MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020561	CGA	2	6	235467	235472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212187
6002	NC_020561	GC	3	6	235482	235487	0 %	0 %	50 %	50 %	470212187
6003	NC_020561	TTA	2	6	235489	235494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212187
6004	NC_020561	CTG	2	6	235508	235513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212187
6005	NC_020561	GAG	2	6	235577	235582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212187
6006	NC_020561	GAC	2	6	235607	235612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212187
6007	NC_020561	CGC	2	6	235665	235670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212187
6008	NC_020561	CGC	2	6	235698	235703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212187
6009	NC_020561	CGC	2	6	235720	235725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212187
6010	NC_020561	CG	3	6	235729	235734	0 %	0 %	50 %	50 %	470212187
6011	NC_020561	CTG	2	6	235748	235753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212187
6012	NC_020561	CGC	2	6	235816	235821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212187
6013	NC_020561	AGC	2	6	235879	235884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212188
6014	NC_020561	TGG	2	6	235894	235899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212188
6015	NC_020561	GCC	2	6	235938	235943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212188
6016	NC_020561	AAG	2	6	236037	236042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212188
6017	NC_020561	CCGG	2	8	236111	236118	0 %	0 %	50 %	50 %	470212188
6018	NC_020561	GGC	2	6	236127	236132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212188
6019	NC_020561	GGCC	2	8	236189	236196	0 %	0 %	50 %	50 %	470212188
6020	NC_020561	CG	3	6	236208	236213	0 %	0 %	50 %	50 %	470212188
6021	NC_020561	GAT	2	6	236222	236227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212188
6022	NC_020561	GC	3	6	236243	236248	0 %	0 %	50 %	50 %	470212188
6023	NC_020561	CAG	2	6	236282	236287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212188
6024	NC_020561	GCC	2	6	236304	236309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212188
6025	NC_020561	GCC	2	6	236321	236326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212189
6026	NC_020561	CGG	2	6	236356	236361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212189
6027	NC_020561	CGC	2	6	236377	236382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212189
6028	NC_020561	T	6	6	236420	236425	0 %	100 %	0 %	0 %	470212189
6029	NC_020561	GCC	2	6	236432	236437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212189
6030	NC_020561	GGCGAC	2	12	236462	236473	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470212189
6031	NC_020561	GC	3	6	236494	236499	0 %	0 %	50 %	50 %	470212189
6032	NC_020561	CG	3	6	236500	236505	0 %	0 %	50 %	50 %	470212189
6033	NC_020561	GCG	2	6	236652	236657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212189
6034	NC_020561	GCC	2	6	236666	236671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212189
6035	NC_020561	GCCG	2	8	236702	236709	0 %	0 %	50 %	50 %	470212189
6036	NC_020561	CG	3	6	236708	236713	0 %	0 %	50 %	50 %	470212189
6037	NC_020561	GC	3	6	236732	236737	0 %	0 %	50 %	50 %	470212189
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6040	NC_020561	CCA	2	6	236770	236775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212189
6041	NC_020561	GGC	2	6	236793	236798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212190
6042	NC_020561	GC	3	6	236828	236833	0 %	0 %	50 %	50 %	470212190
6043	NC_020561	ATC	2	6	236851	236856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212190
6044	NC_020561	GCCG	2	8	236870	236877	0 %	0 %	50 %	50 %	470212190
6045	NC_020561	CGG	2	6	236885	236890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212190
6046	NC_020561	CGT	2	6	236997	237002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212190
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6048	NC_020561	CGCT	2	8	237070	237077	0 %	25 %	25 %	50 %	470212190
6049	NC_020561	CG	3	6	237081	237086	0 %	0 %	50 %	50 %	470212190
6050	NC_020561	GCCGG	2	10	237103	237112	0 %	0 %	60 %	40 %	470212190
6051	NC_020561	TCA	2	6	237194	237199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212190
6052	NC_020561	GCC	2	6	237265	237270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212190
6053	NC_020561	CAG	2	6	237288	237293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212190
6054	NC_020561	GGGAT	2	10	237302	237311	20 %	20 %	60 %	0 %	470212190
6055	NC_020561	CCGG	2	8	237401	237408	0 %	0 %	50 %	50 %	470212191
6056	NC_020561	GGT	3	9	237425	237433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212191
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6058	NC_020561	GC	3	6	237486	237491	0 %	0 %	50 %	50 %	470212191
6059	NC_020561	GAT	2	6	237530	237535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212191
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6061	NC_020561	CGA	2	6	237595	237600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212191
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6064	NC_020561	GCATC	2	10	237682	237691	20 %	20 %	20 %	40 %	470212191
6065	NC_020561	GGCC	2	8	237727	237734	0 %	0 %	50 %	50 %	470212191
6066	NC_020561	CG	3	6	237820	237825	0 %	0 %	50 %	50 %	470212191
6067	NC_020561	GC	4	8	237833	237840	0 %	0 %	50 %	50 %	470212191
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6070	NC_020561	TCT	2	6	237883	237888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212191
6071	NC_020561	CGCC	2	8	237901	237908	0 %	0 %	25 %	75 %	470212191
6072	NC_020561	CGG	2	6	237928	237933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212191
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6088	NC_020561	GCC	3	9	238451	238459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212191
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6109	NC_020561	TCGA	2	8	239372	239379	25 %	25 %	25 %	25 %	470212192
6110	NC_020561	CGGCT	2	10	239494	239503	0 %	20 %	40 %	40 %	470212192
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6118	NC_020561	CGT	2	6	239937	239942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212193
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6120	NC_020561	CGGC	2	8	239976	239983	0 %	0 %	50 %	50 %	470212193
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6122	NC_020561	CCG	2	6	240011	240016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212193
6123	NC_020561	CGGCG	2	10	240018	240027	0 %	0 %	60 %	40 %	470212193
6124	NC_020561	GCT	2	6	240084	240089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212193
6125	NC_020561	CGA	2	6	240102	240107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212193
6126	NC_020561	GATC	2	8	240165	240172	25 %	25 %	25 %	25 %	470212193
6127	NC_020561	GGC	2	6	240197	240202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212193
6128	NC_020561	CCT	3	9	240228	240236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212193
6129	NC_020561	GGGGA	2	10	240452	240461	20 %	0 %	80 %	0 %	470212193
6130	NC_020561	GCTC	2	8	240470	240477	0 %	25 %	25 %	50 %	470212193
6131	NC_020561	CGA	2	6	240498	240503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212193
6132	NC_020561	GC	3	6	240512	240517	0 %	0 %	50 %	50 %	470212193
6133	NC_020561	ATC	2	6	240533	240538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212193
6134	NC_020561	TCG	2	6	240593	240598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212193
6135	NC_020561	CAT	2	6	240624	240629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212193
6136	NC_020561	GC	3	6	240637	240642	0 %	0 %	50 %	50 %	470212193
6137	NC_020561	CGC	2	6	240653	240658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212193
6138	NC_020561	CCT	3	9	240672	240680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212193
6139	NC_020561	CG	4	8	240683	240690	0 %	0 %	50 %	50 %	470212193
6140	NC_020561	TCG	3	9	240718	240726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212194
6141	NC_020561	GCC	2	6	240735	240740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212194
6142	NC_020561	CGT	2	6	240749	240754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212194
6143	NC_020561	CCG	2	6	240767	240772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212194
6144	NC_020561	GCC	2	6	240795	240800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212194
6145	NC_020561	AGC	2	6	240811	240816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212194
6146	NC_020561	GACG	2	8	240854	240861	25 %	0 %	50 %	25 %	470212194
6147	NC_020561	CG	3	6	240972	240977	0 %	0 %	50 %	50 %	470212194
6148	NC_020561	CG	3	6	241035	241040	0 %	0 %	50 %	50 %	470212194
6149	NC_020561	CG	3	6	241058	241063	0 %	0 %	50 %	50 %	470212194
6150	NC_020561	G	6	6	241063	241068	0 %	0 %	100 %	0 %	470212194
6151	NC_020561	GAT	2	6	241077	241082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212194
6152	NC_020561	AGG	2	6	241141	241146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212194
6153	NC_020561	CG	3	6	241160	241165	0 %	0 %	50 %	50 %	470212194
6154	NC_020561	CG	4	8	241229	241236	0 %	0 %	50 %	50 %	470212194
6155	NC_020561	TCG	2	6	241273	241278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212194
6156	NC_020561	G	6	6	241339	241344	0 %	0 %	100 %	0 %	470212194
6157	NC_020561	GCG	2	6	241356	241361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212194
6158	NC_020561	GGC	2	6	241395	241400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212194
6159	NC_020561	GCT	2	6	241451	241456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212194
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6161	NC_020561	GC	3	6	241495	241500	0 %	0 %	50 %	50 %	470212194
6162	NC_020561	GATC	2	8	241501	241508	25 %	25 %	25 %	25 %	470212194
6163	NC_020561	CAT	2	6	241523	241528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212194
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6165	NC_020561	GGC	2	6	241682	241687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212194
6166	NC_020561	GC	3	6	241718	241723	0 %	0 %	50 %	50 %	470212194
6167	NC_020561	GCG	2	6	241787	241792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212194
6168	NC_020561	ATCG	2	8	241829	241836	25 %	25 %	25 %	25 %	470212194
6169	NC_020561	GCG	2	6	241852	241857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212194
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6172	NC_020561	CAT	2	6	241926	241931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212194
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6189	NC_020561	TGC	2	6	242480	242485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212195
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6192	NC_020561	GGC	2	6	242530	242535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212195
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6195	NC_020561	GCT	2	6	242619	242624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212195
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6200	NC_020561	GCG	2	6	242753	242758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212195
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6203	NC_020561	CTGGC	2	10	242815	242824	0 %	20 %	40 %	40 %	470212195
6204	NC_020561	CCGC	2	8	242831	242838	0 %	0 %	25 %	75 %	470212195
6205	NC_020561	TCA	2	6	242858	242863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212195
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6220	NC_020561	GCT	2	6	243171	243176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212195
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6223	NC_020561	TCG	2	6	243194	243199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212195
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6225	NC_020561	CG	3	6	243300	243305	0 %	0 %	50 %	50 %	470212195
6226	NC_020561	GCC	2	6	243349	243354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212195
6227	NC_020561	GGA	2	6	243378	243383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212195
6228	NC_020561	GC	3	6	243392	243397	0 %	0 %	50 %	50 %	470212195
6229	NC_020561	CAG	2	6	243412	243417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212195
6230	NC_020561	CAG	2	6	243518	243523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212195
6231	NC_020561	GC	3	6	243590	243595	0 %	0 %	50 %	50 %	470212195
6232	NC_020561	CAA	2	6	243718	243723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212195
6233	NC_020561	GCG	2	6	243735	243740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212195
6234	NC_020561	GCC	2	6	243742	243747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212195
6235	NC_020561	CG	3	6	243759	243764	0 %	0 %	50 %	50 %	470212195
6236	NC_020561	GCC	2	6	243811	243816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212195
6237	NC_020561	AGG	2	6	243842	243847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212195
6238	NC_020561	CCG	2	6	243912	243917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212195
6239	NC_020561	CGA	2	6	243924	243929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212195
6240	NC_020561	CGCA	2	8	243942	243949	25 %	0 %	25 %	50 %	470212195
6241	NC_020561	CG	3	6	243967	243972	0 %	0 %	50 %	50 %	470212195
6242	NC_020561	CGCC	2	8	243990	243997	0 %	0 %	25 %	75 %	470212195
6243	NC_020561	TGG	2	6	244046	244051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212195
6244	NC_020561	TCGA	2	8	244168	244175	25 %	25 %	25 %	25 %	470212195
6245	NC_020561	GCT	2	6	244203	244208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212195
6246	NC_020561	CAT	2	6	244209	244214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212195
6247	NC_020561	GAC	2	6	244222	244227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212195
6248	NC_020561	CCG	2	6	244240	244245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212195
6249	NC_020561	ACC	2	6	244276	244281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212195
6250	NC_020561	CGGCCT	2	12	244296	244307	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470212195
6251	NC_020561	TCG	2	6	244325	244330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212195
6252	NC_020561	CGG	3	9	244368	244376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212195
6253	NC_020561	CTCGC	2	10	244411	244420	0 %	20 %	20 %	60 %	470212195
6254	NC_020561	GATGCC	2	12	244435	244446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212195
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6257	NC_020561	TCG	2	6	244520	244525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212196
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6259	NC_020561	CGG	2	6	244592	244597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212196
6260	NC_020561	GACAGC	2	12	244600	244611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212196
6261	NC_020561	GCCG	2	8	244634	244641	0 %	0 %	50 %	50 %	470212196
6262	NC_020561	TGC	2	6	244649	244654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212196
6263	NC_020561	CTG	2	6	244696	244701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212196
6264	NC_020561	GAG	2	6	244702	244707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212196
6265	NC_020561	GCG	2	6	244713	244718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212196
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6268	NC_020561	CTG	4	12	244834	244845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212196
6269	NC_020561	CG	3	6	244852	244857	0 %	0 %	50 %	50 %	470212196
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6273	NC_020561	CGC	2	6	244977	244982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212196
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6277	NC_020561	GCT	2	6	245043	245048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212196
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6280	NC_020561	CG	3	6	245097	245102	0 %	0 %	50 %	50 %	470212196
6281	NC_020561	GGA	3	9	245121	245129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212196
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6284	NC_020561	GGC	2	6	245191	245196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212196
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6291	NC_020561	CGT	2	6	245400	245405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212196
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6321	NC_020561	CAG	2	6	246788	246793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212198
6322	NC_020561	ATCG	2	8	246827	246834	25 %	25 %	25 %	25 %	470212198
6323	NC_020561	GGC	2	6	246885	246890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212198
6324	NC_020561	CGGCTT	2	12	246970	246981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212198
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6329	NC_020561	CGA	2	6	247230	247235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212198
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6332	NC_020561	CG	3	6	247331	247336	0 %	0 %	50 %	50 %	470212198
6333	NC_020561	GGA	2	6	247342	247347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212198
6334	NC_020561	TCA	2	6	247365	247370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212198
6335	NC_020561	TCG	2	6	247449	247454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212198
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6337	NC_020561	GAG	2	6	247514	247519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212198
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6339	NC_020561	CGG	2	6	247547	247552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212198
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6341	NC_020561	CCG	2	6	247665	247670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212198
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6344	NC_020561	GC	3	6	247787	247792	0 %	0 %	50 %	50 %	470212198
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6352	NC_020561	ACCCG	2	10	248093	248102	20 %	0 %	20 %	60 %	470212199
6353	NC_020561	CGC	2	6	248103	248108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212199
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6355	NC_020561	CAG	2	6	248133	248138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212199
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6358	NC_020561	GAC	2	6	248286	248291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212199
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6361	NC_020561	ATC	2	6	248388	248393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212199
6362	NC_020561	ATG	2	6	248509	248514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212199
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6365	NC_020561	GCG	2	6	248884	248889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212200
6366	NC_020561	CA	3	6	248907	248912	50 %	0 %	0 %	50 %	470212200
6367	NC_020561	GC	3	6	248913	248918	0 %	0 %	50 %	50 %	470212200
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6403	NC_020561	TCG	2	6	250205	250210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212201
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6474	NC_020561	GCCGG	2	10	252816	252825	0 %	0 %	60 %	40 %	470212202
6475	NC_020561	GCG	2	6	252830	252835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212202
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6483	NC_020561	GC	3	6	253202	253207	0 %	0 %	50 %	50 %	470212203
6484	NC_020561	CGG	2	6	253299	253304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212203
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6486	NC_020561	GGCCC	2	10	253329	253338	0 %	0 %	40 %	60 %	470212203
6487	NC_020561	CTC	2	6	253358	253363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212203
6488	NC_020561	CGG	2	6	253392	253397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212203
6489	NC_020561	GCCC	2	8	253423	253430	0 %	0 %	25 %	75 %	470212203
6490	NC_020561	CGGC	2	8	253462	253469	0 %	0 %	50 %	50 %	470212203
6491	NC_020561	GATC	2	8	253500	253507	25 %	25 %	25 %	25 %	470212203
6492	NC_020561	CAC	2	6	253513	253518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212203
6493	NC_020561	GCA	2	6	253522	253527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212203
6494	NC_020561	CCA	2	6	253599	253604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212203
6495	NC_020561	CGAT	2	8	253611	253618	25 %	25 %	25 %	25 %	470212203
6496	NC_020561	GGC	2	6	253625	253630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212203
6497	NC_020561	CGC	2	6	253672	253677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212203
6498	NC_020561	GCCA	2	8	253739	253746	25 %	0 %	25 %	50 %	470212203
6499	NC_020561	CGC	2	6	253787	253792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212203
6500	NC_020561	TCG	2	6	253860	253865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212203

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