MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020561	CGCGC	2	10	216040	216049	0 %	0 %	40 %	60 %	470212170
5502	NC_020561	CTGC	2	8	216096	216103	0 %	25 %	25 %	50 %	470212170
5503	NC_020561	TAC	2	6	216115	216120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212170
5504	NC_020561	TCG	2	6	216158	216163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212170
5505	NC_020561	GAT	2	6	216228	216233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212170
5506	NC_020561	GGT	2	6	216252	216257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212170
5507	NC_020561	CGC	2	6	216270	216275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212170
5508	NC_020561	ATC	2	6	216304	216309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212170
5509	NC_020561	GCC	2	6	216333	216338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212170
5510	NC_020561	GCG	2	6	216369	216374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212170
5511	NC_020561	CGG	2	6	216392	216397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212170
5512	NC_020561	GCC	2	6	216401	216406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212170
5513	NC_020561	TCG	2	6	216425	216430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212170
5514	NC_020561	CGC	2	6	216438	216443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212170
5515	NC_020561	TGC	2	6	216482	216487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212170
5516	NC_020561	CGG	2	6	216495	216500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212170
5517	NC_020561	CAC	2	6	216501	216506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212170
5518	NC_020561	GC	3	6	216557	216562	0 %	0 %	50 %	50 %	470212170
5519	NC_020561	CGG	2	6	216579	216584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212170
5520	NC_020561	GCGG	2	8	216588	216595	0 %	0 %	75 %	25 %	470212170
5521	NC_020561	ACGC	2	8	216603	216610	25 %	0 %	25 %	50 %	470212170
5522	NC_020561	TGC	2	6	216617	216622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212170
5523	NC_020561	CAC	2	6	216645	216650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212170
5524	NC_020561	GAT	2	6	216684	216689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212170
5525	NC_020561	CTG	2	6	216691	216696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212170
5526	NC_020561	CGA	2	6	216725	216730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212170
5527	NC_020561	CCCA	2	8	216745	216752	25 %	0 %	0 %	75 %	470212170
5528	NC_020561	TTC	2	6	216754	216759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212170
5529	NC_020561	CGGG	2	8	216842	216849	0 %	0 %	75 %	25 %	470212170
5530	NC_020561	GCCGCT	2	12	216852	216863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470212170
5531	NC_020561	ATC	2	6	216940	216945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212170
5532	NC_020561	TGA	2	6	217094	217099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212170
5533	NC_020561	CGA	2	6	217119	217124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212170
5534	NC_020561	CGA	2	6	217179	217184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212170
5535	NC_020561	CGG	2	6	217233	217238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212170
5536	NC_020561	CG	3	6	217253	217258	0 %	0 %	50 %	50 %	470212170
5537	NC_020561	TCG	2	6	217352	217357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212170
5538	NC_020561	GGA	3	9	217383	217391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212170
5539	NC_020561	AT	3	6	217440	217445	50 %	50 %	0 %	0 %	470212170
5540	NC_020561	GGA	3	9	217506	217514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212170
5541	NC_020561	GCG	2	6	217521	217526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212170
5542	NC_020561	GGAT	2	8	217603	217610	25 %	25 %	50 %	0 %	470212171
5543	NC_020561	GGC	2	6	217671	217676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212171
5544	NC_020561	CGC	2	6	217733	217738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212171
5545	NC_020561	CCG	2	6	217767	217772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212171
5546	NC_020561	CGGCT	2	10	217810	217819	0 %	20 %	40 %	40 %	470212171
5547	NC_020561	ATG	2	6	217856	217861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212171
5548	NC_020561	GCG	2	6	217887	217892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212171
5549	NC_020561	AGC	2	6	217934	217939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212171
5550	NC_020561	GACGA	2	10	217951	217960	40 %	0 %	40 %	20 %	470212171
5551	NC_020561	TCG	2	6	217961	217966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212171
5552	NC_020561	GC	3	6	217983	217988	0 %	0 %	50 %	50 %	470212171
5553	NC_020561	GAA	2	6	218021	218026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212171
5554	NC_020561	CGGG	2	8	218176	218183	0 %	0 %	75 %	25 %	470212172
5555	NC_020561	G	6	6	218197	218202	0 %	0 %	100 %	0 %	470212172
5556	NC_020561	CCG	2	6	218230	218235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212172
5557	NC_020561	CCG	3	9	218241	218249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212172
5558	NC_020561	CGG	3	9	218323	218331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212172
5559	NC_020561	CG	3	6	218375	218380	0 %	0 %	50 %	50 %	470212172
5560	NC_020561	GCCGC	2	10	218391	218400	0 %	0 %	40 %	60 %	470212172
5561	NC_020561	CGAT	2	8	218415	218422	25 %	25 %	25 %	25 %	470212172
5562	NC_020561	CAA	2	6	218431	218436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212172
5563	NC_020561	CGC	3	9	218437	218445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212172
5564	NC_020561	AAT	2	6	218447	218452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470212172
5565	NC_020561	CGG	3	9	218486	218494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212172
5566	NC_020561	CAG	2	6	218534	218539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212172
5567	NC_020561	GTC	2	6	218576	218581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212172
5568	NC_020561	GCC	2	6	218605	218610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212172
5569	NC_020561	GCA	2	6	218635	218640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212172
5570	NC_020561	CGG	2	6	218706	218711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212172
5571	NC_020561	GCACG	2	10	218716	218725	20 %	0 %	40 %	40 %	470212172
5572	NC_020561	G	6	6	218820	218825	0 %	0 %	100 %	0 %	470212172
5573	NC_020561	ATG	2	6	218837	218842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212172
5574	NC_020561	GCC	2	6	218849	218854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212172
5575	NC_020561	CTG	3	9	218855	218863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212172
5576	NC_020561	TGC	2	6	218889	218894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212172
5577	NC_020561	CTG	2	6	218915	218920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212172
5578	NC_020561	GC	3	6	219008	219013	0 %	0 %	50 %	50 %	470212173
5579	NC_020561	CGCC	2	8	219081	219088	0 %	0 %	25 %	75 %	470212173
5580	NC_020561	CTCGC	2	10	219091	219100	0 %	20 %	20 %	60 %	470212173
5581	NC_020561	TCG	2	6	219113	219118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212173
5582	NC_020561	GC	3	6	219186	219191	0 %	0 %	50 %	50 %	470212173
5583	NC_020561	CG	3	6	219225	219230	0 %	0 %	50 %	50 %	470212173
5584	NC_020561	CAA	2	6	219285	219290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212173
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5587	NC_020561	CGC	2	6	219314	219319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212173
5588	NC_020561	C	6	6	219374	219379	0 %	0 %	0 %	100 %	470212173
5589	NC_020561	GGC	2	6	219393	219398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212173
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5592	NC_020561	GAT	2	6	219693	219698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212173
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5599	NC_020561	GGT	2	6	220174	220179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212174
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5601	NC_020561	CAG	2	6	220244	220249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212174
5602	NC_020561	CG	4	8	220273	220280	0 %	0 %	50 %	50 %	470212174
5603	NC_020561	CCGAT	2	10	220344	220353	20 %	20 %	20 %	40 %	470212174
5604	NC_020561	CTGG	2	8	220426	220433	0 %	25 %	50 %	25 %	470212174
5605	NC_020561	CGC	2	6	220510	220515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212174
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5610	NC_020561	GC	3	6	220644	220649	0 %	0 %	50 %	50 %	470212174
5611	NC_020561	GAAG	2	8	220732	220739	50 %	0 %	50 %	0 %	470212174
5612	NC_020561	CG	3	6	220740	220745	0 %	0 %	50 %	50 %	470212174
5613	NC_020561	GCT	2	6	220768	220773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212174
5614	NC_020561	GCC	4	12	220823	220834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212174
5615	NC_020561	GGCCG	2	10	220882	220891	0 %	0 %	60 %	40 %	470212174
5616	NC_020561	GCCA	2	8	220895	220902	25 %	0 %	25 %	50 %	470212174
5617	NC_020561	CCG	2	6	220947	220952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212174
5618	NC_020561	TCG	2	6	220962	220967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212174
5619	NC_020561	GCCGG	2	10	220999	221008	0 %	0 %	60 %	40 %	470212174
5620	NC_020561	GGA	2	6	221026	221031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212174
5621	NC_020561	TG	3	6	221131	221136	0 %	50 %	50 %	0 %	470212174
5622	NC_020561	GCT	2	6	221137	221142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212174
5623	NC_020561	CGC	2	6	221146	221151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212174
5624	NC_020561	CGC	2	6	221173	221178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212174
5625	NC_020561	GGC	2	6	221211	221216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212174
5626	NC_020561	CGG	2	6	221251	221256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212174
5627	NC_020561	GC	4	8	221284	221291	0 %	0 %	50 %	50 %	470212174
5628	NC_020561	ATGTCG	2	12	221307	221318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470212174
5629	NC_020561	GGCC	2	8	221359	221366	0 %	0 %	50 %	50 %	470212174
5630	NC_020561	CG	4	8	221386	221393	0 %	0 %	50 %	50 %	470212174
5631	NC_020561	TCG	2	6	221400	221405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212174
5632	NC_020561	GTC	2	6	221438	221443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212174
5633	NC_020561	CGC	2	6	221444	221449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212174
5634	NC_020561	CGGCC	2	10	221459	221468	0 %	0 %	40 %	60 %	470212174
5635	NC_020561	TCG	2	6	221469	221474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212174
5636	NC_020561	TCC	2	6	221529	221534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212174
5637	NC_020561	CTT	2	6	221557	221562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212174
5638	NC_020561	ATC	2	6	221586	221591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212174
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5641	NC_020561	CGAT	2	8	221735	221742	25 %	25 %	25 %	25 %	470212174
5642	NC_020561	CAC	2	6	221782	221787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212174
5643	NC_020561	CGC	2	6	221812	221817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212174
5644	NC_020561	CAG	2	6	221819	221824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212174
5645	NC_020561	CGA	2	6	221860	221865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212174
5646	NC_020561	TGC	3	9	221952	221960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212174
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5650	NC_020561	GGC	2	6	221992	221997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212174
5651	NC_020561	ATC	2	6	222008	222013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212174
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5653	NC_020561	GCG	2	6	222102	222107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212174
5654	NC_020561	CTG	2	6	222110	222115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212174
5655	NC_020561	GGAT	2	8	222123	222130	25 %	25 %	50 %	0 %	470212174
5656	NC_020561	CCTGTT	2	12	222136	222147	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470212174
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5659	NC_020561	CGC	3	9	222251	222259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212174
5660	NC_020561	CG	3	6	222289	222294	0 %	0 %	50 %	50 %	470212174
5661	NC_020561	CCG	2	6	222352	222357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212174
5662	NC_020561	GTGATC	2	12	222389	222400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470212174
5663	NC_020561	GAC	2	6	222401	222406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212174
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5696	NC_020561	GCTC	2	8	223770	223777	0 %	25 %	25 %	50 %	470212175
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5701	NC_020561	TGC	2	6	223905	223910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212175
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5735	NC_020561	GTCC	2	8	225272	225279	0 %	25 %	25 %	50 %	470212177
5736	NC_020561	ATCGCC	2	12	225333	225344	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470212177
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5741	NC_020561	ATC	2	6	225444	225449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212177
5742	NC_020561	CGGG	2	8	225472	225479	0 %	0 %	75 %	25 %	470212177
5743	NC_020561	CGC	2	6	225506	225511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212177
5744	NC_020561	CGC	2	6	225526	225531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212177
5745	NC_020561	GCT	2	6	225536	225541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212177
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5750	NC_020561	GTC	2	6	225609	225614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212177
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5752	NC_020561	CGC	2	6	225644	225649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212177
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5763	NC_020561	CTG	3	9	225912	225920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212177
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5854	NC_020561	GCT	2	6	229439	229444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212181
5855	NC_020561	GATC	2	8	229477	229484	25 %	25 %	25 %	25 %	470212181
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5860	NC_020561	CCG	3	9	229645	229653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212181
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5862	NC_020561	CGCC	2	8	229711	229718	0 %	0 %	25 %	75 %	470212181
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5864	NC_020561	GCC	2	6	229897	229902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212182
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5866	NC_020561	CGG	2	6	229946	229951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212182
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5982	NC_020561	GCG	2	6	234824	234829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212186
5983	NC_020561	CGCT	2	8	234939	234946	0 %	25 %	25 %	50 %	470212187
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5985	NC_020561	TCCGCG	2	12	234984	234995	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470212187
5986	NC_020561	GCG	2	6	235036	235041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212187
5987	NC_020561	GAG	2	6	235064	235069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212187
5988	NC_020561	GAA	2	6	235102	235107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212187
5989	NC_020561	TGA	2	6	235119	235124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212187
5990	NC_020561	CG	3	6	235184	235189	0 %	0 %	50 %	50 %	470212187
5991	NC_020561	GCA	2	6	235207	235212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212187
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