MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020561	GAAGC	2	10	64422	64431	40 %	0 %	40 %	20 %	470212024
1502	NC_020561	CAC	2	6	64457	64462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212024
1503	NC_020561	CAA	2	6	64478	64483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212024
1504	NC_020561	GCG	2	6	64561	64566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212024
1505	NC_020561	AGG	2	6	64588	64593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212024
1506	NC_020561	GCCGG	2	10	64605	64614	0 %	0 %	60 %	40 %	470212024
1507	NC_020561	CAA	2	6	64643	64648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212024
1508	NC_020561	ACC	2	6	64662	64667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212024
1509	NC_020561	CGA	2	6	64676	64681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212024
1510	NC_020561	ATC	2	6	64689	64694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212024
1511	NC_020561	CTG	2	6	64707	64712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212024
1512	NC_020561	GAC	2	6	64713	64718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212024
1513	NC_020561	GCT	2	6	64748	64753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212024
1514	NC_020561	CCGC	2	8	64832	64839	0 %	0 %	25 %	75 %	470212024
1515	NC_020561	TCG	2	6	64870	64875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212024
1516	NC_020561	GCC	2	6	64911	64916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212024
1517	NC_020561	CGA	2	6	64943	64948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212024
1518	NC_020561	GCC	2	6	64976	64981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212024
1519	NC_020561	CCGT	2	8	65022	65029	0 %	25 %	25 %	50 %	470212024
1520	NC_020561	CTC	2	6	65033	65038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212024
1521	NC_020561	GTG	2	6	65046	65051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212024
1522	NC_020561	GTGCCG	2	12	65058	65069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470212024
1523	NC_020561	CG	3	6	65095	65100	0 %	0 %	50 %	50 %	470212025
1524	NC_020561	CGG	2	6	65112	65117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212025
1525	NC_020561	G	6	6	65119	65124	0 %	0 %	100 %	0 %	470212025
1526	NC_020561	GCC	2	6	65138	65143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212025
1527	NC_020561	CG	3	6	65167	65172	0 %	0 %	50 %	50 %	470212025
1528	NC_020561	GGCG	2	8	65194	65201	0 %	0 %	75 %	25 %	470212025
1529	NC_020561	GCG	2	6	65229	65234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212025
1530	NC_020561	CG	4	8	65238	65245	0 %	0 %	50 %	50 %	470212025
1531	NC_020561	CGGC	2	8	65269	65276	0 %	0 %	50 %	50 %	470212025
1532	NC_020561	CCG	2	6	65298	65303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212025
1533	NC_020561	GGC	2	6	65350	65355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212025
1534	NC_020561	GCC	2	6	65363	65368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212025
1535	NC_020561	CGA	2	6	65386	65391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212025
1536	NC_020561	CCG	2	6	65421	65426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212025
1537	NC_020561	CGG	2	6	65442	65447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212025
1538	NC_020561	CAT	2	6	65479	65484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212025
1539	NC_020561	CG	3	6	65494	65499	0 %	0 %	50 %	50 %	470212025
1540	NC_020561	TGC	2	6	65571	65576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212025
1541	NC_020561	GCC	2	6	65593	65598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212025
1542	NC_020561	GTC	2	6	65615	65620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212025
1543	NC_020561	CGC	2	6	65660	65665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212025
1544	NC_020561	GCT	2	6	65707	65712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212025
1545	NC_020561	CGGG	2	8	65741	65748	0 %	0 %	75 %	25 %	470212025
1546	NC_020561	GTG	2	6	65756	65761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212025
1547	NC_020561	GCC	2	6	65815	65820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212025
1548	NC_020561	CAT	2	6	65866	65871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212025
1549	NC_020561	GACC	2	8	65883	65890	25 %	0 %	25 %	50 %	470212025
1550	NC_020561	GAC	3	9	65902	65910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212025
1551	NC_020561	GCCTGC	2	12	65922	65933	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470212025
1552	NC_020561	ACG	2	6	65937	65942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212025
1553	NC_020561	CGC	2	6	66037	66042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212025
1554	NC_020561	GC	3	6	66049	66054	0 %	0 %	50 %	50 %	470212025
1555	NC_020561	GTG	2	6	66077	66082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212025
1556	NC_020561	CGG	2	6	66111	66116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212025
1557	NC_020561	GC	3	6	66244	66249	0 %	0 %	50 %	50 %	470212025
1558	NC_020561	GCG	2	6	66271	66276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212025
1559	NC_020561	GCT	2	6	66328	66333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212025
1560	NC_020561	CGA	2	6	66436	66441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212025
1561	NC_020561	TCA	2	6	66456	66461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212025
1562	NC_020561	CGA	2	6	66472	66477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212025
1563	NC_020561	CGG	2	6	66522	66527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212025
1564	NC_020561	CCGC	2	8	66528	66535	0 %	0 %	25 %	75 %	470212025
1565	NC_020561	GC	3	6	66534	66539	0 %	0 %	50 %	50 %	470212025
1566	NC_020561	CGAT	2	8	66597	66604	25 %	25 %	25 %	25 %	470212025
1567	NC_020561	ATTATG	2	12	66610	66621	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470212025
1568	NC_020561	CGG	2	6	66635	66640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212026
1569	NC_020561	GC	3	6	66662	66667	0 %	0 %	50 %	50 %	470212026
1570	NC_020561	GC	3	6	66702	66707	0 %	0 %	50 %	50 %	470212026
1571	NC_020561	GTC	2	6	66717	66722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212026
1572	NC_020561	CCGCGC	2	12	66745	66756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212026
1573	NC_020561	GC	3	6	66778	66783	0 %	0 %	50 %	50 %	470212026
1574	NC_020561	AGC	2	6	66811	66816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212026
1575	NC_020561	GGA	2	6	66866	66871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212026
1576	NC_020561	AGC	2	6	66901	66906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212026
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1578	NC_020561	GC	3	6	66978	66983	0 %	0 %	50 %	50 %	470212026
1579	NC_020561	CCG	2	6	66999	67004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212026
1580	NC_020561	CG	3	6	67011	67016	0 %	0 %	50 %	50 %	470212026
1581	NC_020561	TGG	2	6	67018	67023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212026
1582	NC_020561	CGG	2	6	67024	67029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212026
1583	NC_020561	CCA	2	6	67051	67056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212026
1584	NC_020561	GGC	2	6	67091	67096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212026
1585	NC_020561	GC	3	6	67100	67105	0 %	0 %	50 %	50 %	470212026
1586	NC_020561	TGA	2	6	67111	67116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212026
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1588	NC_020561	TGG	2	6	67147	67152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212026
1589	NC_020561	GTG	2	6	67161	67166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212026
1590	NC_020561	GTG	2	6	67185	67190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212026
1591	NC_020561	GTC	2	6	67197	67202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212026
1592	NC_020561	GCT	2	6	67235	67240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212026
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1595	NC_020561	CGGC	2	8	67397	67404	0 %	0 %	50 %	50 %	470212026
1596	NC_020561	CGC	2	6	67421	67426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212026
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1598	NC_020561	CTG	2	6	67473	67478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212026
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1601	NC_020561	GC	3	6	67523	67528	0 %	0 %	50 %	50 %	470212026
1602	NC_020561	TCG	2	6	67543	67548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212026
1603	NC_020561	GCG	2	6	67561	67566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212026
1604	NC_020561	CGGG	2	8	67590	67597	0 %	0 %	75 %	25 %	470212026
1605	NC_020561	CGC	2	6	67606	67611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212026
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1609	NC_020561	CAT	2	6	67742	67747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212026
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1623	NC_020561	CCGG	2	8	68161	68168	0 %	0 %	50 %	50 %	470212027
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1625	NC_020561	GAA	2	6	68194	68199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212027
1626	NC_020561	GGC	2	6	68297	68302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212027
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1630	NC_020561	CCG	2	6	68498	68503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212028
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1654	NC_020561	GAG	2	6	69254	69259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212029
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1734	NC_020561	CGT	2	6	71581	71586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212032
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1742	NC_020561	GCG	2	6	71737	71742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212032
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1746	NC_020561	GC	3	6	71793	71798	0 %	0 %	50 %	50 %	470212032
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1748	NC_020561	GCG	2	6	71931	71936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212032
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1998	NC_020561	GGC	2	6	81319	81324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212041
1999	NC_020561	GGT	2	6	81350	81355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212041
2000	NC_020561	GCC	2	6	81396	81401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212041

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