MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020564	TAAAT	2	10	225480	225489	60 %	40 %	0 %	0 %	470218108
4502	NC_020564	AGC	2	6	225491	225496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218108
4503	NC_020564	ATG	2	6	225497	225502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218108
4504	NC_020564	TTA	2	6	225566	225571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218108
4505	NC_020564	GAA	2	6	225576	225581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218108
4506	NC_020564	CGA	2	6	225587	225592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218108
4507	NC_020564	GAA	3	9	225793	225801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218108
4508	NC_020564	CAT	2	6	225957	225962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218109
4509	NC_020564	TGG	2	6	225993	225998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218109
4510	NC_020564	GAT	2	6	226086	226091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218109
4511	NC_020564	TTG	2	6	226154	226159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218109
4512	NC_020564	GGT	2	6	226164	226169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218109
4513	NC_020564	GAC	2	6	226260	226265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218109
4514	NC_020564	TAA	2	6	226296	226301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218109
4515	NC_020564	ATT	2	6	226311	226316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218109
4516	NC_020564	CA	3	6	226339	226344	50 %	0 %	0 %	50 %	470218109
4517	NC_020564	A	6	6	226363	226368	100 %	0 %	0 %	0 %	470218109
4518	NC_020564	TGGT	2	8	226385	226392	0 %	50 %	50 %	0 %	470218109
4519	NC_020564	TAG	2	6	226400	226405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218109
4520	NC_020564	TGGG	2	8	226440	226447	0 %	25 %	75 %	0 %	470218109
4521	NC_020564	AAC	2	6	226589	226594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218109
4522	NC_020564	GAT	2	6	226645	226650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218109
4523	NC_020564	AGCA	2	8	226683	226690	50 %	0 %	25 %	25 %	470218109
4524	NC_020564	ATTT	2	8	226772	226779	25 %	75 %	0 %	0 %	470218109
4525	NC_020564	AT	3	6	226789	226794	50 %	50 %	0 %	0 %	470218109
4526	NC_020564	AAAGC	2	10	226820	226829	60 %	0 %	20 %	20 %	470218109
4527	NC_020564	GA	3	6	226861	226866	50 %	0 %	50 %	0 %	470218109
4528	NC_020564	AGA	2	6	226902	226907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218109
4529	NC_020564	GAA	2	6	226924	226929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218109
4530	NC_020564	TAT	2	6	227078	227083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218110
4531	NC_020564	TGGAT	2	10	227130	227139	20 %	40 %	40 %	0 %	470218110
4532	NC_020564	GGT	2	6	227158	227163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218110
4533	NC_020564	GTT	2	6	227196	227201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218110
4534	NC_020564	CAGA	2	8	227243	227250	50 %	0 %	25 %	25 %	470218110
4535	NC_020564	AAG	2	6	227315	227320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218110
4536	NC_020564	GTT	2	6	227374	227379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218110
4537	NC_020564	GAT	2	6	227407	227412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218110
4538	NC_020564	AT	3	6	227625	227630	50 %	50 %	0 %	0 %	470218110
4539	NC_020564	TGG	2	6	227659	227664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218110
4540	NC_020564	TGC	2	6	227682	227687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218110
4541	NC_020564	TCA	2	6	227718	227723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218110
4542	NC_020564	TTA	3	9	227882	227890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218110
4543	NC_020564	TAT	2	6	227931	227936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218110
4544	NC_020564	AGA	2	6	227943	227948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218110
4545	NC_020564	CAG	2	6	228002	228007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218110
4546	NC_020564	TGG	2	6	228013	228018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218110
4547	NC_020564	ATA	2	6	228021	228026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218110
4548	NC_020564	TCT	2	6	228404	228409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218111
4549	NC_020564	TAA	2	6	228448	228453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
4550	NC_020564	GT	3	6	228472	228477	0 %	50 %	50 %	0 %	470218111
4551	NC_020564	TAA	3	9	228478	228486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
4552	NC_020564	ATG	2	6	228506	228511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218111
4553	NC_020564	AAG	2	6	228515	228520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218111
4554	NC_020564	TA	3	6	228543	228548	50 %	50 %	0 %	0 %	470218111
4555	NC_020564	TAA	2	6	228558	228563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
4556	NC_020564	AAT	2	6	228584	228589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
4557	NC_020564	ACC	2	6	228604	228609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218111
4558	NC_020564	TAA	2	6	228618	228623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
4559	NC_020564	ATAA	2	8	228626	228633	75 %	25 %	0 %	0 %	470218111
4560	NC_020564	TAA	2	6	228699	228704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
4561	NC_020564	GT	3	6	228739	228744	0 %	50 %	50 %	0 %	470218111
4562	NC_020564	ATAG	2	8	228866	228873	50 %	25 %	25 %	0 %	470218111
4563	NC_020564	ATG	2	6	228878	228883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218111
4564	NC_020564	TCC	2	6	228884	228889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470218111
4565	NC_020564	ACA	2	6	228923	228928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218111
4566	NC_020564	T	6	6	229118	229123	0 %	100 %	0 %	0 %	470218112
4567	NC_020564	CTTT	2	8	229200	229207	0 %	75 %	0 %	25 %	470218112
4568	NC_020564	AAC	2	6	229247	229252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218112
4569	NC_020564	GGC	2	6	229258	229263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218112
4570	NC_020564	TAT	2	6	229396	229401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
4571	NC_020564	CTTA	2	8	229408	229415	25 %	50 %	0 %	25 %	470218112
4572	NC_020564	ATT	2	6	229480	229485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
4573	NC_020564	TGG	2	6	229525	229530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218112
4574	NC_020564	ATA	2	6	229611	229616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218112
4575	NC_020564	GGT	2	6	229619	229624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218112
4576	NC_020564	GGT	2	6	229634	229639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218112
4577	NC_020564	TTC	2	6	229664	229669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218112
4578	NC_020564	ATT	2	6	229735	229740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
4579	NC_020564	GAT	2	6	229751	229756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218112
4580	NC_020564	AGA	2	6	229759	229764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218112
4581	NC_020564	GAA	2	6	229784	229789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218112
4582	NC_020564	A	6	6	229856	229861	100 %	0 %	0 %	0 %	470218112
4583	NC_020564	TAT	2	6	230040	230045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
4584	NC_020564	TTA	2	6	230063	230068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
4585	NC_020564	GTC	2	6	230073	230078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218112
4586	NC_020564	TGT	2	6	230119	230124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218112
4587	NC_020564	ATG	2	6	230153	230158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218112
4588	NC_020564	ATT	2	6	230206	230211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
4589	NC_020564	GGC	2	6	230323	230328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218112
4590	NC_020564	TGGA	2	8	230380	230387	25 %	25 %	50 %	0 %	470218112
4591	NC_020564	TCT	2	6	230403	230408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218112
4592	NC_020564	ATT	2	6	230416	230421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
4593	NC_020564	GAA	2	6	230459	230464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218112
4594	NC_020564	GCTT	2	8	230857	230864	0 %	50 %	25 %	25 %	470218113
4595	NC_020564	AAT	2	6	230867	230872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
4596	NC_020564	T	6	6	230895	230900	0 %	100 %	0 %	0 %	470218113
4597	NC_020564	AAT	2	6	231014	231019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
4598	NC_020564	TCGCA	2	10	231054	231063	20 %	20 %	20 %	40 %	470218113
4599	NC_020564	CAA	2	6	231140	231145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218113
4600	NC_020564	ATA	2	6	231156	231161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
4601	NC_020564	ATC	2	6	231162	231167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218113
4602	NC_020564	CAT	2	6	231197	231202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218113
4603	NC_020564	TTG	2	6	231234	231239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218113
4604	NC_020564	TAA	2	6	231243	231248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
4605	NC_020564	TAA	2	6	231303	231308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
4606	NC_020564	ATG	2	6	231321	231326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218113
4607	NC_020564	AT	3	6	231343	231348	50 %	50 %	0 %	0 %	470218113
4608	NC_020564	ATA	2	6	231368	231373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
4609	NC_020564	TGA	2	6	231374	231379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218113
4610	NC_020564	A	6	6	231669	231674	100 %	0 %	0 %	0 %	470218114
4611	NC_020564	CAT	2	6	231756	231761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218114
4612	NC_020564	GAC	2	6	231797	231802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218114
4613	NC_020564	CAT	2	6	231928	231933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218114
4614	NC_020564	CTT	2	6	231957	231962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218114
4615	NC_020564	TCA	2	6	231992	231997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218114
4616	NC_020564	GTAAC	2	10	232084	232093	40 %	20 %	20 %	20 %	470218114
4617	NC_020564	TTG	2	6	232105	232110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218114
4618	NC_020564	ATTGT	2	10	232152	232161	20 %	60 %	20 %	0 %	470218114
4619	NC_020564	AAAT	2	8	232279	232286	75 %	25 %	0 %	0 %	470218114
4620	NC_020564	ATT	2	6	232297	232302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218114
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4622	NC_020564	TGT	2	6	232320	232325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218114
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4624	NC_020564	T	6	6	232374	232379	0 %	100 %	0 %	0 %	470218114
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4735	NC_020564	A	6	6	238508	238513	100 %	0 %	0 %	0 %	470218118
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4738	NC_020564	TTACC	2	10	238624	238633	20 %	40 %	0 %	40 %	470218118
4739	NC_020564	TCA	2	6	238741	238746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218118
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4741	NC_020564	GAA	2	6	238806	238811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218118
4742	NC_020564	TCA	2	6	238830	238835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218118
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4989	NC_020564	TGG	2	6	252458	252463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218125
4990	NC_020564	TTG	2	6	252484	252489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218125
4991	NC_020564	TGC	2	6	252491	252496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218125
4992	NC_020564	ATTT	2	8	252641	252648	25 %	75 %	0 %	0 %	470218125
4993	NC_020564	TG	3	6	252659	252664	0 %	50 %	50 %	0 %	470218125
4994	NC_020564	AGAA	2	8	252718	252725	75 %	0 %	25 %	0 %	470218125
4995	NC_020564	AAC	2	6	252733	252738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218125
4996	NC_020564	A	6	6	252741	252746	100 %	0 %	0 %	0 %	470218125
4997	NC_020564	AAT	3	9	252754	252762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218125
4998	NC_020564	GTT	2	6	253085	253090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218126
4999	NC_020564	AGC	2	6	253150	253155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218126
5000	NC_020564	TAA	2	6	253212	253217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218126

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