MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP2

Total Repeats: 645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020543	CAA	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434165
2	NC_020543	CGA	2	6	281	286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434165
3	NC_020543	CAC	2	6	474	479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434165
4	NC_020543	TCA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434165
5	NC_020543	GCG	2	6	707	712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434165
6	NC_020543	TGC	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434165
7	NC_020543	TCG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434165
8	NC_020543	ATC	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434165
9	NC_020543	ACG	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434165
10	NC_020543	TGG	2	6	1009	1014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434165
11	NC_020543	CGC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434165
12	NC_020543	CAA	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434165
13	NC_020543	CTT	2	6	1157	1162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434166
14	NC_020543	GTC	2	6	1172	1177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434166
15	NC_020543	GTC	2	6	1206	1211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434166
16	NC_020543	ATA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472434166
17	NC_020543	CGG	2	6	1298	1303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434166
18	NC_020543	CGC	2	6	1420	1425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434167
19	NC_020543	TCG	2	6	1478	1483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434167
20	NC_020543	CCG	2	6	1791	1796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434167
21	NC_020543	CGG	2	6	1881	1886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434167
22	NC_020543	GAT	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434167
23	NC_020543	CGT	2	6	2002	2007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434167
24	NC_020543	CAT	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434168
25	NC_020543	TCC	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434168
26	NC_020543	TGC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434168
27	NC_020543	GCG	2	6	2248	2253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434168
28	NC_020543	CTT	2	6	2339	2344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434168
29	NC_020543	GTG	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434168
30	NC_020543	GGC	2	6	2483	2488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434168
31	NC_020543	CTG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434168
32	NC_020543	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434168
33	NC_020543	CGG	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434169
34	NC_020543	GAC	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434169
35	NC_020543	GTC	2	6	3074	3079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434169
36	NC_020543	CGA	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434170
37	NC_020543	CGA	2	6	3338	3343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434170
38	NC_020543	AGG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434171
39	NC_020543	GGT	2	6	3649	3654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434171
40	NC_020543	CTG	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434171
41	NC_020543	AAG	2	6	3813	3818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434171
42	NC_020543	GGC	2	6	3949	3954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434172
43	NC_020543	ATG	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434172
44	NC_020543	GGC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434173
45	NC_020543	CGA	2	6	4193	4198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434173
46	NC_020543	GAT	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434174
47	NC_020543	CGA	2	6	4431	4436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434174
48	NC_020543	ATT	2	6	4575	4580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472434174
49	NC_020543	CGC	2	6	4648	4653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434174
50	NC_020543	TCG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434174
51	NC_020543	GCC	2	6	4780	4785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434174
52	NC_020543	GCC	2	6	4988	4993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434175
53	NC_020543	TCG	2	6	5100	5105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434175
54	NC_020543	TTG	2	6	5144	5149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472434175
55	NC_020543	ACG	2	6	5445	5450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434176
56	NC_020543	GGC	2	6	5509	5514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434176
57	NC_020543	CCG	2	6	5699	5704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434177
58	NC_020543	TTC	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434177
59	NC_020543	TCG	2	6	5991	5996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434177
60	NC_020543	GGC	2	6	6092	6097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434177
61	NC_020543	CGA	2	6	6109	6114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434177
62	NC_020543	CTT	2	6	6209	6214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434177
63	NC_020543	TTC	2	6	6216	6221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434177
64	NC_020543	AGC	2	6	6417	6422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434177
65	NC_020543	TCG	2	6	6504	6509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434177
66	NC_020543	GCG	2	6	6612	6617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434177
67	NC_020543	GCA	2	6	6685	6690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434177
68	NC_020543	CAG	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434177
69	NC_020543	GAT	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434177
70	NC_020543	TCA	2	6	7027	7032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434177
71	NC_020543	GGC	2	6	7093	7098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434178
72	NC_020543	TGG	2	6	7114	7119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434178
73	NC_020543	TGC	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434178
74	NC_020543	ACG	2	6	7507	7512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434179
75	NC_020543	GGC	2	6	7571	7576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434179
76	NC_020543	ACC	2	6	8114	8119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434179
77	NC_020543	GCA	2	6	8125	8130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434179
78	NC_020543	GCC	2	6	8131	8136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434179
79	NC_020543	CGC	2	6	8336	8341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434180
80	NC_020543	GCC	2	6	8347	8352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434180
81	NC_020543	AGC	2	6	8357	8362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434180
82	NC_020543	TCG	2	6	8462	8467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434180
83	NC_020543	ACA	2	6	8495	8500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434180
84	NC_020543	CGG	2	6	8555	8560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434180
85	NC_020543	AGC	2	6	8570	8575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434180
86	NC_020543	AAC	2	6	8623	8628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434180
87	NC_020543	ATC	2	6	8650	8655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434180
88	NC_020543	GGC	2	6	8760	8765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434180
89	NC_020543	GCG	2	6	8815	8820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434181
90	NC_020543	CGT	2	6	8891	8896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434181
91	NC_020543	TCC	2	6	8971	8976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434181
92	NC_020543	CGA	2	6	9010	9015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
93	NC_020543	TCA	2	6	9232	9237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434181
94	NC_020543	GCC	2	6	9354	9359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434181
95	NC_020543	CAG	2	6	9387	9392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
96	NC_020543	TCA	3	9	9430	9438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434181
97	NC_020543	GAT	2	6	9482	9487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434181
98	NC_020543	GGC	2	6	9545	9550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434181
99	NC_020543	GAG	2	6	9604	9609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434181
100	NC_020543	CAG	2	6	9762	9767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
101	NC_020543	GGT	2	6	9806	9811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434181
102	NC_020543	CTT	2	6	9812	9817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434181
103	NC_020543	ACG	2	6	9888	9893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
104	NC_020543	TCT	2	6	9898	9903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434181
105	NC_020543	GCC	2	6	9909	9914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434181
106	NC_020543	TTC	2	6	9934	9939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434181
107	NC_020543	CGG	2	6	9967	9972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434181
108	NC_020543	CGG	3	9	9986	9994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434181
109	NC_020543	CGA	2	6	10045	10050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
110	NC_020543	GGC	2	6	10166	10171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434181
111	NC_020543	ACC	2	6	10185	10190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434181
112	NC_020543	ACC	2	6	10260	10265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434181
113	NC_020543	AGC	2	6	10560	10565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
114	NC_020543	AGC	2	6	10614	10619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
115	NC_020543	CGA	2	6	10642	10647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
116	NC_020543	GAC	2	6	10672	10677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
117	NC_020543	CGG	2	6	10733	10738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434181
118	NC_020543	GGA	2	6	10752	10757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434181
119	NC_020543	GGT	2	6	10758	10763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434181
120	NC_020543	ACC	2	6	10830	10835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434181
121	NC_020543	GAT	2	6	10836	10841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434181
122	NC_020543	AGC	2	6	10848	10853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
123	NC_020543	TCG	2	6	10869	10874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434181
124	NC_020543	GTG	2	6	10876	10881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434181
125	NC_020543	GCG	2	6	10942	10947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434181
126	NC_020543	GCG	2	6	10959	10964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434181
127	NC_020543	ACG	2	6	10965	10970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
128	NC_020543	CTT	2	6	10975	10980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434181
129	NC_020543	TGA	2	6	11042	11047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434181
130	NC_020543	GCA	2	6	11054	11059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
131	NC_020543	CAG	3	9	11145	11153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
132	NC_020543	CAG	2	6	11208	11213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434181
133	NC_020543	GAT	2	6	11231	11236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434181
134	NC_020543	GCG	2	6	11421	11426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434181
135	NC_020543	ATC	2	6	11430	11435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434181
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138	NC_020543	TCC	2	6	12226	12231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434182
139	NC_020543	GCG	2	6	12253	12258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434182
140	NC_020543	GGC	2	6	12263	12268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434182
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144	NC_020543	GGC	2	6	12567	12572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434182
145	NC_020543	GGC	2	6	12708	12713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434182
146	NC_020543	TAT	2	6	12739	12744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472434182
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152	NC_020543	GCG	2	6	13551	13556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434183
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159	NC_020543	GCG	2	6	13953	13958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434183
160	NC_020543	GGA	2	6	13983	13988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434183
161	NC_020543	GCC	2	6	14184	14189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434184
162	NC_020543	GCC	2	6	14225	14230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434184
163	NC_020543	AGC	2	6	14312	14317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434184
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240	NC_020543	CGC	2	6	21364	21369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434193
241	NC_020543	CGA	2	6	21416	21421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434193
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243	NC_020543	CGC	2	6	21455	21460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434193
244	NC_020543	CAA	2	6	21461	21466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434193
245	NC_020543	GCG	3	9	21514	21522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434193
246	NC_020543	GCC	2	6	21586	21591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434193
247	NC_020543	TGC	2	6	21614	21619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434193
248	NC_020543	CGA	2	6	21800	21805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434194
249	NC_020543	GGC	2	6	21836	21841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434194
250	NC_020543	GCC	3	9	21855	21863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434194
251	NC_020543	TGC	2	6	21865	21870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434194
252	NC_020543	ACC	2	6	21922	21927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434194
253	NC_020543	CCG	2	6	21959	21964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434194
254	NC_020543	AAG	2	6	21972	21977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434194
255	NC_020543	GCC	2	6	22011	22016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434194
256	NC_020543	CGA	2	6	22073	22078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434194
257	NC_020543	CAC	2	6	22079	22084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434194
258	NC_020543	GCT	2	6	22097	22102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434194
259	NC_020543	GCG	2	6	22151	22156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434194
260	NC_020543	ATC	2	6	22164	22169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434194
261	NC_020543	CGC	2	6	22280	22285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434194
262	NC_020543	CGC	2	6	22302	22307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434194
263	NC_020543	CGG	2	6	22429	22434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434194
264	NC_020543	GCT	5	15	22493	22507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434194
265	NC_020543	GCC	2	6	22555	22560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434194
266	NC_020543	CGG	2	6	22595	22600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434194
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269	NC_020543	GCG	2	6	22816	22821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434194
270	NC_020543	CGC	2	6	22902	22907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434194
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272	NC_020543	CGA	3	9	22943	22951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434194
273	NC_020543	AAG	2	6	22980	22985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434194
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275	NC_020543	GCG	3	9	23036	23044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434194
276	NC_020543	TCG	2	6	23056	23061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434194
277	NC_020543	GCT	2	6	23168	23173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434194
278	NC_020543	GCT	2	6	23195	23200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434194
279	NC_020543	GAT	2	6	23374	23379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434195
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281	NC_020543	CGC	2	6	23490	23495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434195
282	NC_020543	TGG	2	6	23582	23587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434195
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284	NC_020543	GCC	2	6	23650	23655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434195
285	NC_020543	CCG	2	6	23782	23787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434195
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287	NC_020543	GGC	2	6	24046	24051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434196
288	NC_020543	AAT	2	6	24075	24080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472434196
289	NC_020543	TCG	2	6	24119	24124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434196
290	NC_020543	CGC	2	6	24215	24220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434196
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330	NC_020543	CCG	2	6	28837	28842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
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332	NC_020543	GCA	2	6	28883	28888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
333	NC_020543	GCC	2	6	28964	28969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
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369	NC_020543	ATG	2	6	31259	31264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434200
370	NC_020543	GTC	2	6	31413	31418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
371	NC_020543	CGA	3	9	31444	31452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
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373	NC_020543	AGG	2	6	31815	31820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434200
374	NC_020543	GGC	2	6	31876	31881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
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498	NC_020543	CGA	2	6	41473	41478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434205
499	NC_020543	GGC	2	6	41512	41517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434205
500	NC_020543	GCA	2	6	41603	41608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434205

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