MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 35057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020560	GCAT	2	8	164507	164514	25 %	25 %	25 %	25 %	470185520
3502	NC_020560	CAC	2	6	164573	164578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185520
3503	NC_020560	AAG	2	6	164583	164588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185520
3504	NC_020560	CCG	2	6	164602	164607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185520
3505	NC_020560	ACG	2	6	164620	164625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185520
3506	NC_020560	GGCCG	2	10	164652	164661	0 %	0 %	60 %	40 %	470185520
3507	NC_020560	GCG	2	6	164663	164668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185520
3508	NC_020560	ATG	2	6	164689	164694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185520
3509	NC_020560	GCT	2	6	164723	164728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185520
3510	NC_020560	GCA	2	6	164777	164782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185520
3511	NC_020560	CG	3	6	164810	164815	0 %	0 %	50 %	50 %	470185520
3512	NC_020560	CGA	3	9	164819	164827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185520
3513	NC_020560	GCCG	2	8	164934	164941	0 %	0 %	50 %	50 %	470185520
3514	NC_020560	GGC	2	6	164958	164963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185520
3515	NC_020560	CCA	2	6	165077	165082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185520
3516	NC_020560	CGA	2	6	165113	165118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185520
3517	NC_020560	CG	3	6	165120	165125	0 %	0 %	50 %	50 %	470185520
3518	NC_020560	GC	3	6	165240	165245	0 %	0 %	50 %	50 %	470185520
3519	NC_020560	GAC	2	6	165279	165284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185520
3520	NC_020560	GCA	2	6	165310	165315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185520
3521	NC_020560	ATC	2	6	165399	165404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185520
3522	NC_020560	GCGAG	2	10	165840	165849	20 %	0 %	60 %	20 %	470185521
3523	NC_020560	CTT	2	6	165955	165960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185521
3524	NC_020560	GTC	2	6	166001	166006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185521
3525	NC_020560	CG	3	6	166033	166038	0 %	0 %	50 %	50 %	470185521
3526	NC_020560	CGC	2	6	166096	166101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185521
3527	NC_020560	CG	3	6	166135	166140	0 %	0 %	50 %	50 %	470185521
3528	NC_020560	GGCGCG	2	12	166145	166156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185521
3529	NC_020560	TGC	2	6	166204	166209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185521
3530	NC_020560	GCT	2	6	166273	166278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185521
3531	NC_020560	CGC	2	6	166298	166303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185521
3532	NC_020560	TTGCC	2	10	166387	166396	0 %	40 %	20 %	40 %	470185521
3533	NC_020560	GGCG	2	8	166417	166424	0 %	0 %	75 %	25 %	470185521
3534	NC_020560	GTC	2	6	166427	166432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185521
3535	NC_020560	CGG	2	6	166465	166470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185521
3536	NC_020560	CGG	2	6	166551	166556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185521
3537	NC_020560	CT	3	6	166715	166720	0 %	50 %	0 %	50 %	470185522
3538	NC_020560	CGG	2	6	166725	166730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185522
3539	NC_020560	GC	4	8	166739	166746	0 %	0 %	50 %	50 %	470185522
3540	NC_020560	CGA	2	6	166762	166767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185522
3541	NC_020560	CCG	2	6	166778	166783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185522
3542	NC_020560	CTA	2	6	166881	166886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185522
3543	NC_020560	CGG	2	6	167007	167012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185522
3544	NC_020560	CGG	2	6	167034	167039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185522
3545	NC_020560	TCG	2	6	167060	167065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185522
3546	NC_020560	AGC	2	6	167081	167086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185522
3547	NC_020560	GGC	2	6	167121	167126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185522
3548	NC_020560	CG	4	8	167131	167138	0 %	0 %	50 %	50 %	470185522
3549	NC_020560	GCA	2	6	167194	167199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185522
3550	NC_020560	CGGC	2	8	167271	167278	0 %	0 %	50 %	50 %	470185523
3551	NC_020560	GGC	2	6	167432	167437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185523
3552	NC_020560	CGT	2	6	167471	167476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185523
3553	NC_020560	GCT	2	6	167477	167482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185523
3554	NC_020560	GAC	2	6	167496	167501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185523
3555	NC_020560	GC	3	6	167507	167512	0 %	0 %	50 %	50 %	470185523
3556	NC_020560	CAC	2	6	167513	167518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185523
3557	NC_020560	CA	3	6	167622	167627	50 %	0 %	0 %	50 %	470185523
3558	NC_020560	GCG	2	6	167692	167697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185523
3559	NC_020560	CGG	2	6	167734	167739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185523
3560	NC_020560	GGC	2	6	167753	167758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185523
3561	NC_020560	GCA	2	6	167860	167865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185523
3562	NC_020560	GCT	2	6	167921	167926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185523
3563	NC_020560	GAT	2	6	167927	167932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185523
3564	NC_020560	GGC	2	6	168009	168014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185523
3565	NC_020560	GAT	2	6	168023	168028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185523
3566	NC_020560	GTC	2	6	168045	168050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185523
3567	NC_020560	GCACGG	2	12	168072	168083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470185523
3568	NC_020560	TTGC	2	8	168222	168229	0 %	50 %	25 %	25 %	470185523
3569	NC_020560	CGC	2	6	168282	168287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185523
3570	NC_020560	TCG	2	6	168331	168336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185523
3571	NC_020560	CCG	2	6	168342	168347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185523
3572	NC_020560	CGT	3	9	168380	168388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185523
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3574	NC_020560	GCT	2	6	168458	168463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185523
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3577	NC_020560	GTCA	2	8	168537	168544	25 %	25 %	25 %	25 %	470185523
3578	NC_020560	GCC	2	6	168566	168571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185523
3579	NC_020560	GTC	2	6	168576	168581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185523
3580	NC_020560	GAG	2	6	168606	168611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185523
3581	NC_020560	CCG	2	6	168637	168642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185523
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3583	NC_020560	GAT	2	6	168713	168718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185523
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3585	NC_020560	TCG	2	6	168865	168870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185523
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3587	NC_020560	TCG	2	6	168931	168936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185523
3588	NC_020560	GCT	3	9	169102	169110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185524
3589	NC_020560	GC	3	6	169155	169160	0 %	0 %	50 %	50 %	470185524
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3591	NC_020560	CG	3	6	169188	169193	0 %	0 %	50 %	50 %	470185524
3592	NC_020560	CGTT	2	8	169202	169209	0 %	50 %	25 %	25 %	470185524
3593	NC_020560	TCG	2	6	169221	169226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185524
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3600	NC_020560	GCC	2	6	169595	169600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185524
3601	NC_020560	CCT	2	6	169617	169622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185524
3602	NC_020560	GTG	2	6	169637	169642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185524
3603	NC_020560	GCGG	2	8	169664	169671	0 %	0 %	75 %	25 %	470185524
3604	NC_020560	CTCG	2	8	169681	169688	0 %	25 %	25 %	50 %	470185524
3605	NC_020560	TCG	3	9	169686	169694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185524
3606	NC_020560	CGG	2	6	169717	169722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185524
3607	NC_020560	GCC	2	6	169729	169734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185524
3608	NC_020560	CG	3	6	169765	169770	0 %	0 %	50 %	50 %	470185524
3609	NC_020560	CGC	2	6	169872	169877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185524
3610	NC_020560	TCT	2	6	169900	169905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185524
3611	NC_020560	GAT	2	6	169924	169929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185524
3612	NC_020560	CGC	2	6	170044	170049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185524
3613	NC_020560	TGCCGG	2	12	170053	170064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470185524
3614	NC_020560	GAC	2	6	170246	170251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185524
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3616	NC_020560	A	6	6	170341	170346	100 %	0 %	0 %	0 %	470185524
3617	NC_020560	GGA	2	6	170371	170376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185524
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3619	NC_020560	GCG	2	6	170470	170475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185524
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3621	NC_020560	CGG	2	6	170520	170525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185524
3622	NC_020560	GGC	2	6	170553	170558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185524
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3627	NC_020560	CCA	2	6	170772	170777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185525
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3742	NC_020560	TGC	2	6	176170	176175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185528
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3862	NC_020560	CGG	2	6	182374	182379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185536
3863	NC_020560	GCAA	2	8	182385	182392	50 %	0 %	25 %	25 %	470185536
3864	NC_020560	GAG	2	6	182406	182411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185536
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3890	NC_020560	TCT	2	6	183754	183759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185536
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3897	NC_020560	GC	4	8	184052	184059	0 %	0 %	50 %	50 %	470185536
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3981	NC_020560	CCT	2	6	188692	188697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185542
3982	NC_020560	CCA	2	6	188801	188806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185542
3983	NC_020560	GCT	2	6	188815	188820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185542
3984	NC_020560	TGC	2	6	188842	188847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185542
3985	NC_020560	GCG	2	6	188911	188916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185542
3986	NC_020560	CAC	2	6	188918	188923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185542
3987	NC_020560	CGG	2	6	188990	188995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185542
3988	NC_020560	ATC	2	6	189045	189050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185542
3989	NC_020560	CAA	2	6	189062	189067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470185542
3990	NC_020560	AAG	2	6	189072	189077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185542
3991	NC_020560	AGG	2	6	189121	189126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185542
3992	NC_020560	CGA	2	6	189131	189136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185542
3993	NC_020560	CGG	2	6	189185	189190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185542
3994	NC_020560	ATC	2	6	189279	189284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185542
3995	NC_020560	CGCCGG	2	12	189290	189301	0 %	0 %	50 %	50 %	470185542
3996	NC_020560	GGC	2	6	189366	189371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185542
3997	NC_020560	GC	4	8	189370	189377	0 %	0 %	50 %	50 %	470185542
3998	NC_020560	TCG	2	6	189400	189405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185542
3999	NC_020560	AGATCG	2	12	189424	189435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470185542
4000	NC_020560	GAT	2	6	189440	189445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185542

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