MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 3079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020562	GCG	2	6	86473	86478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434056
1502	NC_020562	ATC	2	6	86486	86491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434056
1503	NC_020562	CAG	2	6	86507	86512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434056
1504	NC_020562	GCG	2	6	86513	86518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434056
1505	NC_020562	GCT	2	6	86524	86529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434056
1506	NC_020562	GCC	2	6	86534	86539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434056
1507	NC_020562	TC	3	6	86581	86586	0 %	50 %	0 %	50 %	472434056
1508	NC_020562	CGA	2	6	86619	86624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434056
1509	NC_020562	TTCCC	2	10	86631	86640	0 %	40 %	0 %	60 %	472434056
1510	NC_020562	CG	3	6	86673	86678	0 %	0 %	50 %	50 %	472434056
1511	NC_020562	AGG	2	6	86685	86690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434056
1512	NC_020562	GGC	2	6	87031	87036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434057
1513	NC_020562	CAG	2	6	87049	87054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434057
1514	NC_020562	AG	3	6	87088	87093	50 %	0 %	50 %	0 %	472434057
1515	NC_020562	GCC	2	6	87121	87126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434057
1516	NC_020562	CGC	3	9	87132	87140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434057
1517	NC_020562	AGC	2	6	87158	87163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434057
1518	NC_020562	CGA	2	6	87232	87237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434057
1519	NC_020562	CCG	3	9	87299	87307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434057
1520	NC_020562	CGC	2	6	87339	87344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434057
1521	NC_020562	CGC	2	6	87405	87410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434057
1522	NC_020562	GC	3	6	87426	87431	0 %	0 %	50 %	50 %	472434057
1523	NC_020562	CGA	2	6	87432	87437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434057
1524	NC_020562	ATC	2	6	87440	87445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434057
1525	NC_020562	AGC	2	6	87446	87451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434057
1526	NC_020562	AGC	2	6	87464	87469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434057
1527	NC_020562	ACG	2	6	87518	87523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434057
1528	NC_020562	GAGGC	2	10	87642	87651	20 %	0 %	60 %	20 %	472434057
1529	NC_020562	CGC	3	9	87696	87704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434057
1530	NC_020562	CGA	2	6	87726	87731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434057
1531	NC_020562	CAG	2	6	87751	87756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434057
1532	NC_020562	CTCCGG	2	12	87830	87841	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	472434058
1533	NC_020562	GCC	2	6	87848	87853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434058
1534	NC_020562	GCGTC	2	10	87901	87910	0 %	20 %	40 %	40 %	472434058
1535	NC_020562	GC	3	6	87911	87916	0 %	0 %	50 %	50 %	472434058
1536	NC_020562	CTC	2	6	87980	87985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434058
1537	NC_020562	GC	3	6	88103	88108	0 %	0 %	50 %	50 %	472434058
1538	NC_020562	CCG	2	6	88113	88118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434058
1539	NC_020562	GC	4	8	88128	88135	0 %	0 %	50 %	50 %	472434058
1540	NC_020562	GT	3	6	88210	88215	0 %	50 %	50 %	0 %	472434058
1541	NC_020562	TCGA	2	8	88242	88249	25 %	25 %	25 %	25 %	472434058
1542	NC_020562	CCT	2	6	88345	88350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434058
1543	NC_020562	CCCA	2	8	88385	88392	25 %	0 %	0 %	75 %	472434058
1544	NC_020562	GA	3	6	88419	88424	50 %	0 %	50 %	0 %	472434058
1545	NC_020562	GCGT	2	8	88437	88444	0 %	25 %	50 %	25 %	472434058
1546	NC_020562	AGC	2	6	88449	88454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434058
1547	NC_020562	GAAG	2	8	88511	88518	50 %	0 %	50 %	0 %	472434058
1548	NC_020562	GAT	2	6	88556	88561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434058
1549	NC_020562	TCG	2	6	88617	88622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434058
1550	NC_020562	CGA	2	6	88666	88671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434058
1551	NC_020562	CTT	2	6	88798	88803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434059
1552	NC_020562	GGC	2	6	88852	88857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434059
1553	NC_020562	TTG	2	6	88925	88930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472434059
1554	NC_020562	GTA	2	6	88999	89004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434059
1555	NC_020562	CG	3	6	89011	89016	0 %	0 %	50 %	50 %	472434059
1556	NC_020562	GAT	2	6	89017	89022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434059
1557	NC_020562	GAT	2	6	89035	89040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434059
1558	NC_020562	CCG	2	6	89055	89060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434059
1559	NC_020562	GGAT	2	8	89078	89085	25 %	25 %	50 %	0 %	472434059
1560	NC_020562	CGA	2	6	89103	89108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434059
1561	NC_020562	GTC	2	6	89119	89124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434059
1562	NC_020562	GAT	2	6	89125	89130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434059
1563	NC_020562	CAG	2	6	89215	89220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434059
1564	NC_020562	CCG	2	6	89247	89252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434059
1565	NC_020562	TCG	2	6	89339	89344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434059
1566	NC_020562	AGCG	2	8	89345	89352	25 %	0 %	50 %	25 %	472434059
1567	NC_020562	GTGG	2	8	89359	89366	0 %	25 %	75 %	0 %	472434059
1568	NC_020562	GGCG	2	8	89380	89387	0 %	0 %	75 %	25 %	472434059
1569	NC_020562	CGA	2	6	89675	89680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434060
1570	NC_020562	CG	3	6	89710	89715	0 %	0 %	50 %	50 %	472434060
1571	NC_020562	GCC	2	6	89724	89729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434060
1572	NC_020562	CGG	2	6	89834	89839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434060
1573	NC_020562	CGA	2	6	89900	89905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434060
1574	NC_020562	CAGG	2	8	89909	89916	25 %	0 %	50 %	25 %	472434060
1575	NC_020562	GCC	2	6	89944	89949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434060
1576	NC_020562	ATCGAC	2	12	89952	89963	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472434060
1577	NC_020562	AAC	2	6	89977	89982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434060
1578	NC_020562	GT	3	6	90223	90228	0 %	50 %	50 %	0 %	472434061
1579	NC_020562	GC	3	6	90268	90273	0 %	0 %	50 %	50 %	472434061
1580	NC_020562	TCG	2	6	90371	90376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434061
1581	NC_020562	GGAT	2	8	90460	90467	25 %	25 %	50 %	0 %	472434061
1582	NC_020562	CGGT	2	8	90497	90504	0 %	25 %	50 %	25 %	472434061
1583	NC_020562	TCG	2	6	90512	90517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434061
1584	NC_020562	GAT	2	6	90552	90557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434061
1585	NC_020562	GC	3	6	90588	90593	0 %	0 %	50 %	50 %	472434061
1586	NC_020562	CTT	2	6	90597	90602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434061
1587	NC_020562	CAT	2	6	90618	90623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434061
1588	NC_020562	GGA	2	6	90666	90671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434061
1589	NC_020562	GCT	2	6	90672	90677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434061
1590	NC_020562	CGT	2	6	90681	90686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434061
1591	NC_020562	CGC	2	6	90687	90692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434061
1592	NC_020562	TGC	2	6	90755	90760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434061
1593	NC_020562	CTG	2	6	90810	90815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434061
1594	NC_020562	AGGC	2	8	90848	90855	25 %	0 %	50 %	25 %	472434061
1595	NC_020562	GAC	2	6	90860	90865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434061
1596	NC_020562	CACCGA	2	12	90869	90880	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	472434062
1597	NC_020562	GCT	2	6	90947	90952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434062
1598	NC_020562	TCGG	2	8	90969	90976	0 %	25 %	50 %	25 %	472434062
1599	NC_020562	GCA	2	6	91019	91024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434062
1600	NC_020562	CGC	2	6	91062	91067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434062
1601	NC_020562	TCT	2	6	91081	91086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434062
1602	NC_020562	GCT	2	6	91124	91129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434062
1603	NC_020562	GC	4	8	91188	91195	0 %	0 %	50 %	50 %	472434062
1604	NC_020562	CGT	2	6	91271	91276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434063
1605	NC_020562	CG	3	6	91279	91284	0 %	0 %	50 %	50 %	472434063
1606	NC_020562	GAT	2	6	91291	91296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434063
1607	NC_020562	ACG	2	6	91340	91345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434063
1608	NC_020562	GCCC	2	8	91497	91504	0 %	0 %	25 %	75 %	472434063
1609	NC_020562	CG	3	6	91511	91516	0 %	0 %	50 %	50 %	472434063
1610	NC_020562	CG	3	6	91555	91560	0 %	0 %	50 %	50 %	472434063
1611	NC_020562	AGGC	2	8	91574	91581	25 %	0 %	50 %	25 %	472434063
1612	NC_020562	CGC	2	6	91591	91596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434063
1613	NC_020562	TCG	2	6	91607	91612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434063
1614	NC_020562	GC	3	6	91624	91629	0 %	0 %	50 %	50 %	472434063
1615	NC_020562	GCG	2	6	91677	91682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434063
1616	NC_020562	CGC	2	6	91693	91698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434063
1617	NC_020562	GC	3	6	91719	91724	0 %	0 %	50 %	50 %	472434063
1618	NC_020562	CAG	2	6	91764	91769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434063
1619	NC_020562	GGCA	2	8	91924	91931	25 %	0 %	50 %	25 %	472434063
1620	NC_020562	GTC	2	6	91951	91956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434063
1621	NC_020562	CG	3	6	91961	91966	0 %	0 %	50 %	50 %	472434063
1622	NC_020562	GGC	2	6	91969	91974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434063
1623	NC_020562	GC	3	6	91983	91988	0 %	0 %	50 %	50 %	472434063
1624	NC_020562	GCC	2	6	92039	92044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434063
1625	NC_020562	GAT	2	6	92137	92142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434063
1626	NC_020562	CG	3	6	92168	92173	0 %	0 %	50 %	50 %	472434063
1627	NC_020562	GTCG	2	8	92305	92312	0 %	25 %	50 %	25 %	472434063
1628	NC_020562	GCC	2	6	92336	92341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434063
1629	NC_020562	GAG	2	6	92368	92373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434063
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1631	NC_020562	CACCG	2	10	92431	92440	20 %	0 %	20 %	60 %	472434063
1632	NC_020562	GCG	2	6	92447	92452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434063
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1862	NC_020562	ACG	2	6	102513	102518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434073
1863	NC_020562	TTCG	2	8	102566	102573	0 %	50 %	25 %	25 %	472434073
1864	NC_020562	GAC	2	6	102668	102673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434073
1865	NC_020562	GC	3	6	102721	102726	0 %	0 %	50 %	50 %	472434073
1866	NC_020562	CG	3	6	102793	102798	0 %	0 %	50 %	50 %	472434073
1867	NC_020562	TG	3	6	102804	102809	0 %	50 %	50 %	0 %	472434073
1868	NC_020562	GACCG	2	10	102852	102861	20 %	0 %	40 %	40 %	472434073
1869	NC_020562	CAT	2	6	103081	103086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434073
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1871	NC_020562	GAC	2	6	103184	103189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434073
1872	NC_020562	GC	3	6	103263	103268	0 %	0 %	50 %	50 %	472434073
1873	NC_020562	GCG	2	6	103290	103295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434073
1874	NC_020562	CGA	2	6	103312	103317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434073
1875	NC_020562	GC	3	6	103322	103327	0 %	0 %	50 %	50 %	472434073
1876	NC_020562	CGG	3	9	103432	103440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434073
1877	NC_020562	CCA	2	6	103468	103473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434073
1878	NC_020562	CTC	3	9	103493	103501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434073
1879	NC_020562	CAG	2	6	103523	103528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434073
1880	NC_020562	CGC	2	6	103541	103546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434073
1881	NC_020562	GCG	2	6	103558	103563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434073
1882	NC_020562	TGG	2	6	103579	103584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434073
1883	NC_020562	GGCG	2	8	103633	103640	0 %	0 %	75 %	25 %	472434074
1884	NC_020562	CGG	2	6	103665	103670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434074
1885	NC_020562	AC	3	6	103671	103676	50 %	0 %	0 %	50 %	472434074
1886	NC_020562	ATCTGA	2	12	103775	103786	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472434074
1887	NC_020562	GTG	2	6	103802	103807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434074
1888	NC_020562	ACGA	2	8	103808	103815	50 %	0 %	25 %	25 %	472434074
1889	NC_020562	CGA	2	6	103875	103880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434074
1890	NC_020562	GCGTC	2	10	103902	103911	0 %	20 %	40 %	40 %	472434074
1891	NC_020562	ATC	2	6	103984	103989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434074
1892	NC_020562	CG	4	8	104004	104011	0 %	0 %	50 %	50 %	472434074
1893	NC_020562	CCTGC	2	10	104022	104031	0 %	20 %	20 %	60 %	472434074
1894	NC_020562	GC	3	6	104109	104114	0 %	0 %	50 %	50 %	472434074
1895	NC_020562	CCG	2	6	104115	104120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434074
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1900	NC_020562	CG	3	6	104306	104311	0 %	0 %	50 %	50 %	472434074
1901	NC_020562	GC	4	8	104324	104331	0 %	0 %	50 %	50 %	472434074
1902	NC_020562	GC	3	6	104358	104363	0 %	0 %	50 %	50 %	472434074
1903	NC_020562	CGA	2	6	104397	104402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434074
1904	NC_020562	GC	3	6	104476	104481	0 %	0 %	50 %	50 %	472434074
1905	NC_020562	CG	3	6	104499	104504	0 %	0 %	50 %	50 %	472434074
1906	NC_020562	CGG	2	6	104571	104576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434074
1907	NC_020562	CGC	3	9	104584	104592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434074
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1913	NC_020562	GCC	2	6	104772	104777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434075
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1926	NC_020562	CGA	2	6	105452	105457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434076
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1957	NC_020562	CCGATG	2	12	106755	106766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	472434078
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1981	NC_020562	GCT	2	6	107857	107862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434078
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1984	NC_020562	GGC	4	12	108001	108012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434079
1985	NC_020562	CAGG	2	8	108017	108024	25 %	0 %	50 %	25 %	472434079
1986	NC_020562	GGC	2	6	108112	108117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434079
1987	NC_020562	CG	3	6	108135	108140	0 %	0 %	50 %	50 %	472434079
1988	NC_020562	CGC	2	6	108560	108565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434080
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1991	NC_020562	CGT	2	6	108774	108779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434080
1992	NC_020562	TCG	2	6	109336	109341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434081
1993	NC_020562	CCACCC	2	12	109441	109452	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	472434081
1994	NC_020562	CCG	2	6	109471	109476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434081
1995	NC_020562	CTT	2	6	109520	109525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434081
1996	NC_020562	GC	3	6	109587	109592	0 %	0 %	50 %	50 %	472434081
1997	NC_020562	GC	3	6	109676	109681	0 %	0 %	50 %	50 %	472434081
1998	NC_020562	AGGCCC	2	12	109711	109722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	472434081
1999	NC_020562	GGTC	2	8	109735	109742	0 %	25 %	50 %	25 %	472434081
2000	NC_020562	AAC	2	6	109758	109763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434081

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