MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces davawensis JCM 4913 plasmid pSDA1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020545	GCGCA	2	10	311	320	20 %	0 %	40 %	40 %	471327981
2	NC_020545	GACGA	2	10	2293	2302	40 %	0 %	40 %	20 %	471327982
3	NC_020545	CCGCC	2	10	4319	4328	0 %	0 %	20 %	80 %	471327982
4	NC_020545	TCCGA	2	10	6605	6614	20 %	20 %	20 %	40 %	471327985
5	NC_020545	CTGGA	2	10	6713	6722	20 %	20 %	40 %	20 %	471327985
6	NC_020545	ACCGG	2	10	7019	7028	20 %	0 %	40 %	40 %	471327985
7	NC_020545	GCCCG	2	10	13750	13759	0 %	0 %	40 %	60 %	471327996
8	NC_020545	CCGGT	2	10	13871	13880	0 %	20 %	40 %	40 %	471327996
9	NC_020545	GCCGC	2	10	17447	17456	0 %	0 %	40 %	60 %	471328000
10	NC_020545	CGAGC	2	10	18520	18529	20 %	0 %	40 %	40 %	471328001
11	NC_020545	CGGTG	2	10	20244	20253	0 %	20 %	60 %	20 %	471328004
12	NC_020545	CGCGC	2	10	21433	21442	0 %	0 %	40 %	60 %	471328006
13	NC_020545	CGGCA	2	10	24623	24632	20 %	0 %	40 %	40 %	471328010
14	NC_020545	TGAGC	2	10	25213	25222	20 %	20 %	40 %	20 %	471328010
15	NC_020545	TGCCC	2	10	26004	26013	0 %	20 %	20 %	60 %	471328012
16	NC_020545	TCGGG	2	10	26761	26770	0 %	20 %	60 %	20 %	471328014
17	NC_020545	GTCGC	2	10	27716	27725	0 %	20 %	40 %	40 %	471328015
18	NC_020545	TCGTG	2	10	27781	27790	0 %	40 %	40 %	20 %	471328015
19	NC_020545	GCCGG	2	10	30123	30132	0 %	0 %	60 %	40 %	471328020
20	NC_020545	CGGCC	2	10	30251	30260	0 %	0 %	40 %	60 %	471328020
21	NC_020545	CCCGG	2	10	30392	30401	0 %	0 %	40 %	60 %	471328020
22	NC_020545	ACCGC	2	10	31580	31589	20 %	0 %	20 %	60 %	471328022
23	NC_020545	GCTCG	2	10	31847	31856	0 %	20 %	40 %	40 %	471328023
24	NC_020545	CGGGG	2	10	32446	32455	0 %	0 %	80 %	20 %	471328025
25	NC_020545	GGGTG	2	10	34069	34078	0 %	20 %	80 %	0 %	471328027
26	NC_020545	TGCCG	2	10	34897	34906	0 %	20 %	40 %	40 %	471328028
27	NC_020545	AGGCC	2	10	35377	35386	20 %	0 %	40 %	40 %	471328029
28	NC_020545	GGTGG	2	10	35552	35561	0 %	20 %	80 %	0 %	471328029
29	NC_020545	CACCG	2	10	35832	35841	20 %	0 %	20 %	60 %	471328030
30	NC_020545	GCGGG	2	10	38078	38087	0 %	0 %	80 %	20 %	471328032
31	NC_020545	AGGCG	2	10	38414	38423	20 %	0 %	60 %	20 %	471328032
32	NC_020545	CCGGC	2	10	39740	39749	0 %	0 %	40 %	60 %	471328034
33	NC_020545	CCGGC	2	10	39782	39791	0 %	0 %	40 %	60 %	471328034
34	NC_020545	CGGCG	2	10	40053	40062	0 %	0 %	60 %	40 %	471328034
35	NC_020545	TGCCG	2	10	40154	40163	0 %	20 %	40 %	40 %	471328034
36	NC_020545	CGCGG	2	10	40753	40762	0 %	0 %	60 %	40 %	471328034
37	NC_020545	GCCTG	2	10	41935	41944	0 %	20 %	40 %	40 %	471328036
38	NC_020545	CAGGT	2	10	42244	42253	20 %	20 %	40 %	20 %	471328037
39	NC_020545	TGTGC	2	10	44435	44444	0 %	40 %	40 %	20 %	471328038
40	NC_020545	GGCAG	2	10	46281	46290	20 %	0 %	60 %	20 %	471328042
41	NC_020545	CAGGC	2	10	46325	46334	20 %	0 %	40 %	40 %	471328042
42	NC_020545	GCGGG	2	10	46383	46392	0 %	0 %	80 %	20 %	471328042
43	NC_020545	GCGCA	2	10	47283	47292	20 %	0 %	40 %	40 %	471328043
44	NC_020545	TGGGG	2	10	48247	48256	0 %	20 %	80 %	0 %	471328044
45	NC_020545	GTGCG	2	10	49046	49055	0 %	20 %	60 %	20 %	471328044
46	NC_020545	GTCGG	2	10	49366	49375	0 %	20 %	60 %	20 %	471328045
47	NC_020545	CGCTG	2	10	54726	54735	0 %	20 %	40 %	40 %	471328049
48	NC_020545	CGGGA	2	10	54796	54805	20 %	0 %	60 %	20 %	471328049
49	NC_020545	ACCGC	2	10	56809	56818	20 %	0 %	20 %	60 %	471328051
50	NC_020545	CGCCC	2	10	57147	57156	0 %	0 %	20 %	80 %	471328051
51	NC_020545	TGACA	2	10	59332	59341	40 %	20 %	20 %	20 %	471328056
52	NC_020545	CCCAG	2	10	67083	67092	20 %	0 %	20 %	60 %	471328066
53	NC_020545	CGGTG	2	10	67411	67420	0 %	20 %	60 %	20 %	471328066
54	NC_020545	AGCGC	2	10	70046	70055	20 %	0 %	40 %	40 %	471328068
55	NC_020545	CCGGG	2	10	72155	72164	0 %	0 %	60 %	40 %	471328069
56	NC_020545	GGAAA	2	10	75511	75520	60 %	0 %	40 %	0 %	471328072
57	NC_020545	GCCAT	2	10	77427	77436	20 %	20 %	20 %	40 %	471328074
58	NC_020545	CGGCC	2	10	79246	79255	0 %	0 %	40 %	60 %	471328076
59	NC_020545	AGCCC	2	10	81967	81976	20 %	0 %	20 %	60 %	471328081
60	NC_020545	GCGGA	2	10	82512	82521	20 %	0 %	60 %	20 %	471328082
61	NC_020545	CGGAA	2	10	85233	85242	40 %	0 %	40 %	20 %	471328086

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.