MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 35057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020560	CGG	2	6	20982	20987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185388
502	NC_020560	TCA	2	6	21003	21008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185388
503	NC_020560	GCA	2	6	21036	21041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185388
504	NC_020560	CG	3	6	21111	21116	0 %	0 %	50 %	50 %	470185388
505	NC_020560	CG	3	6	21246	21251	0 %	0 %	50 %	50 %	470185388
506	NC_020560	CGG	2	6	21279	21284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185388
507	NC_020560	GC	3	6	21308	21313	0 %	0 %	50 %	50 %	470185388
508	NC_020560	CGCC	2	8	21333	21340	0 %	0 %	25 %	75 %	470185388
509	NC_020560	GC	3	6	21396	21401	0 %	0 %	50 %	50 %	470185389
510	NC_020560	CAT	2	6	21425	21430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185389
511	NC_020560	GAGCAG	2	12	21431	21442	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	470185389
512	NC_020560	CTC	2	6	21473	21478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185389
513	NC_020560	TCG	2	6	21487	21492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185389
514	NC_020560	CAG	2	6	21515	21520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185389
515	NC_020560	CGCC	2	8	21526	21533	0 %	0 %	25 %	75 %	470185389
516	NC_020560	GCC	2	6	21548	21553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185389
517	NC_020560	GCC	2	6	21575	21580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185389
518	NC_020560	GAC	2	6	21584	21589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185389
519	NC_020560	GAT	2	6	21593	21598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185389
520	NC_020560	GCAG	2	8	21655	21662	25 %	0 %	50 %	25 %	470185389
521	NC_020560	CGG	2	6	21667	21672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185389
522	NC_020560	CGCC	2	8	21730	21737	0 %	0 %	25 %	75 %	470185389
523	NC_020560	AGG	2	6	21813	21818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185389
524	NC_020560	GAT	2	6	21842	21847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185389
525	NC_020560	GCGCGG	2	12	21892	21903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185389
526	NC_020560	GAC	2	6	21932	21937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185389
527	NC_020560	GCA	2	6	21949	21954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185389
528	NC_020560	TCA	2	6	21973	21978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185389
529	NC_020560	GCG	2	6	21982	21987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185389
530	NC_020560	GAG	2	6	21995	22000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185389
531	NC_020560	GAA	2	6	22028	22033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185389
532	NC_020560	GCCG	2	8	22037	22044	0 %	0 %	50 %	50 %	470185389
533	NC_020560	GGC	2	6	22052	22057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185389
534	NC_020560	CGGC	2	8	22060	22067	0 %	0 %	50 %	50 %	470185389
535	NC_020560	GCC	2	6	22073	22078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185389
536	NC_020560	GAC	2	6	22124	22129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185389
537	NC_020560	GCC	2	6	22130	22135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185389
538	NC_020560	GA	3	6	22140	22145	50 %	0 %	50 %	0 %	470185389
539	NC_020560	CCG	2	6	22161	22166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185389
540	NC_020560	GAC	2	6	22172	22177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185389
541	NC_020560	GGCC	2	8	22183	22190	0 %	0 %	50 %	50 %	470185389
542	NC_020560	CGA	2	6	22192	22197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185389
543	NC_020560	AGC	2	6	22203	22208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185389
544	NC_020560	CGA	2	6	22213	22218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185389
545	NC_020560	CCG	2	6	22239	22244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185389
546	NC_020560	CGA	3	9	22306	22314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185389
547	NC_020560	GACG	2	8	22321	22328	25 %	0 %	50 %	25 %	470185389
548	NC_020560	ACC	2	6	22335	22340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185389
549	NC_020560	GC	3	6	22351	22356	0 %	0 %	50 %	50 %	470185390
550	NC_020560	CCT	2	6	22357	22362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185390
551	NC_020560	CGCC	2	8	22374	22381	0 %	0 %	25 %	75 %	470185390
552	NC_020560	GAG	2	6	22390	22395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185390
553	NC_020560	GAA	2	6	22444	22449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185390
554	NC_020560	GAC	2	6	22450	22455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185390
555	NC_020560	TGA	2	6	22461	22466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185390
556	NC_020560	AGC	2	6	22487	22492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185390
557	NC_020560	CGA	2	6	22497	22502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185390
558	NC_020560	GCC	2	6	22513	22518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185390
559	NC_020560	GC	3	6	22524	22529	0 %	0 %	50 %	50 %	470185390
560	NC_020560	CCG	2	6	22545	22550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185390
561	NC_020560	GCC	2	6	22573	22578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185390
562	NC_020560	CGC	2	6	22590	22595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185390
563	NC_020560	GGC	2	6	22621	22626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185390
564	NC_020560	GCC	2	6	22700	22705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185390
565	NC_020560	GTC	2	6	22711	22716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185390
566	NC_020560	TCA	2	6	22755	22760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185390
567	NC_020560	GAG	2	6	22765	22770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185390
568	NC_020560	GCC	2	6	22781	22786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185390
569	NC_020560	AGA	2	6	22794	22799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185390
570	NC_020560	AGA	2	6	22839	22844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185390
571	NC_020560	GAA	2	6	22897	22902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185390
572	NC_020560	CGA	2	6	22923	22928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185390
573	NC_020560	GAG	3	9	22987	22995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185390
574	NC_020560	GCCG	2	8	23089	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	470185390
575	NC_020560	GAC	2	6	23119	23124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185390
576	NC_020560	AGC	2	6	23171	23176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185390
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578	NC_020560	GAG	2	6	23224	23229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185390
579	NC_020560	CGA	2	6	23241	23246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185390
580	NC_020560	CAG	2	6	23278	23283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185390
581	NC_020560	GCC	2	6	23293	23298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185390
582	NC_020560	GC	3	6	23300	23305	0 %	0 %	50 %	50 %	470185390
583	NC_020560	CCG	2	6	23413	23418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
584	NC_020560	TCC	2	6	23461	23466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185391
585	NC_020560	GGTCG	2	10	23556	23565	0 %	20 %	60 %	20 %	470185391
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587	NC_020560	CAGC	2	8	23595	23602	25 %	0 %	25 %	50 %	470185391
588	NC_020560	GAT	2	6	23607	23612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185391
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590	NC_020560	GCC	2	6	23628	23633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
591	NC_020560	GC	3	6	23707	23712	0 %	0 %	50 %	50 %	470185391
592	NC_020560	ATC	2	6	23731	23736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185391
593	NC_020560	GAT	2	6	23775	23780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185391
594	NC_020560	TGA	2	6	23792	23797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185391
595	NC_020560	CCG	2	6	23939	23944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
596	NC_020560	CCG	2	6	23965	23970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
597	NC_020560	CGC	2	6	23984	23989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
598	NC_020560	CCTC	2	8	24055	24062	0 %	25 %	0 %	75 %	470185391
599	NC_020560	CCA	2	6	24068	24073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185391
600	NC_020560	CCG	2	6	24074	24079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
601	NC_020560	CGA	2	6	24084	24089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185391
602	NC_020560	CCG	2	6	24115	24120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
603	NC_020560	GTG	2	6	24169	24174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185391
604	NC_020560	ATG	2	6	24193	24198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185391
605	NC_020560	GAT	2	6	24249	24254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185391
606	NC_020560	GAA	2	6	24291	24296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185391
607	NC_020560	TCG	2	6	24334	24339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185391
608	NC_020560	GAG	2	6	24345	24350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185391
609	NC_020560	CTCG	2	8	24357	24364	0 %	25 %	25 %	50 %	470185391
610	NC_020560	CGA	2	6	24383	24388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185391
611	NC_020560	CGA	2	6	24416	24421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185391
612	NC_020560	GT	3	6	24422	24427	0 %	50 %	50 %	0 %	470185391
613	NC_020560	CGG	2	6	24428	24433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185391
614	NC_020560	CGC	2	6	24443	24448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
615	NC_020560	GC	3	6	24474	24479	0 %	0 %	50 %	50 %	470185391
616	NC_020560	CG	3	6	24480	24485	0 %	0 %	50 %	50 %	470185391
617	NC_020560	CGAT	2	8	24502	24509	25 %	25 %	25 %	25 %	470185391
618	NC_020560	GCG	2	6	24564	24569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185391
619	NC_020560	CG	3	6	24568	24573	0 %	0 %	50 %	50 %	470185391
620	NC_020560	AGA	2	6	24593	24598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185391
621	NC_020560	GTC	2	6	24651	24656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185391
622	NC_020560	GCC	2	6	24669	24674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
623	NC_020560	CGC	2	6	24776	24781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
624	NC_020560	CGC	2	6	24818	24823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185391
625	NC_020560	TCGA	2	8	25117	25124	25 %	25 %	25 %	25 %	470185392
626	NC_020560	AAT	2	6	25142	25147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470185392
627	NC_020560	GCT	2	6	25166	25171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185392
628	NC_020560	TTC	2	6	25189	25194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185392
629	NC_020560	GCA	2	6	25274	25279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185392
630	NC_020560	CGGG	2	8	25316	25323	0 %	0 %	75 %	25 %	470185392
631	NC_020560	CGC	2	6	25395	25400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185392
632	NC_020560	GGCC	2	8	25406	25413	0 %	0 %	50 %	50 %	470185392
633	NC_020560	GCCG	2	8	25443	25450	0 %	0 %	50 %	50 %	470185392
634	NC_020560	CTG	2	6	25515	25520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185392
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639	NC_020560	GAT	2	6	25842	25847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185392
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641	NC_020560	TTCC	2	8	25947	25954	0 %	50 %	0 %	50 %	470185392
642	NC_020560	TCG	2	6	25978	25983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185392
643	NC_020560	ATC	2	6	25984	25989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185392
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