282708	50 %	50 %	0 %	0 %	470218146
5521	NC_020564	CAA	2	6	282737	282742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218146
5522	NC_020564	AC	3	6	283415	283420	50 %	0 %	0 %	50 %	470218147
5523	NC_020564	ATT	2	6	283470	283475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218147
5524	NC_020564	A	6	6	283478	283483	100 %	0 %	0 %	0 %	470218147
5525	NC_020564	TCT	2	6	283493	283498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218147
5526	NC_020564	ATT	2	6	283591	283596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218147
5527	NC_020564	CTT	3	9	283599	283607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218147
5528	NC_020564	CAA	2	6	283616	283621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218147
5529	NC_020564	TA	3	6	283640	283645	50 %	50 %	0 %	0 %	470218147
5530	NC_020564	AGG	2	6	283686	283691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218147
5531	NC_020564	TTA	2	6	283717	283722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218147
5532	NC_020564	ATT	2	6	283723	283728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218147
5533	NC_020564	ATG	2	6	283760	283765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218147
5534	NC_020564	AGC	2	6	283788	283793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218147
5535	NC_020564	GGT	2	6	283831	283836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218147
5536	NC_020564	CAT	2	6	283850	283855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218147
5537	NC_020564	ATT	2	6	283879	283884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218147
5538	NC_020564	TAA	2	6	283896	283901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218147
5539	NC_020564	CA	3	6	283966	283971	50 %	0 %	0 %	50 %	470218147
5540	NC_020564	AGA	2	6	284007	284012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218147
5541	NC_020564	GTT	2	6	284050	284055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218147
5542	NC_020564	TTC	2	6	284086	284091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218147
5543	NC_020564	TATT	2	8	284196	284203	25 %	75 %	0 %	0 %	470218148
5544	NC_020564	TGG	2	6	284296	284301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218148
5545	NC_020564	GTA	2	6	284333	284338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218148
5546	NC_020564	AAT	2	6	284420	284425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218148
5547	NC_020564	ATC	2	6	284448	284453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218148
5548	NC_020564	ATA	2	6	284481	284486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218148
5549	NC_020564	CAT	2	6	284507	284512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218148
5550	NC_020564	TAG	2	6	284539	284544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218148
5551	NC_020564	ATC	2	6	284550	284555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218148
5552	NC_020564	CTTA	2	8	284787	284794	25 %	50 %	0 %	25 %	470218148
5553	NC_020564	AATA	2	8	285061	285068	75 %	25 %	0 %	0 %	470218149
5554	NC_020564	GGT	2	6	285103	285108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218149
5555	NC_020564	TTG	2	6	285119	285124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218149
5556	NC_020564	ATG	2	6	285230	285235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218149
5557	NC_020564	ATTA	2	8	285294	285301	50 %	50 %	0 %	0 %	470218149
5558	NC_020564	AG	3	6	285318	285323	50 %	0 %	50 %	0 %	470218149
5559	NC_020564	AAGTAA	2	12	285371	285382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218149
5560	NC_020564	GTC	2	6	285416	285421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218149
5561	NC_020564	AAG	2	6	285434	285439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218149
5562	NC_020564	AG	3	6	285457	285462	50 %	0 %	50 %	0 %	470218149
5563	NC_020564	GAA	2	6	285499	285504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218149
5564	NC_020564	AGA	2	6	285579	285584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218149
5565	NC_020564	TCAT	2	8	285599	285606	25 %	50 %	0 %	25 %	470218149
5566	NC_020564	GTT	2	6	285690	285695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218149
5567	NC_020564	AT	3	6	285711	285716	50 %	50 %	0 %	0 %	470218149
5568	NC_020564	ACA	3	9	285717	285725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218149
5569	NC_020564	TTA	2	6	285752	285757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218149
5570	NC_020564	AATG	2	8	285792	285799	50 %	25 %	25 %	0 %	470218149
5571	NC_020564	TAA	2	6	285857	285862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218150
5572	NC_020564	GGT	2	6	285937	285942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218150
5573	NC_020564	GTG	2	6	285974	285979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218150
5574	NC_020564	TAT	2	6	286027	286032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218150
5575	NC_020564	ATC	2	6	286058	286063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218150
5576	NC_020564	TACG	2	8	286112	286119	25 %	25 %	25 %	25 %	470218150
5577	NC_020564	GAA	2	6	286171	286176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218150
5578	NC_020564	TGA	2	6	286203	286208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218150
5579	NC_020564	TGT	2	6	286233	286238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218150
5580	NC_020564	TGG	2	6	286284	286289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218150
5581	NC_020564	ATT	2	6	286313	286318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218150
5582	NC_020564	ATAAAG	2	12	286352	286363	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218150
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5585	NC_020564	CAT	2	6	286495	286500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218150
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5587	NC_020564	TTA	2	6	286680	286685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218150
5588	NC_020564	A	7	7	286699	286705	100 %	0 %	0 %	0 %	470218150
5589	NC_020564	ATG	2	6	286724	286729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218150
5590	NC_020564	AAG	2	6	286739	286744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218150
5591	NC_020564	GAC	2	6	286747	286752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218150
5592	NC_020564	CAG	2	6	286762	286767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218150
5593	NC_020564	TTA	2	6	286794	286799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218150
5594	NC_020564	ATG	2	6	286820	286825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218150
5595	NC_020564	TAC	2	6	286830	286835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218150
5596	NC_020564	ACA	2	6	286844	286849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218150
5597	NC_020564	GGT	2	6	286858	286863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218150
5598	NC_020564	TGA	2	6	287010	287015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218150
5599	NC_020564	ATG	2	6	287036	287041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218150
5600	NC_020564	CAG	2	6	287075	287080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218150
5601	NC_020564	GAA	2	6	287172	287177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218150
5602	NC_020564	AT	3	6	287191	287196	50 %	50 %	0 %	0 %	470218150
5603	NC_020564	ATG	2	6	287210	287215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218150
5604	NC_020564	A	6	6	287239	287244	100 %	0 %	0 %	0 %	470218150
5605	NC_020564	CAA	2	6	287263	287268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218150
5606	NC_020564	T	6	6	287794	287799	0 %	100 %	0 %	0 %	470218151
5607	NC_020564	T	7	7	287881	287887	0 %	100 %	0 %	0 %	470218151
5608	NC_020564	CAA	2	6	287916	287921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218151
5609	NC_020564	TGA	2	6	288002	288007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218151
5610	NC_020564	GACATT	2	12	288043	288054	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218151
5611	NC_020564	TGC	2	6	288058	288063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218151
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5613	NC_020564	TG	3	6	288083	288088	0 %	50 %	50 %	0 %	470218151
5614	NC_020564	GTA	2	6	288154	288159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218151
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5616	NC_020564	TCA	2	6	288239	288244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218151
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5619	NC_020564	CTG	3	9	288297	288305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218151
5620	NC_020564	TTAT	2	8	288338	288345	25 %	75 %	0 %	0 %	470218151
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5991	NC_020564	ACT	2	6	307981	307986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218165
5992	NC_020564	TAT	2	6	307987	307992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218165
5993	NC_020564	TGGA	2	8	307995	308002	25 %	25 %	50 %	0 %	470218165
5994	NC_020564	AGGACA	2	12	308006	308017	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470218165
5995	NC_020564	TGA	2	6	308021	308026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218165
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5999	NC_020564	GAA	2	6	308220	308225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218165
6000	NC_020564	CAA	2	6	308259	308264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218165

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