MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020561	GCT	2	6	21954	21959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211985
502	NC_020561	AGA	2	6	22016	22021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211985
503	NC_020561	CTG	2	6	22105	22110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211985
504	NC_020561	ACT	2	6	22115	22120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211985
505	NC_020561	ACC	2	6	22172	22177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211985
506	NC_020561	CGCC	2	8	22208	22215	0 %	0 %	25 %	75 %	470211985
507	NC_020561	ATC	2	6	22243	22248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211985
508	NC_020561	GCA	2	6	22296	22301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211985
509	NC_020561	CGC	2	6	22311	22316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211985
510	NC_020561	CTT	3	9	23661	23669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211986
511	NC_020561	CG	3	6	23717	23722	0 %	0 %	50 %	50 %	470211986
512	NC_020561	CGC	2	6	23726	23731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211986
513	NC_020561	TGA	2	6	23756	23761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211986
514	NC_020561	GCTG	2	8	23777	23784	0 %	25 %	50 %	25 %	470211986
515	NC_020561	GCC	2	6	23862	23867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211986
516	NC_020561	ATCG	2	8	23880	23887	25 %	25 %	25 %	25 %	470211986
517	NC_020561	GTC	2	6	23892	23897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211986
518	NC_020561	GCC	2	6	24015	24020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211986
519	NC_020561	TGA	2	6	24035	24040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211986
520	NC_020561	CTTCAT	2	12	24045	24056	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470211986
521	NC_020561	CGGC	2	8	24130	24137	0 %	0 %	50 %	50 %	470211987
522	NC_020561	GGC	3	9	24135	24143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211987
523	NC_020561	GTG	2	6	24239	24244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211987
524	NC_020561	GCG	2	6	24301	24306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211987
525	NC_020561	TCA	2	6	24391	24396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211987
526	NC_020561	TTC	2	6	24431	24436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211987
527	NC_020561	GCGCG	2	10	24439	24448	0 %	0 %	60 %	40 %	470211987
528	NC_020561	CGC	2	6	24463	24468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211987
529	NC_020561	CGA	2	6	24478	24483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211987
530	NC_020561	GCGG	2	8	24488	24495	0 %	0 %	75 %	25 %	470211987
531	NC_020561	TTC	2	6	24507	24512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211987
532	NC_020561	CTG	2	6	24581	24586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211987
533	NC_020561	TTG	2	6	24624	24629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211987
534	NC_020561	GTCG	2	8	24638	24645	0 %	25 %	50 %	25 %	470211987
535	NC_020561	GCGACC	2	12	24660	24671	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470211987
536	NC_020561	AGC	2	6	24672	24677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211987
537	NC_020561	GCC	2	6	24733	24738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211987
538	NC_020561	CGT	2	6	24792	24797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211988
539	NC_020561	CGGC	2	8	24821	24828	0 %	0 %	50 %	50 %	470211988
540	NC_020561	GGC	2	6	24838	24843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211988
541	NC_020561	CCGCG	2	10	24849	24858	0 %	0 %	40 %	60 %	470211988
542	NC_020561	CG	4	8	24855	24862	0 %	0 %	50 %	50 %	470211988
543	NC_020561	ACC	2	6	24923	24928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211988
544	NC_020561	TGA	2	6	24929	24934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211988
545	NC_020561	GCC	2	6	24949	24954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211988
546	NC_020561	GCA	2	6	24957	24962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211988
547	NC_020561	CG	3	6	24989	24994	0 %	0 %	50 %	50 %	470211988
548	NC_020561	GGC	3	9	25054	25062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211988
549	NC_020561	GAG	2	6	25069	25074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211988
550	NC_020561	GGT	2	6	25110	25115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211988
551	NC_020561	CGA	2	6	25122	25127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211988
552	NC_020561	GCG	2	6	25157	25162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211988
553	NC_020561	CGAG	2	8	25197	25204	25 %	0 %	50 %	25 %	470211988
554	NC_020561	GGA	2	6	25218	25223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211988
555	NC_020561	CGC	2	6	25237	25242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211988
556	NC_020561	ATG	2	6	25258	25263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211988
557	NC_020561	GGT	2	6	25279	25284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211988
558	NC_020561	CGG	5	15	25305	25319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211988
559	NC_020561	GGC	2	6	25330	25335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211988
560	NC_020561	CGGC	2	8	25341	25348	0 %	0 %	50 %	50 %	470211988
561	NC_020561	GGC	2	6	25375	25380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211988
562	NC_020561	CGAG	2	8	25383	25390	25 %	0 %	50 %	25 %	470211988
563	NC_020561	AGC	2	6	25403	25408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211988
564	NC_020561	CCCG	2	8	25453	25460	0 %	0 %	25 %	75 %	470211988
565	NC_020561	CGG	3	9	25482	25490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211988
566	NC_020561	CG	3	6	25498	25503	0 %	0 %	50 %	50 %	470211988
567	NC_020561	TCCG	2	8	25509	25516	0 %	25 %	25 %	50 %	470211988
568	NC_020561	GAT	2	6	25525	25530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211988
569	NC_020561	CAGG	2	8	25775	25782	25 %	0 %	50 %	25 %	470211989
570	NC_020561	CGG	2	6	25785	25790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211989
571	NC_020561	AGGCG	2	10	25806	25815	20 %	0 %	60 %	20 %	470211989
572	NC_020561	GAC	2	6	25816	25821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211989
573	NC_020561	CCG	2	6	25836	25841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211989
574	NC_020561	TGCG	2	8	25854	25861	0 %	25 %	50 %	25 %	470211989
575	NC_020561	GGC	2	6	25951	25956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211989
576	NC_020561	CG	4	8	25959	25966	0 %	0 %	50 %	50 %	470211989
577	NC_020561	GCCCG	2	10	25973	25982	0 %	0 %	40 %	60 %	470211989
578	NC_020561	CGGCG	2	10	25992	26001	0 %	0 %	60 %	40 %	470211989
579	NC_020561	TCG	2	6	26006	26011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211989
580	NC_020561	TCG	2	6	26025	26030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211989
581	NC_020561	CCG	2	6	26039	26044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211989
582	NC_020561	GGCT	2	8	26045	26052	0 %	25 %	50 %	25 %	470211989
583	NC_020561	CCAG	2	8	26055	26062	25 %	0 %	25 %	50 %	470211989
584	NC_020561	AGG	2	6	26078	26083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211989
585	NC_020561	CCA	2	6	26097	26102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211989
586	NC_020561	CG	3	6	26127	26132	0 %	0 %	50 %	50 %	470211989
587	NC_020561	GCG	2	6	26157	26162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211989
588	NC_020561	TGCC	2	8	26164	26171	0 %	25 %	25 %	50 %	470211989
589	NC_020561	GGC	2	6	26187	26192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211989
590	NC_020561	CCT	2	6	26199	26204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211989
591	NC_020561	AGATCG	2	12	26219	26230	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470211989
592	NC_020561	CAT	2	6	26247	26252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211989
593	NC_020561	GGC	2	6	26268	26273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211989
594	NC_020561	GCC	2	6	26282	26287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211989
595	NC_020561	GCGAT	2	10	26333	26342	20 %	20 %	40 %	20 %	470211989
596	NC_020561	TCA	2	6	26382	26387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211989
597	NC_020561	GGC	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211990
598	NC_020561	CCG	2	6	26559	26564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211990
599	NC_020561	TGGG	2	8	26573	26580	0 %	25 %	75 %	0 %	470211990
600	NC_020561	CGA	2	6	26598	26603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211990
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605	NC_020561	CG	3	6	26765	26770	0 %	0 %	50 %	50 %	470211990
606	NC_020561	GGA	2	6	26794	26799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211990
607	NC_020561	GCC	2	6	26830	26835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211991
608	NC_020561	CGC	2	6	26883	26888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211991
609	NC_020561	GGCCTC	2	12	26944	26955	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470211991
610	NC_020561	GC	3	6	26957	26962	0 %	0 %	50 %	50 %	470211991
611	NC_020561	CGG	2	6	26966	26971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211991
612	NC_020561	GCG	2	6	27143	27148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211991
613	NC_020561	GCC	2	6	27211	27216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211991
614	NC_020561	GGGC	3	12	27284	27295	0 %	0 %	75 %	25 %	470211991
615	NC_020561	GCC	2	6	27311	27316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211991
616	NC_020561	CGC	2	6	27420	27425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211991
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619	NC_020561	CAG	2	6	27553	27558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211991
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621	NC_020561	GGC	2	6	27709	27714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211991
622	NC_020561	ATA	2	6	27754	27759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211991
623	NC_020561	GCC	2	6	27785	27790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211991
624	NC_020561	CGT	2	6	27793	27798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211991
625	NC_020561	GC	3	6	27799	27804	0 %	0 %	50 %	50 %	470211991
626	NC_020561	AT	3	6	27812	27817	50 %	50 %	0 %	0 %	470211991
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628	NC_020561	CAC	2	6	27856	27861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211991
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631	NC_020561	TCGA	2	8	27989	27996	25 %	25 %	25 %	25 %	470211991
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753	NC_020561	GCC	2	6	33446	33451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211995
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871	NC_020561	TCC	2	6	38187	38192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212002
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1000	NC_020561	GC	4	8	42839	42846	0 %	0 %	50 %	50 %	470212006

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