MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020564	ATTA	2	8	253270	253277	50 %	50 %	0 %	0 %	470218126
5002	NC_020564	ATC	2	6	253279	253284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218126
5003	NC_020564	TAT	2	6	253293	253298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218126
5004	NC_020564	TTA	2	6	253310	253315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218126
5005	NC_020564	T	6	6	253327	253332	0 %	100 %	0 %	0 %	470218126
5006	NC_020564	TCA	2	6	253436	253441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218126
5007	NC_020564	T	6	6	253471	253476	0 %	100 %	0 %	0 %	470218126
5008	NC_020564	GAC	2	6	253518	253523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218126
5009	NC_020564	TAA	2	6	253582	253587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218126
5010	NC_020564	TTTG	2	8	253608	253615	0 %	75 %	25 %	0 %	470218126
5011	NC_020564	AT	3	6	253634	253639	50 %	50 %	0 %	0 %	470218126
5012	NC_020564	ATGAT	2	10	253718	253727	40 %	40 %	20 %	0 %	470218126
5013	NC_020564	T	7	7	253755	253761	0 %	100 %	0 %	0 %	470218126
5014	NC_020564	AAG	2	6	253785	253790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218126
5015	NC_020564	ATT	2	6	253828	253833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218126
5016	NC_020564	TTA	2	6	253850	253855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218126
5017	NC_020564	TTA	2	6	253869	253874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218126
5018	NC_020564	ATC	2	6	253876	253881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218126
5019	NC_020564	ATT	2	6	253909	253914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218126
5020	NC_020564	TCT	2	6	253919	253924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218126
5021	NC_020564	TAA	2	6	254078	254083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218126
5022	NC_020564	TGA	2	6	254173	254178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218126
5023	NC_020564	T	7	7	254208	254214	0 %	100 %	0 %	0 %	470218126
5024	NC_020564	TGA	2	6	254321	254326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218126
5025	NC_020564	AAT	2	6	254375	254380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218126
5026	NC_020564	GCA	2	6	254387	254392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218126
5027	NC_020564	CTG	2	6	254511	254516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218126
5028	NC_020564	TTCAT	2	10	254543	254552	20 %	60 %	0 %	20 %	470218126
5029	NC_020564	ACC	2	6	255562	255567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218127
5030	NC_020564	TTC	2	6	255610	255615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218127
5031	NC_020564	GT	3	6	255646	255651	0 %	50 %	50 %	0 %	470218127
5032	NC_020564	TGT	2	6	255713	255718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218127
5033	NC_020564	CTA	2	6	255783	255788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218127
5034	NC_020564	CTT	2	6	255888	255893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218127
5035	NC_020564	TTG	2	6	255912	255917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218127
5036	NC_020564	TGT	2	6	255937	255942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218127
5037	NC_020564	T	7	7	255974	255980	0 %	100 %	0 %	0 %	470218127
5038	NC_020564	TTC	2	6	256084	256089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218127
5039	NC_020564	CAT	2	6	256168	256173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218127
5040	NC_020564	TTC	2	6	256261	256266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218127
5041	NC_020564	TAA	2	6	256294	256299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218127
5042	NC_020564	TAA	2	6	256380	256385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218127
5043	NC_020564	GTTT	2	8	256565	256572	0 %	75 %	25 %	0 %	470218127
5044	NC_020564	TTG	2	6	257263	257268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218128
5045	NC_020564	TCA	2	6	257278	257283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218128
5046	NC_020564	GAG	2	6	257308	257313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218128
5047	NC_020564	CAA	2	6	257350	257355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218128
5048	NC_020564	ATG	2	6	257392	257397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218128
5049	NC_020564	TGC	2	6	257423	257428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218128
5050	NC_020564	TTG	2	6	257491	257496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218128
5051	NC_020564	ATT	2	6	257645	257650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218128
5052	NC_020564	AAGCG	2	10	257654	257663	40 %	0 %	40 %	20 %	470218128
5053	NC_020564	ATT	2	6	257697	257702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218128
5054	NC_020564	AAC	2	6	257779	257784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218128
5055	NC_020564	GCA	2	6	257835	257840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218128
5056	NC_020564	ATT	2	6	257847	257852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218128
5057	NC_020564	TTA	2	6	257870	257875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218128
5058	NC_020564	ATT	2	6	257951	257956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218128
5059	NC_020564	ATG	2	6	257968	257973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218128
5060	NC_020564	AAG	2	6	257974	257979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218128
5061	NC_020564	CAG	2	6	257998	258003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218128
5062	NC_020564	TCA	2	6	258004	258009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218128
5063	NC_020564	CGT	2	6	258029	258034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218128
5064	NC_020564	ACG	2	6	258049	258054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218128
5065	NC_020564	AGA	2	6	258113	258118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218128
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5068	NC_020564	TTG	2	6	258694	258699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218129
5069	NC_020564	TGC	2	6	258700	258705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218129
5070	NC_020564	TCT	2	6	258713	258718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218129
5071	NC_020564	AAATT	2	10	258734	258743	60 %	40 %	0 %	0 %	470218129
5072	NC_020564	CA	3	6	258785	258790	50 %	0 %	0 %	50 %	470218129
5073	NC_020564	GTTT	2	8	258817	258824	0 %	75 %	25 %	0 %	470218129
5074	NC_020564	CAT	2	6	258913	258918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218129
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5077	NC_020564	AAACT	2	10	258977	258986	60 %	20 %	0 %	20 %	470218129
5078	NC_020564	AGTG	2	8	259018	259025	25 %	25 %	50 %	0 %	470218129
5079	NC_020564	CCG	2	6	259043	259048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470218129
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5081	NC_020564	TG	3	6	259075	259080	0 %	50 %	50 %	0 %	470218129
5082	NC_020564	CAC	2	6	259098	259103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218129
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5086	NC_020564	AAT	2	6	259158	259163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218129
5087	NC_020564	AGA	2	6	259197	259202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218129
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5089	NC_020564	GTAA	2	8	259272	259279	50 %	25 %	25 %	0 %	470218129
5090	NC_020564	A	6	6	259278	259283	100 %	0 %	0 %	0 %	470218129
5091	NC_020564	CCA	2	6	259367	259372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218129
5092	NC_020564	CCA	2	6	259472	259477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218129
5093	NC_020564	GGT	2	6	259493	259498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218129
5094	NC_020564	TGT	2	6	259518	259523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218129
5095	NC_020564	ATA	2	6	259538	259543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218129
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5099	NC_020564	TAA	2	6	259822	259827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218129
5100	NC_020564	CAC	2	6	259878	259883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218129
5101	NC_020564	CAA	2	6	259891	259896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218129
5102	NC_020564	CTG	2	6	259948	259953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218129
5103	NC_020564	TCA	2	6	259974	259979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218129
5104	NC_020564	ATT	2	6	260351	260356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218130
5105	NC_020564	GAT	2	6	260378	260383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218130
5106	NC_020564	AAC	2	6	260440	260445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218130
5107	NC_020564	AATC	2	8	260456	260463	50 %	25 %	0 %	25 %	470218130
5108	NC_020564	TTAA	2	8	260552	260559	50 %	50 %	0 %	0 %	470218130
5109	NC_020564	TGA	2	6	260679	260684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218130
5110	NC_020564	GTG	2	6	260796	260801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218130
5111	NC_020564	CAG	2	6	260826	260831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218130
5112	NC_020564	AGC	2	6	260857	260862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218130
5113	NC_020564	AAT	2	6	260966	260971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218130
5114	NC_020564	TCG	2	6	260985	260990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218130
5115	NC_020564	ATT	2	6	260995	261000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218130
5116	NC_020564	AAG	2	6	261011	261016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218130
5117	NC_020564	ATGG	2	8	261038	261045	25 %	25 %	50 %	0 %	470218130
5118	NC_020564	ATG	2	6	261057	261062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218130
5119	NC_020564	CAG	2	6	261213	261218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218130
5120	NC_020564	GAA	2	6	261227	261232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218130
5121	NC_020564	AAT	3	9	261270	261278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218130
5122	NC_020564	AGG	2	6	261599	261604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218131
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5155	NC_020564	TGA	2	6	263384	263389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218131
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5231	NC_020564	TAT	2	6	268133	268138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218135
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5233	NC_020564	AAGA	2	8	268194	268201	75 %	0 %	25 %	0 %	470218135
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5239	NC_020564	ATT	2	6	268907	268912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218136
5240	NC_020564	A	7	7	268957	268963	100 %	0 %	0 %	0 %	470218136
5241	NC_020564	AGT	2	6	268990	268995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218136
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5244	NC_020564	TAA	2	6	269065	269070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218136
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5370	NC_020564	TGT	2	6	275661	275666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218141
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5399	NC_020564	AT	3	6	277270	277275	50 %	50 %	0 %	0 %	470218142
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5404	NC_020564	ATG	2	6	277563	277568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218143
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5476	NC_020564	TATCT	2	10	280716	280725	20 %	60 %	0 %	20 %	470218145
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5486	NC_020564	AAG	2	6	281242	281247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218145
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5488	NC_020564	AGC	2	6	281297	281302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218145
5489	NC_020564	TCG	2	6	281335	281340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218145
5490	NC_020564	TAG	2	6	281423	281428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218145
5491	NC_020564	AAGT	2	8	281459	281466	50 %	25 %	25 %	0 %	470218145
5492	NC_020564	T	6	6	281516	281521	0 %	100 %	0 %	0 %	470218145
5493	NC_020564	TTCAA	2	10	281523	281532	40 %	40 %	0 %	20 %	470218145
5494	NC_020564	AATA	2	8	281558	281565	75 %	25 %	0 %	0 %	470218145
5495	NC_020564	T	6	6	281603	281608	0 %	100 %	0 %	0 %	470218145
5496	NC_020564	GTGC	2	8	281670	281677	0 %	25 %	50 %	25 %	470218145
5497	NC_020564	ACC	2	6	281762	281767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218145
5498	NC_020564	TAT	2	6	281879	281884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218145
5499	NC_020564	TTG	2	6	281928	281933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218145
5500	NC_020564	AGAATC	2	12	281948	281959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470218145

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