MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 35057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_020560	GAA	2	6	95050	95055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185455
2004	NC_020560	GCC	2	6	95159	95164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185456
2005	NC_020560	GCT	2	6	95167	95172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185456
2006	NC_020560	CGT	2	6	95181	95186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185456
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2122	NC_020560	GCG	2	6	100166	100171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185463
2123	NC_020560	GC	3	6	100191	100196	0 %	0 %	50 %	50 %	470185463
2124	NC_020560	GAGGG	2	10	100214	100223	20 %	0 %	80 %	0 %	470185463
2125	NC_020560	TGC	2	6	100225	100230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185463
2126	NC_020560	TCC	2	6	100283	100288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185463
2127	NC_020560	CGG	2	6	100428	100433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185463
2128	NC_020560	GC	3	6	100438	100443	0 %	0 %	50 %	50 %	470185463
2129	NC_020560	CGGT	2	8	100457	100464	0 %	25 %	50 %	25 %	470185463
2130	NC_020560	AGC	2	6	100470	100475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185463
2131	NC_020560	GCA	2	6	100530	100535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185463
2132	NC_020560	TTG	2	6	100713	100718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470185464
2133	NC_020560	TTCCT	2	10	100733	100742	0 %	60 %	0 %	40 %	470185464
2134	NC_020560	ATCGCC	2	12	100811	100822	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470185464
2135	NC_020560	CGG	2	6	100855	100860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185464
2136	NC_020560	AGC	2	6	100871	100876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185464
2137	NC_020560	TTCTG	2	10	100941	100950	0 %	60 %	20 %	20 %	470185464
2138	NC_020560	TCGGCC	2	12	100962	100973	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470185464
2139	NC_020560	CG	3	6	101020	101025	0 %	0 %	50 %	50 %	470185464
2140	NC_020560	CTGC	2	8	101067	101074	0 %	25 %	25 %	50 %	470185464
2141	NC_020560	GCGGCC	2	12	101078	101089	0 %	0 %	50 %	50 %	470185464
2142	NC_020560	GCC	2	6	101171	101176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185464
2143	NC_020560	GTC	3	9	101183	101191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185464
2144	NC_020560	CAGCG	2	10	101215	101224	20 %	0 %	40 %	40 %	470185464
2145	NC_020560	GCT	2	6	101233	101238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185464
2146	NC_020560	GAG	2	6	101249	101254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185464
2147	NC_020560	CGG	2	6	101323	101328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185464
2148	NC_020560	CTGCCG	2	12	101420	101431	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470185464
2149	NC_020560	TCG	2	6	101463	101468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185464
2150	NC_020560	A	6	6	101484	101489	100 %	0 %	0 %	0 %	470185464
2151	NC_020560	TGCG	2	8	101540	101547	0 %	25 %	50 %	25 %	470185465
2152	NC_020560	CGA	2	6	101577	101582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185465
2153	NC_020560	CGT	2	6	101613	101618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185465
2154	NC_020560	GGC	2	6	101674	101679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185465
2155	NC_020560	CGAG	2	8	101682	101689	25 %	0 %	50 %	25 %	470185465
2156	NC_020560	GGC	2	6	101773	101778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185465
2157	NC_020560	GC	3	6	101777	101782	0 %	0 %	50 %	50 %	470185465
2158	NC_020560	GGC	2	6	101794	101799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185465
2159	NC_020560	GGT	2	6	101841	101846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185465
2160	NC_020560	CGA	2	6	101854	101859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185465
2161	NC_020560	A	6	6	101870	101875	100 %	0 %	0 %	0 %	470185465
2162	NC_020560	TCG	2	6	101879	101884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185465
2163	NC_020560	ACC	2	6	101891	101896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185465
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2165	NC_020560	CGG	3	9	101931	101939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185465
2166	NC_020560	TCGG	2	8	101974	101981	0 %	25 %	50 %	25 %	470185465
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2174	NC_020560	GCACCG	2	12	102273	102284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470185465
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2191	NC_020560	CGGC	2	8	102953	102960	0 %	0 %	50 %	50 %	470185465
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2226	NC_020560	GAA	2	6	104343	104348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185466
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2228	NC_020560	ATCTCG	2	12	104399	104410	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470185466
2229	NC_020560	CCTCG	2	10	104442	104451	0 %	20 %	20 %	60 %	470185466
2230	NC_020560	CGG	2	6	104480	104485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185466
2231	NC_020560	GTC	2	6	104518	104523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185466
2232	NC_020560	CGG	2	6	104529	104534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185466
2233	NC_020560	GAT	2	6	104640	104645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185466
2234	NC_020560	GCC	2	6	104679	104684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185466
2235	NC_020560	CGC	3	9	104694	104702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185466
2236	NC_020560	GGC	2	6	104716	104721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185466
2237	NC_020560	GGT	2	6	104793	104798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185466
2238	NC_020560	GCC	2	6	104835	104840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185466
2239	NC_020560	CGG	2	6	104849	104854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185466
2240	NC_020560	TCC	2	6	104929	104934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185466
2241	NC_020560	CGA	2	6	104952	104957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185466
2242	NC_020560	AGCCGC	2	12	104960	104971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470185466
2243	NC_020560	GGC	2	6	104979	104984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185466
2244	NC_020560	GCA	2	6	105117	105122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185467
2245	NC_020560	CTT	2	6	105153	105158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185467
2246	NC_020560	CGAGCG	2	12	105159	105170	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470185467
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2365	NC_020560	TCG	2	6	111003	111008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185472
2366	NC_020560	CTC	2	6	111027	111032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185472
2367	NC_020560	CGA	2	6	111241	111246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185473
2368	NC_020560	GCTGC	2	10	111265	111274	0 %	20 %	40 %	40 %	470185473
2369	NC_020560	CAA	2	6	111353	111358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470185473
2370	NC_020560	GGA	2	6	111361	111366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185473
2371	NC_020560	ATCGCC	2	12	111371	111382	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470185473
2372	NC_020560	TGC	3	9	111432	111440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185473
2373	NC_020560	GC	3	6	111544	111549	0 %	0 %	50 %	50 %	470185473
2374	NC_020560	CCA	2	6	111601	111606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185473
2375	NC_020560	GACC	2	8	111607	111614	25 %	0 %	25 %	50 %	470185473
2376	NC_020560	ACA	2	6	111621	111626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470185473
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2379	NC_020560	GGC	2	6	111865	111870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185473
2380	NC_020560	TCGA	2	8	111875	111882	25 %	25 %	25 %	25 %	470185473
2381	NC_020560	GCA	2	6	111964	111969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185473
2382	NC_020560	CTT	2	6	111994	111999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185473
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2384	NC_020560	CG	3	6	112066	112071	0 %	0 %	50 %	50 %	470185473
2385	NC_020560	CG	3	6	112137	112142	0 %	0 %	50 %	50 %	470185473
2386	NC_020560	GCG	2	6	112162	112167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185473
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2388	NC_020560	GGC	2	6	112210	112215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185473
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2390	NC_020560	TCG	2	6	112323	112328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185473
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2393	NC_020560	CGA	2	6	112465	112470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185473
2394	NC_020560	TGC	2	6	112533	112538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185473
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2397	NC_020560	CGC	2	6	112834	112839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185473
2398	NC_020560	CGT	2	6	112858	112863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185473
2399	NC_020560	CGG	2	6	112912	112917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185473
2400	NC_020560	CCG	2	6	112984	112989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185473
2401	NC_020560	ACCGC	2	10	113044	113053	20 %	0 %	20 %	60 %	470185473
2402	NC_020560	GAA	2	6	113280	113285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185474
2403	NC_020560	TCG	2	6	113398	113403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185474
2404	NC_020560	GAC	2	6	113459	113464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185474
2405	NC_020560	GCGCCG	2	12	113521	113532	0 %	0 %	50 %	50 %	470185474
2406	NC_020560	GTTCGA	2	12	113549	113560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470185474
2407	NC_020560	GC	3	6	113571	113576	0 %	0 %	50 %	50 %	470185474
2408	NC_020560	GAC	2	6	113624	113629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185474
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2417	NC_020560	CGA	2	6	113842	113847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185474
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2420	NC_020560	CTGC	2	8	113906	113913	0 %	25 %	25 %	50 %	470185474
2421	NC_020560	CTGG	2	8	113999	114006	0 %	25 %	50 %	25 %	470185474
2422	NC_020560	ATT	2	6	114034	114039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470185474
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2424	NC_020560	TCG	2	6	114100	114105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185474
2425	NC_020560	AACGG	2	10	114106	114115	40 %	0 %	40 %	20 %	470185474
2426	NC_020560	GAG	2	6	114117	114122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185474
2427	NC_020560	GTC	2	6	114123	114128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185474
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2433	NC_020560	CAA	2	6	114287	114292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470185474
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2437	NC_020560	GAC	2	6	114443	114448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185474
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2439	NC_020560	GCA	2	6	114679	114684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185474
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2442	NC_020560	TCG	2	6	114769	114774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185474
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2446	NC_020560	CGG	2	6	114956	114961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185474
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2450	NC_020560	CCGCT	2	10	115208	115217	0 %	20 %	20 %	60 %	470185475
2451	NC_020560	CG	3	6	115242	115247	0 %	0 %	50 %	50 %	470185475
2452	NC_020560	GCTC	2	8	115256	115263	0 %	25 %	25 %	50 %	470185475
2453	NC_020560	GA	3	6	115297	115302	50 %	0 %	50 %	0 %	470185475
2454	NC_020560	CGG	2	6	115316	115321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185475
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2456	NC_020560	AGC	2	6	115336	115341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185475
2457	NC_020560	GAAA	2	8	115498	115505	75 %	0 %	25 %	0 %	470185475
2458	NC_020560	CGA	3	9	115508	115516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185475
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2461	NC_020560	CGA	3	9	115610	115618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185475
2462	NC_020560	CCG	2	6	115631	115636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185475
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2465	NC_020560	GCGCC	2	10	115676	115685	0 %	0 %	40 %	60 %	470185475
2466	NC_020560	GGC	2	6	115698	115703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185475
2467	NC_020560	A	8	8	115725	115732	100 %	0 %	0 %	0 %	470185475
2468	NC_020560	CCA	2	6	115772	115777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185475
2469	NC_020560	CCG	3	9	115843	115851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185475
2470	NC_020560	GGC	2	6	115884	115889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185475
2471	NC_020560	GAG	2	6	115890	115895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185475
2472	NC_020560	CAT	2	6	115905	115910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185475
2473	NC_020560	CGC	2	6	116042	116047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185476
2474	NC_020560	GTC	2	6	116051	116056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185476
2475	NC_020560	ATC	2	6	116058	116063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185476
2476	NC_020560	GAT	2	6	116135	116140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185476
2477	NC_020560	CCA	2	6	116155	116160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185476
2478	NC_020560	CGAT	2	8	116202	116209	25 %	25 %	25 %	25 %	470185476
2479	NC_020560	GGC	2	6	116221	116226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185476
2480	NC_020560	GAT	2	6	116228	116233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185476
2481	NC_020560	GAT	2	6	116267	116272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185476
2482	NC_020560	GCC	2	6	116292	116297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185476
2483	NC_020560	CG	3	6	116420	116425	0 %	0 %	50 %	50 %	470185476
2484	NC_020560	TCC	3	9	116511	116519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185476
2485	NC_020560	GCG	2	6	116650	116655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185476
2486	NC_020560	GCCC	2	8	116863	116870	0 %	0 %	25 %	75 %	470185477
2487	NC_020560	GAAC	2	8	116958	116965	50 %	0 %	25 %	25 %	470185477
2488	NC_020560	GGT	2	6	116994	116999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185477
2489	NC_020560	GC	3	6	117013	117018	0 %	0 %	50 %	50 %	470185477
2490	NC_020560	GCGCG	2	10	117043	117052	0 %	0 %	60 %	40 %	470185477
2491	NC_020560	GGA	2	6	117111	117116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185477
2492	NC_020560	GCTTC	2	10	117144	117153	0 %	40 %	20 %	40 %	470185477
2493	NC_020560	GGC	2	6	117168	117173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185477
2494	NC_020560	AGCGG	2	10	117183	117192	20 %	0 %	60 %	20 %	470185477
2495	NC_020560	AGC	2	6	117203	117208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185477
2496	NC_020560	GCC	2	6	117211	117216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185477
2497	NC_020560	CCG	2	6	117420	117425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185477
2498	NC_020560	TCG	2	6	117449	117454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185477
2499	NC_020560	CAT	2	6	117507	117512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185477
2500	NC_020560	CG	3	6	117516	117521	0 %	0 %	50 %	50 %	470185477

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