MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP4

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020563	GCAC	2	8	372	379	25 %	0 %	25 %	50 %	470211925
2	NC_020563	CATC	2	8	1302	1309	25 %	25 %	0 %	50 %	470211926
3	NC_020563	GCTC	2	8	3230	3237	0 %	25 %	25 %	50 %	470211929
4	NC_020563	CGCT	2	8	4043	4050	0 %	25 %	25 %	50 %	470211930
5	NC_020563	GTCG	2	8	4354	4361	0 %	25 %	50 %	25 %	470211930
6	NC_020563	GATC	2	8	4466	4473	25 %	25 %	25 %	25 %	470211931
7	NC_020563	CCGC	2	8	4729	4736	0 %	0 %	25 %	75 %	470211931
8	NC_020563	CGTT	2	8	4883	4890	0 %	50 %	25 %	25 %	470211931
9	NC_020563	ACCT	2	8	6300	6307	25 %	25 %	0 %	50 %	470211932
10	NC_020563	CGAT	2	8	6337	6344	25 %	25 %	25 %	25 %	470211932
11	NC_020563	AAGG	2	8	7077	7084	50 %	0 %	50 %	0 %	470211933
12	NC_020563	TCCG	2	8	8165	8172	0 %	25 %	25 %	50 %	470211935
13	NC_020563	GGCT	2	8	8709	8716	0 %	25 %	50 %	25 %	470211935
14	NC_020563	ACCT	2	8	9699	9706	25 %	25 %	0 %	50 %	470211937
15	NC_020563	CGAT	2	8	9736	9743	25 %	25 %	25 %	25 %	470211937
16	NC_020563	GGCC	2	8	10703	10710	0 %	0 %	50 %	50 %	470211939
17	NC_020563	GTCC	2	8	11051	11058	0 %	25 %	25 %	50 %	470211939
18	NC_020563	ACGA	2	8	11416	11423	50 %	0 %	25 %	25 %	485191030
19	NC_020563	CGAT	2	8	11714	11721	25 %	25 %	25 %	25 %	485191030
20	NC_020563	ATCG	2	8	12863	12870	25 %	25 %	25 %	25 %	470211942
21	NC_020563	AGGT	2	8	12900	12907	25 %	25 %	50 %	0 %	470211942
22	NC_020563	CGGG	2	8	13480	13487	0 %	0 %	75 %	25 %	470211943
23	NC_020563	TTCG	2	8	14450	14457	0 %	50 %	25 %	25 %	470211944
24	NC_020563	TCGA	2	8	14910	14917	25 %	25 %	25 %	25 %	470211945
25	NC_020563	GATC	2	8	15797	15804	25 %	25 %	25 %	25 %	470211946
26	NC_020563	CAAG	2	8	16869	16876	50 %	0 %	25 %	25 %	470211947
27	NC_020563	TCTT	2	8	17094	17101	0 %	75 %	0 %	25 %	470211947
28	NC_020563	CGCT	2	8	17656	17663	0 %	25 %	25 %	50 %	470211949
29	NC_020563	AGCG	2	8	17798	17805	25 %	0 %	50 %	25 %	470211949
30	NC_020563	ACCT	2	8	18294	18301	25 %	25 %	0 %	50 %	470211950
31	NC_020563	CGAT	2	8	18331	18338	25 %	25 %	25 %	25 %	470211950
32	NC_020563	AGCC	2	8	19156	19163	25 %	0 %	25 %	50 %	470211951
33	NC_020563	GTCG	2	8	19237	19244	0 %	25 %	50 %	25 %	470211951
34	NC_020563	GCGA	2	8	19379	19386	25 %	0 %	50 %	25 %	470211951
35	NC_020563	GGAC	2	8	19511	19518	25 %	0 %	50 %	25 %	470211951
36	NC_020563	GATG	2	8	19974	19981	25 %	25 %	50 %	0 %	470211952
37	NC_020563	GGAC	2	8	20202	20209	25 %	0 %	50 %	25 %	470211953
38	NC_020563	ACCT	2	8	20477	20484	25 %	25 %	0 %	50 %	470211953
39	NC_020563	CGAT	2	8	20514	20521	25 %	25 %	25 %	25 %	470211953
40	NC_020563	TCCG	2	8	20959	20966	0 %	25 %	25 %	50 %	470211954
41	NC_020563	ATCG	2	8	21379	21386	25 %	25 %	25 %	25 %	470211954
42	NC_020563	GGCA	2	8	21800	21807	25 %	0 %	50 %	25 %	470211954
43	NC_020563	CGAG	2	8	21997	22004	25 %	0 %	50 %	25 %	470211954
44	NC_020563	CGAT	2	8	22146	22153	25 %	25 %	25 %	25 %	470211954
45	NC_020563	ACGA	2	8	22317	22324	50 %	0 %	25 %	25 %	470211954
46	NC_020563	GCCC	2	8	22596	22603	0 %	0 %	25 %	75 %	470211954
47	NC_020563	ATCG	2	8	22622	22629	25 %	25 %	25 %	25 %	470211954
48	NC_020563	ATCG	2	8	22961	22968	25 %	25 %	25 %	25 %	470211954
49	NC_020563	GCCG	2	8	23074	23081	0 %	0 %	50 %	50 %	470211954
50	NC_020563	GCGG	2	8	23149	23156	0 %	0 %	75 %	25 %	470211954
51	NC_020563	GCGT	2	8	23215	23222	0 %	25 %	50 %	25 %	470211954
52	NC_020563	GCAG	2	8	23289	23296	25 %	0 %	50 %	25 %	470211954
53	NC_020563	GGCG	2	8	23369	23376	0 %	0 %	75 %	25 %	470211954
54	NC_020563	GGCG	2	8	23761	23768	0 %	0 %	75 %	25 %	470211955
55	NC_020563	CGCT	2	8	23914	23921	0 %	25 %	25 %	50 %	470211955
56	NC_020563	GGCC	2	8	24491	24498	0 %	0 %	50 %	50 %	470211956
57	NC_020563	GCCC	2	8	25007	25014	0 %	0 %	25 %	75 %	470211956
58	NC_020563	AGGA	2	8	25288	25295	50 %	0 %	50 %	0 %	470211956
59	NC_020563	CGTG	2	8	28262	28269	0 %	25 %	50 %	25 %	470211959
60	NC_020563	ATGG	2	8	28610	28617	25 %	25 %	50 %	0 %	470211959
61	NC_020563	CGCC	2	8	29215	29222	0 %	0 %	25 %	75 %	470211959
62	NC_020563	GCAC	2	8	29239	29246	25 %	0 %	25 %	50 %	470211959
63	NC_020563	GGCG	2	8	29845	29852	0 %	0 %	75 %	25 %	470211959
64	NC_020563	CGAA	2	8	30946	30953	50 %	0 %	25 %	25 %	470211960
65	NC_020563	GAAA	2	8	31728	31735	75 %	0 %	25 %	0 %	470211962
66	NC_020563	GGCG	2	8	31904	31911	0 %	0 %	75 %	25 %	470211962
67	NC_020563	CGCT	2	8	32210	32217	0 %	25 %	25 %	50 %	470211963

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.