MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020561	CGC	3	9	42844	42852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212006
1002	NC_020561	TGC	2	6	42942	42947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212006
1003	NC_020561	GAT	2	6	42955	42960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212006
1004	NC_020561	CGG	2	6	42991	42996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212006
1005	NC_020561	CCCG	2	8	42999	43006	0 %	0 %	25 %	75 %	470212006
1006	NC_020561	CGT	2	6	43031	43036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212006
1007	NC_020561	GAA	2	6	43167	43172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212007
1008	NC_020561	ATC	3	9	43177	43185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212007
1009	NC_020561	TGG	2	6	43229	43234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212007
1010	NC_020561	TCG	2	6	43259	43264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212007
1011	NC_020561	GCC	2	6	43297	43302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212007
1012	NC_020561	GGC	2	6	43308	43313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212007
1013	NC_020561	CCGCGG	2	12	43344	43355	0 %	0 %	50 %	50 %	470212007
1014	NC_020561	CGA	2	6	43368	43373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212007
1015	NC_020561	GAT	2	6	43391	43396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212007
1016	NC_020561	GCT	2	6	43471	43476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1017	NC_020561	ATC	2	6	43484	43489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212008
1018	NC_020561	CGC	2	6	43522	43527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212008
1019	NC_020561	GAC	2	6	43537	43542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1020	NC_020561	GC	3	6	43545	43550	0 %	0 %	50 %	50 %	470212008
1021	NC_020561	GC	3	6	43563	43568	0 %	0 %	50 %	50 %	470212008
1022	NC_020561	CGG	2	6	43597	43602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212008
1023	NC_020561	CGG	2	6	43648	43653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212008
1024	NC_020561	CGG	2	6	43692	43697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212008
1025	NC_020561	TGG	3	9	43704	43712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212008
1026	NC_020561	CAC	2	6	43714	43719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212008
1027	NC_020561	GGA	2	6	43762	43767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212008
1028	NC_020561	CAGC	2	8	43771	43778	25 %	0 %	25 %	50 %	470212008
1029	NC_020561	CTT	2	6	43783	43788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212008
1030	NC_020561	ATGCTG	2	12	43817	43828	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470212008
1031	NC_020561	TTC	2	6	43856	43861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212008
1032	NC_020561	CTG	2	6	43892	43897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1033	NC_020561	GGC	2	6	43930	43935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212008
1034	NC_020561	GCG	2	6	44045	44050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212008
1035	NC_020561	CTGC	2	8	44113	44120	0 %	25 %	25 %	50 %	470212008
1036	NC_020561	CGA	2	6	44226	44231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1037	NC_020561	CGGC	2	8	44238	44245	0 %	0 %	50 %	50 %	470212008
1038	NC_020561	GCC	2	6	44259	44264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212008
1039	NC_020561	CCAG	2	8	44283	44290	25 %	0 %	25 %	50 %	470212008
1040	NC_020561	CGT	2	6	44302	44307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1041	NC_020561	GCC	2	6	44321	44326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212008
1042	NC_020561	CTT	2	6	44332	44337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212008
1043	NC_020561	ACG	2	6	44354	44359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1044	NC_020561	TTC	2	6	44417	44422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212008
1045	NC_020561	GCG	2	6	44423	44428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212008
1046	NC_020561	GCG	2	6	44447	44452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212008
1047	NC_020561	CACG	2	8	44467	44474	25 %	0 %	25 %	50 %	470212008
1048	NC_020561	CTT	2	6	44476	44481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212008
1049	NC_020561	GCT	2	6	44488	44493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1050	NC_020561	CCATG	2	10	44518	44527	20 %	20 %	20 %	40 %	470212008
1051	NC_020561	GGC	2	6	44555	44560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212008
1052	NC_020561	GAT	2	6	44593	44598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212008
1053	NC_020561	GGCGTG	2	12	44621	44632	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	470212008
1054	NC_020561	ATC	2	6	44675	44680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212008
1055	NC_020561	GGC	2	6	44683	44688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212008
1056	NC_020561	GGCCT	2	10	44714	44723	0 %	20 %	40 %	40 %	470212008
1057	NC_020561	TCG	2	6	44727	44732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1058	NC_020561	GCT	2	6	44746	44751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1059	NC_020561	CTT	2	6	44788	44793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212008
1060	NC_020561	CAT	2	6	44867	44872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212008
1061	NC_020561	CCG	2	6	44949	44954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212008
1062	NC_020561	TGC	3	9	44985	44993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1063	NC_020561	TGG	2	6	44997	45002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212008
1064	NC_020561	ATGC	2	8	45113	45120	25 %	25 %	25 %	25 %	470212008
1065	NC_020561	GGT	2	6	45160	45165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212008
1066	NC_020561	GAT	2	6	45166	45171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212008
1067	NC_020561	CTG	2	6	45179	45184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1068	NC_020561	ACG	2	6	45212	45217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1069	NC_020561	GC	3	6	45224	45229	0 %	0 %	50 %	50 %	470212008
1070	NC_020561	CTTC	2	8	45259	45266	0 %	50 %	0 %	50 %	470212008
1071	NC_020561	CGA	2	6	45283	45288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1072	NC_020561	CGTC	2	8	45307	45314	0 %	25 %	25 %	50 %	470212008
1073	NC_020561	CTT	2	6	45334	45339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212008
1074	NC_020561	TCG	2	6	45402	45407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1075	NC_020561	GCG	3	9	45408	45416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212008
1076	NC_020561	CCG	2	6	45424	45429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212008
1077	NC_020561	TGC	2	6	45468	45473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
1078	NC_020561	CGCGGC	2	12	45481	45492	0 %	0 %	50 %	50 %	470212008
1079	NC_020561	TGA	2	6	45547	45552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212009
1080	NC_020561	GGC	2	6	45569	45574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212009
1081	NC_020561	GCCT	2	8	45579	45586	0 %	25 %	25 %	50 %	470212009
1082	NC_020561	GC	4	8	45604	45611	0 %	0 %	50 %	50 %	470212009
1083	NC_020561	GAC	2	6	45626	45631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212009
1084	NC_020561	TCG	2	6	45634	45639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212009
1085	NC_020561	CAT	2	6	45653	45658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212009
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1087	NC_020561	GC	3	6	45685	45690	0 %	0 %	50 %	50 %	470212009
1088	NC_020561	GCTGAT	2	12	45761	45772	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470212009
1089	NC_020561	CGT	2	6	45811	45816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212009
1090	NC_020561	AT	3	6	45845	45850	50 %	50 %	0 %	0 %	470212009
1091	NC_020561	GCC	2	6	45852	45857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212009
1092	NC_020561	CTG	2	6	45861	45866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212009
1093	NC_020561	TGA	2	6	45877	45882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212009
1094	NC_020561	CCTGTT	2	12	45905	45916	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470212009
1095	NC_020561	TCT	2	6	45922	45927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212009
1096	NC_020561	TCA	2	6	45955	45960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212009
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1099	NC_020561	GCT	2	6	46019	46024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212009
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1101	NC_020561	CAC	2	6	46076	46081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212009
1102	NC_020561	CTT	2	6	46145	46150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212009
1103	NC_020561	CCT	2	6	46153	46158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212009
1104	NC_020561	CGG	2	6	46225	46230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212009
1105	NC_020561	TGC	2	6	46252	46257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212009
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1107	NC_020561	TGG	2	6	46351	46356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212009
1108	NC_020561	CGT	2	6	46358	46363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212009
1109	NC_020561	CTCG	2	8	46370	46377	0 %	25 %	25 %	50 %	470212009
1110	NC_020561	GAA	2	6	46400	46405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212009
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1112	NC_020561	CGG	2	6	46589	46594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212009
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1114	NC_020561	TCGG	2	8	46650	46657	0 %	25 %	50 %	25 %	470212009
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1118	NC_020561	TCG	2	6	46735	46740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212009
1119	NC_020561	CGA	2	6	46741	46746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212009
1120	NC_020561	CTCTAT	2	12	46776	46787	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470212009
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1122	NC_020561	GC	3	6	46848	46853	0 %	0 %	50 %	50 %	470212009
1123	NC_020561	CTG	3	9	46863	46871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212009
1124	NC_020561	CCG	2	6	46931	46936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212009
1125	NC_020561	CGT	3	9	46946	46954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212009
1126	NC_020561	CCG	2	6	46999	47004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212009
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1139	NC_020561	GATCCT	2	12	47374	47385	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470212010
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1226	NC_020561	CGCGAT	2	12	50701	50712	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212012
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1240	NC_020561	GC	3	6	51044	51049	0 %	0 %	50 %	50 %	470212013
1241	NC_020561	CGC	3	9	51047	51055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212013
1242	NC_020561	TGGC	2	8	51138	51145	0 %	25 %	50 %	25 %	470212013
1243	NC_020561	TCT	2	6	51167	51172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212013
1244	NC_020561	CGG	2	6	51184	51189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212013
1245	NC_020561	GGC	3	9	51240	51248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212014
1246	NC_020561	GTC	2	6	51307	51312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212014
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1248	NC_020561	GCC	2	6	51337	51342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212014
1249	NC_020561	GC	3	6	51357	51362	0 %	0 %	50 %	50 %	470212014
1250	NC_020561	ACC	2	6	51386	51391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212014
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1369	NC_020561	ACC	2	6	59856	59861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212020
1370	NC_020561	TGC	2	6	59908	59913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212020
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1374	NC_020561	CTG	2	6	59993	59998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212020
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1495	NC_020561	ACC	2	6	64224	64229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212024
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