MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 106606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020561	CAG	2	6	194848	194853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5002	NC_020561	CGG	2	6	194862	194867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212152
5003	NC_020561	GAT	2	6	194872	194877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212152
5004	NC_020561	GCC	2	6	194974	194979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5005	NC_020561	GCC	2	6	195013	195018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5006	NC_020561	CGA	2	6	195079	195084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5007	NC_020561	CGT	2	6	195117	195122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5008	NC_020561	CG	3	6	195160	195165	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
5009	NC_020561	GC	3	6	195174	195179	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
5010	NC_020561	GCC	2	6	195229	195234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5011	NC_020561	GCC	2	6	195253	195258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5012	NC_020561	GC	3	6	195261	195266	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
5013	NC_020561	GCT	2	6	195295	195300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5014	NC_020561	GGC	2	6	195397	195402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212152
5015	NC_020561	CGC	2	6	195424	195429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5016	NC_020561	GCC	2	6	195430	195435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5017	NC_020561	CCG	2	6	195465	195470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5018	NC_020561	GCC	2	6	195481	195486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5019	NC_020561	CGA	2	6	195489	195494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5020	NC_020561	C	6	6	195577	195582	0 %	0 %	0 %	100 %	470212152
5021	NC_020561	CGC	2	6	195648	195653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5022	NC_020561	GGC	2	6	195735	195740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212152
5023	NC_020561	GCCCGA	2	12	195763	195774	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212152
5024	NC_020561	CGC	2	6	195780	195785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5025	NC_020561	GC	3	6	195879	195884	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
5026	NC_020561	CCG	2	6	195902	195907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5027	NC_020561	GCG	3	9	195908	195916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212152
5028	NC_020561	GCC	2	6	195967	195972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5029	NC_020561	GCC	2	6	196027	196032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5030	NC_020561	CGA	2	6	196053	196058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5031	NC_020561	GCCG	2	8	196125	196132	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
5032	NC_020561	CGA	2	6	196158	196163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5033	NC_020561	GCC	2	6	196207	196212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5034	NC_020561	GCCC	2	8	196249	196256	0 %	0 %	25 %	75 %	470212152
5035	NC_020561	GGT	2	6	196291	196296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212152
5036	NC_020561	GCC	2	6	196321	196326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5037	NC_020561	CGG	3	9	196353	196361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212152
5038	NC_020561	CGA	2	6	196362	196367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5039	NC_020561	GGGC	2	8	196422	196429	0 %	0 %	75 %	25 %	470212152
5040	NC_020561	GTC	2	6	196430	196435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5041	NC_020561	GGCCA	2	10	196441	196450	20 %	0 %	40 %	40 %	470212152
5042	NC_020561	ATA	2	6	196486	196491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470212152
5043	NC_020561	GGCC	2	8	196497	196504	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
5044	NC_020561	TGA	2	6	196539	196544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212152
5045	NC_020561	GCCG	2	8	196591	196598	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
5046	NC_020561	GCA	2	6	196610	196615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5047	NC_020561	GATC	2	8	196642	196649	25 %	25 %	25 %	25 %	470212152
5048	NC_020561	CGCC	2	8	196668	196675	0 %	0 %	25 %	75 %	470212152
5049	NC_020561	TCCG	2	8	196710	196717	0 %	25 %	25 %	50 %	470212152
5050	NC_020561	CGT	2	6	196729	196734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5051	NC_020561	CG	3	6	196763	196768	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
5052	NC_020561	CAG	2	6	196783	196788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5053	NC_020561	GCT	2	6	196789	196794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5054	NC_020561	CGAT	2	8	196800	196807	25 %	25 %	25 %	25 %	470212152
5055	NC_020561	GCC	2	6	196825	196830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5056	NC_020561	TGG	2	6	196947	196952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212152
5057	NC_020561	TGT	2	6	196956	196961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470212152
5058	NC_020561	CGC	2	6	196962	196967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5059	NC_020561	GC	3	6	197022	197027	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
5060	NC_020561	TGGTC	2	10	197031	197040	0 %	40 %	40 %	20 %	470212152
5061	NC_020561	TGC	2	6	197127	197132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5062	NC_020561	CGA	2	6	197134	197139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
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5064	NC_020561	GCC	2	6	197248	197253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5065	NC_020561	CGC	2	6	197368	197373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
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5070	NC_020561	AAGG	2	8	197560	197567	50 %	0 %	50 %	0 %	470212152
5071	NC_020561	GCG	2	6	197591	197596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212152
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5080	NC_020561	GCA	2	6	197865	197870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
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5082	NC_020561	TGA	2	6	197982	197987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212152
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5094	NC_020561	GC	3	6	198461	198466	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
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5104	NC_020561	GCCGAT	2	12	198898	198909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5105	NC_020561	CGA	2	6	198927	198932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5106	NC_020561	GCC	3	9	199006	199014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5107	NC_020561	GAGC	2	8	199087	199094	25 %	0 %	50 %	25 %	470212152
5108	NC_020561	GCC	2	6	199108	199113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5109	NC_020561	CTGC	3	12	199118	199129	0 %	25 %	25 %	50 %	470212152
5110	NC_020561	CGA	2	6	199134	199139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5111	NC_020561	CCG	2	6	199163	199168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5112	NC_020561	GTCACG	2	12	199247	199258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5113	NC_020561	TGGCC	2	10	199305	199314	0 %	20 %	40 %	40 %	470212152
5114	NC_020561	CCG	2	6	199349	199354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
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5119	NC_020561	GTCCA	2	10	199471	199480	20 %	20 %	20 %	40 %	470212152
5120	NC_020561	CGA	2	6	199497	199502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5121	NC_020561	CCG	2	6	199560	199565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5122	NC_020561	GCC	2	6	199589	199594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5123	NC_020561	GGT	2	6	199618	199623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212152
5124	NC_020561	GAT	2	6	199659	199664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212152
5125	NC_020561	GACC	2	8	199672	199679	25 %	0 %	25 %	50 %	470212152
5126	NC_020561	TGG	2	6	199991	199996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212153
5127	NC_020561	CCGCC	2	10	200031	200040	0 %	0 %	20 %	80 %	470212153
5128	NC_020561	TCC	2	6	200225	200230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212153
5129	NC_020561	ATG	2	6	200276	200281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212153
5130	NC_020561	GCG	2	6	200286	200291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212153
5131	NC_020561	GTG	2	6	200297	200302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212153
5132	NC_020561	TCG	2	6	200315	200320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212153
5133	NC_020561	GGCG	2	8	200325	200332	0 %	0 %	75 %	25 %	470212153
5134	NC_020561	CCG	2	6	200335	200340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212153
5135	NC_020561	GCG	3	9	200402	200410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212153
5136	NC_020561	GGCC	2	8	200415	200422	0 %	0 %	50 %	50 %	470212153
5137	NC_020561	TCC	2	6	200429	200434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212153
5138	NC_020561	CGC	3	9	200437	200445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212153
5139	NC_020561	CAG	2	6	200500	200505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212153
5140	NC_020561	CCG	2	6	200523	200528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212153
5141	NC_020561	GCCG	2	8	200557	200564	0 %	0 %	50 %	50 %	470212153
5142	NC_020561	CG	3	6	200563	200568	0 %	0 %	50 %	50 %	470212153
5143	NC_020561	GGGC	2	8	200633	200640	0 %	0 %	75 %	25 %	470212153
5144	NC_020561	GC	3	6	200710	200715	0 %	0 %	50 %	50 %	470212153
5145	NC_020561	GGTC	2	8	200757	200764	0 %	25 %	50 %	25 %	470212153
5146	NC_020561	CTT	2	6	200779	200784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212153
5147	NC_020561	GCG	2	6	201287	201292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212154
5148	NC_020561	CCG	2	6	201323	201328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212154
5149	NC_020561	GC	3	6	201330	201335	0 %	0 %	50 %	50 %	470212154
5150	NC_020561	TCGA	2	8	201423	201430	25 %	25 %	25 %	25 %	470212154
5151	NC_020561	CAC	2	6	201458	201463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212154
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5153	NC_020561	GCT	2	6	201485	201490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212154
5154	NC_020561	GCC	2	6	201550	201555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212154
5155	NC_020561	CGA	2	6	201557	201562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212154
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5159	NC_020561	CGC	2	6	201965	201970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212155
5160	NC_020561	GCCGC	2	10	202045	202054	0 %	0 %	40 %	60 %	470212155
5161	NC_020561	GCC	2	6	202060	202065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212155
5162	NC_020561	GCCT	2	8	202068	202075	0 %	25 %	25 %	50 %	470212155
5163	NC_020561	AAGC	2	8	202135	202142	50 %	0 %	25 %	25 %	470212155
5164	NC_020561	CAGG	2	8	202176	202183	25 %	0 %	50 %	25 %	470212155
5165	NC_020561	GCCGG	2	10	202227	202236	0 %	0 %	60 %	40 %	470212156
5166	NC_020561	GCC	2	6	202323	202328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212156
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5170	NC_020561	CGA	2	6	202488	202493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212156
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5174	NC_020561	CGG	2	6	202608	202613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212156
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5177	NC_020561	GAT	2	6	202724	202729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212157
5178	NC_020561	TCA	2	6	202732	202737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212157
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5180	NC_020561	TTC	2	6	202854	202859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212157
5181	NC_020561	CTG	2	6	202863	202868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212157
5182	NC_020561	CG	3	6	202870	202875	0 %	0 %	50 %	50 %	470212157
5183	NC_020561	ATT	2	6	202876	202881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212157
5184	NC_020561	TGC	2	6	202933	202938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212157
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5190	NC_020561	TGA	2	6	203302	203307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212158
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5194	NC_020561	AGC	2	6	203455	203460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212158
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5196	NC_020561	ACCG	2	8	203502	203509	25 %	0 %	25 %	50 %	470212158
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5199	NC_020561	TGA	2	6	203632	203637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212158
5200	NC_020561	TCA	2	6	203644	203649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212158
5201	NC_020561	GCC	2	6	203700	203705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212158
5202	NC_020561	GGC	2	6	203720	203725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212158
5203	NC_020561	GCG	3	9	203759	203767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212159
5204	NC_020561	GCT	2	6	203791	203796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212159
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5244	NC_020561	GCG	2	6	205415	205420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212161
5245	NC_020561	CGG	2	6	205542	205547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212161
5246	NC_020561	TCA	2	6	205596	205601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212161
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5248	NC_020561	TGG	2	6	205706	205711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212162
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5262	NC_020561	CCGGC	2	10	206214	206223	0 %	0 %	40 %	60 %	470212162
5263	NC_020561	GCG	2	6	206361	206366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212162
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5273	NC_020561	GCG	2	6	206794	206799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212163
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5350	NC_020561	GGTCA	2	10	209791	209800	20 %	20 %	40 %	20 %	470212165
5351	NC_020561	GCA	2	6	209877	209882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212165
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5361	NC_020561	TCG	2	6	210221	210226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212165
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5363	NC_020561	GCGG	2	8	210265	210272	0 %	0 %	75 %	25 %	470212165
5364	NC_020561	TCC	2	6	210275	210280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212165
5365	NC_020561	TGCG	2	8	210513	210520	0 %	25 %	50 %	25 %	470212166
5366	NC_020561	CAG	2	6	210563	210568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212166
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5368	NC_020561	ACC	2	6	210639	210644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212166
5369	NC_020561	GCCCG	2	10	210705	210714	0 %	0 %	40 %	60 %	470212166
5370	NC_020561	GC	3	6	210748	210753	0 %	0 %	50 %	50 %	470212166
5371	NC_020561	GCCTTG	2	12	210777	210788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212166
5372	NC_020561	CAG	2	6	210797	210802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212166
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5381	NC_020561	GC	3	6	211105	211110	0 %	0 %	50 %	50 %	470212166
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5384	NC_020561	GCCG	2	8	211232	211239	0 %	0 %	50 %	50 %	470212166
5385	NC_020561	TGC	2	6	211246	211251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212166
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5388	NC_020561	CAGG	2	8	211361	211368	25 %	0 %	50 %	25 %	470212166
5389	NC_020561	GCG	2	6	211395	211400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212166
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5394	NC_020561	CGG	2	6	211582	211587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212166
5395	NC_020561	CGC	2	6	211607	211612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212166
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5399	NC_020561	GGC	2	6	211790	211795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212166
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5402	NC_020561	GCCCTT	2	12	211919	211930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470212166
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5405	NC_020561	CTG	2	6	211988	211993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212166
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5435	NC_020561	CGC	2	6	212940	212945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212167
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5441	NC_020561	CTCG	2	8	213184	213191	0 %	25 %	25 %	50 %	470212167
5442	NC_020561	CCA	2	6	213192	213197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212167
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5451	NC_020561	GCGG	2	8	213505	213512	0 %	0 %	75 %	25 %	470212167
5452	NC_020561	CGG	2	6	213618	213623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212167
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5466	NC_020561	GC	3	6	214323	214328	0 %	0 %	50 %	50 %	470212168
5467	NC_020561	GGC	2	6	214355	214360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212168
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5470	NC_020561	TGA	3	9	214551	214559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212169
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5472	NC_020561	TGC	2	6	214594	214599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212169
5473	NC_020561	GGCG	2	8	214630	214637	0 %	0 %	75 %	25 %	470212169
5474	NC_020561	TGG	2	6	214721	214726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212169
5475	NC_020561	CGG	2	6	214741	214746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212169
5476	NC_020561	GC	3	6	214761	214766	0 %	0 %	50 %	50 %	470212169
5477	NC_020561	GGCGCC	2	12	214840	214851	0 %	0 %	50 %	50 %	470212169
5478	NC_020561	GCG	2	6	214857	214862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212169
5479	NC_020561	CAA	2	6	214885	214890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212169
5480	NC_020561	TCGCC	2	10	214956	214965	0 %	20 %	20 %	60 %	470212169
5481	NC_020561	CAC	2	6	214975	214980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212169
5482	NC_020561	GACGA	2	10	214988	214997	40 %	0 %	40 %	20 %	470212169
5483	NC_020561	GC	3	6	215003	215008	0 %	0 %	50 %	50 %	470212169
5484	NC_020561	CCA	2	6	215170	215175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212169
5485	NC_020561	GC	3	6	215217	215222	0 %	0 %	50 %	50 %	470212169
5486	NC_020561	GAT	2	6	215293	215298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212169
5487	NC_020561	CGG	2	6	215530	215535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212169
5488	NC_020561	TC	3	6	215548	215553	0 %	50 %	0 %	50 %	470212169
5489	NC_020561	CGG	2	6	215572	215577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212169
5490	NC_020561	GATC	2	8	215734	215741	25 %	25 %	25 %	25 %	470212169
5491	NC_020561	CAC	2	6	215743	215748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212169
5492	NC_020561	GCC	2	6	215750	215755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212169
5493	NC_020561	CAA	2	6	215803	215808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212169
5494	NC_020561	CG	3	6	215813	215818	0 %	0 %	50 %	50 %	470212169
5495	NC_020561	CGG	2	6	215833	215838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212169
5496	NC_020561	TGA	2	6	215852	215857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212169
5497	NC_020561	CGA	2	6	215949	215954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212170
5498	NC_020561	GGC	2	6	215961	215966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212170
5499	NC_020561	GC	3	6	215979	215984	0 %	0 %	50 %	50 %	470212170
5500	NC_020561	GC	3	6	216026	216031	0 %	0 %	50 %	50 %	470212170

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