MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020561	TCA	2	6	437091	437096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212366
11502	NC_020561	CAC	2	6	437104	437109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212366
11503	NC_020561	GGC	2	6	437162	437167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212366
11504	NC_020561	CGGC	2	8	437181	437188	0 %	0 %	50 %	50 %	470212366
11505	NC_020561	CGC	2	6	437206	437211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212366
11506	NC_020561	CCT	2	6	437214	437219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212366
11507	NC_020561	CG	3	6	437238	437243	0 %	0 %	50 %	50 %	470212366
11508	NC_020561	TGC	2	6	437247	437252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212366
11509	NC_020561	GCTC	2	8	437259	437266	0 %	25 %	25 %	50 %	470212366
11510	NC_020561	CGC	2	6	437286	437291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212366
11511	NC_020561	TCA	2	6	437310	437315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212366
11512	NC_020561	TGC	2	6	437328	437333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212366
11513	NC_020561	GCC	2	6	437424	437429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212366
11514	NC_020561	GTC	2	6	437431	437436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212366
11515	NC_020561	ACA	3	9	437640	437648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212366
11516	NC_020561	CAA	2	6	437665	437670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212366
11517	NC_020561	CCTCG	2	10	437671	437680	0 %	20 %	20 %	60 %	470212366
11518	NC_020561	GCC	2	6	437732	437737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212366
11519	NC_020561	CGGC	2	8	437787	437794	0 %	0 %	50 %	50 %	470212366
11520	NC_020561	CTC	2	6	437821	437826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212366
11521	NC_020561	CAATAT	2	12	437834	437845	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470212366
11522	NC_020561	CCGG	2	8	437848	437855	0 %	0 %	50 %	50 %	470212366
11523	NC_020561	ACA	2	6	437928	437933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212366
11524	NC_020561	TCC	2	6	437951	437956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212366
11525	NC_020561	ATG	2	6	437976	437981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212366
11526	NC_020561	AGGCGG	2	12	438012	438023	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	470212366
11527	NC_020561	TCC	2	6	438027	438032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212366
11528	NC_020561	CCG	2	6	438048	438053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212366
11529	NC_020561	AAG	2	6	438122	438127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212366
11530	NC_020561	ATT	2	6	438129	438134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212366
11531	NC_020561	CGG	2	6	438141	438146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212366
11532	NC_020561	GGA	2	6	438169	438174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212366
11533	NC_020561	AGC	2	6	438237	438242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212366
11534	NC_020561	TGG	2	6	438291	438296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212366
11535	NC_020561	ATT	2	6	438333	438338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212366
11536	NC_020561	AAG	2	6	438377	438382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212366
11537	NC_020561	CTT	2	6	438409	438414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212366
11538	NC_020561	GGC	3	9	438419	438427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212366
11539	NC_020561	GC	3	6	438426	438431	0 %	0 %	50 %	50 %	470212366
11540	NC_020561	CGG	2	6	438472	438477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212366
11541	NC_020561	CTG	2	6	438551	438556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212366
11542	NC_020561	CTACAC	2	12	438568	438579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	470212366
11543	NC_020561	GCA	2	6	438622	438627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212366
11544	NC_020561	CTG	2	6	438647	438652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212366
11545	NC_020561	GCA	2	6	438736	438741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212366
11546	NC_020561	TGA	2	6	438747	438752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212366
11547	NC_020561	CG	4	8	438853	438860	0 %	0 %	50 %	50 %	470212366
11548	NC_020561	GC	3	6	438905	438910	0 %	0 %	50 %	50 %	470212366
11549	NC_020561	CCA	2	6	438921	438926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212366
11550	NC_020561	CAG	2	6	438941	438946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212366
11551	NC_020561	GCG	2	6	438953	438958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212366
11552	NC_020561	CCA	2	6	439136	439141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212367
11553	NC_020561	CGC	2	6	439181	439186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212367
11554	NC_020561	CGC	2	6	439217	439222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212367
11555	NC_020561	CCA	2	6	439223	439228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212367
11556	NC_020561	CGCC	2	8	439232	439239	0 %	0 %	25 %	75 %	470212367
11557	NC_020561	AGC	2	6	439246	439251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212367
11558	NC_020561	CGC	2	6	439257	439262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212367
11559	NC_020561	CCCG	2	8	439272	439279	0 %	0 %	25 %	75 %	470212367
11560	NC_020561	GTC	2	6	439290	439295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212367
11561	NC_020561	CAG	2	6	439299	439304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212367
11562	NC_020561	CAC	2	6	439320	439325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212367
11563	NC_020561	GCAT	2	8	439333	439340	25 %	25 %	25 %	25 %	470212367
11564	NC_020561	CAG	3	9	439419	439427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212367
11565	NC_020561	CCG	2	6	439451	439456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212367
11566	NC_020561	CG	3	6	439472	439477	0 %	0 %	50 %	50 %	470212367
11567	NC_020561	TCG	2	6	439517	439522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212367
11568	NC_020561	CAG	3	9	439560	439568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212367
11569	NC_020561	GTG	2	6	439570	439575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212367
11570	NC_020561	CAG	2	6	439910	439915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212368
11571	NC_020561	CAC	2	6	439922	439927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212368
11572	NC_020561	CGGTG	2	10	439936	439945	0 %	20 %	60 %	20 %	470212368
11573	NC_020561	CCG	2	6	439966	439971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212368
11574	NC_020561	CCA	2	6	440056	440061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212368
11575	NC_020561	GGC	2	6	440067	440072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212368
11576	NC_020561	CTT	2	6	440141	440146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212368
11577	NC_020561	CAG	2	6	440147	440152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212368
11578	NC_020561	CCG	2	6	440155	440160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212368
11579	NC_020561	CAG	2	6	440180	440185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212368
11580	NC_020561	GGC	2	6	440198	440203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212368
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11582	NC_020561	CGG	2	6	440240	440245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212368
11583	NC_020561	GTT	3	9	440252	440260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470212368
11584	NC_020561	CGC	2	6	440261	440266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212368
11585	NC_020561	CGC	2	6	440270	440275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212368
11586	NC_020561	GCC	2	6	440310	440315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212368
11587	NC_020561	GGCA	2	8	440458	440465	25 %	0 %	50 %	25 %	470212368
11588	NC_020561	GCT	2	6	440503	440508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212368
11589	NC_020561	CGCCAG	2	12	440540	440551	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212368
11590	NC_020561	CGG	2	6	440581	440586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212368
11591	NC_020561	GGC	2	6	440588	440593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212368
11592	NC_020561	GGC	2	6	440595	440600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212368
11593	NC_020561	TGA	2	6	440605	440610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212368
11594	NC_020561	CGA	2	6	440623	440628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212368
11595	NC_020561	CGA	2	6	440665	440670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212368
11596	NC_020561	GGAC	2	8	440682	440689	25 %	0 %	50 %	25 %	470212368
11597	NC_020561	CGGCAG	2	12	440780	440791	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470212369
11598	NC_020561	GAT	2	6	440810	440815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212369
11599	NC_020561	GAT	2	6	440822	440827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212369
11600	NC_020561	ATA	2	6	440843	440848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470212369
11601	NC_020561	GCC	2	6	440850	440855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212369
11602	NC_020561	ATC	2	6	440868	440873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212369
11603	NC_020561	TTC	2	6	440882	440887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212369
11604	NC_020561	GC	3	6	440893	440898	0 %	0 %	50 %	50 %	470212369
11605	NC_020561	CGC	3	9	440896	440904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212369
11606	NC_020561	CGAGGA	2	12	440911	440922	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	470212369
11607	NC_020561	AGA	2	6	440941	440946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212369
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11609	NC_020561	CAG	3	9	441014	441022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212369
11610	NC_020561	GC	3	6	441087	441092	0 %	0 %	50 %	50 %	470212369
11611	NC_020561	CGC	2	6	441158	441163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212369
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11614	NC_020561	TAA	2	6	441264	441269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470212369
11615	NC_020561	CAC	2	6	441362	441367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212369
11616	NC_020561	GGC	2	6	441368	441373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212369
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11976	NC_020561	ATC	2	6	455214	455219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212386
11977	NC_020561	CCG	2	6	455273	455278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212386
11978	NC_020561	GCA	2	6	455317	455322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212386
11979	NC_020561	TCG	2	6	455358	455363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212386
11980	NC_020561	GCC	2	6	455375	455380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212386
11981	NC_020561	GGT	2	6	455405	455410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212386
11982	NC_020561	CAG	2	6	455462	455467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212386
11983	NC_020561	CGC	2	6	455480	455485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212386
11984	NC_020561	CG	3	6	455539	455544	0 %	0 %	50 %	50 %	470212386
11985	NC_020561	CAG	2	6	455576	455581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212386
11986	NC_020561	TTGGCG	2	12	455595	455606	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470212386
11987	NC_020561	TGC	2	6	455659	455664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212386
11988	NC_020561	CGCCGG	2	12	455680	455691	0 %	0 %	50 %	50 %	470212386
11989	NC_020561	GC	3	6	455821	455826	0 %	0 %	50 %	50 %	470212386
11990	NC_020561	CG	3	6	455832	455837	0 %	0 %	50 %	50 %	470212386
11991	NC_020561	CGA	2	6	455851	455856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212386
11992	NC_020561	TCC	2	6	455889	455894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212386
11993	NC_020561	GGC	2	6	455931	455936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212386
11994	NC_020561	CAC	2	6	455954	455959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212386
11995	NC_020561	CG	3	6	455972	455977	0 %	0 %	50 %	50 %	470212386
11996	NC_020561	ATCG	2	8	455984	455991	25 %	25 %	25 %	25 %	470212386
11997	NC_020561	CGG	2	6	455992	455997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212386
11998	NC_020561	CGA	2	6	456010	456015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212386
11999	NC_020561	TCG	2	6	456063	456068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212386
12000	NC_020561	CGA	2	6	456073	456078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212386

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