MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 3079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020562	TGC	2	6	56161	56166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434026
1002	NC_020562	CGA	2	6	56198	56203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434026
1003	NC_020562	GAC	2	6	56214	56219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434026
1004	NC_020562	CCG	3	9	56356	56364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434026
1005	NC_020562	GC	3	6	56459	56464	0 %	0 %	50 %	50 %	472434026
1006	NC_020562	CGCC	2	8	56468	56475	0 %	0 %	25 %	75 %	472434026
1007	NC_020562	CG	3	6	56482	56487	0 %	0 %	50 %	50 %	472434026
1008	NC_020562	CGG	2	6	56699	56704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434027
1009	NC_020562	CG	3	6	56723	56728	0 %	0 %	50 %	50 %	472434027
1010	NC_020562	TGC	2	6	56851	56856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434027
1011	NC_020562	GCG	2	6	56987	56992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434027
1012	NC_020562	GAC	2	6	57011	57016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434027
1013	NC_020562	GC	3	6	57201	57206	0 %	0 %	50 %	50 %	472434027
1014	NC_020562	ATA	2	6	57250	57255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472434027
1015	NC_020562	CGG	2	6	57262	57267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434027
1016	NC_020562	CGG	2	6	57306	57311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434027
1017	NC_020562	CGG	3	9	57361	57369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434027
1018	NC_020562	CTT	2	6	57419	57424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434027
1019	NC_020562	GAG	2	6	57453	57458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434027
1020	NC_020562	TGGC	2	8	57464	57471	0 %	25 %	50 %	25 %	472434027
1021	NC_020562	GAGC	2	8	57605	57612	25 %	0 %	50 %	25 %	472434027
1022	NC_020562	CCTG	2	8	57628	57635	0 %	25 %	25 %	50 %	472434027
1023	NC_020562	TC	3	6	57665	57670	0 %	50 %	0 %	50 %	472434027
1024	NC_020562	ACG	2	6	57680	57685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434027
1025	NC_020562	GTC	2	6	57720	57725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434027
1026	NC_020562	CGATG	2	10	57726	57735	20 %	20 %	40 %	20 %	472434027
1027	NC_020562	CTT	2	6	57761	57766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434027
1028	NC_020562	GCC	2	6	57869	57874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434027
1029	NC_020562	GAT	2	6	57912	57917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434027
1030	NC_020562	CGG	2	6	57924	57929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434027
1031	NC_020562	GGC	2	6	57944	57949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434027
1032	NC_020562	TCG	2	6	57973	57978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434027
1033	NC_020562	GCC	2	6	57981	57986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434027
1034	NC_020562	GCGA	2	8	58014	58021	25 %	0 %	50 %	25 %	472434027
1035	NC_020562	TGATC	2	10	58022	58031	20 %	40 %	20 %	20 %	472434027
1036	NC_020562	GGCGC	2	10	58043	58052	0 %	0 %	60 %	40 %	472434027
1037	NC_020562	CCG	2	6	58059	58064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434027
1038	NC_020562	GGA	2	6	58088	58093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434027
1039	NC_020562	CCG	2	6	58110	58115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434027
1040	NC_020562	CATGA	2	10	58165	58174	40 %	20 %	20 %	20 %	472434027
1041	NC_020562	CAC	2	6	58233	58238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434028
1042	NC_020562	ACG	2	6	58258	58263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434028
1043	NC_020562	CTG	2	6	58282	58287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434028
1044	NC_020562	CG	3	6	58288	58293	0 %	0 %	50 %	50 %	472434028
1045	NC_020562	GCC	2	6	58339	58344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434028
1046	NC_020562	GGT	2	6	58353	58358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434028
1047	NC_020562	GCG	2	6	58427	58432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434028
1048	NC_020562	CCTG	2	8	58437	58444	0 %	25 %	25 %	50 %	472434028
1049	NC_020562	GTC	2	6	58456	58461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434028
1050	NC_020562	CGG	2	6	58467	58472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434028
1051	NC_020562	GCCATC	2	12	58498	58509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	472434028
1052	NC_020562	GTC	2	6	58519	58524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434028
1053	NC_020562	GAA	2	6	58579	58584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434028
1054	NC_020562	GC	3	6	58607	58612	0 %	0 %	50 %	50 %	472434028
1055	NC_020562	GCC	2	6	58615	58620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434028
1056	NC_020562	TCG	2	6	58640	58645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434028
1057	NC_020562	CGT	2	6	58734	58739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434028
1058	NC_020562	CAC	2	6	58743	58748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434028
1059	NC_020562	ACC	2	6	58798	58803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434028
1060	NC_020562	CTC	2	6	58807	58812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434028
1061	NC_020562	TCA	2	6	58824	58829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434028
1062	NC_020562	CAT	2	6	58836	58841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434028
1063	NC_020562	GCCG	2	8	59147	59154	0 %	0 %	50 %	50 %	472434029
1064	NC_020562	GCTC	2	8	59280	59287	0 %	25 %	25 %	50 %	472434029
1065	NC_020562	CGC	2	6	59303	59308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434029
1066	NC_020562	GA	4	8	59317	59324	50 %	0 %	50 %	0 %	472434029
1067	NC_020562	CCA	2	6	59445	59450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434030
1068	NC_020562	ATC	2	6	59530	59535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434030
1069	NC_020562	GTC	2	6	59614	59619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434030
1070	NC_020562	GAC	3	9	60131	60139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434031
1071	NC_020562	CCG	2	6	60150	60155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434031
1072	NC_020562	AGGC	2	8	60174	60181	25 %	0 %	50 %	25 %	472434031
1073	NC_020562	CGAA	2	8	60234	60241	50 %	0 %	25 %	25 %	472434031
1074	NC_020562	GCC	2	6	60244	60249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434031
1075	NC_020562	C	6	6	60248	60253	0 %	0 %	0 %	100 %	472434031
1076	NC_020562	GCA	2	6	60384	60389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434032
1077	NC_020562	ATT	2	6	60396	60401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472434032
1078	NC_020562	CGG	2	6	60406	60411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434032
1079	NC_020562	CCG	2	6	60451	60456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434032
1080	NC_020562	GTC	2	6	60523	60528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434032
1081	NC_020562	CGCC	2	8	60549	60556	0 %	0 %	25 %	75 %	472434032
1082	NC_020562	GCA	2	6	60662	60667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434032
1083	NC_020562	TCG	2	6	60794	60799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434033
1084	NC_020562	CG	3	6	60880	60885	0 %	0 %	50 %	50 %	472434033
1085	NC_020562	GGCG	2	8	60894	60901	0 %	0 %	75 %	25 %	472434033
1086	NC_020562	CGC	2	6	60921	60926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434033
1087	NC_020562	CGT	2	6	60929	60934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434033
1088	NC_020562	TCG	2	6	60952	60957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434033
1089	NC_020562	CTC	2	6	60993	60998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434033
1090	NC_020562	CCG	2	6	61274	61279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434034
1091	NC_020562	AAG	2	6	61330	61335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434034
1092	NC_020562	ATCCC	2	10	61442	61451	20 %	20 %	0 %	60 %	472434034
1093	NC_020562	GAA	2	6	61515	61520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434034
1094	NC_020562	TCG	2	6	61531	61536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434034
1095	NC_020562	CGCTG	2	10	61585	61594	0 %	20 %	40 %	40 %	472434034
1096	NC_020562	ACC	2	6	61603	61608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434034
1097	NC_020562	CGC	2	6	61685	61690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434034
1098	NC_020562	GCG	2	6	61772	61777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434034
1099	NC_020562	CGGC	2	8	61796	61803	0 %	0 %	50 %	50 %	472434034
1100	NC_020562	TGGC	2	8	61825	61832	0 %	25 %	50 %	25 %	472434034
1101	NC_020562	ACG	2	6	61849	61854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434034
1102	NC_020562	GCA	2	6	61868	61873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434034
1103	NC_020562	CGC	2	6	61881	61886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434034
1104	NC_020562	CGG	2	6	61898	61903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434034
1105	NC_020562	GCC	2	6	61910	61915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434034
1106	NC_020562	GAA	2	6	61926	61931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434034
1107	NC_020562	GTCGAT	2	12	62513	62524	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	472434035
1108	NC_020562	GGC	2	6	62553	62558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434035
1109	NC_020562	GC	3	6	62586	62591	0 %	0 %	50 %	50 %	472434035
1110	NC_020562	TCG	2	6	62596	62601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434035
1111	NC_020562	CGC	3	9	62621	62629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434035
1112	NC_020562	TCA	2	6	62639	62644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434035
1113	NC_020562	GAC	2	6	62703	62708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434035
1114	NC_020562	GCC	2	6	62764	62769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434035
1115	NC_020562	GGT	2	6	62777	62782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434035
1116	NC_020562	CGG	2	6	62792	62797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434035
1117	NC_020562	GC	3	6	62843	62848	0 %	0 %	50 %	50 %	472434035
1118	NC_020562	TAG	2	6	62929	62934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434035
1119	NC_020562	CAC	2	6	62965	62970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434035
1120	NC_020562	GCC	2	6	62981	62986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434035
1121	NC_020562	TGA	2	6	62998	63003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434035
1122	NC_020562	GCA	2	6	63014	63019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434035
1123	NC_020562	AAC	2	6	63055	63060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434035
1124	NC_020562	GTC	2	6	63082	63087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434035
1125	NC_020562	GGC	2	6	63145	63150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434035
1126	NC_020562	CCG	2	6	63243	63248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434035
1127	NC_020562	AG	3	6	63258	63263	50 %	0 %	50 %	0 %	472434035
1128	NC_020562	TCG	2	6	63268	63273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434035
1129	NC_020562	GCGG	2	8	63278	63285	0 %	0 %	75 %	25 %	472434035
1130	NC_020562	GCG	2	6	63324	63329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434036
1131	NC_020562	GGC	2	6	63337	63342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434036
1132	NC_020562	GAG	2	6	63346	63351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434036
1133	NC_020562	TCC	2	6	63356	63361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434036
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1135	NC_020562	AGCG	2	8	63395	63402	25 %	0 %	50 %	25 %	472434036
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1139	NC_020562	GCG	2	6	63677	63682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434036
1140	NC_020562	CGA	2	6	63696	63701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434036
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1154	NC_020562	GCG	2	6	64328	64333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434037
1155	NC_020562	CGG	2	6	64340	64345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434037
1156	NC_020562	CCG	2	6	64362	64367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434037
1157	NC_020562	CTT	2	6	64398	64403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434037
1158	NC_020562	CAG	2	6	64425	64430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434037
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1161	NC_020562	GGA	2	6	64589	64594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434037
1162	NC_020562	CGT	2	6	64610	64615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434037
1163	NC_020562	CGG	2	6	64624	64629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434037
1164	NC_020562	ACG	2	6	64630	64635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434037
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1186	NC_020562	CAGG	2	8	65730	65737	25 %	0 %	50 %	25 %	472434037
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1209	NC_020562	CGG	2	6	66489	66494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434038
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1211	NC_020562	GCT	2	6	66621	66626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434038
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1213	NC_020562	TCT	2	6	66717	66722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434038
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1218	NC_020562	CAT	2	6	67243	67248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434039
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1221	NC_020562	CTG	2	6	67486	67491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434040
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1225	NC_020562	CCCAG	2	10	67588	67597	20 %	0 %	20 %	60 %	472434040
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1230	NC_020562	ATG	2	6	67810	67815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434040
1231	NC_020562	GCCC	2	8	67861	67868	0 %	0 %	25 %	75 %	472434040
1232	NC_020562	ACC	2	6	67884	67889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434040
1233	NC_020562	GCG	2	6	67915	67920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434040
1234	NC_020562	CGG	2	6	67925	67930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434040
1235	NC_020562	TCT	2	6	67947	67952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434040
1236	NC_020562	GAT	2	6	67991	67996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434040
1237	NC_020562	AGC	2	6	68049	68054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
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1239	NC_020562	ATC	2	6	68171	68176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434040
1240	NC_020562	CCA	2	6	68179	68184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434040
1241	NC_020562	CGAT	2	8	68188	68195	25 %	25 %	25 %	25 %	472434040
1242	NC_020562	CGA	2	6	68296	68301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1243	NC_020562	CG	3	6	68358	68363	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1244	NC_020562	CAA	2	6	68390	68395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434040
1245	NC_020562	CGC	2	6	68483	68488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1246	NC_020562	TGATCA	2	12	68500	68511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472434040
1247	NC_020562	GAT	2	6	68614	68619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434040
1248	NC_020562	GCC	2	6	68628	68633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1249	NC_020562	CG	3	6	68635	68640	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1250	NC_020562	GGC	2	6	68696	68701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434040
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1365	NC_020562	GAT	2	6	74727	74732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434046
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1497	NC_020562	GGT	2	6	86119	86124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434056
1498	NC_020562	CGA	2	6	86220	86225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434056
1499	NC_020562	AGA	2	6	86349	86354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434056
1500	NC_020562	CG	3	6	86446	86451	0 %	0 %	50 %	50 %	472434056

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