MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB

Total Repeats: 35057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020560	GGC	2	6	238124	238129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185596
5002	NC_020560	GAT	2	6	238130	238135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185596
5003	NC_020560	TCA	2	6	238168	238173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185596
5004	NC_020560	GC	3	6	238240	238245	0 %	0 %	50 %	50 %	470185596
5005	NC_020560	CAT	2	6	238256	238261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185596
5006	NC_020560	GGGC	2	8	238277	238284	0 %	0 %	75 %	25 %	470185596
5007	NC_020560	CAG	2	6	238323	238328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185596
5008	NC_020560	TTTCGG	2	12	238331	238342	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	470185596
5009	NC_020560	GGA	2	6	238428	238433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185596
5010	NC_020560	CAT	2	6	238440	238445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185596
5011	NC_020560	TGG	2	6	238511	238516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185597
5012	NC_020560	CTC	2	6	238552	238557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185597
5013	NC_020560	ATCG	2	8	238566	238573	25 %	25 %	25 %	25 %	470185597
5014	NC_020560	GCCG	2	8	238581	238588	0 %	0 %	50 %	50 %	470185597
5015	NC_020560	CGTTC	2	10	238659	238668	0 %	40 %	20 %	40 %	470185597
5016	NC_020560	CACGGT	2	12	238704	238715	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470185597
5017	NC_020560	TTC	2	6	238726	238731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185597
5018	NC_020560	TC	3	6	238791	238796	0 %	50 %	0 %	50 %	470185597
5019	NC_020560	TCT	2	6	238799	238804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185597
5020	NC_020560	ATC	2	6	238831	238836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185597
5021	NC_020560	TCGTCA	2	12	238847	238858	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470185597
5022	NC_020560	ATC	2	6	238894	238899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185597
5023	NC_020560	CG	3	6	238977	238982	0 %	0 %	50 %	50 %	470185597
5024	NC_020560	TCC	2	6	239024	239029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185597
5025	NC_020560	GCC	2	6	239036	239041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185597
5026	NC_020560	TCCT	2	8	239089	239096	0 %	50 %	0 %	50 %	470185597
5027	NC_020560	GTC	2	6	239134	239139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185597
5028	NC_020560	ATG	2	6	239191	239196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185597
5029	NC_020560	TCG	2	6	239210	239215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185597
5030	NC_020560	CGC	2	6	239383	239388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185598
5031	NC_020560	CGG	2	6	239409	239414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185598
5032	NC_020560	ACG	2	6	239417	239422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185598
5033	NC_020560	GGT	2	6	239451	239456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185598
5034	NC_020560	CTT	2	6	239601	239606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185598
5035	NC_020560	GGA	2	6	239664	239669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185598
5036	NC_020560	ACG	2	6	239747	239752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185598
5037	NC_020560	CTA	3	9	239760	239768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185598
5038	NC_020560	GAG	2	6	239797	239802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185598
5039	NC_020560	CGGC	2	8	239839	239846	0 %	0 %	50 %	50 %	470185598
5040	NC_020560	CGG	2	6	239889	239894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185598
5041	NC_020560	GA	3	6	239912	239917	50 %	0 %	50 %	0 %	470185598
5042	NC_020560	CGA	2	6	240021	240026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185598
5043	NC_020560	GGC	2	6	240105	240110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185598
5044	NC_020560	ACG	2	6	240149	240154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185598
5045	NC_020560	GCACG	2	10	240171	240180	20 %	0 %	40 %	40 %	470185598
5046	NC_020560	GC	3	6	240230	240235	0 %	0 %	50 %	50 %	470185598
5047	NC_020560	CAT	2	6	240246	240251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185598
5048	NC_020560	CGGC	2	8	240254	240261	0 %	0 %	50 %	50 %	470185598
5049	NC_020560	CCG	2	6	240366	240371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185598
5050	NC_020560	CGA	2	6	240375	240380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185598
5051	NC_020560	TCC	2	6	240385	240390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185598
5052	NC_020560	CGC	2	6	240469	240474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185598
5053	NC_020560	GC	3	6	240561	240566	0 %	0 %	50 %	50 %	470185599
5054	NC_020560	GTC	2	6	240572	240577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185599
5055	NC_020560	CGG	2	6	240588	240593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185599
5056	NC_020560	TCG	2	6	240612	240617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185599
5057	NC_020560	GAT	2	6	240661	240666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185599
5058	NC_020560	GGA	2	6	240707	240712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185599
5059	NC_020560	CGCTT	2	10	240816	240825	0 %	40 %	20 %	40 %	470185599
5060	NC_020560	AGA	2	6	240849	240854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185599
5061	NC_020560	CGG	2	6	240889	240894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185599
5062	NC_020560	CGG	2	6	240925	240930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185599
5063	NC_020560	CCAGCG	2	12	240931	240942	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470185599
5064	NC_020560	GGGC	2	8	240953	240960	0 %	0 %	75 %	25 %	470185599
5065	NC_020560	CCG	2	6	240967	240972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185599
5066	NC_020560	CGA	2	6	240991	240996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185599
5067	NC_020560	CAC	2	6	241072	241077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185599
5068	NC_020560	TCG	2	6	241131	241136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185599
5069	NC_020560	CGC	2	6	241170	241175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185599
5070	NC_020560	TCG	2	6	241206	241211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185599
5071	NC_020560	GGC	2	6	241262	241267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185599
5072	NC_020560	CGG	2	6	241282	241287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185599
5073	NC_020560	CAT	3	9	241288	241296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185599
5074	NC_020560	CGA	2	6	241411	241416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185599
5075	NC_020560	AC	3	6	241418	241423	50 %	0 %	0 %	50 %	470185599
5076	NC_020560	TGG	2	6	241428	241433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185599
5077	NC_020560	CTT	2	6	241531	241536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185599
5078	NC_020560	ACC	2	6	241547	241552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185599
5079	NC_020560	CCGC	2	8	241595	241602	0 %	0 %	25 %	75 %	470185599
5080	NC_020560	GCAA	2	8	241744	241751	50 %	0 %	25 %	25 %	470185600
5081	NC_020560	GCG	2	6	241766	241771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185600
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5083	NC_020560	CGG	2	6	241820	241825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185600
5084	NC_020560	CGC	2	6	241826	241831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185600
5085	NC_020560	GAC	2	6	241840	241845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185600
5086	NC_020560	ACG	2	6	241940	241945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185600
5087	NC_020560	GCG	2	6	241963	241968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185600
5088	NC_020560	CCG	2	6	241973	241978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185600
5089	NC_020560	GGC	2	6	242038	242043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185600
5090	NC_020560	CGG	2	6	242055	242060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185600
5091	NC_020560	TC	3	6	242064	242069	0 %	50 %	0 %	50 %	470185600
5092	NC_020560	CGC	2	6	242484	242489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185601
5093	NC_020560	GCA	2	6	242547	242552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185601
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5095	NC_020560	CGA	2	6	242616	242621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185601
5096	NC_020560	TGCA	2	8	242714	242721	25 %	25 %	25 %	25 %	470185601
5097	NC_020560	CGA	2	6	242742	242747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185601
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5099	NC_020560	CAG	2	6	242773	242778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185601
5100	NC_020560	GCG	2	6	242962	242967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185601
5101	NC_020560	TCCT	2	8	243018	243025	0 %	50 %	0 %	50 %	470185601
5102	NC_020560	TCC	2	6	243032	243037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185601
5103	NC_020560	TGT	2	6	243126	243131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470185601
5104	NC_020560	CTGA	2	8	243210	243217	25 %	25 %	25 %	25 %	470185602
5105	NC_020560	TCC	2	6	243319	243324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185602
5106	NC_020560	GC	4	8	243361	243368	0 %	0 %	50 %	50 %	470185602
5107	NC_020560	CCG	2	6	243398	243403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185602
5108	NC_020560	TCG	2	6	243422	243427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185602
5109	NC_020560	TCA	2	6	243530	243535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185602
5110	NC_020560	GTCC	2	8	243545	243552	0 %	25 %	25 %	50 %	470185602
5111	NC_020560	TTC	2	6	243619	243624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185602
5112	NC_020560	TCCG	2	8	243653	243660	0 %	25 %	25 %	50 %	470185602
5113	NC_020560	GCGA	2	8	243699	243706	25 %	0 %	50 %	25 %	470185602
5114	NC_020560	CG	3	6	243759	243764	0 %	0 %	50 %	50 %	470185602
5115	NC_020560	TCG	2	6	243772	243777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185602
5116	NC_020560	AGT	2	6	243815	243820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185602
5117	NC_020560	CTG	2	6	243825	243830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185602
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5119	NC_020560	TCCCG	2	10	243918	243927	0 %	20 %	20 %	60 %	470185602
5120	NC_020560	TCA	2	6	243938	243943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185602
5121	NC_020560	CGG	2	6	243972	243977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185602
5122	NC_020560	CCA	2	6	244052	244057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185602
5123	NC_020560	CCG	2	6	244189	244194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185602
5124	NC_020560	GAT	2	6	244203	244208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185602
5125	NC_020560	GCTT	2	8	244218	244225	0 %	50 %	25 %	25 %	470185602
5126	NC_020560	GCC	2	6	244272	244277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185603
5127	NC_020560	TGG	2	6	244290	244295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470185603
5128	NC_020560	GGC	2	6	244309	244314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185603
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5130	NC_020560	GCG	3	9	244367	244375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185603
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5132	NC_020560	GAC	2	6	244441	244446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185603
5133	NC_020560	GAT	2	6	244465	244470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185603
5134	NC_020560	GCCG	2	8	244480	244487	0 %	0 %	50 %	50 %	470185603
5135	NC_020560	GAA	2	6	244489	244494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185603
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5138	NC_020560	GCC	2	6	244544	244549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185603
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5142	NC_020560	TCA	2	6	244697	244702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185603
5143	NC_020560	CGGCC	2	10	244711	244720	0 %	0 %	40 %	60 %	470185603
5144	NC_020560	ACG	2	6	244721	244726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185603
5145	NC_020560	GCGCC	2	10	244744	244753	0 %	0 %	40 %	60 %	470185603
5146	NC_020560	GCC	2	6	244887	244892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185603
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5148	NC_020560	AAAT	2	8	244946	244953	75 %	25 %	0 %	0 %	470185603
5149	NC_020560	CGC	2	6	244960	244965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185603
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5151	NC_020560	CTC	2	6	244987	244992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185603
5152	NC_020560	CGC	2	6	244995	245000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185603
5153	NC_020560	GAC	2	6	245116	245121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185603
5154	NC_020560	GC	3	6	245283	245288	0 %	0 %	50 %	50 %	470185603
5155	NC_020560	AAGCA	2	10	245290	245299	60 %	0 %	20 %	20 %	470185603
5156	NC_020560	GTC	2	6	245306	245311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185603
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5158	NC_020560	GA	3	6	245342	245347	50 %	0 %	50 %	0 %	470185603
5159	NC_020560	CGC	2	6	245404	245409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185604
5160	NC_020560	CCT	2	6	245423	245428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185604
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5162	NC_020560	CTT	2	6	245558	245563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470185604
5163	NC_020560	AGT	2	6	245597	245602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185604
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5172	NC_020560	CGG	2	6	245922	245927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185604
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5179	NC_020560	GAC	2	6	246210	246215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185604
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5181	NC_020560	GAC	3	9	246276	246284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185604
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5186	NC_020560	AGG	2	6	246511	246516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185605
5187	NC_020560	AGC	2	6	246528	246533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185605
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5189	NC_020560	TG	3	6	246554	246559	0 %	50 %	50 %	0 %	470185605
5190	NC_020560	GC	3	6	246560	246565	0 %	0 %	50 %	50 %	470185605
5191	NC_020560	AGC	2	6	246621	246626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185605
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5193	NC_020560	CCGG	2	8	246682	246689	0 %	0 %	50 %	50 %	470185605
5194	NC_020560	CGG	2	6	246847	246852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185605
5195	NC_020560	AGCC	2	8	246861	246868	25 %	0 %	25 %	50 %	470185605
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5199	NC_020560	TCG	3	9	246999	247007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185605
5200	NC_020560	GCC	2	6	247253	247258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185605
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5203	NC_020560	ATG	2	6	247512	247517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470185605
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5210	NC_020560	TCC	2	6	247732	247737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185606
5211	NC_020560	GGC	2	6	247764	247769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185606
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5220	NC_020560	CCA	2	6	248091	248096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185606
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5222	NC_020560	GCAT	2	8	248139	248146	25 %	25 %	25 %	25 %	470185606
5223	NC_020560	GAC	2	6	248163	248168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185606
5224	NC_020560	TCGGC	2	10	248220	248229	0 %	20 %	40 %	40 %	470185606
5225	NC_020560	GAC	2	6	248355	248360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185606
5226	NC_020560	CCG	2	6	248369	248374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185606
5227	NC_020560	CG	3	6	248380	248385	0 %	0 %	50 %	50 %	470185606
5228	NC_020560	GGA	2	6	248408	248413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470185606
5229	NC_020560	GCTC	2	8	248468	248475	0 %	25 %	25 %	50 %	470185606
5230	NC_020560	GCCG	2	8	248519	248526	0 %	0 %	50 %	50 %	470185606
5231	NC_020560	CGA	2	6	248576	248581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185606
5232	NC_020560	GGC	2	6	248610	248615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185606
5233	NC_020560	CATAG	2	10	248625	248634	40 %	20 %	20 %	20 %	470185606
5234	NC_020560	CGC	2	6	248642	248647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185606
5235	NC_020560	TCA	2	6	248663	248668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185606
5236	NC_020560	CGC	2	6	248674	248679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185606
5237	NC_020560	GTC	2	6	248706	248711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185606
5238	NC_020560	GCG	2	6	248719	248724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185606
5239	NC_020560	G	6	6	248730	248735	0 %	0 %	100 %	0 %	470185606
5240	NC_020560	TCG	2	6	248793	248798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185607
5241	NC_020560	CG	4	8	248873	248880	0 %	0 %	50 %	50 %	470185607
5242	NC_020560	CGA	2	6	248887	248892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185607
5243	NC_020560	GC	3	6	248910	248915	0 %	0 %	50 %	50 %	470185607
5244	NC_020560	GC	3	6	249021	249026	0 %	0 %	50 %	50 %	470185607
5245	NC_020560	TCGA	2	8	249039	249046	25 %	25 %	25 %	25 %	470185607
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5251	NC_020560	TCG	2	6	249357	249362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185607
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5254	NC_020560	GC	3	6	249448	249453	0 %	0 %	50 %	50 %	470185607
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5365	NC_020560	TCC	2	6	255290	255295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185612
5366	NC_020560	CGCGA	2	10	255320	255329	20 %	0 %	40 %	40 %	470185612
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5369	NC_020560	CGC	2	6	255418	255423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185612
5370	NC_020560	CGC	2	6	255460	255465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185612
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5374	NC_020560	CGC	2	6	255586	255591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185612
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5385	NC_020560	TCGAG	2	10	256072	256081	20 %	20 %	40 %	20 %	470185612
5386	NC_020560	GTC	2	6	256157	256162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185612
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5397	NC_020560	CGG	2	6	256689	256694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185613
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5401	NC_020560	GCCG	2	8	256938	256945	0 %	0 %	50 %	50 %	470185613
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5486	NC_020560	GGC	2	6	260874	260879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185618
5487	NC_020560	GAA	2	6	260888	260893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470185618
5488	NC_020560	CCT	2	6	260912	260917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470185618
5489	NC_020560	TCG	2	6	260959	260964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185618
5490	NC_020560	GGTCG	2	10	261054	261063	0 %	20 %	60 %	20 %	470185618
5491	NC_020560	CGA	2	6	261134	261139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470185618
5492	NC_020560	CCGC	2	8	261195	261202	0 %	0 %	25 %	75 %	470185618
5493	NC_020560	CGC	2	6	261217	261222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470185618
5494	NC_020560	GCG	2	6	261268	261273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185618
5495	NC_020560	TCA	2	6	261440	261445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470185619
5496	NC_020560	GCG	2	6	261489	261494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185619
5497	NC_020560	GCT	2	6	261601	261606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185619
5498	NC_020560	GGC	2	6	261639	261644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470185619
5499	NC_020560	GTC	2	6	261656	261661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470185619
5500	NC_020560	CAC	2	6	261695	261700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470185619

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